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Open Science, Open Access,
                    Science 2.0
                       Les nouvelles modalités de la communication
                                       scientifique



                                Julien Sicot <julien.sicot@univ-rennes2.fr>
                                                Stage URFIST
                                                1er juin 2010

mercredi 2 juin 2010                                                          1
La communication
                          scientifique
                          État des lieux




mercredi 2 juin 2010                       2
Les grandes évolutions de la
               communication scientifique
                                                  1970                                                     2002
                                                                                                                                           2009
                                            Bases de données                             Budapest Open
                                                                                                           Web sémantique
                                1948             e-mails                                 Access Initiative
  Échanges                                    Request For                      1989                          Linked data
                           Vannevar Bush                                     Le Web      Green and Gold
 épistolaires                                  Comments                                                    Data repositories
                             le Memex                                     Tim Bernes-Lee     Roads




                1665                       1963          1975                      1991
                                                                                                                  2004
 Invention de la revue scientifique    Eugène Garfield Facteur                      ArXiv
                                                                                                                 Google
    H. Oldenburg : Philosophical      Science Citation d’Impact                  Premier
 Transactions of the Royal Society                                              serveur de                       Scholar
                                           Index
             (London)                                                            preprints
Marin Mersenne. Journal des savants
               (Paris)

                                            D’après Gabriel Gallezot et al., “Chercheurs 2.0 ?,” Les Cahiers du numérique 5, no. 2 (Juin 15, 2009): 15-32,
                                                                               http://archivesic.ccsd.cnrs.fr/sic_00396278/en/

mercredi 2 juin 2010                                                                                                                                         3
Acteurs de la recherche

                       •   Chercheurs, équipes, laboratoires

                       •   Financeurs de la Recherche (acteurs institutionnels :
                           universités et bibliothèques, agences nationales, acteurs
                           privés)

                       •   Acteurs éditoriaux (éditeurs scientifiques : “Big Four” :
                           Elsevier, Springer Verlag, Blackwell-Wiley, Thomson
                           Scientific)

                       •   Diffuseurs (Agences d’abonnement, agrégateurs, portails,
                           moteurs de recherche (Google Scholar, Books /
                           Microsoft), 	

 serveurs de bases de données
                           bibliographiques)



mercredi 2 juin 2010                                                                   4
Le cycle de la Recherche




                Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing
           (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009).
mercredi 2 juin 2010                                                                                                                  5
Journée type du chercheur
                       50% administratif, 50% enseignement, 50% recherche !
                         •   Navigation internet (veille) / recherche documentaire / lecture
                             d’articles scientifiques

                         •   Vérification dates prochaines conférences / Organisation de
                             colloques, de communications

                         •   Réfléchir à d’éventuelles hypothèses de recherche / Trouver des
                             financements / répondre à des appels à projet

                         •   Relations avec ses pairs / collaborateurs / partenaires

                         •   Activités pédagogiques (cours, etc)

                         •   Participation aux referees d’articles

                         •   Aspects politiques, groupes de travail, vie universitaire, etc...




mercredi 2 juin 2010                                                                             6
Le cycle de l’Information scientifique
                                                                 D’après G. Gallezot

          Bases
    bibliographiques
       Banques de
        données
                                          Collecte
   Revues, ouvrages                                       Recherche de documents
        Colloques
                                                          Extraction d’information
  Archives ouvertes
        Sites web
 Listes de discussion                                                - Activité cognitive
      Bibliothèques                                                     du chercheur
                           Diffusion de         Traitement de        - Manipulation par
              …
                            document             l’information            des outils
                                                                        informatiques


               Production de                               Construction de
                documents                                   connaissance

                               Production d’information

mercredi 2 juin 2010                                                                        7
La cycle de la Revue




                   Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing
              (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009).
mercredi 2 juin 2010                                                                                                                     8
Fonctions remplies par la revue

                       •   Aujourd’hui = principal vecteur de l’IST

                       •   Diffusion des résultats de recherche

                       •   Garant de la qualité de la recherche “en
                           amont” (autorité, peer-reviewing)

                       •   Constitution d’une mémoire scientifique
                           (archives pérennes)

                       •   Évaluation des chercheurs “en aval” (OST,
                           AERES, citations, h-index, classements, etc)


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Nbre d’articles par discipline et par an




              Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing
         (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009).


mercredi 2 juin 2010                                                                                                                10
Une croissance exponentielle

                  •    + de 25 000 titres de revues

                  •    1,5 Millions d’articles publiés par an (2,5 Millions en 2004)

                  •    Sur la totalité des chercheurs, 90% sont en vie aujourd’hui

                  •    2000 éditeurs

                  •    3% de croissance / an

                  •    1 millions d’auteurs (chercheurs)

                  •    10 à 15 millions de lecteurs dans plus de 10000 institutions



mercredi 2 juin 2010                                                                   11
Croissance des revues à comité de
                              lecture depuis 1665




              Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing
         (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009).
mercredi 2 juin 2010                                                                                                                12
Corrélation entre augmentation nombres
                  de chercheurs, revues et articles




              Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing
         (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009).
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Vers le e-only ?




              Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing
         (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009).


mercredi 2 juin 2010                                                                                                                14
Le big deal

        •       39% (780) des éditeurs basés en Europe = 49% de la
                production d’articles = puissant lobby

        •       Big 3 = 80% du marché STM (Thomson Reuters $2.639,
                Reed Elsevier $1.764, Wolters Kluwer $1.158) Other
                $1.250 Total : $6.811

        •       Augmentation du prix des périodiques : +10% par an de
                1975 à 2000 (de 1975 à 1995 +300%)

        •       Depuis 2000, inflation annuelle de 6 à 8% en moy.



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Le coût des revues




mercredi 2 juin 2010                        16
Ghost writing

                  "... during key marketing periods as many as 40% of published
                 articles focusing on specific drugs are ghost managed"


                 Sismondo S. « Ghost Management: How Much of the Medical Literature Is Shaped Behind
                 the Scenes by the Pharmaceutical Industry? ». PLoS Med [En ligne]. 2007,Vol. 4, n°9, p. e286.
                 Disponible sur : < http://dx.doi.org/10.1371/journal.pmed.0040286 > (consulté le 30 Mai,
                 2010)




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Des résultats erronés

                 "Simulations show that for most study designs and settings, it is more
                 likely for a research claim to be false than true. Moreover, most study
                 designs and settings, it is more likely for a research claim to be false
                 than true. Moreover, for many current scientific fields, claimed research
                 findings may often be simply accurate measures of the prevailing bias."
                 Ioannidis JPA. « Why Most Published Research Findings Are False ». PLoS Med [En
                 ligne]. 2005,Vol. 2, n°8, p. e124. Disponible sur : < http://dx.doi.org/10.1371/
                 journal.pmed.0020124 > (consulté le 30 Mai, 2010)




mercredi 2 juin 2010                                                                                18
Fake journals




                   Source : http://www.the-scientist.com/blog/display/55671/ et http://www.the-scientist.com/blog/display/55679/

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“Duplicate articles”




        Mounir Errami et Harold Garner, “A tale of two citations,” Nature 451, no. 7177 (Janvier 24, 2008): 397-399, http://dx.doi.org/
                                                                10.1038/451397a.  
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Vers de nouvelles pratiques ?




              Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing
         (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009).


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Et l’évaluation scientifique ?


                       2 types d’évaluation :
                       •   En amont, qualitative, par les pairs = peer
                           reviewing

                       •   En aval, quantitative, par les citations des pairs


                                                         D’après P. Mounier et G. Gallezot


mercredi 2 juin 2010                                                                         22
Évaluer l’activité recherche ?

           • Pour qui ?            Le pilotage (DGES, universités…) : orientation de la prod.
                   Scientifique, répartition budgétaire, recrutement…

           • Comment ? Quels référentiels ? Quels
                   indicateurs ?
           • Qui, quoi ?
                   programmes…
                                    Les chercheurs, les établissements, les revues, les



           • Par qui ?          OST, AERES, CNU, Universités…




mercredi 2 juin 2010                                                                            23
Évaluer l’activité
                                      recherche?
             • Un modèle prégnant et valeur de cette publication par la
               Publication (article de revue)
                       mesure des citations « reçues » par d’autres publications
                       (bibliométrie)




             • Un modèle dominant (STM) et quasi monopole
                       de l’analyse et du référentiel (ISI - Institute of
                       Scientific Information, Groupe U.S. Thomson
                       Reuters)

                       	

   	

 	

 	

 	

 	

   d’après G. Gallezot
mercredi 2 juin 2010                                                               24
Le facteur d’impact

           •       Concerne les revues scientifiques

           •       Fréquence annuelle moyenne de citation des articles d’un journal
                   donné, estimé sur les 2 années précédentes

           •       Calculé par l’ISI à partir de la base JCR (Journal Citations Report)
                   - Statistiques de citation et facteur d’impact des principales revues en
                   science
                   - Corpus de + de 7600 revues, les plus citées au monde (nombreuses
                   revues françaises absentes)

           •       Limites :
                   - Contrainte de durée (2 ans)
                   - % de revues sur la base de données ISI
                   - Indice de visibilité des revues et non des articles




mercredi 2 juin 2010                                                                          25
Le facteur d’Impact

                       Créé en 1960 par Eugene Garfield (ISI)

                          citations /   articles
                            2008      2006 et 2007

                                          IF=5
                            Les articles publiés en 2006/07
                       ont été cités en moyenne 5 fois en 2008.

                                                          D’après Björn Brembs


mercredi 2 juin 2010                                                             26
L’index-H


        • Créé par J. Hirsh
               (université de Californie à
               San Diego)

        • Mesure des citations au
               niveau du chercheur

        • Le nombre h d'articles de
               l'auteur qui ont été cités
               au moins h fois chacun

                                             Source : http://fr.wikipedia.org/wiki/Indice_h

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L’évaluation en question

               •       Problème des critères quantitatifs d’évaluation de la
                       recherche : Nombre de publications dans les revues internationales « peer-reviewed »,
                       facteur d’impact


               •       Déséquilibre structurel en France, GB et Allemagne :
                        ➡ Problème du différentiel de publication entre chercheurs français et anglais, du classement de
                          Shanghai

                        ➡     Problème de visibilité de la recherche


               •       Quelle explication ? Poids écrasant des « Big 4 » de
                       l’édition scientifique

               •       Aujourd’hui : la performance bibliométrique l’emporte sur
                       la découverte scientifique !


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Les biais du facteur
                                   d’impact




                       Source : PhD Comics : http://www.phdcomics.com/comics.php?n=1108
                A lire : Gingras Y. « La fièvre de l’évaluation de la recherche – Du mauvais usage de faux
                indicateurs ». Bulletin de méthodologie sociologique [En ligne]. 1 Octobre 2008, n°100,
                p. 42-44. Disponible sur : < http://bms.revues.org/index3313.html > (consulté le 30
                Mai, 2010)
mercredi 2 juin 2010                                                                                        29
“Le durcissement actuel de l'évaluation de
                          l’activité scientifique n’est-il pas un frein majeur à
                          l’ouverture des systèmes de lecture et d’écriture
                          des travaux scientifiques ?”



                Broudoux E, Chartron G. « La communication scientifique face au Web2.0 : Premiers constats
                   et analyse ». In : H2PTM [En ligne]. [s.l.] : Hermès Science - Lavoisier, 2009. p. 323-336.
                              Disponible sur : < http://archivesic.ccsd.cnrs.fr/sic_00424826/en/ >




mercredi 2 juin 2010                                                                                             30
Quelques anomalies
                       •   Barrière technologique : comment jongler entre les
                           multiples outils/ressources ?

                       •   Barrière économique : Coût de l’IST, les
                           bibliothèque ne sont pas abonnées à toutes les
                           bases et revues

                       •   Barrière juridique : Editeur détenteur du copyright
                           => ne facilite pas la créativité /réutilisation /
                           l’exploitation des contenus. Obstacle au partage et à
                           la collaboration


          Parrini M. barriers, 2007. Disponible sur : < http://www.flickr.com/photos/remuz78/463810013/ >
mercredi 2 juin 2010                                                                                       31
Crise(s) ?
                       Vers un épuisement des modèles classiques



                       • Crise de l’édition scientifique                   (copyright, scandales,
                         concentration, augmentation des coût, nouveaux modèles de publications,
                         l’article n’est pas le seul support de l’IST)


                       • Crise du chercheur               (individualisme & impersonnalité de la
                         recherche ? Concurrence, compétition, “publish or perish”, mutations
                         profondes des pratiques, etc.)


                       • Crise de l’évaluation                  (diktat “publish or perish” (encore),
                         Shanghai, biais du facteur d’impact, facéties de la bibliométrie, etc.)




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Vers une e-Science ?

