Réseaux d’information sur la         biodiversité                            Situation, outils et perspectives            ...
Menu du jour                  • décrire la vie sur Terre                  • la biodiversité informatique                  ...
Décrire la vieMonday 19 December 11
Biogéographie                  • Etude des distributions des organismes                        vivants et des écosystèmes ...
Biodiversité                        La biodiversité est la diversité naturelle des                        organismes vivan...
Biodiversité                        La variabilité des organismes vivants de toute                        origine y compri...
Mesurer la biodiversité              • pas de mesure unique              • utilisation d’indices              • processus ...
Etat des lieux                  • 1,75 M d’espèces décrites                  • 3,6 - 100 M d’espèces en tout              ...
Aspects politiques                  • CBD 1992: MEA, CHM, GBIF                  • Pas d’agence mondiale pour la biodiversi...
Le besoin d’information                  • recherche scientifique                  • conservation                  • gestio...
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original slide: Huw GriffithsMonday 19 December 11
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“best&viewed&when&enlarged&to&a&1.55meter&diameter”Monday 19 December 11
addMonday 19 December 11
h8p://flare.prefuse.org/demo/Monday 19 December 11
Les Réseaux                        d’informationMonday 19 December 11
L’évolution du webMonday 19 December 11
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Web2.0               Web participatif, social et intelligence collective.                                                 ...
original slide: Mark Parsons      Notre vision:      Les données sont ouvertes, liées, utiles, et sauves                  ...
original slide: Mark Parsons      Ouvertes      Open Data is a philosophy and practice requiring that certain data are fre...
original slide: Mark Parsons      Liées      The term Linked Data is used to describe a method of exposing, sharing, and  ...
original slide: Mark Parsons      Utiles      Documentées, et utilisable dans un certain contexte d’analyseMonday 19 Decem...
original slide: Mark Parsons     Interopérables      La standardisation des données et des métadonnées permet aux systèmes...
original slide: Mark Parsons      Sauves      Safe from hackers, from obsolescence, from undocumented change, from loss,  ...
original slide: Vishwas Chavan   Les données primaires sur         la biodiversité           un enregistrement digital dét...
original slide: Vishwas Chavan        Importance des données                                          Policy              ...
original slide: Vishwas Chavan       Applications des données primaires            • Prédire les effets des changements cl...
original slide: Vishwas Chavan                         www.GBIF.org        • Global Biodiversity Information Facility     ...
original slide: Vishwas Chavan               Le portail de données du GBIF                                Seamless integra...
original slide: Peter Desmet                        313&M&records                                h8p://eol.org/pages/1/map...
original slide: Vishwas Chavan     Utilisateurs de GBIF    Scientists,               experts    Government officials at ...
original slide: Vishwas Chavan                                     Intégration des données            World Database on   ...
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original slide: Vishwas Chavan Moving towards…        global integration                                  ?               ...
Cartographier les vecteurs                                                original slide: Vishwas Chavan                  ...
original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus – native range                             Modeled native range in         ...
original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus:potential USA invasion          Projected Asian niche onto present USA to c...
original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus:actual USA invasion (by county)Monday 19 December 11
original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus:world risk-map (present)Monday 19 December 11
original slide: Vishwas Chavan    Impact des changements climatiques                        Sterculiaceae (Meliaceae, Dipt...
original slide: Vishwas Chavan    Impact des changements climatiques        ! Allfamilies and genera suffer habitat loss; ...
Autres réseaux                  • OBIS                  • ALA                  • EOL                  • ANTABIF           ...
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www. biodiversity.aqMonday 19 December 11
original slide: Mike Sparrow                 Le cas de l’AntarctiqueMonday 19 December 11
original slide: Mike Sparrow              Changes in the Earth system have been observed. These                are mainly ...
original slide: Mike Sparrow                 Such changes can only be explained by including both                     anth...
original slide: Mike Sparrow            Surface temperature of the Earth until 2100 if greenhouse             gas concentr...
original slide: Mike Sparrow               GOUVERNANCE DE L’ANTARCTIQUE   • Pas de gouvernement central   • Régime juridiq...
original slide: Mike Sparrow                        LE TRAITE ANTARCTIQUE  • Antarctica shall be used for peaceful purpose...
original slide: Mike Sparrow                        L’ANTARCTIQUE DANS LE                             SYSTEME TERREMonday ...
