Successfully reported this slideshow.

Searching for medical information biostats


Published on

Published in: Health & Medicine, Technology
  • Be the first to comment

Searching for medical information biostats

  1. 1. Searching the Literature Biostats Susan Fowler, MLIS Medical Librarian 314‐362‐8092 pg: 314‐360‐1069
  2. 2. Outline • Search Strategy • Pulling Keywords from Your PICO Question • Boolean, Truncation, and Wild Cards • Hierarchy of Evidence and Study Design • Google Scholar • Cochrane Database of Systematic Reviews • PubMed (MEDLINE) • EMBASE
  3. 3. Choosing Appropriate Evidence Higher  Percentage of  Quality  Meta‐ the Literature  analyses Systematic  reviews Randomized  controlled trials Prospective blind  comparisons Cohort studies Case‐control studies Case series and case reports Animal and laboratory research Will Olmstadt, MS, MPH 
  4. 4. PICO • Patient or problem ‐ How would I describe a group of  patients similar to mine? • Intervention ‐ Which main intervention, prognostic  factor, or exposure am I considering? • Comparison ‐ What is the main alternative to compare  with the intervention? • Outcome ‐ What can I hope to accomplish, measure,  improve or affect? Will Olmstadt, MS, MPH 
  5. 5. The Search Strategy • Develop PICO question • Identify keywords and terms from PICO • Identify standardized subject headings • Combine subject headings and keywords  to narrow or broaden your search • Evaluate your search results • Revise the search in light of your results
  6. 6. Pulling Keywords from Your PICO Question • What are the main topics of your PICO? • Brainstorm – what other words could you  use to describe your topic? • What are some synonyms for the words  you’ve come up with?
  7. 7. Evaluate the Search Results Don’t be afraid if you have zero (0) or thousands of results,  play around with search strategies – you wont break  anything! – Read the titles and abstracts of “hits” in your search  to get a feel for their relevance – Identify relevant MeSH and Keywords used to index  particularly relevant “hits” – If your search yields too many or too few hits,  modify it and try again
  8. 8. Revise the Search in Light of your Results • Narrow the search by combining search  terms and applying limits • Broaden the search if the results are too  limited by removing keywords and limits
  9. 9. Boolean • AND • OR • NOT
  10. 10. Boolean strawberry AND  AND chocolate Strickland, Jennifer and Henderson, John R. (October 10, 2005). Boolean Logic. Retrieved September 22, 2007, from
  11. 11. Boolean strawberry OR  OR chocolate Strickland, Jennifer and Henderson, John R. (October 10, 2005). Boolean Logic. Retrieved September 22, 2007, from
  12. 12. Boolean and Nesting (strawberry OR  NOT chocolate Strickland, Jennifer and Henderson, John R. (October 10, 2005). Boolean Logic. Retrieved September 22, 2007, from
  13. 13. Truncation and Wild Cards • Truncation is a searchable shortened form of a word.  – adolescen* will include • adolescence • adolescent • adolescents, etc… • Wild card characters are useful because of alternate spellings and  other quirks in the English language.  – behavio?r, will include • behaviour  • behavior  – Wom*n, will include • women  • woman
  14. 14. Quotation Marks Using quotation marks for a phrase forces the database to  return results where those words appear together.  Without Quotations = 57,360 results With Quotations = 13,180 results
  15. 15. Google Scholar • • Freely accessible database of a vast array of materials  and media archived in the web • Customizable to point to your full text available through  your library • Customizable to send citations to your citation manager • Set up auto search alerts to track materials that match a  specific search query
  16. 16. Go to “Advanced  Scholar Search”
  17. 17. Advanced Scholar Search Use truncation Search exact  phrases Use limits to  narrow results by  specific author,  publication, and date range. Narrow by  subject area
  18. 18. Set Up Alert Click the envelope  to access the  alert service.
  19. 19. Set Up Alert, cont… Alerts will  automatically be  sent to your email.
  20. 20. Scholar Preferences
  21. 21. Scholar Preferences, cont…
  22. 22. Cochrane Database of Systematic Reviews • • “Gold Standard” for systematic reviews  • Free database, but requires paid subscription to access  most content
