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Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage
Le déploiement de la
génomique en bovin
viande
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Introduction
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Dans les populations allaitantes
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Les évaluations génomiques IBOVAL
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Les évaluations génomiques IBOVAL
1. Principe de l’évaluatio...
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Principe de l’évaluation génomique
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« L’évaluation
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• Un service de qualité :
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Offre raciale au service des éleveurs
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Constitution de l’offre
• Mâles (Puce MD):
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Tests kit BlondoTyp
• Tests sur haplotypes :
Axonopathie
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Service de Génotypage
• Piloté par SAS Gen&Blond
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Sommet2016 Le déploiement génomique en bovin viande

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Conférence organisée par l'Institut de l'Elevage et présidée par Jean-Marc Alibert, Président de la commission bovin viande de FGE et Président du Herd-Book Limousin.

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Sommet2016 Le déploiement génomique en bovin viande

  1. 1. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Le déploiement de la génomique en bovin viande • UMT 3G (INRA, Institut de l’Elevage et Allice). • APIS-GENE, Charolais France, France Limousin Sélection et France Blonde d’Aquitaine Sélection. • Sociétés d’exploitation des races Charolaise, Limousine et Blonde d’Aquitaine : Herd-Book Charolais, Charolais Univers, Gènes Diffusion, France Limousin Sélection et France GEN&BLOND. 1
  2. 2. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Le déploiement de la génomique en bovin viande Présentation de l’outil génomique IBOVAL UMT 3G : • INRA : Thierry Tribout, Eric Venot • Allice : Romain Saintilan, Marine Barbat, Laure Hugues • Institut de l’Elevage : Philippe Boulesteix, Armelle Govignon-Gion, Jean Guerrier 2
  3. 3. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Introduction 3 Depuis quelques années, nouvelle approche pour estimer la valeur génétique des animaux :l’Evaluation Génomique En place chez Bovins Laitiers depuis plusieurs années Principe : Index classiqueIndex Génomique
  4. 4. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 4 Dans les populations allaitantes françaises Actions complémentaires • GPSAB • DEGERAM • … Programmes de recherche • QUALVIGENE • GEMBAL Au cours des dernières années : Génotypage de plusieurs milliers d’individus dans les populations allaitantes mise en place d’évaluations génomiques
  5. 5. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 5 Les évaluations génomiques IBOVAL Evaluations Génomiques IBOVAL :  Phase d’études  mise en place officielle fin 2015  dans populations Charolais, Limousin, Blonde Index Génomiques : • naissance & sevrage ferme - IFNAIS, CRsev, DMsev, DSsev, FOSsev, ISEVR - AVel, ALait, MERPsev, IVMAT • croissance & conformation carcasse jeunes bovins - ICRCjbf, CONFjbf, IABjbf
  6. 6. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 6 Les évaluations génomiques IBOVAL 1. Principe de l’évaluation génomique 2. Les index génomiques IBOVAL - comment sont ils calculés en pratique ? - gains de précision / index IBOVAL classiques
  7. 7. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 7 Principe de l’évaluation génomique x x x ♂ ♀ ♂ ♀ ♂ ♀ Population (race) Echantillon de la population : performances et génotypes = « Population de Référence » 1
  8. 8. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 8 Performance d’un individu de la Popul. de Référence ~ Moyenne performance individuelle & performances des descendants Génotypes : prélèvement de sang, poils, semence  extraction ADN  en laboratoire, on regarde quelle base est portée par l’individu = « génotype » de l’individuMarqueur SNP Performances et Génotypes
  9. 9. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 9 A quoi sert la Population de Référence ? Génome de l’individu i chr1 chr2 chr3 Génome de l’individu j chr1 chr2 chr3 Génome de l’individu k chr1 chr2 chr3 La position des QTL sur les chromosomes et leurs effets sur les caractères sont inconnus ! Population de Référence favorable défavorable