original slide: Mike Sparrow                        Summer&DJF&                 Autumn&MAM&                        WinterJ...
original slide: Mike Sparrow    THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM                        (1) Ice Sheets and Sea Level ...
original slide: Mike Sparrow    THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM                        (3) The Oceans: Global Overtu...
original slide: Mike Sparrow    THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM                         (3) The Oceans: Melting Glac...
original slide: Mike Sparrow    THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM                        (3) The Oceans: Ocean Acidific...
original slide: Mike Sparrow      ANTARCTIC      ECOSYSTEMS     Shifts in Penguin    Populations on the    Western Antarct...
original slide: Mike Sparrow                                    ANTARCTIC ECOSYSTEMS          Change per decade           ...
original slide: Mike Sparrow            ANTARCTIC ECOSYSTEMS AND PEOPLE                        Economic and Strategic Inte...
Biodiversité Antarctique• Haute adaptation à un environnement extrême• Haut niveau d’endémisme (>50% des espèces)• Essenti...
SCAR-MarBIN                        Marine Biodiversity Information Network         • Année Polaire Internationale 2007/08 ...
ANTABIF                        Antarctic Biodiversity Information Facility         • SCAR-MarBIN         • Global Biodiver...
Antarctic Biodiversity                  Information Networks    • Antarctic Node for OBIS    • Antarctic Node for GBIF    ...
Philosophie           • Construire un réseau (écosystème) d’information           • Accès ouvert et gratuit aux données et...
Portails de données •      En ligne depuis Oct 2005 •      open access •      935,000 visiteurs •      8,400,000 hits •   ...
Taxonomie •      Le premier RAMS •      Panel de 60+ éditeurs •      WoRMS, CoL and EoL •      17,098 taxa (RAMS) •      R...
Biogeographie  •     1,288,441 entrées  •     198 datasets  •     5,235 taxa  •     OBIS, GBIF  •     Téléchargeable  •   ...
Aperçu du portail de                             donnéesMonday 19 December 11
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FonctionnalitésMonday 19 December 11
biodiversity.aq        • organisé en sous-domaines: “.aq” = Antarctica        • www.biodiversity.aq        • data.biodiver...
www. biodiversity.aq        • site généraliste        • news        • contact        • sponsors        • governance       ...
www. biodiversity.aqMonday 19 December 11
data. biodiversity.aq                  • trouver les données primaires                  • visualiser les occurrences sur u...
data. biodiversity.aqMonday 19 December 11
ipt. biodiversity.aq                  • préparer et nettoyer les données                  • publier les données primaires ...
ipt. biodiversity.aqMonday 19 December 11
Flux de données                                       (votre point de vue)  Your data                           DwC-A     ...
afg. biodiversity.aq                  • Aide à l’identification                  • Plateforme de publication/partage pour d...
afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
afg. biodiversity.aq                            afg.biodiversity.aq                    Antarctic Field GuidesMonday 19 Dec...
afg. biodiversity.aq                               afg.biodiversity.aqMonday 19 December 11
afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
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L’Atlas biogéographique                             atlas.biodiversity.aq                             atlas.scarmarbin.be ...
Hedgpeth&1969’s&FolioMonday 19 December 11
Mashing&(and&sharing)&data&layers                                       Slope                                    Bathymetr...
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Identifier les lacunesMonday 19 December 11
Evaluer notre ignorance       •      “Nettoyage” de toute la base de donnée       •      Données bathymétriques ajoutées à...
Ensemble des donnéesMonday 19 December 11
Toutes les espècesMonday 19 December 11
NematodaMonday 19 December 11
AnnelidaMonday 19 December 11
CnidariaMonday 19 December 11
EchinodermataMonday 19 December 11
MolluscaMonday 19 December 11
ChordataMonday 19 December 11
ArthropodaMonday 19 December 11
Résumé              • La couverture spatiale & taxonomique varie                fortement en fonction du groupe considéré ...
BenthosMonday 19 December 11
BenthosMonday 19 December 11
PelagosMonday 19 December 11
Oiseaux et MammifèresMonday 19 December 11
PoissonsMonday 19 December 11
Conclusions       • Distorsion vers les zones peu profondes, les stations de         recherche et les trajectoires de navi...
Notre ignorance est abyssaleMonday 19 December 11
Conclusions       • La distorsion due à la variabilité de l’effort         d’échantillonnage est responsable d’un grand no...
