異分野融合型の科学データ公開サイト
LinkData.org
http://linkdata.org/
（独）理化学研究所 下山 紗代子, 豊田 哲郎
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会

RDF公開プラットフォームの必要性
 RDF (Resource Description Framework)
はWeb上でデータを共有するための標準形式
 幅広い分野で活躍する研究者や多くの人々が
RDFでデータを公開していける場が必要
 そのためにLinkDataでは、
誰でも簡単に使えるRDF変換ツールを提供
サーバを持たない人にRDF公開の場を提供
Web上でRDF教育の場を提供
RDFとは何かを分かりやすく学べる
自分のデータに最適なRDFモデルをデザインできる
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 2

データをRDF作品として公開できる
データ 簡単に公開！
第3回LinkedData勉強会
2012/5/24 3

3ステップでRDFを公開できる
テーブルデータ RDF形式へ
作成 変換
ステップ ステップ ステップ
テーブルデータの ステップ1で作成した 公開されたRDF作品を
ひな形ファイルを作成 テーブルデータの ダウンロード
ファイルをアップロード
ひな形ファイルに 世界中の人が利用し、
あなたのデータを入力 あなたの貢献を高く
評価
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 4

入力形式は扱いやすいテーブルで
データモデル RDFモデル テーブルモデル
• 人が直感的に理解し
• データ間の関係をリ
やすい
ンクで明確に表現で
メリット きる
• 行単位でテキスト処
理できて簡単に扱え
• webとの相性が良い
る
• データ間の関係を表
• 人がデータ構造の全
すための意味論が不
体像を把握しにくい
明確になりやすい
デメリット
• 扱うには専門知識が
• 機械的に解釈させに
必要
くい
Property Property
モデルの図示 Subject Object
Subject Object
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 5

テーブルデータとRDFの対応例
元のテーブ 電話番号 電話番号
045-111-
中央図書館
ルデータ 1111
中央図書館 045-111-1111
電話番号 045-111-
電話番号 蔵書数 1111
列を追加 中央図書館
中央図書館 045-111-1111 154,265 154,265
蔵書数
行を追加 電話番号 045-111-
電話番号 蔵書数 1111
中央図書館
154,265
蔵書数
中央図書館 045-111-1111 154,265
電話番号 045-222-
2222
西区図書館
65,489
西区図書館 045-222-2222 65,489 蔵書数
電話番号 045-333-
3333
南区図書館 045-333-3333 98,548 南区図書館
98,548
2012/5/24 蔵書数 6

異分野融合型プラットフォーム
地域、行政、学術、経済等、様々な分野のデータ
→ サイエンス分野以外にも広がる利用と教育
7

分野融合的であることの重要性
 分野融合的な研究者の交流を促進
 新しい融合研究領域の創造
 科学データを扱う技術を科学以外の分野へと波及
 Linked dataに関する教育効果
 分野を制限せず、好きなデータでRDF技術を学べる
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 8

LinkData の機能一覧
1. スキーマ定義の支援機能
2. 標準プロパティのサジェスト機能
3. URIの自動生成機能
4. テーブルとRDFの対比機能
5. RDFへの変換・公開機能
6. データのつながりの可視化機能
7. アプリケーション開発者支援機能
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 9

1. スキーマ定義の支援機能
スキーマ定義のGUI
 スキーマ定義（入力データ
のひな形）を簡単に作成で
きる
 すでに公開されているRDF
作品からスキーマ定義を再
利用できる
入力データのひな形
（Excelファイル）
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 10

2. 標準プロパティのサジェスト機能
 使用するプロパティをリスト
（全385件）から選択できる
 Dublin Core等の汎用的に用
いられるプロパティに加えて、
OBO (Open Biomedical
Ontologies) 等のライフサイ
エンス分野で用いられるプロ
パティも登録されている
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 11

