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Universidade Estadual
Paulista – UNESP
A Ciência da Informação e o Ciclo de Vida dos
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13
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CVD - Apresentação

  • 1. Universidade Estadual Paulista – UNESP A Ciência da Informação e o Ciclo de Vida dos Dados: Fronteiras de Pesquisa Fernando de Assis Rodrigues fernando@elleth.org Programa de Pós-Graduação em Ciência da Informação Faculdade de Filosofia e Ciências Marília, SP
  • 2. Objetivos ● Apresentação do Texto ● Contextualização na CI ● Reflexões Fernando de Assis Rodrigues - 2013 2
  • 3. Texto ● ● Título: Interlinking scientific data on a global scale Autor: Christian Bizer – ● Research Group Data and Web Science, School of Business Informatics and Mathematics, University of Mannheim, Germany Data Science Journal, Volume 12, 23 July 2013 Fernando de Assis Rodrigues - 2013 3
  • 4. Apresentação do Texto ● Recurrent problem with scientific data: – Storing, processing, access are made by isolated scenarios and solutions. – Even when have scientific repositories, they are isolated solutions too, like: ● ● USA Europe Fernando de Assis Rodrigues - 2013 4
  • 5. Apresentação do Texto ● High-Level Expert Group on Scientific Data (HLEG, 2010) – Vision 2030 – “To overcome these limitations and to allow scientists to discover all data that is relevant for their task” Fernando de Assis Rodrigues - 2013 5
  • 6. Apresentação do Texto ● Linked Data – Use URIs as names for things; – Use HTTP URIs so that people can look up those names; – When someone looks up a URI, provide useful information using recommended standards (RDF, SPARQL); – Include links to other URIs so that they can discover more things. Fernando de Assis Rodrigues - 2013 6
  • 7. Apresentação do Texto ● Linked Data – Open Archives Initiative (OAI) ● Harvest Fernando de Assis Rodrigues - 2013 7
  • 8. Apresentação do Texto ● Topology of the Web of Linked Data – LOD community (W3C) ● Catalogue: datahub.io – LOD Cloud: http://datahub.io/group/lodcloud Fernando de Assis Rodrigues - 2013 8
  • 9. Apresentação do Texto ● Linked Data in Life Science – Bio2RDF ● 30 Datasets – – – – – – UniProt (Proteins) KEGG (Genes and Genomes) CAS (Chemical Abstracts) PubMed Gene Onthology Linked Open Drug Data ● http://www.w3.org/wiki/HCLSIG/LODD Fernando de Assis Rodrigues - 2013 9
  • 10. Apresentação do Texto ● Libraries and Scholarly Communication – Linked data principles on ● ● ● ● American Library of Congress German National Library OpenLibrary Europeana – “Linked Data principles together with the OAI-ORE, Dublin Core, SKOS, and FOAF” Fernando de Assis Rodrigues - 2013 10
  • 11. Apresentação do Texto ● 10 years vision: – Linked Data will develop into the standard technology of sharing scientific data on a global scale and for interconnecting data between different scientific data sources. – The emerging Web of Linked Data will contain scientific data as well as data from other domains and might become as omnipresent in our daily lives as the classic document Web is today. Fernando de Assis Rodrigues - 2013 11
  • 12. Apresentação do Texto ● 10 years vision: – Most open-license scientific data sets will be directly available as Linked Data on the Web. For extremely large data sets from astronomy or physics for which it is inefficient to generate an RDF representation, the Web of Linked Data will contain detailed metadata that will enable the discovery of these data sets. Fernando de Assis Rodrigues - 2013 12
  • 13. Apresentação do Texto ● 10 years vision: – Scientific work environments will have Linked Data import and export features and will provide for publishing scientific data directly to the Web of Linked Data. Disciplinary repositories of scientific data as well as data archives will provide Linked Data views on the archived data and will thus make their content available on the Web. Fernando de Assis Rodrigues - 2013 13
  • 14. Apresentação do Texto ● 10 years vision: – Scientists will navigate along RDF links between different scientific data sets as well as between publications and supporting experimental data. They will use Linked Data search engines to discover all data on the global scale that is relevant to their question at hand. Fernando de Assis Rodrigues - 2013 14
  • 15. Apresentação do Texto ● Challenges – Data Interoperability – Data Quality – Scientific Work Environments – Research on Pay-as-You-Go-Data Integration ● – Desenvolvimento de ontologias e outros artefatos de acordo com as necessidades Research on Data Quality Assessment in the Web Context Fernando de Assis Rodrigues - 2013 15
  • 17. Contexualização com CI ● Dados coletados: – A obtenção dos dados pelo pesquisador deverá ser a priori norteada por um guideline ● ● ● 24 meses para um mestrado 48 meses para um doutorado A composição dos dados científicos é originária de diversas áreas da ciência – CI → estudos de coleta, processamento, armazenamento, (…), acesso a dados... ● – Biólogo não deve ter preocupações com Endpoints, SPARQL... Ontologias: estudos interdisciplinares com a CI Fernando de Assis Rodrigues - 2013 17
  • 18. Contexualização com CI ● Alternativas: – Web Services – Redução do Cenário: ● ● ● Área Nacionalidade Recuperação – Ausência e/ou rudimentares sistemas de informação e recuperação ● SPARQL: lentidão – Cruzamento de 1Tb de dados científicos? (Big Data) Fernando de Assis Rodrigues - 2013 18
  • 19. Reflexões ● ● ● Enorme gap entre dados científicos e endpoints Grande número de Datasets inativos, fora do ar e não atualizados Linha Tecnologia e Informação (PPGCI) – Preocupações na coleta de dados com a estrutura de Linked Data – Entendimento de Endpoint Fernando de Assis Rodrigues - 2013 19