Identifier les lacunes                                                                2,8 espèces d’isopodes               ...
Biodiversité et                 changement climatiqueMonday 19 December 11
original slide: Huw Griffiths                            Sea-ice change                                             Colonie...
original slide: Huw Griffiths                                ≤50% decrease in krill population                             ...
original slide: Huw Griffiths                        Bracegirdle, 2008Monday 19 December 11
original slide: Huw Griffiths                        Ocean warming   COPE or ADAPT  MOVE   • deeper   • further South   EXT...
original slide: Huw Griffiths                        Changes in species composition - 2050                                 ...
original slide: Huw Griffiths                Southern Ocean Continuous Plankton Recorder                                   ...
InfluencerMonday 19 December 11
CCAMLR                  • Convention for the Conservation of                        Antarctic Marine Living Resources     ...
“Bio”regionalisation        • nécessaire afin d’entreprendre la désignation d’un               système d’AMPs        • donn...
Mettre du ‘bio’ dans la                    bioregionalisation       • utiliser la biodiversité afin de rendre les processus...
PerspectivesMonday 19 December 11
Le futur (proche)     Expansion/évolution des capacités     Interopérabilité     Exploration des données     Intégration d...
Perspectives   Héritage digital du CAML et de l’API   Etat de l’environnement Antarctique, Etat 0   Nouvelle biorégionalis...
Défis                  • Science faisant un usage intensif des                        données                  • Déluges de...
PIC                        Les Polar Information CommonsMonday 19 December 11
Remerciements                  • Huw Griffiths, BAS                  • Mike Sparrow, SCAR                  • Mark Parsons, ...
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Réseaux d'information sur la biodiversité - situation outils et perspectives

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Présentation donnée dans le cadre du cours de biogéographie (Chantal De Ridder, ULB)

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Réseaux d'information sur la biodiversité - situation outils et perspectives

  1. 1. Réseaux d’information sur la biodiversité Situation, outils et perspectives Bruno Danis, Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique #biodiversityaqMonday 19 December 11
  2. 2. Menu du jour • décrire la vie sur Terre • la biodiversité informatique • le cas de l’Antarctique • applications: biogéographie, conservation • défis et perspectivesMonday 19 December 11
  3. 3. Décrire la vieMonday 19 December 11
  4. 4. Biogéographie • Etude des distributions des organismes vivants et des écosystèmes connexes; • les rélations géographiques de ces organismes avec leur environment au cours du temps • QUOI? OU? QUAND?Monday 19 December 11
  5. 5. Biodiversité La biodiversité est la diversité naturelle des organismes vivants. Elle sapprécie en considérant la diversité des écosystèmes, des espèces, des populations et celle des gènes dans lespace et dans le temps, ainsi que lorganisation et la répartition des écosystèmes aux échelles biogéographiques. (Wikipedia)Monday 19 December 11
  6. 6. Biodiversité La variabilité des organismes vivants de toute origine y compris, entre autres, les écosystèmes terrestres, marins et autres écosystèmes aquatiques et les complexes écologiques dont ils font partie; cela comprend la diversité au sein des espèces et entre espèces ainsi que celle des écosystèmes. (Convention on Biodiversity)Monday 19 December 11
  7. 7. Mesurer la biodiversité • pas de mesure unique • utilisation d’indices • processus complexes, dynamiques, dans l’espace et le tempsMonday 19 December 11
  8. 8. Etat des lieux • 1,75 M d’espèces décrites • 3,6 - 100 M d’espèces en tout • période d’extinction massive • perte de services écosystémiquesMonday 19 December 11
  9. 9. Aspects politiques • CBD 1992: MEA, CHM, GBIF • Pas d’agence mondiale pour la biodiversité (vs FAO, OMS) • IMOSEB => IPBES (sous UNEP) • SPIMonday 19 December 11