  10. 10. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 10 A quoi sert la Population de Référence ? Génome de l’individu i Génome de l’individu j Génome de l’individu k chr1 chr2 chr3 chr1 chr2 chr3 chr1 chr2 chr3 marqueurs SNP Population de Référence
  11. 11. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 11 A quoi sert la Population de Référence ? Génome de l’individu i Génome de l’individu j Génome de l’individu k chr1 chr2 chr3 chr1 chr2 chr3 chr1 chr2 chr3 Population de Référence
  12. 12. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 12 A quoi sert la Population de Référence ? estimation de l’effet de chaque marqueur sur chacun des caractères évalués Equation de prédiction de la Valeur Génomique Directe « DGV » Utilisable sur n’importe quel animal génotypé, même s’il n’appartient pas à la Population de Référence
  13. 13. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 13 Principe de l’évaluation génomique x x x ♂ ♀ ♂ ♀ ♂ ♀ Population (race) Echantillon de la population : performances et génotypes = « Population de Référence » 1 Equations de prédictions des valeurs génomiques (« effets marqueurs ») 2 Application des équations de prédictions aux génotypes des reproducteurs et candidats à évaluer  Valeur Génomique Directe « DGV »
  14. 14. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 14 Qualités d’une bonne Population de Référence La Population de référence doit être de grande taille en pratique : plusieurs milliers d’individus nécessaires sinon, valeur génomique mal estimée pour certains individus La Population de référence doit être représentative de la population à évaluer Les individus de la Population de Référence doivent (idéalement) avoir un phénotype précis
  15. 15. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 15 Qualités d’une bonne Population de Référence Impact de la précision du phénotype des individus de la Population de Référence : 0 0,2 0,4 0,6 0,8 1 h2=0,9 h2=0,3Individus avec 1 perf. individuelle Taureaux avec 100 descendants contrôlés h² = 0,30 Précision (CD) des DGV Taille de la Population de Référence D’après Goddard, 2009 reproducteurs avec descendants contrôlés : très importants !
  16. 16. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 16 Taille des Population de Référence Ensemble des individus disponibles 06/2016 Charolais Limousin Blonde Indexations Naissance-Sevrage Effet direct poids-conditions naissance 15 000 6 600 5 600 Effet direct croissance-morpho sevrage 12 500 5 600 2 800 – 3 900 Effet maternel conditions de naissance 5 200 3 300 3 000 Effet maternel croissance au sevrage 4 500 2 400 2 100 Indexations Croissance Conformation Carcasse jeunes bovins AGA – CONF - PCAR 2 400 1 750 720
  17. 17. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 17 Taille des Population de Référence Charolais Limousin Blonde Indexations Naissance-Sevrage Effet direct poids-conditions naissance ~1 800 ~2 700 ~1 200 Effet direct croissance-morpho sevrage ~1 500 ~2 400 ~1 000 Effet maternel conditions de naissance ~500 ~200 ~200 Effet maternel croissance au sevrage ~450 ~500 ~200 Indexations Croissance Conformation Carcasse jeunes bovins AGA – CONF - PCAR ~600 ~400 ~300 Pour l’instant, précision modeste des DGV, mais va augmenter ! Taureaux avec nombreux descendants contrôlés 06/2016 Tous les animaux sont utiles !
  18. 18. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 18 Production des Index Génomiques Si parents connus & dans base contrôlée : Index IBOVAL classiques Performances et généalogies Valeur Génomique Directe DGV Information de la Population de Référence toute l’information disponible est valorisée Index Génomique : GEBV = combinaison Index IBOVAL classique Valeur Génomique Directe précision GEBV > précision Index IBOVAL classique > précision Valeur Génomique Directe DGV
  19. 19. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 19 Production des Valeurs Génomiques En bref … • Pour tout animal génotypé (veau, taureau, vache) : Cas 1: index IBOVAL classique disponible (individuel ou sur ascendance) index génomique GEBV, accompagné d’un CD (précision) Cas 2: pas d’index IBOVAL classique  DGV = « indicateur génomique » Plus de détails dans la présentation suivante …