                   Nouvelles formes de publication : Open Access,
                   Archives Ouvertes et Revues en libre accès
                   Nouvelles pratiques de la recherche : Science 2.0,
                   Open Science, Open data
                   Nouvelles formes d’évaluation : Open peer
                   reviewing, facteurs d’usages, etc



mercredi 2 juin 2010                                                    33
L’Open Access
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Le Libre accès : repères
                                 historiques
             •         1991 : naissance d’ArXiv = 1er serveur de preprints
             •         1999 : naissance du mouvement Open Archives Initiative
                       (OAI)
             •         2002 : Budapest Open Access Initiative (BOAI)
             •         2003 : Déclaration de Berlin
             •         2006 : en France, signature d’un accord inter-établissements
             •         2009 : Berlin 7 > 9 universités françaises signent la
                       déclaration de Berlin pour le libre accès à la littérature
                       scientifique


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BOAI
                              Fondements de l’Open Access

               •       Une définition : « Le libre accès à la littérature scientifique est sa mise
                       à disposition gratuite sur l’Internet public, permettant à tout un chacun de lire,
                       télécharger, copier, transmettre, imprimer (…), ou s’en servir à toute autre fin
                       légale, sans barrière financière, légale ou technique autre que celles
                       indissociables de l’accès et l’utilisation d’Internet. » (d’après Libre Accès Inist).

               •       Deux stratégies (2 voies)
                       •   La voie verte (Green road – BOAI 1) : l’auto-archivage des
                           publications par les chercheurs

                       •   La voie dorée (Gold road – BOAI 2) : la publication d’articles dans des
                           revues en libre accès



mercredi 2 juin 2010                                                                                           36
• H. Varmus <http://seedmagazine.com/
                       content/article/science_2.0_pioneers/>

                   “True “open access” is different from “public access.” It
                   means that the author holds the copyrights, that the journal
                   places the work immediately and freely in the public domain
                   under a Creative Common license or something equivalent
                   to it, and that the work is in public libraries and available for
                   all kinds of reasonable use, as long as attribution is
                   maintained.”




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La déclaration de Berlin
                       La déclaration de Berlin date de 2003 et a été signée à ce jour
                       par plus de 300 institutions scientifiques majeures dans le monde. 


                       Étape clé dans le développement libre accès = implication des
                       principaux organismes de recherche Européens signataires qui
                       s’engagent à :

                       « promouvoir un Internet qui soit un instrument fonctionnel au service
                       d’une base de connaissance globale et de la pensée humaine »,

                       et à définir « des mesures (…) à envisager par les responsables
                       politiques en charge de la science, les institutions de recherche, les
                       agences de financement, les bibliothèques, les archives et les musées. »



mercredi 2 juin 2010                                                                             38
Les archives ouvertes
                         La communication scientifique directe

              •        La parabole d’Harnad

              •        La solution : promouvoir chez les chercheurs le processus d’auto-
                       archivage des pré-publications et post-publications sur des
                       serveurs dédiés à cet effet.

              •        « Archive, repository » synonymes d’« entrepôt / réservoir de
                       données » où sont déposées des données issues de la recherche
                       scientifique et de l’enseignement et dont l’accès se veut ouvert,
                       c’est à dire sans barrières (techniques, économiques,
                       juridiques) …»

              •        Architecture technique distribuée et interopérable (OAI-PMH)



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Accès restreint -- Impact Restreint
                       LE CYCLE D’IMPACT
                            DÉMARRE :           Le chercheur écrit
                        La recherche se fait    le « prétirage » de
                                                    son article




                                             Le prétirage est
                                           soumis à une revue

                                         Le prétirage est évalué
 12-18 Mois




                                        par un comité de lecture
                                               Le prétirage corrigé par l’auteur
                                                       devient un «post-tirage»
                         Le post-tirage est accepté,
                        validé et publié par une revue




                                     Les autres chercheurs
                                     ne peuvent accéder au
                                     post-tirage que si leur
                                     université est abonnée            NOUVEAUX CYCLES
                                       à la revue où il est         D’IMPACT : les nouvelles
              D’après S. HARNAD               publié                recherches s’appuient sur
                                                                   les recherches précédentes
mercredi 2 juin 2010                                                                                        40
Accès maximal - Impact maximal
                        LE CYCLE D’IMPACT Le chercheur écrit
                            DÉMARRE :        le « prétirage » de
                        La recherche se fait     son article           Le pré-tirage est
                                                                    auto-archivé sur le
                                                                            site Web de
                                                                    l’établissement où
                                                                 travaille le chercheur
                                            Le prétirage est soumis
                                                 à une revue
                                          Le prétirage est évalué            Le post-tirage est publié
 12-18 Mois




                                          par un comité de lecture       dans une revue à accès libre
                                               Le prétirage corrigé                   ou auto-archivé
                                           par l’auteur: devient un                 sur le site Web de
                                                     « post-tirage »    l’établissement du chercheur
                              Le post-tirage est accepté,
                              validé et publié par la revue
                                                                        NOUVEAUX CYCLES D’IMPACT
                                                                              L’impact scientifique des
                                                                            articles de recherche libres
                                                                         d’accès s’accroît et s’accélère
                                                                             grâce à l’augmentation de
                                     Les autres chercheurs ne                                    l’accès
                                     peuvent accéder au post-
                                    tirage que si leur université
                                            est abonnée NOUVEAUX CYCLES D’IMPACT :
                                                             Les nouvelles recherches s’appuient
              D’après S. HARNAD
                                                                sur les recherches précédentes
mercredi 2 juin 2010                                                                                       41
AO disciplinaire
                          ArXiv.org
mercredi 2 juin 2010                      42
AO à dimension nationale
                                 HAL
mercredi 2 juin 2010                              43
AO spécialisée
                            TEL
mercredi 2 juin 2010                    44
Archive institutionnelle
                              ORBI (Ulg)
mercredi 2 juin 2010                              45
Les Archives ouvertes :
                       bénéfice pour le chercheur
          •       Disposer d’un moyen de communication scientifique directe et rapide : une
                  mise en ligne simple et rapide des résultats de la recherche

          •       Accéder à un corpus scientifique ouvert et accessible

          •       Améliorer son audience et sa visibilité face à ses pairs et ses sources de
                  financement (L’impact d’une publication est accru de manière substantielle si celle-ci est accessible
                  librement sur le Web ? S. Lawrence)


          •       Disposer d´études d´impact sur ces publications récentes

          •       Augmenter le cycle de vie d’un article au-delà de la publication dans une
                  revue : e-publication

          •       Garantir l’archivage à long terme et la citation électronique : URLs pérennes



mercredi 2 juin 2010                                                                                                     46
Les éditeurs et AO

                       •   Liste ROMEO/SHERPA (UK) sur la politique éditoriale (copyright) de 686
                           éditeurs

                       •   Elle recense les possibilités de mise sur le web (donc d’auto-archiver) des
                           articles scientifiques par éditeurs.
                           •   Les revues blanches : celles dont les éditeurs n'ont pas de politique formelle autorisant
                               l'auto-archivage

                           •   Les revues jaunes : autorisent l'auto-archivage des pré-publications (avant les révisions
                               par le comité de lecture)

                           •   Les revues bleues : autorisent l'auto-archivage des post-publications (version finale
                               après révision)

                           •   Les revues vertes : autorisent l'auto-archivage des pré- ET des postpublications

                       •   Liste JULIET/SHERPA (UK) politiques des “financeurs »




mercredi 2 juin 2010                                                                                                       47
SHERPA RoMEO
mercredi 2 juin 2010                  48
RoMEO (statistiques)
mercredi 2 juin 2010                          49
Rechercher dans les AO
              •        Identifier les archives ouvertes (+ de 1400 dans le monde)
                       •   L’OpenDOAR : The Directory of Open Access Repositories http://www.opendoar.org/index.html

                       •   Registry of Open Access Repositories (ROAR) http://roar.eprints.org/

              •        Rechercher des articles scientifiques à l’aide des moissonneurs
                       (harvesters) = « moteurs pour les archives ouvertes »
                       •   OAIster http://www.oaister.org (versé dans le WorldCat depuis 2009)

                       •   Scientific Commons http://www.scientificcommons.org

                       •   Driver (Digital Repository Infrastructure Vision for European Research) http://
                           search.driver.research-infrastructures.eu/

                       •   Base (Bielefeld Academic Search Engine) http://www.base-search.net

              •        Évaluer une Archive Ouverte
                       •   Ranking repositories http://repositories.webometrics.info/




mercredi 2 juin 2010                                                                                                   50
OpenDOAR
                       http://www.opendoar.org/find.php
mercredi 2 juin 2010                                     51
ROAR
                       http://roar.eprints.org/
mercredi 2 juin 2010                              52
Repository Maps
                         http://maps.repository66.org/
mercredi 2 juin 2010                                     53
BASE
                       http://www.base-search.net
mercredi 2 juin 2010                                54
ScientificCommons
                         http://www.scientificcommons.org/
mercredi 2 juin 2010                                        55
Un mouvement irréversible, mais
                       progressif…
        •       Des soutiens institutionnels importants : Sénat américain, Union
                Européenne, gouvernements, grands organismes scientifiques : ANR,
                CNRS, INSERM, INRIA (Fr.), NIH (E.U.), RCUK (G.B.)…
         •    Des initiatives nationales fortes (France : HAL, G.B.: The Depot )
         •    Vers une obligation de dépôt ? ROARMAP (Registry of Open Access
              Repository Material Archiving Policies) et SHERPA/Juliet (Research
              funders' open access policies) 179 mandats institutionnels + financeurs de
              la recherche
                  •    Aux USA : PubMed (pour les recherches financées par le NIH) ; projet de loi en juin
                       2009 pour toutes les disciplines ;
                  •    Au niveau européen : 7ème PCRD > Open Access Pilot / OpenAIRE (Open Access
                       Infrastructure for Research in Europe)

         •    Prise en compte dans l’évaluation des chercheurs (ex : université de Liège,
              etc)

mercredi 2 juin 2010                                                                                        56
ROARMAP
                       http://www.eprints.org/openaccess/policysignup/
mercredi 2 juin 2010                                                     57
SHERPA / Juliet
                         http://www.sherpa.ac.uk/juliet/
mercredi 2 juin 2010                                       58
Ranking Web of World
                          Repositories
                       http://repositories.webometrics.info
mercredi 2 juin 2010                                          59
Les revues en libre accès
                    Une revue en libre accès (open access journal) est une revue
                 scientifique, « nouvelle ou existante, qui répond aux exigences de
                qualité des articles par la présence d’un comité de lecture, mais qui a
                 un mode de financement permettant une diffusion aussi large que
                 possible, sans restriction d’accès et d’utilisation » (d’après l’INIST)




                       •   PloS : http://www.plos.org

                       •   Revues.org : http://www.revues.org/

                       •   BiomedCentral : http://www.biomedcentral.com/e/

                       •   Scielo : http://www.scielo.br/



mercredi 2 juin 2010                                                                       60
Les revues en libre accès
               •       Deuxième composante de l’Open Access (voie
                       dorée)

               •       Nouveau modèle économique :
                       •   frais de publication supportés par les auteurs ou leurs institutions

                       •   généralement subventionnées

               •       Revues en libre accès = revues scientifiques
                       •   Articles soumis aux règles d’évaluation habituelles du « peer-reviewing »

                       •   Sont évaluées avec les mêmes indicateurs bibliométriques (IF)

                       •   + de 500 revues en OA comptabilisées dans le JCR


mercredi 2 juin 2010                                                                                   61
Modèle traditionnel




                       Source : Björn Brembs, What's wrong with scholarly publishing today?, http://www.slideshare.net/brembs/whats-wrong-with-scholarly-
                                                                               publishing-today-ii



mercredi 2 juin 2010                                                                                                                                        62
Modèle auteur/payeur




                       Source : Björn Brembs, What's wrong with scholarly publishing today?, http://www.slideshare.net/brembs/whats-wrong-with-scholarly-
                                                                               publishing-today-ii



mercredi 2 juin 2010                                                                                                                                        63
DOAJ : Directory of Open Access Journals     Open J-Gate
                            4576 revues                      6255 revues

                               Trouver des revues
                                  en libre accès
mercredi 2 juin 2010                                                         64
Nouvelles pratiques de la
                       recherche : Science 2.0 et
                             Open Science




mercredi 2 juin 2010                                65
Le web 2.0
                                                          (O'Reilly, 2005)


                       •   longue traine
                       •   les données sont toutes puissantes
                       •   centré/orienté utilisateur
                       •   effets de réseau / réseaux sociaux
                       •   Quelques droits réservés / favoriser
                           l’exploitation, la réutilisation des
                           contenus
                       •   bêta perpétuelle
                       •   coopération / collaboration
                       •   les applications sont accessibles sur
                           tous les supports


                                      http://oreilly.com/web2/archive/what-is-web-20.html?page=5

mercredi 2 juin 2010                                                                               66
Michel Roland “alors que l’internet est d’origine
                       (en grande partie) universitaire, ses plus récents
                       développements (le web 2.0) sont globalement
                       appréhendés comme venant l’impacter de
                       l’extérieur”



                       source : http://www.slideshare.net/bibliothecaire/100330-pmlpa-science-20-new




mercredi 2 juin 2010                                                                                   67
Génération Y : Nouvelles
                       pratiques informationnelles




                Source : Education for Change Ltd., Researchers of Tomorrow : A three year (BL/JISC) study tracking the research
                                behaviour of 'Generation Y' doctoral students (British Library & JISC, Octobre 2009).

mercredi 2 juin 2010                                                                                                               68
Google Scholar : nouvelle
                               donne ?
        ✓ Explosion,informationnelset hybridation
          des outils
                     diversification


        ✓ Risques d’infobésité ?
        ✓ Autorité VS Popularité
        ✓ Économie de l’attention / Âge de l’accès
        ✓ Besoins : ouverture, accessibilité, accès
          unifié aux documents de la recherche,
                immédiateté, “gratuité”, texte intégral !