  10. 10. Le besoin d’information • recherche scientifique • conservation • gestion • => besoin d’un accès direct aux données primaires sur la biodiversité • => besoin d’un panel d’outils • la visualisation de la biodiversitéMonday 19 December 11
  11. 11. Monday 19 December 11
  12. 12. Monday 19 December 11
  13. 13. Monday 19 December 11
  14. 14. original slide: Huw GriffithsMonday 19 December 11
  15. 15. Monday 19 December 11
  16. 16. “best&viewed&when&enlarged&to&a&1.55meter&diameter”Monday 19 December 11
  17. 17. addMonday 19 December 11
  18. 18. h8p://flare.prefuse.org/demo/Monday 19 December 11
  19. 19. Les Réseaux d’informationMonday 19 December 11
  20. 20. L’évolution du webMonday 19 December 11
  21. 21. Monday 19 December 11
  22. 22. Monday 19 December 11
  23. 23. Web2.0 Web participatif, social et intelligence collective. Markus AngermeierMonday 19 December 11
  24. 24. original slide: Mark Parsons Notre vision: Les données sont ouvertes, liées, utiles, et sauves Copyright: © Christian MorelMonday 19 December 11
  25. 25. original slide: Mark Parsons Ouvertes Open Data is a philosophy and practice requiring that certain data are freely available to everyone, without restrictions from copyright, patents or other mechanisms of control.—WikipediaMonday 19 December 11
  26. 26. original slide: Mark Parsons Liées The term Linked Data is used to describe a method of exposing, sharing, and connecting data via dereferenceable URIs on the Web.—WikipediaMonday 19 December 11
  27. 27. original slide: Mark Parsons Utiles Documentées, et utilisable dans un certain contexte d’analyseMonday 19 December 11
  28. 28. original slide: Mark Parsons Interopérables La standardisation des données et des métadonnées permet aux systèmes d’échanger de l’information, de manière optimaleMonday 19 December 11
  29. 29. original slide: Mark Parsons Sauves Safe from hackers, from obsolescence, from undocumented change, from loss, and from the ravages of time.Monday 19 December 11
  30. 30. original slide: Vishwas Chavan Les données primaires sur la biodiversité un enregistrement digital détaillant l’instance d’un organisme: “quoi, où, quand, comment, par qui?” concernant une occurenceMonday 19 December 11
  31. 31. original slide: Vishwas Chavan Importance des données Policy development and decision making (at local, national, regional, and global levels) Données sur la biodiversité Monitoring of status Conservation and trends of and sustainable biodiversity use of (sound science) biodiversityMonday 19 December 11
  32. 32. original slide: Vishwas Chavan Applications des données primaires • Prédire les effets des changements climatiques • Analyser et prédire la dispersion des maladies sur les humains, les cultures, ... • Choix de nouvelles zones protégées • Suivi des espèces invasives et prédiction des voies d’invasion • Fournir de l’information aux preneurs de décision • Fournir des données aux communautés scientifiquesMonday 19 December 11
  33. 33. original slide: Vishwas Chavan www.GBIF.org • Global Biodiversity Information Facility • organisation intergouvernementale (depuis 2002) • développer une infrastructure informatique globale pour une circulation efficace des données sur la biodiversité • portail de données • standards et outils • formation • réduction de la fracture numérique • rapatriement des donnéesMonday 19 December 11
  34. 34. original slide: Vishwas Chavan Le portail de données du GBIF Seamless integration of data from many sources Searches Taxonomic Geographic, by country, region, or bounding-box By dataset or a combination of these http://data.gbif.org/Monday 19 December 11
  35. 35. original slide: Peter Desmet 313&M&records h8p://eol.org/pages/1/mapsMonday 19 December 11
  36. 36. original slide: Vishwas Chavan Utilisateurs de GBIF  Scientists, experts  Government officials at all levels  Education at all levels  NGOs and the general public These needs are highly varied, but can be met by open access to the same datasets The same data can be analysed differently for different usesMonday 19 December 11
  37. 37. original slide: Vishwas Chavan Intégration des données World Database on Primary Biodiversity Protected Areas Data >60,000 >181 M specimen protected areas and observation data MadagascarSpain Species geo-referenced data. taxonomic resolution Visualisation on WDPA site (intelligence) Protected GBIF GBIF Each Protected areas data geo- Area polygon referenced processed…. Spain 271 2.2 M 51% Madagascar 72 0.35 M 61% Data processing from the two databasesMonday 19 December 11