  20. 20. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 20 Intérêts des Index Génomiques GEBV Index Génomiques GEBV plus précis que Index IBOVAL actuels • estimation plus précise et plus précoce de la VG qu’avec index IBOVAL classique, sans avoir à attendre la mise à la reproduction et le contrôle des 1ers produits jeune individu (♂ ou ♀) sans descendant contrôlé (veau, embryon) : Information de la Population de Référence Performances et généalogies Information supplémentaire contenue dans génotypes  gain de précision (CD)
  21. 21. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 21 0,00 0,05 0,10 0,15 0,20 0,25 0,30 0,00 0,20 0,40 0,60 0,80 1,00 CD index IBOVAL classique IFNAIS ISEVR IVMAT MERPsev Ex : Charolais veau issu de MN 0,00 0,05 0,10 0,15 0,20 0,25 0,30 0,00 0,20 0,40 0,60 0,80 1,00 CD_GEBV-CD_EBVpoly CD index IBOVAL classique IABjbf ICRCjbf Gains de précision par rapport aux index IBOVAL classiques index CD de l’index IBOVAL classique CD de l’index génomique GEBV IFNAIS 0,30 0,40 (+33%) ISEVR 0,27 0,33 (+22%) IVMAT 0,25 0,34 (+36%) MERPsev 0,20 0,29 (+45%) +0,10 CD_GEBV–CD_IBOVALclassique
  22. 22. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 22 Intérêts de la Sélection Génomique possibilité de mise à la reproduction plus précoce  raccourcissement de l’intervalle entre générations  progrès génétique plus rapide Intérêt pour caractères exprimés - tardivement - dans un seul sexe
  23. 23. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 23 Conclusions  mise en place progressive pour autres caractères et dans autres races Génotyper des vaches (femelles) pour augmenter la précision des index aptitudes maternelles ! Gain de précision, qui augmentera avec la taille des Populations de Référence  continuer à génotyper & mesurer performances ! Eval. Génomiques IBOVAL officielles : depuis fin 2015 Charolais, Limousin, Blonde d’Aquitaine - Naissance – Sevrage - Croissance et Conformation Carcasse JB
  24. 24. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Le déploiement de la génomique en bovin viande Valorisation de l’outil génomique GeMBAL  IBOVAL génomique • APIS-GENE • Charolais France, France Limousin Sélection et France Blonde d’Aquitaine Sélection • Institut de l’Elevage 24
  25. 25. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage APIS-GENE mandataire de la valorisation • Représente les co-propriétaires des 4 apports clés : - Matériel biologique - Données / BDD / Formules 25 Nouvelle technologie d'évaluation génomique GeMBAL Formules Base de Données Données • Assure la diffusion de la technologie au travers d’une ou plusieurs Sociétés d’Exploitation  contrat de licence • Gère et perçoit, pour le compte des copropriétaires, les redevances perçues au titre de l’exploitation et : - les redistribue aux co-propriétaires - réinvesti dans de nouveaux programmes de recherche
  26. 26. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Les bénéficiaires potentiels de valeurs génomiques 26
  27. 27. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Populations ‘cibles’ retenues par chacun des Organismes de Sélection raciaux pour le calcul des index génomiques 27 Animaux concernés Charolaise Limousine Blonde d’Aquitaine Mâles Inscrits « race pure certifiée » ou inscriptibles de pères et de mères inscrits « A » au livre généalogique (LG) D’au moins 9 mois, « certifiables » au LG et soumis au Contrôle des Performances Viande (formule complète VA4) Soumis à la Certification de la Parenté Bovine (CPB) Femelles Des adhérents au Contrôle des Performances Viande (formule complète VA4) Des adhérents à la Certification de la Parenté Bovine (CPB) Toutes, aucune restriction
  28. 28. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Différés raciaux de publication pour les mâles • Âge minimal commun aux mâles de la race Race Blonde d’Aquitaine : 18 mois d’âge, sauf pour les veaux contrôlés en SE-CI Race Limousine : 28 70 à 130 + CD - - - à +++ Rien Moins de 9 mois De 9 à 24 mois Plus de 24 mois Moins de 9 mois De 9 à  10- 11 mois* Plus de  10- 11 mois* * : animal effectivement mis en contrôle (avec double pesée début) Resté en ferme Passé en SECI
  29. 29. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage SIG Mise en œuvre pratique(1/3) 29 Client Prélèvement/Génotypage Résultat IPVgéno ‘DGV’ Société d’Exploitation ♀ avec parenté déclarée et résultat de génotypage Parenté non compatible etc. Parenté non démentie etc. Conformité demande Hors CPB Pas de calcul Diffusion privée INRA-CTIGUMT 3G * ** *** ********* Mauvais Plutôt mauvais Moyen Plutôt bon Bon IPVgéno = Indicateur Précoce de Valeur génomique