        ✓ Compétences informationnelles de + en
          + importantes (évaluation de
                l’information)

mercredi 2 juin 2010                                        69
Multiplication et diversification
                         des moteurs de recherche
                                 scientifique
      Un corpus “dit” scientifique :                                Des fonctionnalités avancées
                                                                   •   Recherche en texte intégral, simplicité

              •    sites et portails académiques (.edu, etc.)      •   Possibilité de créer des alertes (cf nouvelle
                                                                       fonctionnalité dans GS)
              •    bases de revues d'éditeurs (SpringerLink,
                   ScienceDirect, Wiley-Blackwell, IEEE, etc.)     •   Exportation et exploitation de références
                                                                       bibliographiques (dans différents formats : bibTeX, RIS,
              •    bases de sommaires (Ingenta Connect)                Refworks, etc.)
              •    bases de données bibliographiques (INIST)
                                                                   •   Analyse Bibliométrique (taux de citations, etc.)
              •    catalogues de bibliothèques (WorldCat,
                                                                   •   Support du résolveur de liens d’une bibliothèque
                   SUDOC)                                              (partenariat avec les bibliothèques pour faciliter le lien
                                                                       vers le texte intégral des documents - technologie
              •    bases de brevets
                                                                       OpenURL)
              •    ressources en Open Access (archives ouvertes,
                                                                   •   Fonctionnalités avancées de recherche (par auteur, par
                   revues)
                                                                       titre de revue, etc)




mercredi 2 juin 2010                                                                                                                70
Les moteurs de recherche
                               scientifique




                       Wikipedia : List of academic databases and search engines
mercredi 2 juin 2010                                                               71
Multiplication des outils
                       numériques pour le chercheur




                            Digital Research Tools
                             http://digitalresearchtools.pbworks.com/

mercredi 2 juin 2010                                                    72
Nouvelle façon de veiller

         La recherche d’information :
         énergie, temps, analyse, stratégie

         Nécessité de rentabiliser sa
         recherche (veille) : suivi des
         nouveautés sur une sujet, mise à
         jour des informations

         Économie par la création
         d’alertes, sauvegardes de
         recherche = déléguer la
         recherche !                          Mike Lee, Newspaper RSS Feed Icon, Juin 6, 2009
                                              Flickr, http://www.flickr.com/photos/curiouslee/3602683294/.




mercredi 2 juin 2010                                                                                        73
http://cravingideas.blogs.com/backinskinnyjeans/2006/09/how_to_explain_.html




                       Mener une veille avec les
                              flux RSS
mercredi 2 juin 2010                                                                                      74
Les flux RSS ?
                       •   RSS = Rich Site Summary (sommaire d’un site enrichi)

                       •   RSS = Really Simple Syndication (souscription vraiment
                           simple)

                       •   Un flux RSS = un fichier (format XML) ou fil de contenu
                           qui va stocker et diffuser les dernières mises à jour d’un
                           site web (ou blogs (hypotheses.org), sites d’actualités (Le
                           Monde), sites institutionnels, Archives ouvertes (ArXiv,
                           HAL), revues scientifiques (Cairn, TicToCs),
                           socialbookmarking (Delicious), etc)

                       •   Autre avantage : RSS déconnecte le texte de sa mise en
                           forme. A partir d’un flux RSS, il est possible de lire le
                           contenu d’un site A sur un site B !

mercredi 2 juin 2010                                                                     75
Intérêts des flux RSS
                  •    Recevoir automatiquement les mises à jour d’un site sans avoir à
                       retourner sur ce dernier
                  •    Suivre l’activité de plusieurs sites à partir d’un seul point d’entrée
                       (“guichet unique” = rôle de l’agrégateur)
                  •    S’abonner aux flux RSS des sommaires de revues
                  •    Générer un flux à partir de requêtes dans des bases de données en
                       IST
                  •    Possibilité de catégoriser / d’organiser ses abonnements (flux rss) +
                       filtres + tags
                  •    Alimenter une véritable base de connaissances
                  •    Moins intrusif que l’e-mail (pubs, spams)



mercredi 2 juin 2010                                                                            76
Entrez dans le flux
                 Repérer les sites & services
                 proposant un flux RSS (ou fil RSS,
                 Syndication RSS, RSS feeds, etc)

                 Icône identifiable (sur la page ou au
                 niveau de l’URL)

                 Choisir un lecteur de flux RSS (ou
                 Agrégateur, ou Reader), en ligne
                 (Google Reader, netvibes) ou un
                 logiciel client (Firefox, Thunderbird,
                 feeddemon)


mercredi 2 juin 2010                                      77
RSS & OPML ?

                       •   Importer et Exporter sa
                           liste de Flux
                           (sauvegarde)

                       •   Echanger et partager sa
                           liste d’abonnements




mercredi 2 juin 2010                                 78
Journal TOCs
                       http://www.journaltocs.hw.ac.uk/

mercredi 2 juin 2010                                      79
TiCToCs
                   Recevoir les tables des matières de revues par fils RSS
                                  http://www.tictocs.ac.uk/

mercredi 2 juin 2010                                                        80
mercredi 2 juin 2010   81
Folksonomie
       Folksonomie : combinaison des termes
       “folks” (usagers) et “taxinomie” (règle de
       classification)

       Systèmes s’appuyant sur réseaux sociaux et
       permettant aux utilisateurs de donner des
       indications de contenu aux ressources qu’ils
       rencontrent, sous la forme de tags (mot-
       clés)

       Esprit collaboratif, notion de partage,
       ouverture, simplicité d’utilisation...

       Ex : plateformes de partage de signets et de
                                                      Cambodia4kids.org Beth Kanter, Tags: Keywords to describe digital objects, Octobre 3, 2006,
       références bibliographiques                    Flickr, http://www.flickr.com/photos/cambodia4kidsorg/260004685/.




mercredi 2 juin 2010                                                                                                                                82
Delicious
                         http://delicious.com

mercredi 2 juin 2010                            83
Diigo
                       http://diigo.com

mercredi 2 juin 2010                      84
Services de partage de signets

                  •    Avantages
                        •   Permet un classement des ressources mais aussi une navigation et un accès simple aux
                            informations via les tags
                        •   Fonctions innovantes de tri ou de classement et de visualisation : nuages de tags
                        •   Les tags sont plus précis et répondent mieux au vocabulaire et aux attentes des utilisateurs
                        •   Permet de parcourir des sources faisant partie du web invisible


                  •    Inconvénients
                        •   Mots-clés détournés ou “Folks Bombing”
                        •   Problèmes de validité, de cohérence (doublons) et de pérennisation

                        A utiliser pour
                        •   Un accès rapide à l’information
                        •   Pour mettre en place une veille en utilisant le « tag tracking » (repérage de termes (tags)
                            précis) qui consiste à suivre les ressources annotées avec un mot-clé (tag) précis




mercredi 2 juin 2010                                                                                                       85
Science 2.0 / Open Science
                                            Objectifs


                •      Changer les pratiques de la recherche afin de rendre ses
                       résultats plus accessibles, d'une manière plus efficace et plus
                       rapide

                •      Comprend l’Open Access, l’Open Data et l’Open Process
                       (accès aux codes sources, par exemple, et aux protocoles
                       d’expérimentation)




mercredi 2 juin 2010                                                                    86
Science 2.0 / Open Science
                                                Concepts

                •      Échange / Conversation / Partage / Collaboration / favoriser la
                       découverte (Sérendipité)

                •      Transparence / Ouverture / Accessibilité / Réciprocité / Intéropérabilité

                •      Enrichissement et valorisation des données (data mashups & Open
                       Data) / Web (2.0 et sémantique) / Infrastructure Numérique de
                       recherche (TGE Adonis)

                •      L’article n’est pas le seul vecteur de la recherche ! L’IST est multiforme !

                •      Des services et outils orientés chercheur, pas seulement contenu




mercredi 2 juin 2010                                                                                  87
D’après Cameron Neylon, Open Science@PSB Introduction, <http://
                       www.slideshare.net/CameronNeylon/open-sciencepsb-introduction-presentation>



mercredi 2 juin 2010                                                                                 88
D’après Cameron Neylon, Open Science@PSB Introduction, <http://
                       www.slideshare.net/CameronNeylon/open-sciencepsb-introduction-presentation>
mercredi 2 juin 2010                                                                                 89
Web 2.0
                           D’après Cameron Neylon, Open Science@PSB Introduction, <http://
                       www.slideshare.net/CameronNeylon/open-sciencepsb-introduction-presentation>
mercredi 2 juin 2010                                                                                 90
Quelles formes ?

               •       Carnets de recherche en ligne (Blogs, Wikis, Open
                       Notebook Science)

               •       Open Labs, Open Data (datasets, protocoles de
                       recherche, expérimentations)

               •       Espaces informationnels et conversationnels : réseaux
                       sociaux, microblogging, life streaming)

               •       Social bookmarking et plateformes de partage



mercredi 2 juin 2010                                                           91
La blogosphère scientifque
                                    Carnets de recherche 2.0
                       Typologie de la blogosphère scientifique
                        •    Blogs de chercheur, de doctorant

                        •    Blogs thématiques ou collectifs

                        •    Blogs de séminaires

                        •    Blogs “compagnons” d’une publication, d’une thèses

                        •    Plateformes d’hébergement / Agrégateurs de blogs (commerciales,
                             institutionnelles, communautaires)

                       2008 : entre 3 000 et 10 000 blogs scientifiques dans le monde, dont
                       2 000 aux USA
                       “According to Adam Bly from Science Blogs (Seed Media Group), around
                       33% of scientists are now using blogs for writing, reading or as a lab
                       notebook.” source : http://www.info.scopus.com/researchtrends/archive/RT17/beh_dat_17.html

mercredi 2 juin 2010                                                                                                92
Diversités de blogs = diversité
                         de contenus, de pratiques
                       •   Un carnet de recherche, projet de recherche, "atelier" de chercheur
                       •   Un cahier de laboratoire
                       •   L'actualité de la recherche, réflexions et débats
                       •   Les informations d'une communauté scientifique (calendrier des
                           manifestations, annonces de parutions...)
                       •   Des conférences, colloques, séminaires virtuels
                       •   La communication institutionnelle
                       •   Des revues de littérature, des comptes-rendus
                       •   Une lettre scientifique, ou un site accompagnant une publication
                       •   Des cours, carnets pédagogiques
                       •   Une veille sur l'information scientifique et technique




mercredi 2 juin 2010                                                                             93
Blog d’André Gunthert
                        http://www.arhv.lhivic.org/

mercredi 2 juin 2010                                  94
Blog d’Antoine Blanchard
                           http://www.enroweb.com/blogsciences/

mercredi 2 juin 2010                                              95
ResearchBlogging
                           http://researchblogging.org/

mercredi 2 juin 2010                                      96
Nature Blogs
                        http://blogs.nature.com/
mercredi 2 juin 2010                               97
PostGenomic
                        http://postgenomic.com/index.php

mercredi 2 juin 2010                                       98
Stanford Blogs
                          http://blog.stanford.edu/
mercredi 2 juin 2010                                  99
Hypothèses
                        http://hypotheses.org/
mercredi 2 juin 2010                             100
C@fé des sciences
                          http://www.cafe-sciences.org/
mercredi 2 juin 2010                                      101
Pourquoi un blog ?
               •       Esquisser ses réflexions

               •       “La recherche en train de se faire” - A . Blanchard

               •       “Deadline is dead”, nouveaux rythmes d’écriture - A. Gunthert

               •       Le séminaire permanent : modèle conversationnel. “Un forum de pairs à
                       ciel ouvert” A. Blanchard

               •       S’enrichir des réflexions et des commentaires de la communauté
                       (lecteurs et blogosphère scientifique = intelligence collective)

               •       Transparence : démocratisation des savoirs, insérer la science dans la
                       société civile, vulgarisation scientifique

               Adapté de A. Serres : LA blogosphère en sciences humaines et sociales, présentation de la plateforme Hypothèses
               http://www.slideshare.net/revuesorg/le-blogosphre-en-sciences-humaines-et-sociales-prsentation-de-la-plateforme-
                                                                  hypothses



mercredi 2 juin 2010                                                                                                              102
Blanchard A. « Ce que le blog apporte à la recherche ». In : Dacos M (éd.). Read/
                       Write Book [En ligne]. [s.l.] : Cléo/revues.org, 2010. p. 157-166. Disponible sur :
                               < http://cleo.revues.org/172 > (consulté le 30 Mai, 2010) ISBN :
                                                       978-2-9536419-0-5

mercredi 2 juin 2010                                                                                         103
Archives Ouvertes et Blogs
                             Les trackbacks




                       Antoine Blanchard (Enro), Ce que le blog apporte à la Recherche, 12/08, http://www.enroweb.com/
                                blogsciences/index.php?2008/12/04/359-ce-que-le-blog-apporte-a-la-recherche

mercredi 2 juin 2010                                                                                                     104
Academic Blog Portal            Google Blogs Search
                        http://www.academicblogs.net   http://blogsearch.google.com/


                                   Trouver des blogs
                                     scientifiques
mercredi 2 juin 2010                                                                   105
Open Labs / Open Notebooks
                          Science / Open Data
                       •   L’article ne donne pas suffisamment accès aux résultats de
                           la recherche / 95% des résultats de la recherche ne seraient
                           jamais publiés

                       •   Rendre public et accessible les résultats d’expérimentations

                       •   Mettre à disposition des autres chercheurs, des protocoles
                           de recherche, des données brutes (grilles de calcul (grids),
                           datasets, etc.)