  38. 38. original slide: Vishwas ChavanMonday 19 December 11
  39. 39. original slide: Vishwas ChavanMonday 19 December 11
  40. 40. original slide: Vishwas ChavanMonday 19 December 11
  41. 41. original slide: Vishwas ChavanMonday 19 December 11
  42. 42. original slide: Vishwas ChavanMonday 19 December 11
  43. 43. original slide: Vishwas Chavan Moving towards… global integration ? Threatened Spp.; Red List Spp. Migratory Spp. Invasives, crop wild relatives, medicinals, etc.Monday 19 December 11
  44. 44. Cartographier les vecteurs original slide: Vishwas Chavan de maladie  Aedes albopictus “Asian Tiger Mosquito”  Invader - fastest spreading mosquito in the world  Aggressive daytime biter and pest  Known to transmit Dengue, La Crosse, St. Louis, Eastern Equine, Ross River, Rift Valley, and West Nile VirusesMonday 19 December 11
  45. 45. original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus – native range Modeled native range in Asia from specimens & observations (ENM)Monday 19 December 11
  46. 46. original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus:potential USA invasion Projected Asian niche onto present USA to create invasion risk-map.Monday 19 December 11
  47. 47. original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus:actual USA invasion (by county)Monday 19 December 11
  48. 48. original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus:world risk-map (present)Monday 19 December 11
  49. 49. original slide: Vishwas Chavan Impact des changements climatiques Sterculiaceae (Meliaceae, Dipterocapaceae)Monday 19 December 11
  50. 50. original slide: Vishwas Chavan Impact des changements climatiques ! Allfamilies and genera suffer habitat loss; ! Some do gain habitat potential, but this requires migration and suitable habitat (for forests) at destination; ! Important implications for REDD and other CC adaptation/mitigation programmesMonday 19 December 11
  51. 51. Autres réseaux • OBIS • ALA • EOL • ANTABIF • => tous interconnectés, forment un écosystème interopérable • => multiplication des contextesMonday 19 December 11
  52. 52. Monday 19 December 11
  53. 53. Monday 19 December 11
  54. 54. Monday 19 December 11
  55. 55. Monday 19 December 11
  56. 56. www. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  57. 57. original slide: Mike Sparrow Le cas de l’AntarctiqueMonday 19 December 11
  58. 58. original slide: Mike Sparrow Changes in the Earth system have been observed. These are mainly (but not exclusively) due to changes in Greenhouse gas concentrations Source: IPCC 2007Monday 19 December 11
  59. 59. original slide: Mike Sparrow Such changes can only be explained by including both anthropogenic (human) and natural forcings Source: IPCC 2007Monday 19 December 11
  60. 60. original slide: Mike Sparrow Surface temperature of the Earth until 2100 if greenhouse gas concentrations double. Based on a weighted average of the IPCC CMIP3 models. Source: John Turner (BAS)Monday 19 December 11
  61. 61. original slide: Mike Sparrow GOUVERNANCE DE L’ANTARCTIQUE • Pas de gouvernement central • Régime juridique défini par l’ATS (1959) • Système du Traité Antarctique • Traité • Comités consultatifs • Secrétariat • CCAMLR • Protocole de MadridMonday 19 December 11
  62. 62. original slide: Mike Sparrow LE TRAITE ANTARCTIQUE • Antarctica shall be used for peaceful purposes only (Art. I) • Freedom of scientific investigation in Antarctica and cooperation toward that end … shall continue (Art. II) • Scientific observations and results from Antarctica shall be exchanged and made freely available (Art. III) • All areas of Antarctica, including all stations, installations and equipment within those areas … shall be open at all times to inspection (Art.VII)Monday 19 December 11
  63. 63. original slide: Mike Sparrow L’ANTARCTIQUE DANS LE SYSTEME TERREMonday 19 December 11
  64. 64. original slide: Mike Sparrow Summer&DJF& Autumn&MAM& WinterJJA SpringSON In the future the whole of the Antarctic Region is predicted to warm: 3.4°C by 2100 Source: John Turner (BAS)Monday 19 December 11