  30. 30. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Mise en œuvre pratique(2/3) 30 Client Prélèvement/Génotypage Résultat Parenté compatible, etc. NOK Pas de calcul Conformité demande Société d’Exploitation Parenté non compatible etc. UMT 3G Filiation pas nécessairement certifiée SIG Index ‘poly’ pour le caractère + DGV ♂/♀ avec parenté déclarée et résultat de génotypage Diffusion privée ‘DGV’ ‘GEBVprov’+CD IPVgéno INRA-CTIG
  31. 31. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Mise en œuvre pratique(3/3) 31 SIGClient Prélèvement/Génotypage Résultat OK GEBV +CD Parenté compatible, etc. Pas de calcul Conformité demande Société d’Exploitation Parenté non compatible etc. Filiation certifiée SIG Index poly. (EBV) pour le caractère + DGV ♂/♀ avec parenté déclarée et résultat de génotypage Publication officielle ‘immédiate’ ou différée Publication officielle UMT 3G INRA-CTIG
  32. 32. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Refonte des règles de publication des index avec l’arrivée de la génomique(1/2) • Dans un souci de simplification et d’harmonisation Un maximum de critères (CD) communs entre évaluations Déconnexion complète des index naissance-vêlage de tout autre index pour publication ISEVR demeure la « pierre angulaire » des diffusions pour les éleveurs au moins au CPV en VA4 Dès qu’ISEVR est publiable les autres index de sélection le sont s’ils respectent leurs propres règles de diffusion Maintien de la différence d’expression des index en fonction de leur  grande comparabilité au niveau racial 32
  33. 33. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Refonte des règles de publication des index avec l’arrivée de la génomique(2/2) • Plus particulièrement pour les index IBOVAL enrichis d’informations du génome Femelles Aucune contrainte particulière de publication Mâles Aucune contrainte de performance de descendant prise en compte dans les indexations mais une précision minimale (CD) nécessaire pour chaque index • Notion de différé ‘Client’ Le différé ‘Client’ consiste, au-delà du différé racial, à pouvoir retarder la diffusion officielle des index, ceci pendant un maximum de180 jours Applicable pour les mâles et femelles Peut être levé par le ‘Client’ à tout moment 33
  34. 34. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Le déploiement de la génomique en bovin viande Présentation de l’offre en Charolais du Herd-Book Charolais • Herd-Book Charolais 34
  35. 35. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage photo photo PERFORMANCES SAVOIR-FAIRE INNOVATION 35
  36. 36. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage UNE OFFRE RECONNUE PAR TOUS LES ACTEURS DU MONDE DE L’ÉLEVAGE DEPUIS 2009, RÉALISÉE DE FAÇON COLLECTIVE : FRANCE GÉNÉTIQUE ÉLEVAGE LES RÉSULTATS SONT CALCULÉS PAR LES RÉGLES DE PUBLICATION SONT DÉFINIES PAR L’INRA 36
  37. 37. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage ** si père et mère connus en SNP Les Index Génomiques (GEBV) La Certificatio n Race Pure Certifiée* La Vérification de Compatibilité Génétique** UNE OFFRE UNIQUE: 4 SERVICES INCLUS DANS LE TARIF 1 2 3 Recherche des caractères culard et sans corne 4 * Si animal inscriptible 37
  38. 38. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Index Génomique : Combinant les valeurs polygéniques & génomique directe NAISSANCE: IFNAIS LAIT: ALAIT VÊLAGE: AVEL MORPHOLOGIE CROISSANCE IDENTIFIER LES MEILLEURS REPRODUCTEURS DEV MUSCULAIRE- DEV SQUELETTIQUE POTENTIEL DE CROISSANCE FINESSE D’OS QUALITÉS MATERNELLES + le gène Culard + le gène Sans Corne la filiation+ + + BVD proposé en option 38
  39. 39. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage l’éleveur reste maître et libre de sa génétique ! Pas d’obligation de signer de contrat en préambule. Le résultat est directement restitué et l’éleveur en reste le seul propriétaire. Il décide de l’avenir de l’animal sans aucune clause exigée par le HBC. LES GARANTIES HBC  LES RÉSULTATS SONT LA PROPRIÉTÉ DE L’ÉLEVEUR  OBTENTION DES RÉSULTATS SANS DIFFÉRÉ EN MOINS DE DEUX MOIS  L’INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS PAR L’EXPERT HBC 39
  40. 40. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage UN PRÉLÈVEMENT À TOUT MOMENT... PAR L’EXPERT RACIAL HBC OU PAR L’ÉLEVEUR** • Sous réserve de l’obtention d’un agrément auprès de son EDE. COMMENT ? 40
  41. 41. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage LA TRANSMISSION DES RÉSULTATS