                       •   Permettre le transfert de compétences, la vérification et la
                           reproduction des expériences



mercredi 2 juin 2010                                                                      106
OpenWetWare
                        http://openwetware.org

mercredi 2 juin 2010                             107
UsefulChem
                       http://usefulchem.wikispaces.com/

mercredi 2 juin 2010                                       108
MyExperiment
                        http://www.myexperiment.org/

mercredi 2 juin 2010                                   109
Many Eyes
                       http://manyeyes.alphaworks.ibm.com/manyeyes/

mercredi 2 juin 2010                                                  110
Nouvelles formes de
                               diffusion de l’IST
              •        Trouver les diaporamas d’une
                       soutenance, d’une
                       présentation à un colloque /
                       une conférence

              •        Trouver une vidéo illustrant
                       un projet de recherche, etc
                       (YouTube edu)...

              •        Podcasts audio : iTunes U

              •        Trouver des images libres de
                       droits (http://www.flickr.com/
                       creativecommons/)


mercredi 2 juin 2010                                   111
Scivee
                       http://www.scivee.tv/

mercredi 2 juin 2010                           112
mercredi 2 juin 2010   113
L’économie de la
                       recommandation




mercredi 2 juin 2010                      114
Socialisation et personnalisation des
                   pratiques informationnelles
                       La pratique des outils ne peut pas être dissociée des questions
                                     culturelles et sociales qui l’entoure

                 •     Socialisation (> e-science : “we-science”)
                        • Combien de personnes ont lu cet article ?
                        • Quels sont mes “amis” / “ennemis” de lecture ?
                        • Quels sont les autres documents qu’ils ont lu / recommandé ?
                 •     Personnalisation (> e-science : “me-science”)
                        • Signaler / référencer / valoriser ses publications
                        • Présenter et gérer sa bibliographie (choses que je lis / que j’ai lu)
                        • Les bibliothèques numériques sont “centrées sur le document” plutôt que “centrées sur le
                              chercheur”

                        •     Le chercheur est-il prêt à devenir un nombre ? (ResearcherID, Scopus Author ID, ORCID)


                             Duncan Hull, Bibliography 2.0: A case study from the Wellcome Trust Genome Campus
                                                http://www.slideshare.net/dullhunk/nesc-4198183


mercredi 2 juin 2010                                                                                                   115
Plateformes de partage de
                       références bibliographiques

         •      Gérer ses références bibliographiques

         •      Partager / recommander / annoter des références

         •      Alimenter une bibliographie sur un sujet à plusieurs
                (Groupes)

         •      Générer automatiquement ses bibliographies

         •      Favoriser et faciliter la découverte d’articles /
                mutualiser sa veille avec les autres utilisateurs




mercredi 2 juin 2010                                                   116
Le social bookmarking pour le
                             chercheur
                  •    Communautés spécifiques (recherche, académique)

                  •    Fonctionnalités spécifiques (formats biblio, interconnexions avec sites
                       d’éditeurs scientifiques, recherches par auteurs, titre, revue,...)

                  •    Pourquoi utiliser un service de partage de citations ?

                       •   Possibilité de savoir qui lit les mêmes publications que vous
                       •   Possibilité de voir la bibliographie (publique) de cette personne
                       •   S’intégrer à un groupe thématique, éventuellement...
                       •   ... ou suivre le travail de ce groupe
                       •   Bénéficier de reviews sur des articles
                       •   Bénéficier d’une évaluation des articles via un système de vote intégré à la plate-
                           forme
                       •   Réaliser une veille via des fils RSS

                                                                                                  d’après A. Marois

mercredi 2 juin 2010                                                                                                  117
CiteULike
                        http://www.citeulike.org/

mercredi 2 juin 2010                                118
Texte




                       Connotea
                        http://www.connotea.org/

mercredi 2 juin 2010                               119
Zotero
mercredi 2 juin 2010            120
Mendeley
mercredi 2 juin 2010              121
MyPeers
                       http://codingseed.com/ (MacOS)
mercredi 2 juin 2010                                    122
Microblogging

          Twitter :
             •         Réseauter / prendre des nouvelles de ses collègues

             •         Signaler une information / Recommander un article

             •         Solliciter de l’aide sur un sujet

             •         Soumettre une idée, une hypothèse / sentir les
                       nouveaux sujets de recherche

             •         Commenter une conférence en live (réactions, etc)

             •         Tweeter ses articles

                                                                            http://www.phdcomics.com/comics.php?f=1198




mercredi 2 juin 2010                                                                                                     123
Saunders N, Beltrão P, Jensen L, Jurczak D, Krause R, et al. 2009 Microblogging the ISMB: A New
                       Approach to Conference Reporting. PLoS Comput Biol 5(1): e1000263. doi:10.1371/journal.pcbi.1000263


mercredi 2 juin 2010                                                                                                         124
mercredi 2 juin 2010   125
Listorious
                       Ex : Liste sur l’Open Science
mercredi 2 juin 2010                                   126
Les SHS qui tweetent
                            http://tweepml.org/?t=1161

mercredi 2 juin 2010                                     127
Topsy
                       Moteur de recherche pour Twitter
                              http://topsy.com/
mercredi 2 juin 2010                                      128
FriendFeed : life (research) streaming
                         Agréger toutes ses activités sur le web
                                   http://friendfeed.com/

mercredi 2 juin 2010                                               129
References Wanted
                        http://friendfeed.com/references-wanted
mercredi 2 juin 2010                                              130
ScienceFeed
                       http://www.sciencefeed.com/

mercredi 2 juin 2010                                 131
Réseaux sociaux scientifiques

                   •   “Facebook du chercheur”

                   •   Recherche et découverte d’experts, “collège invisible”

                   •   Développer son réseau / Multiplier les partenariats / Édition de
                       CV (2.0) / Participation à des programmes de recherche

                   •   Communiquer / Informer / Échanger / S’enrichir (nouvelle
                       sociabilité, intelligence collective, veille mutualisée)

                   •   Construire son identité numérique (gérer ses traces)

                   •   Attention ! (autorité n’est pas notoriété, affluence n’est pas
                       influence, publicité n’est pas légitimité - Olivier Ertzscheid)



mercredi 2 juin 2010                                                                      132
Comparatif des fonctionnalités
                  http://www.geozon.info/2010/04/15/comparison-chart-of-scientific-networks/

mercredi 2 juin 2010                                                                          133
Les réseaux sociaux scientifiques




mercredi 2 juin 2010                               134
Les réseaux sociaux d’éditeurs




mercredi 2 juin 2010                                135
Les réseaux sociaux
                          disciplinaires




mercredi 2 juin 2010                         136
Les réseaux sociaux
                         institutionnels




mercredi 2 juin 2010                         137
Nouvelles formes
                        d’évaluations




mercredi 2 juin 2010                      138
“Online or Invisible?”
                       Steve Lawrence - Nature,Volume 411, Number 6837, p. 521, 2001




mercredi 2 juin 2010                                                                   139
Impact du web 2.0 sur
                           processus d’évaluation

             •         Problème : évaluation tributaire d’éditeurs commerciaux
                       (Thomson : Web of Science et Elsevier : Scopus)

             •         Nouvelles métries basées sur des pratiques sociales, réseaux
                       sociaux et le web (complémentaires à l’évaluation traditionnelle)

             •         Nouvelles formes d’évaluations (open peer commentary,
                       recommandations, annotations, etc)




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Quelques alternatives à
                                  Thomson

             •         Eigenfactor : indice pondérant le nbre de
                       citations par le prestige des revues dont elles
                       proviennent (PageRank). Corpus du JCR, sur 5
                       ans.

             •         Scimago Journal Rank : fondé sur algorithme de
                       Google PageRank. Corpus : Scopus. Evaluation
                       sur 2, 3, 4 ans

             •         Harzing Publish Or Perish et Scholarometer
                       (permettent de retrouver le facteur H d’un
                       chercheur, fondés sur le corpus de Google
                       Scholar)



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Les facteurs d’usage




                            Projet MESUR. http://www.mesur.org

mercredi 2 juin 2010                                             142
“Article level metrics”




                        Bollen J, Van de Sompel H, Hagberg A, Bettencourt L, Chute R, et al. 2009 Clickstream Data Yields High-Resolution Maps of
                                                   Science. PLoS ONE 4(3): e4803. doi:10.1371/journal.pone.0004803

mercredi 2 juin 2010                                                                                                                                143
source : http://www.readwriteweb.com/archives/elseviers_prototype_is_this_the_scientific_article.php




                 Vers un article 2.0 ?
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“ Enhanced publications”
                  Selon Hubert Guillaud “Les clefs de cette nouvelle organisation
                  de l’information scientifique repose sur :
                            •    une présentation hiérarchique du texte et des données qui refonde la
                                 structure organisationnelle de l’article, afin que les lecteurs puissent naviguer
                                 entre les couches de contenu selon leur niveau d’expertise et d’intérêt.

                            •    un résumé graphique qui permet d’acquérir rapidement une compréhension
                                 du message du document

                            •    mise en évidence des principaux résultats de l’article

                            •    on peut naviguer sur l’auteur et son affiliation

                            •    l’article peut intégrer de l’audio et de la vidéo

                            •    les procédures expérimentales sont accessibles

                            •    les listes de citations enrichissent l’environnement de l’article…”



                       Source : http://lafeuille.blog.lemonde.fr/2009/08/20/larticle-scientifique-du-futur/

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•    Sur le web = croissance exponentielle
                           “d’objets numériques” d’origines
                           scientifiques (blogs, multimédia, données
                           brutes, etc)

                       • De plus en plus de publications font
                           références à ces objets numériques

                           ➡ Pourtant, dans la plupart des cas, ces
                             données et contenus ne sont pas reliés
                             entre eux

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Linked data
                       •   Lier les données entre elles

                       •   Le web comme base de
                           données

                                         D’après Yann Nicolas


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                                              B/C75"'(
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                                                       3*#*(
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                            Source : Carole Globe, The future of research, http://www.slideshare.net/
                              dullhunk/the-future-of-research-science-and-technology-presentation
mercredi 2 juin 2010                                                                                                    148
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                                               B/C75"'(
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                                                        3*#*(

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                             Source : Carole Globe, The future of research, http://www.slideshare.net/
                               dullhunk/the-future-of-research-science-and-technology-presentation
mercredi 2 juin 2010                                                                                                     149
L’article du futur
                                                  4 composantes

                       1. La publication linéaire dite “classique” (le texte,
                          l’argumentation)
                       2. Les données de la recherche (la preuve)
                       3. Matériaux supplémentaires (pour illustrer ou
                          clarifier les propos)
                       4. Données post-publication (commentaires,
                          indicateurs bibliométriques, facteurs d’usages,
                          etc)
                 Source : Saskia Woutersen, The future of scholarly communication: Enhanced Publications, http://indico.cern.ch/
                                              contributionDisplay.py?contribId=67&confId=4832I


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mercredi 2 juin 2010   152
JoVE : Journal of Visualized Experiments
                                     http://www.jove.com/


mercredi 2 juin 2010                                              153
mercredi 2 juin 2010   154
Publication liquide
                                                       http://liquidpub.org/


                       “des objets évolutifs, collaboratifs et multiformes pouvant être composés et
                       consommés à différents niveaux de détail, remplaçant les journaux et conférences
                       classiques par des collections 

                       Certes, ceci implique qu’on admette le caractère évolutif de l’écrit, son instabilité
                       dans le temps en fonction de l’évolution du savoir, son caractère collaboratif, chacun
                       pouvant apporter sa contribution personnelle, et son caractère multiforme, incluant
                       tous les modes d’expression modernes actuels et à venir. Ceci demande également
                       une révision profonde et une adaptation des méthodes de jugement, préalables à la
                       publication (le peer review) qui devient plus difficile à maintenir en place, et a
                       posteriori, lors de l’évaluation des programmes, des équipes et des individus.”



                             Source : Bernard Rentier, http://recteur.blogs.ulg.ac.be/?p=188



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Comment expliquer la faible participation
           des chercheurs ?
         David Stuart, Web 2.0 fails to excite today's researchers, Research Information, Oct/Nov 2009
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“(...) Quelles sont les dérives de la communication médiatisée par la
                 technique ? (...) Le cercle vertueux procuré par la « présence
                 Web2.0 » des scientifiques sur le net ne se traduit-il pas
                 essentiellement par un certain nombre d’invitations, de sollicitations
                 à des conférences et à l’écriture d’articles, ces effets positifs
                 participent-ils au renouvellement du débat d’idées ?”



                Broudoux E, Chartron G. « La communication scientifique face au Web2.0 : Premiers constats
                   et analyse ». In : H2PTM [En ligne]. [s.l.] : Hermès Science - Lavoisier, 2009. p. 323-336.
                              Disponible sur : < http://archivesic.ccsd.cnrs.fr/sic_00424826/en/ >




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Quelques limites
                 •     question des données nominatives et privées (e-réputation,
                       gestion des traces)

                 •     pérennité de ces outils

                 •     données au mains d’acteurs privés ou commerciaux
                       (citeulike : Springer, Connotea : Nature)

                 •     Masse critique ?