  65. 65. original slide: Mike Sparrow THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM (1) Ice Sheets and Sea Level Rise Sea Level Rise by 2100: ➡18-59 cm (IPCC 2007) ➡up to140 cm (ACCE 2009) ➡75-190 cm (Rahmstorf 2010) ➡90-160 cm (SWIPA 2011) “Ice sheets will be the dominant contributor to sea level rise in the 21st century” (Rignot et al, 2011)Monday 19 December 11
  66. 66. original slide: Mike Sparrow THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM (3) The Oceans: Global Overturning Circulation Driven by sinking of dense cold waters at both poles - Redistributes heat around the globe (e.g. keeps western Europe ~5 °C warmer)Monday 19 December 11
  67. 67. original slide: Mike Sparrow THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM (3) The Oceans: Melting Glaciers Low pressure cell (ASL) forces warm subsurface water to well up and penetrate under ice shelf ‘Warm’ ocean melts Pine Island Glacier from beneathMonday 19 December 11
  68. 68. original slide: Mike Sparrow THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM (3) The Oceans: Ocean AcidificationMonday 19 December 11
  69. 69. original slide: Mike Sparrow ANTARCTIC ECOSYSTEMS Shifts in Penguin Populations on the Western Antarctic Peninsula are Attributed to Changes in Precipitation Patterns and Sea Ice. McClintock et al. (2008)Monday 19 December 11
  70. 70. original slide: Mike Sparrow ANTARCTIC ECOSYSTEMS Change per decade ove r t wofo ld d ecrease u p to twof old decrease less than 5% cha nge up to twofo ld increa se ove r t wofo ld increase Atkinson et al (2004) As sea ice decreases krill population decreases and salp population increases...Monday 19 December 11
  71. 71. original slide: Mike Sparrow ANTARCTIC ECOSYSTEMS AND PEOPLE Economic and Strategic Interests in the AntarcticMonday 19 December 11
  72. 72. Biodiversité Antarctique• Haute adaptation à un environnement extrême• Haut niveau d’endémisme (>50% des espèces)• Essentiellement marine (78% vivent sur le fond)• >8000 espèces connuses. Estimations: autour de 20.000• Sous-étudié (surtout les zones abyssales)• Probablement très sensible aux changements climatiques• Besoin de systèmes d’information performant et dédiéMonday 19 December 11
  73. 73. SCAR-MarBIN Marine Biodiversity Information Network • Année Polaire Internationale 2007/08 • Census of Antarctic Marine Life (CAML) • Ocean Biogeographic Information System (OBIS) • Financement: Politique Scientifique Belge (BELSPO) • Accès aux données sur la biodiversité marineMonday 19 December 11
  74. 74. ANTABIF Antarctic Biodiversity Information Facility • SCAR-MarBIN • Global Biodiversity Information Facility (GBIF) • Financement: Politique Scientifique Belge (BELSPO) et contributions internationales • types de données: taxonomie et biogeographie • biodiversité marine, terrestre et limnétiqueMonday 19 December 11
  75. 75. Antarctic Biodiversity Information Networks • Antarctic Node for OBIS • Antarctic Node for GBIF • Data management component for new SCAR PPGs: ANT-ECO, ANT-ERA • Biodiversity component of SOOS • Antarctic Node for GEO-BONMonday 19 December 11
  76. 76. Philosophie • Construire un réseau (écosystème) d’information • Accès ouvert et gratuit aux données et aux technologies • Exposer les données et métadonnées • Rester à l’écoute de la communauté • Adopter les meilleurs standards • Servir la science, la conservation, la gestion Riddle, M. Australian Antarctic DivisionMonday 19 December 11
  77. 77. Portails de données • En ligne depuis Oct 2005 • open access • 935,000 visiteurs • 8,400,000 hits • 60,000,000 dld records • Citations: 183Monday 19 December 11
  78. 78. Taxonomie • Le premier RAMS • Panel de 60+ éditeurs • WoRMS, CoL and EoL • 17,098 taxa (RAMS) • RAS en construction • 24,248 taxa (RAS)Monday 19 December 11
  79. 79. Biogeographie • 1,288,441 entrées • 198 datasets • 5,235 taxa • OBIS, GBIF • Téléchargeable • WebGIS • WebservicesMonday 19 December 11
  80. 80. Aperçu du portail de donnéesMonday 19 December 11
  81. 81. Monday 19 December 11
  82. 82. Monday 19 December 11
  83. 83. Monday 19 December 11
  84. 84. Monday 19 December 11
  85. 85. FonctionnalitésMonday 19 December 11
  86. 86. biodiversity.aq • organisé en sous-domaines: “.aq” = Antarctica • www.biodiversity.aq • data.biodiversity.aq • ipt.biodiversity.aq • afg.biodiversity.aq • scratchpads.biodiversity.aq • ogc.biodiversity.aqMonday 19 December 11
