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Agricultural Research Service, USDA
Beltsville, MD 20705-2350, USA
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 La selezione genomica aumenta la
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Molti animali sono stati valutati
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ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (4) Cole
Perchè sono importanti le scelte giuste?
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Come funziona la selezione genetica
 ΔG = progresso genetico ann...
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Posso permettermi la genomica?
Numero di SNP 9K 50K 800K
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Quattro modi per usare la genomica
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Come scegliere gli accoppiamenti
 Scelte 3 aziende di US Jersey...
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Confronto con i veri accoppiamenti
 Utilizzate 3 strategie nell...
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Che tori erano disponibili?
Toriutilizzati
Vacche presenti
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Indice genomico reale e consanguineità
Simile distribuzione dei
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Cosa abbiamo imparato dagli esempi
 Ciascuna delle 3 aziende av...
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Scegliere gli animali di elite
 Genotipizzando le tue vacche sa...
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Conclusioni
 Genotipizzare può aumentare il
progresso genetico
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Holstein Association USA
Brattleboro, ...
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Uso e valore economico dei test genomici in azienda

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Italian translation of the slides from my invited talk at the ANAFI Workshop in Cremona in February 2013.

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Uso e valore economico dei test genomici in azienda

  1. 1. John B. Cole Animal Improvement Programs Laboratory Agricultural Research Service, USDA Beltsville, MD 20705-2350, USA john.cole@ars.usda.gov Uso e valore economico dei test genomici in azienda
  2. 2. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (2) Cole Introduzione  La selezione genomica aumenta la risposta alla selezione.  I tori sono stati genotipizzati prima per una questione di costi  Adesso sono state genotipizzate molte più femmine che maschi.  Come usare la genomica per migliorare le proprie scelte in azienda?
  3. 3. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (3) Cole Molti animali sono stati valutati Data Valutazione (YYMM) Genotypes 0 50000 100000 150000 200000 250000 1004 1008 1012 1104 1108 1112 1204 1208 1212 Bulls Cows 335,929 animali genotipizzati
  4. 4. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (4) Cole Perchè sono importanti le scelte giuste? 0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 2010 2011 2012 M:FP = prezzo di 1 kg di latte/ prezzo di 1 kg of razione al 16% di proteina Mese RapportoPrezzo lattealimento Luglio 2012: Prezzi granaglie Soia: $15.60/bu (€0.46/kg) Mais: $ 7.36/bu (€0.23/kg)
  5. 5. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (5) Cole Come funziona la selezione genetica  ΔG = progresso genetico annuale  reliability = misura della certezza con la quale valutiamo un animale (genomica )  selection intensity = quanto siamo “puntigliosi” nel fare le nostre scelte selettive (la gestione può )  genetic variance = variabilità osservata nella popolazione dovuta alla genetica (non possiamo modificarla molto)  generation interval = tempo che passa tra 2 generazioni (genomica )
  6. 6. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (6) Cole Posso permettermi la genomica? Numero di SNP 9K 50K 800K Prezzo USA €32 €92 €184 Prezzo Internazionale €41 €100 €192
  7. 7. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (7) Cole Quattro modi per usare la genomica  Verifica parentela  E’ davvero l’animale che penso sia?  Pre-selezione o eliminazione  Sto tenendo gli animali giusti?  Accoppiamenti  Come produrre i migliori vitelli/e  Identificazione vacche di elite
  8. 8. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (8) Cole …se l’ascendente mancante è stato genotipizzato: 92% Animale Mancante Mancante 98% 100% Se l’ascendente è stato genotipizzato, lo troviamo !
  9. 9. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (9) Cole 0% 10% 20% 30% 40% 50% 60% 0-2 months 3-15 months 16-23 months 2 yr- olds 3 yr- olds 4 yr- olds 5 yr- olds 6 yr- olds 7 & older 73% hanno meno di 15 mesi di età! Manze genotipizzate negli USA
  10. 10. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (10) Cole Ora sappiamo quale manza è la migliore La migliore ha un PTA NM$ di +868 e REL di 73%. La peggiore ha un PTA NM$ di +48 e una REL di 68%. PLANET ha 3,783 figlie genotipizzate – quale volete nella vostra azienda?
  11. 11. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (11) Cole -600 -400 -200 0 200 400 600 Non è possibile conoscere il suo valore genetico (Net Merit –NM$) Senza pedigree, sono tutte uguali! GeneticMeritforNM$ 46 US Holsteins – genitori sconosciuti
  12. 12. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (12) Cole -600 -400 -200 0 200 400 600 Variazione nel Valore Genetico (NM$) dopo la genotipizzazione GeneticMeritforNM$46 US Holsteins – animali genotipizzati
  13. 13. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (13) Cole -600 -400 -200 0 200 400 600 Se eliminiamo il peggior 10% La media dei rimanenti è di +$99.2 più alta GeneticMeritforNM$ I peggiori animali possono essere eliminati
  14. 14. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (14) Cole Come scegliere gli accoppiamenti  Scelte 3 aziende di US Jersey  Confrontati gli accoppiamenti esistenti con altri possibili  Avremmo potuto scegliere meglio?  I dati si riferiscono a 220 accoppiamenti effettivi ottenuti a partire da 142 vacche/tori
  15. 15. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (15) Cole Confronto con i veri accoppiamenti  Utilizzate 3 strategie nella simulazione  Piani di accoppiamento che usano EBV tradizionali e genomici come descritto da Pryce et al. (2012)  Scelta del genitore con DGV + alto  Numero massimo di figli/e per toro:10
  16. 16. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (16) Cole Che tori erano disponibili? Toriutilizzati Vacche presenti Vitelli genotipizzati Ciascun toro viene accoppiato con tutte le vacche Vitelli nati dagli accoppiamenti reali. Vitelli simulati
  17. 17. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (17) Cole Indice genomico reale e consanguineità Simile distribuzione dei valori genomici (DGV) Diverse distribuzioni delle parentele – diversi gruppi di tori
  18. 18. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (18) Cole Cosa abbiamo imparato dagli esempi  Ciascuna delle 3 aziende avrebbero potuto fare scelte migliori  Le differenze tra I metodi sono minime  La consanguineità è sempre una preoccupazione  Negli USA, molti allevatori non usano un programma di accoppiamento!
  19. 19. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (19) Cole Scegliere gli animali di elite  Genotipizzando le tue vacche saprai quali animali poter contrattare come madri di toro  …saprai anche il valore degli embrioni ottenuti da un flushing  Vendere gli animali di elite può rappresentare una fonte di ricavi addizionale http://vet.tufts.edu/tas/dairy_farm_ services/embryo_transfer_service. html
  20. 20. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (20) Cole Conclusioni  Genotipizzare può aumentare il progresso genetico  Gli errori di paternità possono essere corretti  Le scelte selettive più accurate possono far risparmiare denaro  Migliore scelta degli accoppiamenti produce migliori vitelli  La genetica di elite può essere commercializzata http://houston.cowparade.com/cow/large/917
  21. 21. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (21) Cole Ringraziamenti Tom Lawlor Holstein Association USA Brattleboro, VT Albert De Vries Department of Animal Sciences University of Florida, Gainesville, FL Paul VanRaden, Dan Null, and Tabatha Cooper Animal Improvement Programs Laboratory, ARS, USDA Beltsville, MD
  22. 22. ANAFI Workshop, Cremona, Italy, 7 February 2013 (22) Cole Domande?

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