                 •     légitimité et non reconnaissance de ces outils, faible
                       d’incitation de la part des politiques, des institutions

                 •     multiplication de ces outils, question de l’intéropérabilité ?


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“L’utilisation à des fins professionnelles des nombreux services gratuits disponibles sur
                Internet (messagerie électronique, hébergement de sites web, stockage de données,…)
                suscite de manière générale de sérieuses réserves. En toute rigueur, l’externalisation
                d’un service n’est concevable que dans le cadre d’un contrat où juridiquement toutes les
                implications auront bien été étudiées et où techniquement toutes les mesures destinées
                à assurer la disponibilité, l’intégrité et la confidentialité des informations auront été
                correctement mises en œuvre. Il est bien évident que l’on ne peut attendre de telles
                garanties d’un fournisseur de service gratuit. Les risques sont accrus lorsque ce
                fournisseur est situé à l’étranger.”


                Source : CNRS/FSD/Sécurité des Systèmes d’Information. Recommandations
                pour l’utilisation des services gratuits sur Internet. 2008. Disponible sur : http://
                www.sg.cnrs.fr/FSD/securite-systemes/documentations_pdf/securite_systemes/
                Recommandations%20sur%20les%20services%20gratuits.pdf




mercredi 2 juin 2010                                                                                       159
Rôles et opportunités pour les
                           bibliothèques
                       •   Médiateurs de l’IST

                       •   Formateurs et veilleur (nouveaux outils et nouvelles méthodes de
                           la science 2.0)

                       •   Gestionnaires des données, Fournisseurs de métadonnées,
                           garants de la qualité de ces dernières

                       •   Diffuseurs de la connaissance

                       •   Chargés de la valorisation des contenus

                       •   Prestataires de services auprès des chercheurs

                       •   Bibliomètres


mercredi 2 juin 2010                                                                          160
Vers des services et outils
                         orientés chercheurs
                       •   Les chercheurs ne viennent pas à la bibliothèque. Il faut aller
                           vers eux (se déplacer dans les labos)

                       •   Penser au fait que les chercheurs n’utilisent pas qu’une seule
                           bibliothèque, qu’une seule source d’information ou qu’un seul
                           outil !

                       •   Les services de la bibliothèque doivent s’intégrer dans les
                           outils et dans l’environnement numérique de travail du
                           chercheur

                       •   La bibliothèque doit disséminer l’information, et ses services,
                           devenir invisible et transparente pour le chercheur


mercredi 2 juin 2010                                                                         161

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Open Science, Open Access, Science2.0 : de nouvelles modalités pour la communication scientifique