  42. 42. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 42 Prix * proposé à l’unité Inscription incluse pour les animaux inscriptibles Prix groupé MÂLE 120 € FEMELLE 93 € 10 FAITES = 1 GRATUITE (84.50€ /génotypage) COUPLE 209 € Meilleur Prix du Marché LES TARIFS HBC * En option BVD au tarif de 5 euros HT/ animal. * + 19€ par parent inconnu en SNP • OFFRE DE LANCEMENT 2016 Nouvel Adhérent HBC et AJEC: lors de la 1ère commande, remise de 10% sur les 10ers génotypages
  43. 43. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Le déploiement de la génomique en bovin viande Présentation de l’offre en Charolais de Charolais Univers • Charolais Univers 43
  44. 44. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Offre génotypage Charolais Original •Une marque pour une offre complète •Du prélèvement aux résultats •1er bilan 2016 44
  45. 45. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Une marque pour une offre complète • Une marque Charolais Original utilisée par les coopératives adhérentes et les distributeurs. • Une offre complète Filiation Gènes d’intérêts Indexation IBOVAL génomique utilisant la technologie Gembal 45
  46. 46. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Une marque pour une offre complète •Identification des gènes d’intérêts Gène Culard Gène Sans Cornes Anomalies génétiques  Ataxie progressive du charolais  Blind  DEA (sans poils et sans dents) 46
  47. 47. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Du prélèvement aux résultats • Exemple de protocole pour un mâle * 47 Prélèvement Génotypage des GI Mâle porteur (homo ou hétéro) sur au moins 1 anomalie Pas de génotypage GEMBAL Génotypage GEMBAL Mâle non porteur d’anomalies Transmission des résultats (Filitaion +GI) Transmission des résultats ( Filiation + GI +GEMBAL) * : A compter du 1/11/2016
  48. 48. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Du prélèvement aux résultats • Fiche résultats XPERF Manager 48
  49. 49. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Du prélèvement aux résultats • Tarification 2016/2017 * 49 * : A compter du 1/11/2016 Quantité de génotypages (par commande) 1 à 9 10 à 24 25 et + Gènes d'intérêts seuls + filitation (Ataxie + Blind + DEA + SC + Mh) 47 € 47 € 47 € Mâles (54 k) (GI + GEMBAL + filiation) 129 € 109 € 95 € Femelles (10k) (GI + GEMBAL + filiation) 69 € 59 € 56 € Si mâle vierge d'anomalie ou femelle non homozygote porteuse alors indexation GEMBAL automatique
  50. 50. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 1er bilan 2016 • 2744 génotypages réalisés à fin septembre 2016 50 752 431 335 1226 Mâles Femelles Schéma CH UNIVERS Grands Comptes
  51. 51. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Le déploiement de la génomique en bovin viande Présentation de l’offre en Charolais de Gènes Diffusion • Gènes Diffusion 51
  52. 52. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage « L’évaluation génomique pour tous » • Historique • Offre Génomique Gènes Diffusion 52 Juin-2009 Création de la plateforme Génomique GD Scan Sept-2010 Démarrage du programme de recherche Vache/Veau Juin-2014 Offre de Génotypage GD Scan 38 Oct-2015 Offre de Génotypage GD Scan 38 + Evaluation Génomique IBOVAL Fev-2016 Offre VCG Juin-2016 Nouveaux index GD Scan 11 969 animaux indexés + 4213 animaux indexés VCG 1299 animaux filiés
  53. 53. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Offre 53 6 index Production 9 index Morphologie au sevrage 2 index Comportement 4 index Morphologie post-sevrage 21 index génomiques (dont 15 de différenciation) 2 Gènes d’intérêts Identification Génétique (200 SNP) Gène Culard (Mh / +) Gène Polled (P / +) Population Cible: Tous les animaux CHAROLAIS (code 38 )
  54. 54. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Offre 54 12 index génomiques Population Cible définie par
  55. 55. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Offres Complémentaires: Identification Génétique, Vérification de Compatibilité Génétique, Gène Mh 55 Plateforme Identification Génétique Vérification de Compatibilité Génétique Gène Culard (Mh)
  56. 56. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Tarification des Offres 56
  57. 57. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage • Témoignage de Jean-Pierre LETHENET (Eleveur Charolais dans l’Ain) GAEC de l’ALLIANCE 80 vêlages d’automne 91 GDScan Femelles réalisés 57 Les 1ères confirmations
  58. 58. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 58 Questions ? Merci de votre attention
  59. 59. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Le déploiement de la génomique en bovin viande Présentation de l’offre en Limousin de France Limousin Sélection • France Limousin Sélection et Ingenomix 59
