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Microbioma Humano Argentino (Piloto)

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Etapa Piloto del proyecto de Heritas

Published in: Science
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Microbioma Humano Argentino (Piloto)

  1. 1. 20 individuos sanos 10 H + 10 M Fosas nasales bucofaringeo (4 sitios) Piel (2 sitios) Gastrointestinal Vagina (M) 454 pyroseq •16s V1-V3 •16s V3-V5 Triplicados 1140 muestras SOP HMP Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local Figura 1
  2. 2. Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local NasalGarganta Intestino Garganta Nasal Intestino MHA MHA Existe correlación entre muestras MHA y HMP Figura 2 Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local Figura 2
  3. 3. 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Orden"Clostridiales" Familia"Veillonellaceae" Familia"Porphyromonadaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Rikenellaceae" Familia"Lachnospiraceae" Familia"Ruminococcaceae" Familia"Bacteroidaceae" **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local Bacteroidaceae Prevotellaceae Ruminococcaceae Enterotipo 1 (Diferencias en las medianas) Microbioma intestinal referencia Individuos sanos** ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● Bacteroidaceae_CIBIC Bacteroidaceae_HMP Lachnospiraceae_CIBIC Lachnospiraceae_HMP Order_Clostridiales_CIBIC Order_Clostridiales_HMP phyromonadaceae_CIBIC rphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Rikenellaceae_CIBIC 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Abundanciarelativa ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● Bacteroidaceae_CIBIC Bacteroidaceae_HMP Lachnospiraceae_CIBIC Lachnospiraceae_HMP Order_Clostridiales_CIBIC Order_Clostridiales_HMP phyromonadaceae_CIBIC rphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Rikenellaceae_CIBIC Rikenellaceae_HMP Ruminococcaceae_CIBIC Ruminococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Abundanciarelativa ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● Bacteroidaceae_CIBIC Bacteroidaceae_HMP Lachnospiraceae_CIBIC Lachnospiraceae_HMP rder_Clostridiales_CIBIC Order_Clostridiales_HMP phyromonadaceae_CIBIC rphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Rikenellaceae_CIBIC Rikenellaceae_HMP Ruminococcaceae_CIBIC Ruminococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Abundanciarelativa ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● Bacteroidaceae_CIBIC Bacteroidaceae_HMP Lachnospiraceae_CIBIC Lachnospiraceae_HMP rder_Clostridiales_CIBIC Order_Clostridiales_HMP phyromonadaceae_CIBIC rphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Rikenellaceae_CIBIC Rikenellaceae_HMP Ruminococcaceae_CIBIC Ruminococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Abundanciarelativa ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Abundanciarelativa 0.8 ARG HMP Figura 3 * * * *Test de Mann-Whitney
  4. 4. 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Familia"Fusobacteriaceae" Familia"Ac<nomycetaceae" Familia"Carnobacteriaceae" Familia"Gemellaceae" Familia"Paraprevotellaceae" Familia"Veillonellaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Streptococcaceae" **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local ActinomicetaceaeCarnobacteriaceaeFusobacteriaceae Gemellaceae PrevotellaceaeStreptococacceae ARG HMP * * ** Microbioma Garganta referencia Individuos sanos** ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● Actinomycetaceae_CIBIC Actinomycetaceae_HMP Carnobacteriaceae_CIBIC Carnobacteriaceae_HMP Fusobacteriaceae_CIBIC Fusobacteriaceae_HMP Gemellaceae_CIBIC Gemellaceae_HMP Paraprevotellaceae_CIBIC Paraprevotellaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Streptococcaceae_CIBIC Streptococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 1e−04 1e−03 1e−02 1e−01 1e+00 Abundanciarelativa(log10) Relativeabundancelogscale Paraprevotellaceae Veillonaceae Figura 4 *Test de Mann-Whitney
  5. 5. 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Familia"Sphingomonadaceae" Familia"Neisseriaceae" Familia"Gemellales" Familia"Tissierellaceae" Familia"Streptococcaceae" Familia"Propionibacteriaceae" Familia"Staphylococcaceae" Familia"Corynebacteriaceae" Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local * * * Corynebacteriaceae Gemellales Neisseriaceae Propionibacteriaceae Sphingomonadaceae StaphylococcaceaeStreptococacceae ARG HMP Microbioma Nasal referencia Individuos sanos** ● ● ● ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● Corynebacteriaceae_CIBIC Corynebacteriaceae_HMP Neisseriaceae_CIBIC Neisseriaceae_HMP Order_Gemellales_CIBIC Order_Gemellales_HMP Propionibacteriaceae_CIBIC Propionibacteriaceae_HMP Sphingomonadaceae_CIBIC Sphingomonadaceae_HMP Staphylococcaceae_CIBIC Staphylococcaceae_HMP Streptococcaceae_CIBIC Streptococcaceae_HMP Tissierellaceae_CIBIC Tissierellaceae_HMP 0.001 0.005 0.010 0.050 0.100 0.500 1.000 Abundanciarelativa(log10) Tissierellaceae * Relativeabundancelogscale Figura 5 **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina *Test de Mann-Whitney