  • 1. Open Science, Open Access, Science 2.0 Les nouvelles modalités de la communication scientifique Julien Sicot <julien.sicot@univ-rennes2.fr> Stage URFIST 1er juin 2010 mercredi 2 juin 2010 1
  • 2. La communication scientifique État des lieux mercredi 2 juin 2010 2
  • 3. Les grandes évolutions de la communication scientifique 1970 2002 2009 Bases de données Budapest Open Web sémantique 1948 e-mails Access Initiative Échanges Request For 1989 Linked data Vannevar Bush Le Web Green and Gold épistolaires Comments Data repositories le Memex Tim Bernes-Lee Roads 1665 1963 1975 1991 2004 Invention de la revue scientifique Eugène Garfield Facteur ArXiv Google H. Oldenburg : Philosophical Science Citation d’Impact Premier Transactions of the Royal Society serveur de Scholar Index (London) preprints Marin Mersenne. Journal des savants (Paris) D’après Gabriel Gallezot et al., “Chercheurs 2.0 ?,” Les Cahiers du numérique 5, no. 2 (Juin 15, 2009): 15-32, http://archivesic.ccsd.cnrs.fr/sic_00396278/en/ mercredi 2 juin 2010 3
  • 4. Acteurs de la recherche • Chercheurs, équipes, laboratoires • Financeurs de la Recherche (acteurs institutionnels : universités et bibliothèques, agences nationales, acteurs privés) • Acteurs éditoriaux (éditeurs scientifiques : “Big Four” : Elsevier, Springer Verlag, Blackwell-Wiley, Thomson Scientific) • Diffuseurs (Agences d’abonnement, agrégateurs, portails, moteurs de recherche (Google Scholar, Books / Microsoft), serveurs de bases de données bibliographiques) mercredi 2 juin 2010 4
  • 5. Le cycle de la Recherche Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009). mercredi 2 juin 2010 5
  • 6. Journée type du chercheur 50% administratif, 50% enseignement, 50% recherche ! • Navigation internet (veille) / recherche documentaire / lecture d’articles scientifiques • Vérification dates prochaines conférences / Organisation de colloques, de communications • Réfléchir à d’éventuelles hypothèses de recherche / Trouver des financements / répondre à des appels à projet • Relations avec ses pairs / collaborateurs / partenaires • Activités pédagogiques (cours, etc) • Participation aux referees d’articles • Aspects politiques, groupes de travail, vie universitaire, etc... mercredi 2 juin 2010 6
  • 7. Le cycle de l’Information scientifique D’après G. Gallezot Bases bibliographiques Banques de données Collecte Revues, ouvrages Recherche de documents Colloques Extraction d’information Archives ouvertes Sites web Listes de discussion - Activité cognitive Bibliothèques du chercheur Diffusion de Traitement de - Manipulation par … document l’information des outils informatiques Production de Construction de documents connaissance Production d’information mercredi 2 juin 2010 7
  • 8. La cycle de la Revue Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009). mercredi 2 juin 2010 8
  • 9. Fonctions remplies par la revue • Aujourd’hui = principal vecteur de l’IST • Diffusion des résultats de recherche • Garant de la qualité de la recherche “en amont” (autorité, peer-reviewing) • Constitution d’une mémoire scientifique (archives pérennes) • Évaluation des chercheurs “en aval” (OST, AERES, citations, h-index, classements, etc) mercredi 2 juin 2010 9
  • 10. Nbre d’articles par discipline et par an Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009). mercredi 2 juin 2010 10
  • 11. Une croissance exponentielle • + de 25 000 titres de revues • 1,5 Millions d’articles publiés par an (2,5 Millions en 2004) • Sur la totalité des chercheurs, 90% sont en vie aujourd’hui • 2000 éditeurs • 3% de croissance / an • 1 millions d’auteurs (chercheurs) • 10 à 15 millions de lecteurs dans plus de 10000 institutions mercredi 2 juin 2010 11
  • 12. Croissance des revues à comité de lecture depuis 1665 Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009). mercredi 2 juin 2010 12
  • 13. Corrélation entre augmentation nombres de chercheurs, revues et articles Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009). mercredi 2 juin 2010 13
  • 14. Vers le e-only ? Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009). mercredi 2 juin 2010 14
  • 15. Le big deal • 39% (780) des éditeurs basés en Europe = 49% de la production d’articles = puissant lobby • Big 3 = 80% du marché STM (Thomson Reuters $2.639, Reed Elsevier $1.764, Wolters Kluwer $1.158) Other $1.250 Total : $6.811 • Augmentation du prix des périodiques : +10% par an de 1975 à 2000 (de 1975 à 1995 +300%) • Depuis 2000, inflation annuelle de 6 à 8% en moy. mercredi 2 juin 2010 15
  • 16. Le coût des revues mercredi 2 juin 2010 16
  • 17. Ghost writing "... during key marketing periods as many as 40% of published articles focusing on specific drugs are ghost managed" Sismondo S. « Ghost Management: How Much of the Medical Literature Is Shaped Behind the Scenes by the Pharmaceutical Industry? ». PLoS Med [En ligne]. 2007,Vol. 4, n°9, p. e286. Disponible sur : < http://dx.doi.org/10.1371/journal.pmed.0040286 > (consulté le 30 Mai, 2010) mercredi 2 juin 2010 17
  • 18. Des résultats erronés "Simulations show that for most study designs and settings, it is more likely for a research claim to be false than true. Moreover, most study designs and settings, it is more likely for a research claim to be false than true. Moreover, for many current scientific fields, claimed research findings may often be simply accurate measures of the prevailing bias." Ioannidis JPA. « Why Most Published Research Findings Are False ». PLoS Med [En ligne]. 2005,Vol. 2, n°8, p. e124. Disponible sur : < http://dx.doi.org/10.1371/ journal.pmed.0020124 > (consulté le 30 Mai, 2010) mercredi 2 juin 2010 18
  • 19. Fake journals Source : http://www.the-scientist.com/blog/display/55671/ et http://www.the-scientist.com/blog/display/55679/ mercredi 2 juin 2010 19
  • 20. “Duplicate articles” Mounir Errami et Harold Garner, “A tale of two citations,” Nature 451, no. 7177 (Janvier 24, 2008): 397-399, http://dx.doi.org/ 10.1038/451397a.   mercredi 2 juin 2010 20
  • 21. Vers de nouvelles pratiques ? Source: Mark Ware et Michael Mabe, The stm report : An overview of scientific and scholarly journals publishing (Oxford, United Kingdom: STM: International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers, Septembre 2009). mercredi 2 juin 2010 21
  • 22. Et l’évaluation scientifique ? 2 types d’évaluation : • En amont, qualitative, par les pairs = peer reviewing • En aval, quantitative, par les citations des pairs D’après P. Mounier et G. Gallezot mercredi 2 juin 2010 22
  • 23. Évaluer l’activité recherche ? • Pour qui ? Le pilotage (DGES, universités…) : orientation de la prod. Scientifique, répartition budgétaire, recrutement… • Comment ? Quels référentiels ? Quels indicateurs ? • Qui, quoi ? programmes… Les chercheurs, les établissements, les revues, les • Par qui ? OST, AERES, CNU, Universités… mercredi 2 juin 2010 23
  • 24. Évaluer l’activité recherche? • Un modèle prégnant et valeur de cette publication par la Publication (article de revue) mesure des citations « reçues » par d’autres publications (bibliométrie) • Un modèle dominant (STM) et quasi monopole de l’analyse et du référentiel (ISI - Institute of Scientific Information, Groupe U.S. Thomson Reuters) d’après G. Gallezot mercredi 2 juin 2010 24
  • 25. Le facteur d’impact • Concerne les revues scientifiques • Fréquence annuelle moyenne de citation des articles d’un journal donné, estimé sur les 2 années précédentes • Calculé par l’ISI à partir de la base JCR (Journal Citations Report) - Statistiques de citation et facteur d’impact des principales revues en science - Corpus de + de 7600 revues, les plus citées au monde (nombreuses revues françaises absentes) • Limites : - Contrainte de durée (2 ans) - % de revues sur la base de données ISI - Indice de visibilité des revues et non des articles mercredi 2 juin 2010 25
  • 26. Le facteur d’Impact Créé en 1960 par Eugene Garfield (ISI) citations / articles 2008 2006 et 2007 IF=5 Les articles publiés en 2006/07 ont été cités en moyenne 5 fois en 2008. D’après Björn Brembs mercredi 2 juin 2010 26
  • 27. L’index-H • Créé par J. Hirsh (université de Californie à San Diego) • Mesure des citations au niveau du chercheur • Le nombre h d'articles de l'auteur qui ont été cités au moins h fois chacun Source : http://fr.wikipedia.org/wiki/Indice_h mercredi 2 juin 2010 27
  • 28. L’évaluation en question • Problème des critères quantitatifs d’évaluation de la recherche : Nombre de publications dans les revues internationales « peer-reviewed », facteur d’impact • Déséquilibre structurel en France, GB et Allemagne : ➡ Problème du différentiel de publication entre chercheurs français et anglais, du classement de Shanghai ➡ Problème de visibilité de la recherche • Quelle explication ? Poids écrasant des « Big 4 » de l’édition scientifique • Aujourd’hui : la performance bibliométrique l’emporte sur la découverte scientifique ! mercredi 2 juin 2010 28
  • 29. Les biais du facteur d’impact Source : PhD Comics : http://www.phdcomics.com/comics.php?n=1108 A lire : Gingras Y. « La fièvre de l’évaluation de la recherche – Du mauvais usage de faux indicateurs ». Bulletin de méthodologie sociologique [En ligne]. 1 Octobre 2008, n°100, p. 42-44. Disponible sur : < http://bms.revues.org/index3313.html > (consulté le 30 Mai, 2010) mercredi 2 juin 2010 29
  • 30. “Le durcissement actuel de l'évaluation de l’activité scientifique n’est-il pas un frein majeur à l’ouverture des systèmes de lecture et d’écriture des travaux scientifiques ?” Broudoux E, Chartron G. « La communication scientifique face au Web2.0 : Premiers constats et analyse ». In : H2PTM [En ligne]. [s.l.] : Hermès Science - Lavoisier, 2009. p. 323-336. Disponible sur : < http://archivesic.ccsd.cnrs.fr/sic_00424826/en/ > mercredi 2 juin 2010 30
  • 31. Quelques anomalies • Barrière technologique : comment jongler entre les multiples outils/ressources ? • Barrière économique : Coût de l’IST, les bibliothèque ne sont pas abonnées à toutes les bases et revues • Barrière juridique : Editeur détenteur du copyright => ne facilite pas la créativité /réutilisation / l’exploitation des contenus. Obstacle au partage et à la collaboration Parrini M. barriers, 2007. Disponible sur : < http://www.flickr.com/photos/remuz78/463810013/ > mercredi 2 juin 2010 31
  • 32. Crise(s) ? Vers un épuisement des modèles classiques • Crise de l’édition scientifique (copyright, scandales, concentration, augmentation des coût, nouveaux modèles de publications, l’article n’est pas le seul support de l’IST) • Crise du chercheur (individualisme & impersonnalité de la recherche ? Concurrence, compétition, “publish or perish”, mutations profondes des pratiques, etc.) • Crise de l’évaluation (diktat “publish or perish” (encore), Shanghai, biais du facteur d’impact, facéties de la bibliométrie, etc.) mercredi 2 juin 2010 32
  • 33. Vers une e-Science ? Nouvelles formes de publication : Open Access, Archives Ouvertes et Revues en libre accès Nouvelles pratiques de la recherche : Science 2.0, Open Science, Open data Nouvelles formes d’évaluation : Open peer reviewing, facteurs d’usages, etc mercredi 2 juin 2010 33
  • 35. Le Libre accès : repères historiques • 1991 : naissance d’ArXiv = 1er serveur de preprints • 1999 : naissance du mouvement Open Archives Initiative (OAI) • 2002 : Budapest Open Access Initiative (BOAI) • 2003 : Déclaration de Berlin • 2006 : en France, signature d’un accord inter-établissements • 2009 : Berlin 7 > 9 universités françaises signent la déclaration de Berlin pour le libre accès à la littérature scientifique mercredi 2 juin 2010 35
  • 36. BOAI Fondements de l’Open Access • Une définition : « Le libre accès à la littérature scientifique est sa mise à disposition gratuite sur l’Internet public, permettant à tout un chacun de lire, télécharger, copier, transmettre, imprimer (…), ou s’en servir à toute autre fin légale, sans barrière financière, légale ou technique autre que celles indissociables de l’accès et l’utilisation d’Internet. » (d’après Libre Accès Inist). • Deux stratégies (2 voies) • La voie verte (Green road – BOAI 1) : l’auto-archivage des publications par les chercheurs • La voie dorée (Gold road – BOAI 2) : la publication d’articles dans des revues en libre accès mercredi 2 juin 2010 36
  • 37. • H. Varmus <http://seedmagazine.com/ content/article/science_2.0_pioneers/> “True “open access” is different from “public access.” It means that the author holds the copyrights, that the journal places the work immediately and freely in the public domain under a Creative Common license or something equivalent to it, and that the work is in public libraries and available for all kinds of reasonable use, as long as attribution is maintained.” mercredi 2 juin 2010 37
  • 38. La déclaration de Berlin La déclaration de Berlin date de 2003 et a été signée à ce jour par plus de 300 institutions scientifiques majeures dans le monde.  Étape clé dans le développement libre accès = implication des principaux organismes de recherche Européens signataires qui s’engagent à : « promouvoir un Internet qui soit un instrument fonctionnel au service d’une base de connaissance globale et de la pensée humaine », et à définir « des mesures (…) à envisager par les responsables politiques en charge de la science, les institutions de recherche, les agences de financement, les bibliothèques, les archives et les musées. » mercredi 2 juin 2010 38
  • 39. Les archives ouvertes La communication scientifique directe • La parabole d’Harnad • La solution : promouvoir chez les chercheurs le processus d’auto- archivage des pré-publications et post-publications sur des serveurs dédiés à cet effet. • « Archive, repository » synonymes d’« entrepôt / réservoir de données » où sont déposées des données issues de la recherche scientifique et de l’enseignement et dont l’accès se veut ouvert, c’est à dire sans barrières (techniques, économiques, juridiques) …» • Architecture technique distribuée et interopérable (OAI-PMH) mercredi 2 juin 2010 39
  • 40. Accès restreint -- Impact Restreint LE CYCLE D’IMPACT DÉMARRE : Le chercheur écrit La recherche se fait le « prétirage » de son article Le prétirage est soumis à une revue Le prétirage est évalué 12-18 Mois par un comité de lecture Le prétirage corrigé par l’auteur devient un «post-tirage» Le post-tirage est accepté, validé et publié par une revue Les autres chercheurs ne peuvent accéder au post-tirage que si leur université est abonnée NOUVEAUX CYCLES à la revue où il est D’IMPACT : les nouvelles D’après S. HARNAD publié recherches s’appuient sur les recherches précédentes mercredi 2 juin 2010 40
  • 41. Accès maximal - Impact maximal LE CYCLE D’IMPACT Le chercheur écrit DÉMARRE : le « prétirage » de La recherche se fait son article Le pré-tirage est auto-archivé sur le site Web de l’établissement où travaille le chercheur Le prétirage est soumis à une revue Le prétirage est évalué Le post-tirage est publié 12-18 Mois par un comité de lecture dans une revue à accès libre Le prétirage corrigé ou auto-archivé par l’auteur: devient un sur le site Web de « post-tirage » l’établissement du chercheur Le post-tirage est accepté, validé et publié par la revue NOUVEAUX CYCLES D’IMPACT L’impact scientifique des articles de recherche libres d’accès s’accroît et s’accélère grâce à l’augmentation de Les autres chercheurs ne l’accès peuvent accéder au post- tirage que si leur université est abonnée NOUVEAUX CYCLES D’IMPACT : Les nouvelles recherches s’appuient D’après S. HARNAD sur les recherches précédentes mercredi 2 juin 2010 41
  • 42. AO disciplinaire ArXiv.org mercredi 2 juin 2010 42
  • 43. AO à dimension nationale HAL mercredi 2 juin 2010 43
  • 44. AO spécialisée TEL mercredi 2 juin 2010 44
  • 45. Archive institutionnelle ORBI (Ulg) mercredi 2 juin 2010 45