3. URIの自動生成機能
 サブジェクト・プロパティを
URLではなく、文字列で入力す
ることが可能
 アップロード後に自動でLink
DataオリジナルのURIに変換
URIの形式 URIの生成例
s1
http://linkdata.org
subject /resource/ http://linkdata.or
[作品ID]#[文字列] g/resource/
rdf1s1i#s1
p1
http://linkdata.org
property /property/ http://linkdata.or
[作品ID]#[文字列] g/property/
rdf1s1i#p1
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 12

4. RDFへの変換・公開機能
 アップロード形式： Excel, Text
 ダウンロード形式： Excel, Text, Turtle
@prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
@prefix rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .
@prefix cc: <http://creativecommons.org/ns#> .
@prefix xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> .
<>
cc:attributionName "Sayoko_Shimoyama"@ja ;
cc:attributionURL <http://linkdata.org/user/Sayoko_Shimoyama> ;
cc:license <http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/> .
<http://linkdata.org/property/rdf1s1i#phone_number>
rdf:type rdf:Property ;
rdfs:label "phone_number"@ja .
<http://linkdata.org/resource/rdf1s1i#central_library>
<http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label> "central_library"@ja, "中央図書館"@ja ;
<http://xmlns.com/foaf/0.1/homepage> <http://library.jp/central> ;
<http://linkdata.org/property/rdf1s1i#phone_number> "045-111-1111"@ja .
<http://linkdata.org/resource/rdf1s1i#west_library>
<http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label> "west_library"@ja, "西区図書館"@ja ;
<http://xmlns.com/foaf/0.1/homepage> <http://lib.com/west> ;
<http://linkdata.org/property/rdf1s1i#phone_number> "045-222-2222"@ja .
<http://linkdata.org/resource/rdf1s1i#south_library>
<http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label> "south_library"@ja, "南区図書館"@ja ;
<http://xmlns.com/foaf/0.1/homepage> <http://libraries/city/south> ;
<http://linkdata.org/property/rdf1s1i#phone_number> "045-333-3333"@ja .
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 13

5. テーブルとRDFの対比機能
 W3C RDF Validation Serviceに投
げてグラフモデルで可視化
自分のテーブル
データと対比さ
せることで、
RDFについて理
解を深められる
ようサポート
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 14

6. データのつながりの可視化機能
 グリーン： LODクラウドとして可視化
RDF作品
 ブルー：
外部ドメイン
 RDF作品の各ファ
イル中のsubject,
property, object
に使われている
URIのドメインと
つなげている
2012/5/24 15

7. アプリケーション開発者支援機能
 データ取得用APIを提供（LinkData側）
 外部アプリ
（http://fukuno.jig.jp/2012/jp02）
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 16

2012年3月：アプリ部門最優秀賞
Linked Open Data チャレンジ Japan 2011
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 17

2012年4月：WWW2012に出展
LinkDataブースは大盛況！
5日間で200人を超える訪問者が！
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 18

TBL卿が LinkData を評価
Tim-Barners-Lee 卿
LinkDataのシンプル性
に対して ”Excellent!!”
とのお言葉が！
2012/5/24
※ Tim-Barners-Lee 卿はWebの発明者として世界的な権威 19

国際的なネットワーク作りに成功
ローカルオーガナイザー：
LinkDataサイトを翻訳して、
その言語のコンテンツを管
理してくれる協力者
17カ国からローカルオーガナイザーへのオファー
日本を核に国際連携がスタート！！
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 20

LinkDataでアプリ開発
LinkDataのデー
Sequence_test タセットと連携し
てアプリを作れる
サイトを構築中
データ連携
2012/5/24 21

公開と利用のサイクルが回る
データからアプリを作る
アプリからデータを作る
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 22

LinkDataでゲノム設計
LinkDataのアプリ開発機能
を使って、プログラムでゲ
ノムを設計するコンテスト
「GenoCon」第２回大会を
本年開催予定
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 23

異分野のコミュニティを融合
GenoCon community LOD community
Linked Data links Communities!
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 24

皆様のご参加をお待ちしております
ご清聴ありがとうございました！
@Link_Data
https://www.facebook.com/LinkData
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