  23. 23. Cochrane
  24. 24. Cochrane Search Example Question: Does the use of Echinacea really prevent the common cold?  You are only  interested in  Cochrane Reviews
  25. 25. Cochrane Search Example cont… You are only  interested in  Cochrane Reviews Click “Record” to  view details of review  and access full text if  available. 
  26. 26. Cochrane Systematic Reviews Pros – Compiled through rigorous standards  – Review process has already been done so  you don’t have to Cons – Limited content – Limited search capabilities – Access to most full‐text content requires paid  subscription
  27. 27. PubMed (MEDLINE) • • Created and maintained by the National  Institute of Health (NIH) and the National  Library of Medicine (NLM) • 17 million citations back to 1950s • Free database of citations with some  content available for free
  28. 28. MeSH = Medical Subject Headings Choose MeSH from  Pull Down Menu
  29. 29. MeSH in PubMed Enter your search terms one at a time…
  30. 30. PubMed - MeSH cont… Choose the most  applicable  MeSH terms
  31. 31. PubMed - MeSH cont… Send to Search Box
  32. 32. PubMed ‐ MeSH cont… Click “Search PubMed”
  33. 33. PubMed – Advanced Search
  34. 34. PubMed – Advanced Search Enter search numbers  and combine using  Boolean operators.
  35. 35. PubMed - Limits
  36. 36. PubMed - Limits cont… For the most clinically applicable articles, limit to “Humans,” “English,” and “Type of Article”
  37. 37. PubMed – Limit to Type of Article Tier 1 Tier 2 • Clinical Trial • Meta‐Analysis • Clinical Trial, Phase I • Practice Guideline • Clinical Trial, Phase II • Clinical Trial, Phase III • Randomized Controlled  • Clinical Trial, Phase IV Trial • Comparative Study • Controlled Clinical Trial • Review • Research Support, N.I.H., Extramural • Research Support, N.I.H., Intramural • Guideline • Research Support, Non‐U.S. Gov't • Research Support, U.S. Gov't, Non‐P.H.S. • Multicenter Study • Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.
  38. 38. Accessing Full‐Text Articles Avoid clicking on publisher icons unless they explicitly state that they are free or  unless you are willing to pay $ 35.00 ‐65.00 dollars per article. 
  39. 39. Accessing Full‐Text Articles cont… It is likely that your institution’s library has facilitated link‐out in PubMed to link you  directly to articles from journals to which they subscribe to. It is also likely that your institution’s library has an Inter‐Library Loan service that will  “borrow” the article you want from another library for you for a small charge (certainly  less then $35.00!) or for free.   Contact your librarian and find out what services are available and how to use them. 
  40. 40. PubMed - Send To From “Send to” drop  down menu, choose  “E‐mail” You can email your results to yourself and your colleagues. 
  41. 41. PubMed - Search History Don’t forget to save your search history!
  42. 42. PubMed (MEDLINE) PubMed advantages PubMed disadvantages – Free to search – Still have to appraise articles  – No username/password once located – Searches same content as  Ovid MEDLINE – Links to free full‐text  sometimes available
  43. 43. EMBASE • Over 56,000 preferred terms (of which more than 27,000  are drugs and chemicals) – more than twice as large as  MeSH • More than 230,000 synonyms (with over 144,000 drugs  and chemical synonyms) • Requires a paid subscription to access • over 20 million indexed records from more than 7,000  active, peer‐reviewed journals  • over 2,000 biomedical titles not offered by Medline • Index conference abstracts
  44. 44. EMBASE - Emtree Click Emtree to access database of  standardized terms
  45. 45. EMBASE – Emtree, cont…
  46. 46. EMBASE – Emtree, cont…
  47. 47. EMBASE – Advanced Search
  48. 48. Good Database Searching Rules Following these rules will improve your results… 1. Think out your query, pull out individual concepts 2. Search individual concepts alone and combine them later from search  history 3. Apply Limits to narrow your search and make it more specific to your needs 4. Keep a copy of your search history.  5. If it takes you longer then 20 minutes – ask your librarian for help. 
  49. 49. Library Locations • 660 S. Euclid • St. Louis Children’s Hospital 314‐362‐7085 Lauren Yaeger, 314‐454‐2768 Susan Fowler, 314‐362‐8092 Pg: 314‐360‐1069 • BJ North, Rothschild  Medical Library Reka Kozak, 314‐454‐7208