  • 46. Les Archives ouvertes : bénéfice pour le chercheur • Disposer d’un moyen de communication scientifique directe et rapide : une mise en ligne simple et rapide des résultats de la recherche • Accéder à un corpus scientifique ouvert et accessible • Améliorer son audience et sa visibilité face à ses pairs et ses sources de financement (L’impact d’une publication est accru de manière substantielle si celle-ci est accessible librement sur le Web ? S. Lawrence) • Disposer d´études d´impact sur ces publications récentes • Augmenter le cycle de vie d’un article au-delà de la publication dans une revue : e-publication • Garantir l’archivage à long terme et la citation électronique : URLs pérennes mercredi 2 juin 2010 46
  • 47. Les éditeurs et AO • Liste ROMEO/SHERPA (UK) sur la politique éditoriale (copyright) de 686 éditeurs • Elle recense les possibilités de mise sur le web (donc d’auto-archiver) des articles scientifiques par éditeurs. • Les revues blanches : celles dont les éditeurs n'ont pas de politique formelle autorisant l'auto-archivage • Les revues jaunes : autorisent l'auto-archivage des pré-publications (avant les révisions par le comité de lecture) • Les revues bleues : autorisent l'auto-archivage des post-publications (version finale après révision) • Les revues vertes : autorisent l'auto-archivage des pré- ET des postpublications • Liste JULIET/SHERPA (UK) politiques des “financeurs » mercredi 2 juin 2010 47
  • 48. SHERPA RoMEO mercredi 2 juin 2010 48
  • 50. Rechercher dans les AO • Identifier les archives ouvertes (+ de 1400 dans le monde) • L’OpenDOAR : The Directory of Open Access Repositories http://www.opendoar.org/index.html • Registry of Open Access Repositories (ROAR) http://roar.eprints.org/ • Rechercher des articles scientifiques à l’aide des moissonneurs (harvesters) = « moteurs pour les archives ouvertes » • OAIster http://www.oaister.org (versé dans le WorldCat depuis 2009) • Scientific Commons http://www.scientificcommons.org • Driver (Digital Repository Infrastructure Vision for European Research) http:// search.driver.research-infrastructures.eu/ • Base (Bielefeld Academic Search Engine) http://www.base-search.net • Évaluer une Archive Ouverte • Ranking repositories http://repositories.webometrics.info/ mercredi 2 juin 2010 50
  • 51. OpenDOAR http://www.opendoar.org/find.php mercredi 2 juin 2010 51
  • 52. ROAR http://roar.eprints.org/ mercredi 2 juin 2010 52
  • 53. Repository Maps http://maps.repository66.org/ mercredi 2 juin 2010 53
  • 54. BASE http://www.base-search.net mercredi 2 juin 2010 54
  • 55. ScientificCommons http://www.scientificcommons.org/ mercredi 2 juin 2010 55
  • 56. Un mouvement irréversible, mais progressif… • Des soutiens institutionnels importants : Sénat américain, Union Européenne, gouvernements, grands organismes scientifiques : ANR, CNRS, INSERM, INRIA (Fr.), NIH (E.U.), RCUK (G.B.)… • Des initiatives nationales fortes (France : HAL, G.B.: The Depot ) • Vers une obligation de dépôt ? ROARMAP (Registry of Open Access Repository Material Archiving Policies) et SHERPA/Juliet (Research funders' open access policies) 179 mandats institutionnels + financeurs de la recherche • Aux USA : PubMed (pour les recherches financées par le NIH) ; projet de loi en juin 2009 pour toutes les disciplines ; • Au niveau européen : 7ème PCRD > Open Access Pilot / OpenAIRE (Open Access Infrastructure for Research in Europe) • Prise en compte dans l’évaluation des chercheurs (ex : université de Liège, etc) mercredi 2 juin 2010 56
  • 57. ROARMAP http://www.eprints.org/openaccess/policysignup/ mercredi 2 juin 2010 57
  • 58. SHERPA / Juliet http://www.sherpa.ac.uk/juliet/ mercredi 2 juin 2010 58
  • 59. Ranking Web of World Repositories http://repositories.webometrics.info mercredi 2 juin 2010 59
  • 60. Les revues en libre accès Une revue en libre accès (open access journal) est une revue scientifique, « nouvelle ou existante, qui répond aux exigences de qualité des articles par la présence d’un comité de lecture, mais qui a un mode de financement permettant une diffusion aussi large que possible, sans restriction d’accès et d’utilisation » (d’après l’INIST) • PloS : http://www.plos.org • Revues.org : http://www.revues.org/ • BiomedCentral : http://www.biomedcentral.com/e/ • Scielo : http://www.scielo.br/ mercredi 2 juin 2010 60
  • 61. Les revues en libre accès • Deuxième composante de l’Open Access (voie dorée) • Nouveau modèle économique : • frais de publication supportés par les auteurs ou leurs institutions • généralement subventionnées • Revues en libre accès = revues scientifiques • Articles soumis aux règles d’évaluation habituelles du « peer-reviewing » • Sont évaluées avec les mêmes indicateurs bibliométriques (IF) • + de 500 revues en OA comptabilisées dans le JCR mercredi 2 juin 2010 61
  • 62. Modèle traditionnel Source : Björn Brembs, What's wrong with scholarly publishing today?, http://www.slideshare.net/brembs/whats-wrong-with-scholarly- publishing-today-ii mercredi 2 juin 2010 62
  • 63. Modèle auteur/payeur Source : Björn Brembs, What's wrong with scholarly publishing today?, http://www.slideshare.net/brembs/whats-wrong-with-scholarly- publishing-today-ii mercredi 2 juin 2010 63
  • 64. DOAJ : Directory of Open Access Journals Open J-Gate 4576 revues 6255 revues Trouver des revues en libre accès mercredi 2 juin 2010 64
  • 65. Nouvelles pratiques de la recherche : Science 2.0 et Open Science mercredi 2 juin 2010 65
  • 66. Le web 2.0 (O'Reilly, 2005) • longue traine • les données sont toutes puissantes • centré/orienté utilisateur • effets de réseau / réseaux sociaux • Quelques droits réservés / favoriser l’exploitation, la réutilisation des contenus • bêta perpétuelle • coopération / collaboration • les applications sont accessibles sur tous les supports http://oreilly.com/web2/archive/what-is-web-20.html?page=5 mercredi 2 juin 2010 66
  • 67. Michel Roland “alors que l’internet est d’origine (en grande partie) universitaire, ses plus récents développements (le web 2.0) sont globalement appréhendés comme venant l’impacter de l’extérieur” source : http://www.slideshare.net/bibliothecaire/100330-pmlpa-science-20-new mercredi 2 juin 2010 67
  • 68. Génération Y : Nouvelles pratiques informationnelles Source : Education for Change Ltd., Researchers of Tomorrow : A three year (BL/JISC) study tracking the research behaviour of 'Generation Y' doctoral students (British Library & JISC, Octobre 2009). mercredi 2 juin 2010 68
  • 69. Google Scholar : nouvelle donne ? ✓ Explosion,informationnelset hybridation des outils diversification ✓ Risques d’infobésité ? ✓ Autorité VS Popularité ✓ Économie de l’attention / Âge de l’accès ✓ Besoins : ouverture, accessibilité, accès unifié aux documents de la recherche, immédiateté, “gratuité”, texte intégral ! ✓ Compétences informationnelles de + en + importantes (évaluation de l’information) mercredi 2 juin 2010 69
  • 70. Multiplication et diversification des moteurs de recherche scientifique Un corpus “dit” scientifique : Des fonctionnalités avancées • Recherche en texte intégral, simplicité • sites et portails académiques (.edu, etc.) • Possibilité de créer des alertes (cf nouvelle fonctionnalité dans GS) • bases de revues d'éditeurs (SpringerLink, ScienceDirect, Wiley-Blackwell, IEEE, etc.) • Exportation et exploitation de références bibliographiques (dans différents formats : bibTeX, RIS, • bases de sommaires (Ingenta Connect) Refworks, etc.) • bases de données bibliographiques (INIST) • Analyse Bibliométrique (taux de citations, etc.) • catalogues de bibliothèques (WorldCat, • Support du résolveur de liens d’une bibliothèque SUDOC) (partenariat avec les bibliothèques pour faciliter le lien vers le texte intégral des documents - technologie • bases de brevets OpenURL) • ressources en Open Access (archives ouvertes, • Fonctionnalités avancées de recherche (par auteur, par revues) titre de revue, etc) mercredi 2 juin 2010 70
  • 71. Les moteurs de recherche scientifique Wikipedia : List of academic databases and search engines mercredi 2 juin 2010 71
  • 72. Multiplication des outils numériques pour le chercheur Digital Research Tools http://digitalresearchtools.pbworks.com/ mercredi 2 juin 2010 72
  • 73. Nouvelle façon de veiller La recherche d’information : énergie, temps, analyse, stratégie Nécessité de rentabiliser sa recherche (veille) : suivi des nouveautés sur une sujet, mise à jour des informations Économie par la création d’alertes, sauvegardes de recherche = déléguer la recherche ! Mike Lee, Newspaper RSS Feed Icon, Juin 6, 2009 Flickr, http://www.flickr.com/photos/curiouslee/3602683294/. mercredi 2 juin 2010 73
  • 74. http://cravingideas.blogs.com/backinskinnyjeans/2006/09/how_to_explain_.html Mener une veille avec les flux RSS mercredi 2 juin 2010 74
  • 75. Les flux RSS ? • RSS = Rich Site Summary (sommaire d’un site enrichi) • RSS = Really Simple Syndication (souscription vraiment simple) • Un flux RSS = un fichier (format XML) ou fil de contenu qui va stocker et diffuser les dernières mises à jour d’un site web (ou blogs (hypotheses.org), sites d’actualités (Le Monde), sites institutionnels, Archives ouvertes (ArXiv, HAL), revues scientifiques (Cairn, TicToCs), socialbookmarking (Delicious), etc) • Autre avantage : RSS déconnecte le texte de sa mise en forme. A partir d’un flux RSS, il est possible de lire le contenu d’un site A sur un site B ! mercredi 2 juin 2010 75
  • 76. Intérêts des flux RSS • Recevoir automatiquement les mises à jour d’un site sans avoir à retourner sur ce dernier • Suivre l’activité de plusieurs sites à partir d’un seul point d’entrée (“guichet unique” = rôle de l’agrégateur) • S’abonner aux flux RSS des sommaires de revues • Générer un flux à partir de requêtes dans des bases de données en IST • Possibilité de catégoriser / d’organiser ses abonnements (flux rss) + filtres + tags • Alimenter une véritable base de connaissances • Moins intrusif que l’e-mail (pubs, spams) mercredi 2 juin 2010 76
  • 77. Entrez dans le flux Repérer les sites & services proposant un flux RSS (ou fil RSS, Syndication RSS, RSS feeds, etc) Icône identifiable (sur la page ou au niveau de l’URL) Choisir un lecteur de flux RSS (ou Agrégateur, ou Reader), en ligne (Google Reader, netvibes) ou un logiciel client (Firefox, Thunderbird, feeddemon) mercredi 2 juin 2010 77
  • 78. RSS & OPML ? • Importer et Exporter sa liste de Flux (sauvegarde) • Echanger et partager sa liste d’abonnements mercredi 2 juin 2010 78
  • 79. Journal TOCs http://www.journaltocs.hw.ac.uk/ mercredi 2 juin 2010 79
  • 80. TiCToCs Recevoir les tables des matières de revues par fils RSS http://www.tictocs.ac.uk/ mercredi 2 juin 2010 80
  • 81. mercredi 2 juin 2010 81
  • 82. Folksonomie Folksonomie : combinaison des termes “folks” (usagers) et “taxinomie” (règle de classification) Systèmes s’appuyant sur réseaux sociaux et permettant aux utilisateurs de donner des indications de contenu aux ressources qu’ils rencontrent, sous la forme de tags (mot- clés) Esprit collaboratif, notion de partage, ouverture, simplicité d’utilisation... Ex : plateformes de partage de signets et de Cambodia4kids.org Beth Kanter, Tags: Keywords to describe digital objects, Octobre 3, 2006, références bibliographiques Flickr, http://www.flickr.com/photos/cambodia4kidsorg/260004685/. mercredi 2 juin 2010 82
  • 83. Delicious http://delicious.com mercredi 2 juin 2010 83
  • 84. Diigo http://diigo.com mercredi 2 juin 2010 84
  • 85. Services de partage de signets • Avantages • Permet un classement des ressources mais aussi une navigation et un accès simple aux informations via les tags • Fonctions innovantes de tri ou de classement et de visualisation : nuages de tags • Les tags sont plus précis et répondent mieux au vocabulaire et aux attentes des utilisateurs • Permet de parcourir des sources faisant partie du web invisible • Inconvénients • Mots-clés détournés ou “Folks Bombing” • Problèmes de validité, de cohérence (doublons) et de pérennisation A utiliser pour • Un accès rapide à l’information • Pour mettre en place une veille en utilisant le « tag tracking » (repérage de termes (tags) précis) qui consiste à suivre les ressources annotées avec un mot-clé (tag) précis mercredi 2 juin 2010 85
  • 86. Science 2.0 / Open Science Objectifs • Changer les pratiques de la recherche afin de rendre ses résultats plus accessibles, d'une manière plus efficace et plus rapide • Comprend l’Open Access, l’Open Data et l’Open Process (accès aux codes sources, par exemple, et aux protocoles d’expérimentation) mercredi 2 juin 2010 86
  • 87. Science 2.0 / Open Science Concepts • Échange / Conversation / Partage / Collaboration / favoriser la découverte (Sérendipité) • Transparence / Ouverture / Accessibilité / Réciprocité / Intéropérabilité • Enrichissement et valorisation des données (data mashups & Open Data) / Web (2.0 et sémantique) / Infrastructure Numérique de recherche (TGE Adonis) • L’article n’est pas le seul vecteur de la recherche ! L’IST est multiforme ! • Des services et outils orientés chercheur, pas seulement contenu mercredi 2 juin 2010 87
  • 88. D’après Cameron Neylon, Open Science@PSB Introduction, <http:// www.slideshare.net/CameronNeylon/open-sciencepsb-introduction-presentation> mercredi 2 juin 2010 88
  • 89. D’après Cameron Neylon, Open Science@PSB Introduction, <http:// www.slideshare.net/CameronNeylon/open-sciencepsb-introduction-presentation> mercredi 2 juin 2010 89
  • 90. Web 2.0 D’après Cameron Neylon, Open Science@PSB Introduction, <http:// www.slideshare.net/CameronNeylon/open-sciencepsb-introduction-presentation> mercredi 2 juin 2010 90
  • 91. Quelles formes ? • Carnets de recherche en ligne (Blogs, Wikis, Open Notebook Science) • Open Labs, Open Data (datasets, protocoles de recherche, expérimentations) • Espaces informationnels et conversationnels : réseaux sociaux, microblogging, life streaming) • Social bookmarking et plateformes de partage mercredi 2 juin 2010 91
  • 92. La blogosphère scientifque Carnets de recherche 2.0 Typologie de la blogosphère scientifique • Blogs de chercheur, de doctorant • Blogs thématiques ou collectifs • Blogs de séminaires • Blogs “compagnons” d’une publication, d’une thèses • Plateformes d’hébergement / Agrégateurs de blogs (commerciales, institutionnelles, communautaires) 2008 : entre 3 000 et 10 000 blogs scientifiques dans le monde, dont 2 000 aux USA “According to Adam Bly from Science Blogs (Seed Media Group), around 33% of scientists are now using blogs for writing, reading or as a lab notebook.” source : http://www.info.scopus.com/researchtrends/archive/RT17/beh_dat_17.html mercredi 2 juin 2010 92
  • 93. Diversités de blogs = diversité de contenus, de pratiques • Un carnet de recherche, projet de recherche, "atelier" de chercheur • Un cahier de laboratoire • L'actualité de la recherche, réflexions et débats • Les informations d'une communauté scientifique (calendrier des manifestations, annonces de parutions...) • Des conférences, colloques, séminaires virtuels • La communication institutionnelle • Des revues de littérature, des comptes-rendus • Une lettre scientifique, ou un site accompagnant une publication • Des cours, carnets pédagogiques • Une veille sur l'information scientifique et technique mercredi 2 juin 2010 93
  • 94. Blog d’André Gunthert http://www.arhv.lhivic.org/ mercredi 2 juin 2010 94
  • 95. Blog d’Antoine Blanchard http://www.enroweb.com/blogsciences/ mercredi 2 juin 2010 95
  • 96. ResearchBlogging http://researchblogging.org/ mercredi 2 juin 2010 96
  • 97. Nature Blogs http://blogs.nature.com/ mercredi 2 juin 2010 97
  • 98. PostGenomic http://postgenomic.com/index.php mercredi 2 juin 2010 98
  • 99. Stanford Blogs http://blog.stanford.edu/ mercredi 2 juin 2010 99