  60. 60. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Une offre de service complète Un seul échantillon pour un service complet : • IngenomiX est officiellement habilitée par FGE pour réaliser des profils ADN et rendre des VCG. Les données sont transmises au SIG. • Calcul des index génomiques officiels par l’INRA. • Evaluation de la valeur génomique pour 7 caractères : FN, CR, DM, DS, FOS, AL, AV. • Recherche du gène culard : mh. • Recherche du gène sans corne en option. 60
  61. 61. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Une offre de service complète 61 FEMELLEMÂLE Résultat IBOVAL génomique selon éligibilité. G E M B A L D G V Score génomique sur 10. FN CR DM DS FOS AL AV MH Gène culard inclus +/- HP Sans corne en option Profil ADN + Filiation incluse 7 Caractères inclus dans l’outil
  62. 62. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Une offre originale 62
  63. 63. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Une offre originale 63 Scores génomiques de l’animal, de 1 à 10 Scores pour lesquels les animaux sont en moyenne à 100 en IBOVAL => Déterminez si l’animal sera améliorateur ou non sur ce caractère Visualisation graphique des résultats => Repérez en un coup d’œil les points forts et les points faibles de votre animal Informations sur l’animal
  64. 64. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Le meilleur rapport qualité / prix 64 Evaluations génomiques Filiation Mutations EVALIM complet 7 caractères. EVALIM Modulo 2 caractères. + Recherche mutations en option. Recherche culard et sans corne Evaluations génomiques Test mâle 199 € - Test femelle 89 € 55 € 1 caract. supp - + 8 € - - Filiation Filiation Inclus - 5 € - Profil ADN Inclus + 10 € 20 € - Profil ADN + Filiation inclus + 15 € 25 € - Mutations Caractère "Culard" inclus + 8 € +5 € 22 € Caractère "Sans corne" + 10 € + 10 € +5 € 22 € Culard + "Sans corne" - + 15 € 10 € 27 €
  65. 65. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Un service opérationnel • Un service de qualité : Une équipe disponible à votre écoute pour toutes questions concernant : - les VCG : les prélèvements, le profil ADN, les filiations incompatibles, - les évaluations génomiques, l’interprétation des résultats… • Un service efficace : Des résultats depuis 2011 avec des délais de traitement de 2 à 3 mois. • Un service accessible à tous : Un réseau de distributeurs sur tout le territoire. Pour nous contacter : www.ingenomix.fr 65
  66. 66. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Le déploiement de la génomique en bovin viande Présentation du service de génotypage BLOND • SAS France GEN&BLOND – France Blonde d’Aquitaine Sélection - AURIVA 66
  67. 67. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 67 Offre raciale au service des éleveurs •Outil à la disposition de tous : Population cible large •Diffusion d’un outil génomique au plus près des préoccupations des éleveurs : Intégration de la Filiation et des Gènes d’Intérêt •Valorisation de la participation au phénotypage : Remise aux éleveurs en VA4 •Des précautions techniques : Différé racial pour les mâles jusqu’à 18 mois
  68. 68. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 68 Constitution de l’offre • Mâles (Puce MD): Kit de base : VCG + Tests : 90€  Réduc de 30€ pour les mâles filiés + résultat de transloc 1/29 connu + en VA4 (=> “Rattrapage Axono” possible si participe à la pop de rèf) – Valable jusqu’au 31/05/2017 Option indexation (à partir de 18 mois) : +160€ (réduc 40€ si VA4) • Femelles (Puce LD): VCG + Tests + Index : 90€ (réduc 20€ si VA4)
  69. 69. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 69 Tests kit BlondoTyp • Tests sur haplotypes : Axonopathie Translocation 1/29 • Tests sur mutation : Gène de Muscularité Blonde Gène de coloration de robe Gène Polled
  70. 70. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 70 Service de Génotypage • Piloté par SAS Gen&Blond • Exclut les mâles candidats au programme de sélection • S’appuie sur un réseau de distributeurs locaux ou vendeurs “agréés” • Contact : gen-blond@gmail.com, France Blonde d’Aquitaine Sélection, AURIVA
  71. 71. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage 71
  72. 72. Sommetdel’Elevage2016-Lesconférencesdel’Institutdel’Elevage Merci de votre attention Venez échanger avec nos ingénieurs Hall 1, stand C77 Retrouvez les diaporamas de nos conférences sur idele.fr 72

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