  6. 6. 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Familia"Gemellaceae" Familia"Carnobacteriaceae" Familia"Ac>nomycetaceae" Familia"Leptotrichiaceae" Familia"Paraprevotellaceae" Familia"Veillonellaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Streptococcaceae" Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local ARG HMP Actinomicetaceae CarnobacteriaceaeGemellaceae Leptotrichinaceae ParaprevotellaceaePrevotellaceaeStreptococcaceae Veillonaceae * * * * Microbioma Amigdala referencia Individuos sanos** ● ● ●● ● ●● ● ● ● ●● ● ● ● ● ●●● ● ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● Actinomycetaceae_CIBIC Actinomycetaceae_HMP Carnobacteriaceae_CIBIC Carnobacteriaceae_HMP Gemellaceae_CIBIC Gemellaceae_HMP Leptotrichiaceae_CIBIC Leptotrichiaceae_HMP Paraprevotellaceae_CIBIC Paraprevotellaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Streptococcaceae_CIBIC Streptococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 1e−04 1e−03 1e−02 1e−01 1e+00 Abundanciarelativa(log10) Relativeabundancelogscale Figura 6 **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina * *Test de Mann-Whitney
  7. 7. 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Familia"Neisseriaceae" Familia"Fusobacteriaceae" Familia"Carnobacteriaceae" Familia"Paraprevotellaceae" Familia"Porphyromonadaceae" Familia"Veillonellaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Streptococcaceae" Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local ARG HMP Microbioma Saliva referencia Individuos sanos** ● ● ● ●●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ●● ● ● ● ● ● ● ●● ● ●● ● ● ● ● Carnobacteriaceae_CIBIC Carnobacteriaceae_HMP Fusobacteriaceae_CIBIC Fusobacteriaceae_HMP Neisseriaceae_CIBIC Neisseriaceae_HMP Paraprevotellaceae_CIBIC Paraprevotellaceae_HMP Porphyromonadaceae_CIBIC Porphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Streptococcaceae_CIBIC Streptococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 1e−04 1e−03 1e−02 1e−01 1e+00 Abundanciarelativa(log10) Carnobacteriaceae Fusobacteriaceae NeissereaceaeParaprevotellaceae PorphyromonadaceaePrevotellaceae Streptococcaceae Veillonelaceae * * * * Relativeabundancelogscale Figura 7 **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina *Test de Mann-Whitney
  8. 8. Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local ARG HMP ● ● ● ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● Carnobacteriaceae_CIBIC Carnobacteriaceae_HMP Fusobacteriaceae_CIBIC Fusobacteriaceae_HMP Gemellaceae_CIBIC Gemellaceae_HMP Leptotrichiaceae_CIBIC Leptotrichiaceae_HMP Porphyromonadaceae_CIBIC Porphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Streptococcaceae_CIBIC Streptococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 1e−04 1e−03 1e−02 1e−01 1e+00 Abundanciarelativa(log10) Relativeabundancelogscale CarnobacteriaceaeFusobacteriaceae Gemellaceae Leptotrichiaceae PorphyromonadaceaePrevotellaceae Streptococcaceae Veillonelaceae * * 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Familia"Leptotrichiaceae" Familia"Porphyromonadaceae" Familia"Fusobacteriaceae" Familia"Carnobacteriaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Veillonellaceae" Familia"Gemellaceae" Familia"Streptococcaceae" Microbioma Mucosa Bucal referencia Individuos sanos** Figura 8 * **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina *Test de Mann-Whitney
  9. 9. 20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local Comparación zona bucofaringea-nasal MHA 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" Abundancia)rela-va) Mucosa)bucal))))))))))Garganta)))))))))))))))))))Amígdalas )Saliva )Fosas)nasales)))))))))) Otros" Familia"Veillonellaceae" Familia"Tissierellaceae" Familia"Streptococcaceae" Familia"Staphylococcaceae" Familia"Sphingomonadaceae" Familia"Propionibacteriaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Porphyromonadaceae" Familia"Paraprevotellaceae" Orden"MLE1H12" Orden"Clostridiales" Familia"Neisseriaceae" Familia"Leptotrichiaceae" Familia"Gemellaceae" Familia"Fusobacteriaceae" Familia"Corynebacteriaceae" Familia"Carnobacteriaceae" Familia"AcNnomycetaceae" Strepto * * * *aparecen en nasal Ausentes en Buco * * * * * *Ausentes en nasal Figura 9

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