  • 100. Hypothèses http://hypotheses.org/ mercredi 2 juin 2010 100
  • 101. C@fé des sciences http://www.cafe-sciences.org/ mercredi 2 juin 2010 101
  • 102. Pourquoi un blog ? • Esquisser ses réflexions • “La recherche en train de se faire” - A . Blanchard • “Deadline is dead”, nouveaux rythmes d’écriture - A. Gunthert • Le séminaire permanent : modèle conversationnel. “Un forum de pairs à ciel ouvert” A. Blanchard • S’enrichir des réflexions et des commentaires de la communauté (lecteurs et blogosphère scientifique = intelligence collective) • Transparence : démocratisation des savoirs, insérer la science dans la société civile, vulgarisation scientifique Adapté de A. Serres : LA blogosphère en sciences humaines et sociales, présentation de la plateforme Hypothèses http://www.slideshare.net/revuesorg/le-blogosphre-en-sciences-humaines-et-sociales-prsentation-de-la-plateforme- hypothses mercredi 2 juin 2010 102
  • 103. Blanchard A. « Ce que le blog apporte à la recherche ». In : Dacos M (éd.). Read/ Write Book [En ligne]. [s.l.] : Cléo/revues.org, 2010. p. 157-166. Disponible sur : < http://cleo.revues.org/172 > (consulté le 30 Mai, 2010) ISBN : 978-2-9536419-0-5 mercredi 2 juin 2010 103
  • 104. Archives Ouvertes et Blogs Les trackbacks Antoine Blanchard (Enro), Ce que le blog apporte à la Recherche, 12/08, http://www.enroweb.com/ blogsciences/index.php?2008/12/04/359-ce-que-le-blog-apporte-a-la-recherche mercredi 2 juin 2010 104
  • 105. Academic Blog Portal Google Blogs Search http://www.academicblogs.net http://blogsearch.google.com/ Trouver des blogs scientifiques mercredi 2 juin 2010 105
  • 106. Open Labs / Open Notebooks Science / Open Data • L’article ne donne pas suffisamment accès aux résultats de la recherche / 95% des résultats de la recherche ne seraient jamais publiés • Rendre public et accessible les résultats d’expérimentations • Mettre à disposition des autres chercheurs, des protocoles de recherche, des données brutes (grilles de calcul (grids), datasets, etc.) • Permettre le transfert de compétences, la vérification et la reproduction des expériences mercredi 2 juin 2010 106
  • 107. OpenWetWare http://openwetware.org mercredi 2 juin 2010 107
  • 108. UsefulChem http://usefulchem.wikispaces.com/ mercredi 2 juin 2010 108
  • 109. MyExperiment http://www.myexperiment.org/ mercredi 2 juin 2010 109
  • 110. Many Eyes http://manyeyes.alphaworks.ibm.com/manyeyes/ mercredi 2 juin 2010 110
  • 111. Nouvelles formes de diffusion de l’IST • Trouver les diaporamas d’une soutenance, d’une présentation à un colloque / une conférence • Trouver une vidéo illustrant un projet de recherche, etc (YouTube edu)... • Podcasts audio : iTunes U • Trouver des images libres de droits (http://www.flickr.com/ creativecommons/) mercredi 2 juin 2010 111
  • 112. Scivee http://www.scivee.tv/ mercredi 2 juin 2010 112
  • 113. mercredi 2 juin 2010 113
  • 114. L’économie de la recommandation mercredi 2 juin 2010 114
  • 115. Socialisation et personnalisation des pratiques informationnelles La pratique des outils ne peut pas être dissociée des questions culturelles et sociales qui l’entoure • Socialisation (> e-science : “we-science”) • Combien de personnes ont lu cet article ? • Quels sont mes “amis” / “ennemis” de lecture ? • Quels sont les autres documents qu’ils ont lu / recommandé ? • Personnalisation (> e-science : “me-science”) • Signaler / référencer / valoriser ses publications • Présenter et gérer sa bibliographie (choses que je lis / que j’ai lu) • Les bibliothèques numériques sont “centrées sur le document” plutôt que “centrées sur le chercheur” • Le chercheur est-il prêt à devenir un nombre ? (ResearcherID, Scopus Author ID, ORCID) Duncan Hull, Bibliography 2.0: A case study from the Wellcome Trust Genome Campus http://www.slideshare.net/dullhunk/nesc-4198183 mercredi 2 juin 2010 115
  • 116. Plateformes de partage de références bibliographiques • Gérer ses références bibliographiques • Partager / recommander / annoter des références • Alimenter une bibliographie sur un sujet à plusieurs (Groupes) • Générer automatiquement ses bibliographies • Favoriser et faciliter la découverte d’articles / mutualiser sa veille avec les autres utilisateurs mercredi 2 juin 2010 116
  • 117. Le social bookmarking pour le chercheur • Communautés spécifiques (recherche, académique) • Fonctionnalités spécifiques (formats biblio, interconnexions avec sites d’éditeurs scientifiques, recherches par auteurs, titre, revue,...) • Pourquoi utiliser un service de partage de citations ? • Possibilité de savoir qui lit les mêmes publications que vous • Possibilité de voir la bibliographie (publique) de cette personne • S’intégrer à un groupe thématique, éventuellement... • ... ou suivre le travail de ce groupe • Bénéficier de reviews sur des articles • Bénéficier d’une évaluation des articles via un système de vote intégré à la plate- forme • Réaliser une veille via des fils RSS d’après A. Marois mercredi 2 juin 2010 117
  • 118. CiteULike http://www.citeulike.org/ mercredi 2 juin 2010 118
  • 119. Texte Connotea http://www.connotea.org/ mercredi 2 juin 2010 119
  • 122. MyPeers http://codingseed.com/ (MacOS) mercredi 2 juin 2010 122
  • 123. Microblogging Twitter : • Réseauter / prendre des nouvelles de ses collègues • Signaler une information / Recommander un article • Solliciter de l’aide sur un sujet • Soumettre une idée, une hypothèse / sentir les nouveaux sujets de recherche • Commenter une conférence en live (réactions, etc) • Tweeter ses articles http://www.phdcomics.com/comics.php?f=1198 mercredi 2 juin 2010 123
  • 124. Saunders N, Beltrão P, Jensen L, Jurczak D, Krause R, et al. 2009 Microblogging the ISMB: A New Approach to Conference Reporting. PLoS Comput Biol 5(1): e1000263. doi:10.1371/journal.pcbi.1000263 mercredi 2 juin 2010 124
  • 125. mercredi 2 juin 2010 125
  • 126. Listorious Ex : Liste sur l’Open Science mercredi 2 juin 2010 126
  • 127. Les SHS qui tweetent http://tweepml.org/?t=1161 mercredi 2 juin 2010 127
  • 128. Topsy Moteur de recherche pour Twitter http://topsy.com/ mercredi 2 juin 2010 128
  • 129. FriendFeed : life (research) streaming Agréger toutes ses activités sur le web http://friendfeed.com/ mercredi 2 juin 2010 129
  • 130. References Wanted http://friendfeed.com/references-wanted mercredi 2 juin 2010 130
  • 131. ScienceFeed http://www.sciencefeed.com/ mercredi 2 juin 2010 131
  • 132. Réseaux sociaux scientifiques • “Facebook du chercheur” • Recherche et découverte d’experts, “collège invisible” • Développer son réseau / Multiplier les partenariats / Édition de CV (2.0) / Participation à des programmes de recherche • Communiquer / Informer / Échanger / S’enrichir (nouvelle sociabilité, intelligence collective, veille mutualisée) • Construire son identité numérique (gérer ses traces) • Attention ! (autorité n’est pas notoriété, affluence n’est pas influence, publicité n’est pas légitimité - Olivier Ertzscheid) mercredi 2 juin 2010 132
  • 133. Comparatif des fonctionnalités http://www.geozon.info/2010/04/15/comparison-chart-of-scientific-networks/ mercredi 2 juin 2010 133
  • 134. Les réseaux sociaux scientifiques mercredi 2 juin 2010 134
  • 135. Les réseaux sociaux d’éditeurs mercredi 2 juin 2010 135
  • 136. Les réseaux sociaux disciplinaires mercredi 2 juin 2010 136
  • 137. Les réseaux sociaux institutionnels mercredi 2 juin 2010 137
  • 138. Nouvelles formes d’évaluations mercredi 2 juin 2010 138
  • 139. “Online or Invisible?” Steve Lawrence - Nature,Volume 411, Number 6837, p. 521, 2001 mercredi 2 juin 2010 139
  • 140. Impact du web 2.0 sur processus d’évaluation • Problème : évaluation tributaire d’éditeurs commerciaux (Thomson : Web of Science et Elsevier : Scopus) • Nouvelles métries basées sur des pratiques sociales, réseaux sociaux et le web (complémentaires à l’évaluation traditionnelle) • Nouvelles formes d’évaluations (open peer commentary, recommandations, annotations, etc) mercredi 2 juin 2010 140
  • 141. Quelques alternatives à Thomson • Eigenfactor : indice pondérant le nbre de citations par le prestige des revues dont elles proviennent (PageRank). Corpus du JCR, sur 5 ans. • Scimago Journal Rank : fondé sur algorithme de Google PageRank. Corpus : Scopus. Evaluation sur 2, 3, 4 ans • Harzing Publish Or Perish et Scholarometer (permettent de retrouver le facteur H d’un chercheur, fondés sur le corpus de Google Scholar) mercredi 2 juin 2010 141
  • 142. Les facteurs d’usage Projet MESUR. http://www.mesur.org mercredi 2 juin 2010 142
  • 143. “Article level metrics” Bollen J, Van de Sompel H, Hagberg A, Bettencourt L, Chute R, et al. 2009 Clickstream Data Yields High-Resolution Maps of Science. PLoS ONE 4(3): e4803. doi:10.1371/journal.pone.0004803 mercredi 2 juin 2010 143
  • 145. “ Enhanced publications” Selon Hubert Guillaud “Les clefs de cette nouvelle organisation de l’information scientifique repose sur : • une présentation hiérarchique du texte et des données qui refonde la structure organisationnelle de l’article, afin que les lecteurs puissent naviguer entre les couches de contenu selon leur niveau d’expertise et d’intérêt. • un résumé graphique qui permet d’acquérir rapidement une compréhension du message du document • mise en évidence des principaux résultats de l’article • on peut naviguer sur l’auteur et son affiliation • l’article peut intégrer de l’audio et de la vidéo • les procédures expérimentales sont accessibles • les listes de citations enrichissent l’environnement de l’article…” Source : http://lafeuille.blog.lemonde.fr/2009/08/20/larticle-scientifique-du-futur/ mercredi 2 juin 2010 145
  • 146. Sur le web = croissance exponentielle “d’objets numériques” d’origines scientifiques (blogs, multimédia, données brutes, etc) • De plus en plus de publications font références à ces objets numériques ➡ Pourtant, dans la plupart des cas, ces données et contenus ne sont pas reliés entre eux mercredi 2 juin 2010 146
  • 147. Linked data • Lier les données entre elles • Le web comme base de données D’après Yann Nicolas mercredi 2 juin 2010 147
  • 148. 9"5*#"&(( ,5%6'( B/C75"'( 8%AA"2#'( ./"'"2#*C%2'( )*+(,%%-'( F(9"G1"H'( 8%&"'( ./"0/12#'( !%&"5'( B56%/1#$A'( .%&7*'#'( !"#$%&'( !%&"5'( 41&"%( 3*#*( .5*2'( E2#"/A"&1*#"( D2#%5%61"'( 9"':5#'( 9"0/%&:71+5";(%/(/*#$"/(<=:55>(':00%/#"&?( Source : Carole Globe, The future of research, http://www.slideshare.net/ dullhunk/the-future-of-research-science-and-technology-presentation mercredi 2 juin 2010 148
  • 149. 9"5*#"&(( ,5%6'( B/C75"'( 8%AA"2#'( ./"'"2#*C%2'( )*+(,%%-'( F(9"G1"H'( 8%&"'( ./"0/12#'( B56%/1#$A'( .%&7*'#'( !"#$%&'( !%&"5'( 41&"%( 3*#*( E2#"/A"&1*#"( D2#%5%61"'( 9"':5#'( 9"0/%&:71+5";(%/(/*#$"/(<=:55>(':00%/#"&?( Source : Carole Globe, The future of research, http://www.slideshare.net/ dullhunk/the-future-of-research-science-and-technology-presentation mercredi 2 juin 2010 149
  • 150. L’article du futur 4 composantes 1. La publication linéaire dite “classique” (le texte, l’argumentation) 2. Les données de la recherche (la preuve) 3. Matériaux supplémentaires (pour illustrer ou clarifier les propos) 4. Données post-publication (commentaires, indicateurs bibliométriques, facteurs d’usages, etc) Source : Saskia Woutersen, The future of scholarly communication: Enhanced Publications, http://indico.cern.ch/ contributionDisplay.py?contribId=67&confId=4832I mercredi 2 juin 2010 150
  • 151. mercredi 2 juin 2010 151
  • 152. mercredi 2 juin 2010 152
  • 153. JoVE : Journal of Visualized Experiments http://www.jove.com/ mercredi 2 juin 2010 153
  • 154. mercredi 2 juin 2010 154
  • 155. Publication liquide http://liquidpub.org/ “des objets évolutifs, collaboratifs et multiformes pouvant être composés et consommés à différents niveaux de détail, remplaçant les journaux et conférences classiques par des collections  Certes, ceci implique qu’on admette le caractère évolutif de l’écrit, son instabilité dans le temps en fonction de l’évolution du savoir, son caractère collaboratif, chacun pouvant apporter sa contribution personnelle, et son caractère multiforme, incluant tous les modes d’expression modernes actuels et à venir. Ceci demande également une révision profonde et une adaptation des méthodes de jugement, préalables à la publication (le peer review) qui devient plus difficile à maintenir en place, et a posteriori, lors de l’évaluation des programmes, des équipes et des individus.” Source : Bernard Rentier, http://recteur.blogs.ulg.ac.be/?p=188 mercredi 2 juin 2010 155
  • 156. Comment expliquer la faible participation des chercheurs ? David Stuart, Web 2.0 fails to excite today's researchers, Research Information, Oct/Nov 2009 mercredi 2 juin 2010 156
  • 157. “(...) Quelles sont les dérives de la communication médiatisée par la technique ? (...) Le cercle vertueux procuré par la « présence Web2.0 » des scientifiques sur le net ne se traduit-il pas essentiellement par un certain nombre d’invitations, de sollicitations à des conférences et à l’écriture d’articles, ces effets positifs participent-ils au renouvellement du débat d’idées ?” Broudoux E, Chartron G. « La communication scientifique face au Web2.0 : Premiers constats et analyse ». In : H2PTM [En ligne]. [s.l.] : Hermès Science - Lavoisier, 2009. p. 323-336. Disponible sur : < http://archivesic.ccsd.cnrs.fr/sic_00424826/en/ > mercredi 2 juin 2010 157
  • 158. Quelques limites • question des données nominatives et privées (e-réputation, gestion des traces) • pérennité de ces outils • données au mains d’acteurs privés ou commerciaux (citeulike : Springer, Connotea : Nature) • Masse critique ? • légitimité et non reconnaissance de ces outils, faible d’incitation de la part des politiques, des institutions • multiplication de ces outils, question de l’intéropérabilité ? mercredi 2 juin 2010 158
  • 159. “L’utilisation à des fins professionnelles des nombreux services gratuits disponibles sur Internet (messagerie électronique, hébergement de sites web, stockage de données,…) suscite de manière générale de sérieuses réserves. En toute rigueur, l’externalisation d’un service n’est concevable que dans le cadre d’un contrat où juridiquement toutes les implications auront bien été étudiées et où techniquement toutes les mesures destinées à assurer la disponibilité, l’intégrité et la confidentialité des informations auront été correctement mises en œuvre. Il est bien évident que l’on ne peut attendre de telles garanties d’un fournisseur de service gratuit. Les risques sont accrus lorsque ce fournisseur est situé à l’étranger.” Source : CNRS/FSD/Sécurité des Systèmes d’Information. Recommandations pour l’utilisation des services gratuits sur Internet. 2008. Disponible sur : http:// www.sg.cnrs.fr/FSD/securite-systemes/documentations_pdf/securite_systemes/ Recommandations%20sur%20les%20services%20gratuits.pdf mercredi 2 juin 2010 159
  • 160. Rôles et opportunités pour les bibliothèques • Médiateurs de l’IST • Formateurs et veilleur (nouveaux outils et nouvelles méthodes de la science 2.0) • Gestionnaires des données, Fournisseurs de métadonnées, garants de la qualité de ces dernières • Diffuseurs de la connaissance • Chargés de la valorisation des contenus • Prestataires de services auprès des chercheurs • Bibliomètres mercredi 2 juin 2010 160
  • 161. Vers des services et outils orientés chercheurs • Les chercheurs ne viennent pas à la bibliothèque. Il faut aller vers eux (se déplacer dans les labos) • Penser au fait que les chercheurs n’utilisent pas qu’une seule bibliothèque, qu’une seule source d’information ou qu’un seul outil ! • Les services de la bibliothèque doivent s’intégrer dans les outils et dans l’environnement numérique de travail du chercheur • La bibliothèque doit disséminer l’information, et ses services, devenir invisible et transparente pour le chercheur mercredi 2 juin 2010 161