  87. 87. www. biodiversity.aq • site généraliste • news • contact • sponsors • governance • flux RSS: blog, PIC, photostream, slideshare, MendeleyMonday 19 December 11
  88. 88. www. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  89. 89. data. biodiversity.aq • trouver les données primaires • visualiser les occurrences sur une carte interactive • accéder aux données taxonomiques • télécharger les données • accéder aux statistiques d’utilisation • envoyer du feedback • accéder à la doc techniqueMonday 19 December 11
  90. 90. data. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  91. 91. ipt. biodiversity.aq • préparer et nettoyer les données • publier les données primaires • publier les metadonnées • pousser les données et métadonnées vers ANTABIF & GBIF • générer et soumettre une publication scientifique “Data Paper”Monday 19 December 11
  92. 92. ipt. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  93. 93. Flux de données (votre point de vue) Your data DwC-A IPT ANTABIF standardize upload publish publish Data PaperMonday 19 December 11
  94. 94. afg. biodiversity.aq • Aide à l’identification • Plateforme de publication/partage pour des guides de terrains personnalisés • Images de haute qualité • Descriptions d’experts • Construit à la volée, depuis différents sources • Génération d’un pdfMonday 19 December 11
  95. 95. afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  96. 96. afg. biodiversity.aq afg.biodiversity.aq Antarctic Field GuidesMonday 19 December 11
  97. 97. afg. biodiversity.aq afg.biodiversity.aqMonday 19 December 11
  98. 98. afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  99. 99. afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  100. 100. afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  101. 101. afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  102. 102. afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  103. 103. Monday 19 December 11
  104. 104. Monday 19 December 11
  105. 105. L’Atlas biogéographique atlas.biodiversity.aq atlas.scarmarbin.be • Versions papier et digitale • “Remake” d’un classique (Hedgepeth 1969) • Générer des cartes thématiques • Générer des cartes prédictives • Construire une plateforme interactive • Génération dynamique du contenuMonday 19 December 11
  106. 106. Hedgpeth&1969’s&FolioMonday 19 December 11
  107. 107. Mashing&(and&sharing)&data&layers Slope Bathymetry Chlorophyll Distance to the continent Distance to bird colonies Distance to ice Distance to shelf Distance to canyon Floor temperature ...Monday 19 December 11
  108. 108. Monday 19 December 11
  109. 109. Identifier les lacunesMonday 19 December 11
  110. 110. Evaluer notre ignorance • “Nettoyage” de toute la base de donnée • Données bathymétriques ajoutées à toutes les entrées benthiques • comptage des espèces vs stations pour les phylums majeurs (nematoda, mollusca, cnidaria, echinodermata, chordata, arthropoda & annelida) • comptage des espèces vs stations pour les groupes majeurs (poissons, oiseaux et mammifères, pélagique et benthiques) • Analyse bathymétrique. Stations & espèces benthiques en fonction de la profondeur.Monday 19 December 11
  111. 111. Ensemble des donnéesMonday 19 December 11
  112. 112. Toutes les espècesMonday 19 December 11
  113. 113. NematodaMonday 19 December 11
  114. 114. AnnelidaMonday 19 December 11
  115. 115. CnidariaMonday 19 December 11
  116. 116. EchinodermataMonday 19 December 11
  117. 117. MolluscaMonday 19 December 11
  118. 118. ChordataMonday 19 December 11
  119. 119. ArthropodaMonday 19 December 11
  120. 120. Résumé • La couverture spatiale & taxonomique varie fortement en fonction du groupe considéré • Certains taxa majeurs sont “manquants”: Eponges, Isopodes, Pycnogonides, Bryozoaires, Decapodes, Crinoides & Brachiopodes • Zones sous- ou non-échantillonnées: ouest de la mer de Weddell, mer d’Amundsen, zones abyssalesMonday 19 December 11
  121. 121. BenthosMonday 19 December 11
  122. 122. BenthosMonday 19 December 11
  123. 123. PelagosMonday 19 December 11
  124. 124. Oiseaux et MammifèresMonday 19 December 11
  125. 125. PoissonsMonday 19 December 11
