Seminario investigacion

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Seminario de investigacion 10 de Noviembre

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Seminario investigacion

  1. 1. Dr. David Cano González Dr. Alfonso Leal Cerro Instituto de Biomedicina de Sevilla Unidad de Gestión Clínica de Endocrinología y Nutrición Hospital Universitario Virgen del Rocío
  2. 2. El análisis directo de los genes y su expresión como herramienta diagnóstica
  3. 3. Diagnóstico Molecular Ejemplos Nuevos métodos 1 2 3
  4. 4. Diagnóstico Molecular Disciplina que captura los patrones de expresión genómicos y proteómicos y utiliza la información para distinguir entre tejidos normales y patológicos con el fin de crear nuevas herramientas para mejor detección y diagnóstico de las enfermedades. National Institute of Health, US
  5. 5. Microarrays Proteínas ADN Tradicional Molecular Genómica Proteómica Patología Bioquímica
  6. 6. - Mayor especificidad, mayor sensibilidad, y mayor rapidez. - Diagnóstico precoz. - Monitorización durante tratamiento - Decisión sobre tratamiento - Coste/Aplicabilidad Diagnóstico Molecular
  7. 7. Name Gene MODY1 HNF-4a MODY2 Glucokinase MODY3 HNF-1a MODY4 IPF-1 (PDX-1) MODY5 HNF-1b MODY6 Neuro-D1 / BETA-2 MODY7 Klf11 MODY8 CEL
  8. 8. Paez JG, Janne PA, Lee JC, Tracy S, Greulich H, Gabriel S, Herman P, Kaye FJ, Lindeman N, Boggon TJ, Naoki K, Sasaki H, Fujii Y, Eck MJ, Sellers WR, Johnson BE, Meyerson M. EGFR mutations in lung cancer: correlation with clinical response to gefitinib therapy. Science 304:1497-500, 2004 Lynch TJ, Bell DW, Sordella R, Gurubhagavatula S, Okimoto RA, Brannigan BW, Harris PL, Haserlat SM, Supko JG, Haluska FG, Louis DN, Christiani DC, Settleman J, Haber DA. Activating mutations in the epidermal growth factor receptor underlying responsiveness of non-small-cell lung cancer to gefitinib. N Engl J Med 350:2129-2139, 2004 Cáncer de pulmón - inhibidores EGFR EGFR somatic mutation
  9. 9. EGFR mutations in lung cancer: Correlation with clinical response to gefitinib therapy. Science 304:1497, 2004 Pre-treatment tumors from treated patients: 6 responders, 4 non-responders
  10. 10. • Medicina Personalizada. •El estudio de la influencia de •las diferencias genéticas en la respuesta a fármacos. Farmacogenómica
  11. 11. Gen de inmunoglobulina ARNm de inmunoglobulina Gen de miosina El miocito tiene ambos genes, pero. . . El linfocito tiene ambos genes, pero. . . No produce ARNm de miosina No produce ARNm de inmunoglobulina Gen de inmunoglobulina ARNm de miosina Gen de miosina Cambios de Expresión Con el Tipo de Célula
  12. 12. Célula normal Célula cancerosa Cambios de Expresión Con el Tipo de Célula
  13. 13.  Una visión general del metabolismo o actividad celular  Interacciones acumulativas de muchos fenómenos difíciles de detectar. ¿Por qué medimos la expresión génica?
  14. 14. Microarrays Proteínas ADN Tradicional Molecular Genómica Proteómica Patología Bioquímica
  15. 15. DNA RNA Proteína metabolito Fenotipo/ patología Medida Genomica Transcriptómica Proteómica Metabolómica, fenómica (etc.) Fácil Díficil
  16. 16.  Genoma ◦ Todas los genes en una célula, tejido, órgano u organismo  Transcriptoma ◦ Todas los transcriptos de ARNm en una célula, tejido, órgano u organismo  Proteoma ◦ Todas las proteínas en una célula, tejido, órgano u organismo Diferentes tipos de “omas”
  17. 17. 1. FORMA TRADICIONAL: Un único gen analizado en múltiples muestras. 2. MICROARRAYS: Miles de genes analizados simultáneamente en una única muestra. Medida de la expresión génica
  18. 18.  Differential Display  Serial Analysis of Gene Expression (SAGE)  Rapid Analysis of Gene Expression (RAGE)  RT-PCR (real-time PCR)  Northern/Southern Blotting  DNA Microarrays or Gene Chips Medida de la expresión génica
  19. 19. Encontrando Genes Con Microarrays Chip de gen ADN ADNc fluorescente Microarreglo escaneado
  20. 20. Utilizando Microarrays para medir la expresión de genes Miocito El ADNc fluorescente del linfocito “ilumina” al gen de inmunoglobulina El ADNc fluorescente de la célula muscular “ilumina” al gen de miosina ADNc fluorescente ADNc fluorescenteARNm de inmunoglobulina ARNm de miosina + transcriptasa inversa Inmunoglobulina Linfocito Miosina + transcriptasa inversa
  21. 21. Perfil expresión génica Perfil génico vs IPI Ash et al. Distinct types of diffuse B-cell lymphoma identified by gene expression profiles. Nature 2000, 403:503-11 Linfomas e Investigación de Microarrays
  22. 22. Linfomas e Investigación de Microarrays Biopsia de nódulo linfático Paciente B con linfoma Paciente A con linfoma Células tumorales de linfocitos “viejos” Quimioterapia estándar ~ 30 por ciento de curación ~ 60 por ciento de curación Células tumorales de linfocitos “jóvenes” Quimioterapia estándar Biopsia de nódulo linfático
  23. 23. Working with Agilent to develop microarray based diagnostic
  24. 24. Genoma Transcriptoma Proteoma Diferentes tipos de “omas”
  25. 25. El Diagnóstico Molecular y la Proteómica Gen Proteínas ARNm
  26. 26. De Muestras Conocidas a Proteínas de Suero Proteínas marcadoras normales Proteínas Espectrometría de masa Muestra de sangre Sano Enfermo “Huella digital” molecular con mejor ajuste Proteínas marcadoras de cáncer Muestra de sangre Proteínas Espectrometría de masa
  27. 27. Los Patrones de Proteínas y el Diagnóstico Patrón ovárico Muestra de sangre del paciente Espectrometría de masa Proteínas Cáncer de ovario
  28. 28. Gracias

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