De zwembroek van een bacterie - JCU thesis

737 views

Published on

Poster van Hans Oude Groeninger, Martijn Dietze en Rolf Klein over hun thesis (profielwerkstuk) op het JCU. Voor de Docentenconferentie Blink uit in bèta.

0 Comments
0 Likes
Statistics
Notes
  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

No Downloads
Views
Total views
737
On SlideShare
0
From Embeds
0
Number of Embeds
1
Actions
Shares
0
Downloads
1
Comments
0
Likes
0
Embeds 0
No embeds

No notes for slide

De zwembroek van een bacterie - JCU thesis

  1. 1. De zwembroek van een bacterie JCU-thesis over de aanpassing van Bacillus subtilis aan veranderende JCU- temperaturen Hans Oude Groeniger, Martijn Dietze, Rolf Klein JCU 2011Achtergrond Opzet onderzoekNet zoals jij en ik, hebben bacteriën last van kou en hitte. Ook Aan de hand van onze onderzoeksvraag konden wij beginnen met onsbacteriën passen zich aan aan deze veranderende onderzoek:omstandigheden. Anders zou eten in de koelkast ook bijna nietbederven. Wat is het verschil tussen de fosfolipidensamenstelling van de B.s. van 20⁰C en 40⁰C?Kou is voor veel bacteriën niet gunstig, zoals voor de door onsonderzochte Bacillus subtilis, een veroorzaker van Ons onderzoek vereiste veel voorbereiding: eerst moesten geschiktevoedselvergifiting. Dat komt doordat het celmembraan door de (steriele) groeimedia worden gemaakt om de bacteriën in te kweken.kou hard en star wordt, het gaat naar de ‘vaste’ fase. Hierdoorkunnen verschillende eiwitten in het celmembraan niet goed Tijdens het groeien van de bacteriën konden de eerste onderzoekenfunctioneren. beginnen: er moest een groeicurve worden opgesteld.Om dit probleem op te lossen Nadat de bacteriën volgroeid waren, konden we de membranen oogsten,heeft de B.s. een mechanisme: en de fosfolipiden isloreren. Dit deden we met een twee-fasen systeemhet bouwt d.m.v. een eiwit van chloroform en methanol (Bligh & Dyer, ’59). Daarna volgde nog eenonverzadigde vetzuren, reeks chemische bewerkingen, tot we de lipiden zo bewerkt hadden, datdie de plek innemen van verzadigde ze klaar waren voor analyse.vetzuren in de fosfolipiden inhet celmembraan. Met de lipiden konden we met verschillende analyse-methoden aan de slag, op een rijtje: ‒ Gaschromatografie (GC) ‒ Differential Scanning Calorimetrie (DSC) ‒ 2D-Thin Layer Chromatography (2D-TLC) ‒ Fluorescentie Hier zijn de plaatjes van respectievelijk de GC en de DSC (die gaven de mooiste resultaten):Met ons onderzoek hebben wij onder leiding van onzebegeleiders Martijn en Joost van de Universiteit Utrechtgeprobeerd aan te tonen dat deze veranderingen in hetcelmembraan daadwerkelijk plaatsvinden.Thesis op het JCUEen van de belangrijkste ervaringen die we hebben gedaan bijonze thesis was het meedraaien in een laboratorium, met alleswat er bij komt: veiligheidsvoorschriften, maar ook het gebruikvan professioneel materiaal.De resultaten zijn voor onszelf direct van minder belang, maarwel meer voor onze begeleiders. Tijdens onze thesis hebben wijveel ervaring opgedaan met onderzoek doen en alles wat daar De meting van de GC berust op verschillen in affiniteit van de ‘mobielebij komt kijken. Daarnaast hebben we ook vakinhoudelijke fase’ voor de ‘stationaire fase’. Elke piek is een andere stof, en ookkennis opgedaan. verschillen tussen verzadigde bindingen en onverzadigde bindingenVoordelen en meerwaarde van het doen van je thesis op het worden weergegeven.JCU zijn bijvoorbeeld: de mogelijkheid om onderzoeken bij eenvakgroep van de UU te doen; een kritische blik van docenten opje werk; veel kennis van de begeleider over jouw specifiekeonderwerp; meewerken aan relevant onderzoek.Waarom je onderzoek zou doen bij de universiteit? Omdat jedan iets hebt gedaan wat mogelijk aansluit bij je vervolgstudie.Onderzoek doen bij de universiteit biedt meer uitdaging voor jeprofielwerkstuk en prikkelt je denkvermogen.Met dank aan De meting van de DSC berust op een piek in warmte-toevoer: dit geeftMartijn Koorengevel (UU) een fase-overgang weer, in dit geval van ‘vloeibaar’ naar ‘vast’Joost Ballering (UU) membraan.Frans Teeuw (JCU) Aan de hand van deze metingen hebben wij kunnen concluderen dat er wel degelijk verschillen zijn tussen de membranen van de B.s. van 20⁰C en de B.s. van 40⁰C. De B.s. heeft zich aan de kou aangepastContactgegevensStuur voor vragen een mailtje naar: - Uit de GC-meting kunnen wij concluderen dat de B.s. 20⁰C meerm.dietze@students.uu.nl onverzadigde bindingen heeft dan de B.s. 40⁰C.r.klein@students.uu.nl - Uit de DSC-meting kunnen wij concluderen dat het membraan van de B.s. 20⁰C aangepast is aan de lagere temperatuur.h.oudegroeniger@students.uu.nl - Uit de 2D-TLC kunnen wij concluderen dat de fosfolipiden in hetDeze poster is gemaakt voor de JCU-Docentenconferentie 2011. membraan van de B.s. 20⁰C anders zijn dan bij de B.s. 40⁰C.

×