  126. 126. Conclusions • Distorsion vers les zones peu profondes, les stations de recherche et les trajectoires de navires de recherche • Ensemble du jeu de données: les observations d’oiseaux et de mammifères dominent l’analyse de l’effort d’échantillonnage • Les données benthiques déterminent les schémas d’ensemble de la richesse spécifique • Co-occurrence entre les “hotspots” de données benthiques et la présence de stationsMonday 19 December 11
  127. 127. Notre ignorance est abyssaleMonday 19 December 11
  128. 128. Conclusions • La distorsion due à la variabilité de l’effort d’échantillonnage est responsable d’un grand nombre de patrons observés • Distorsion massive due à un sous-échantillonnage du profond • Certaines zones et taxa, bien représentés, sont utilisables pour des analyses ultérieuresMonday 19 December 11
  129. 129. Identifier les lacunes 2,8 espèces d’isopodes sont décrites chaque année De Broyer C & Danis B, DSRII 2011 600+ ont été découvertes durant ANDEEP 214 années pour tout décrire!Monday 19 December 11
  130. 130. Biodiversité et changement climatiqueMonday 19 December 11
  131. 131. original slide: Huw Griffiths Sea-ice change Colonies: declining growing or stable Parkinson, 2002Monday 19 December 11
  132. 132. original slide: Huw Griffiths ≤50% decrease in krill population © I. Arndt, source: AWI 1976 - 2003 Over 2-fold decrease / 10 years Over 2-fold increase / 10 years Atkinson et al 2004Monday 19 December 11
  133. 133. original slide: Huw Griffiths Bracegirdle, 2008Monday 19 December 11
  134. 134. original slide: Huw Griffiths Ocean warming COPE or ADAPT MOVE • deeper • further South EXTINCTION +0.05°C / year Meredith & King 2005Monday 19 December 11
  135. 135. original slide: Huw Griffiths Changes in species composition - 2050 Cheung et al 2009Monday 19 December 11
  136. 136. original slide: Huw Griffiths Southern Ocean Continuous Plankton Recorder Stress: 0.05 Sea Ice Zone: January 2005 2008 5 mm 2003 6 2007 1998 2000 0.5 mm 1993 2001 2006 Pre-2000: 2004 large zooplankton (krill) Post-2000: small zooplankton (Oithona) 1991 2002 Hosie, pers. com.Monday 19 December 11
  137. 137. InfluencerMonday 19 December 11
  138. 138. CCAMLR • Convention for the Conservation of Antarctic Marine Living Resources • fait partie du système du Traité Antarctique • “to conserve marine life of the Southern Ocean” • s’applique à toutes les ressources marine vivantes entre le continent et le front polaireMonday 19 December 11
  139. 139. “Bio”regionalisation • nécessaire afin d’entreprendre la désignation d’un système d’AMPs • données physiques et environnementales • concentration de chlorophylle BIO • il fallait un peu de “bio” quand même... REGIONAL ISATION OF THE SOUTHERN OCEAN REPORT OF EXPERTS WORKSHOP (HOBART, SEPTEMBER 2006) aMonday 19 December 11
  140. 140. Mettre du ‘bio’ dans la bioregionalisation • utiliser la biodiversité afin de rendre les processus de bioregionalisation et la désignation d’AMP cohérents? • connaît-on réellement la biodiversité Antarctique? • Travail principalement sur les shelfs • avons-nous suffisamment de connaissances? • Beaucoup de travaux sont (toujours) en coursMonday 19 December 11
  141. 141. PerspectivesMonday 19 December 11
  142. 142. Le futur (proche) Expansion/évolution des capacités Interopérabilité Exploration des données Intégration des données génétiques Outils d’aide à l’identification Implication de la communauté Implication des citoyensMonday 19 December 11
  143. 143. Perspectives Héritage digital du CAML et de l’API Etat de l’environnement Antarctique, Etat 0 Nouvelle biorégionalisation, aires marines protégées Le lien entre plusieurs disciplines Consolidation de la communauté du SCAR Un changement de culture Conservation informée et adaptative Optimisation des efforts de recherche Rose A. DZMBMonday 19 December 11
  144. 144. Défis • Science faisant un usage intensif des données • Déluges de données • Fracture numérique • Intégration des autres types de données • Données noire et données orphelines • Changement de cultureMonday 19 December 11
  145. 145. PIC Les Polar Information CommonsMonday 19 December 11
  146. 146. Remerciements • Huw Griffiths, BAS • Mike Sparrow, SCAR • Mark Parsons, NSIDC • Sergio Alvarez,Vizzuality • Vishwas Chavan, GBIF • Peter Desmet, CanadensysMonday 19 December 11
  147. 147. #biodiversityaq image&©&NY&Times&Monday 19 December 11

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