études sur la présence de trayons surnuméraires en espèces caprines, perspectives de sélection.

1. En route pour un observatoire national des anomalies génétiques
Illustration avec l’étude des trayons surnuméraires
Virginie Clément, idele
Isabelle Palhière, INRAE
Journée OMACAP – UMT SPR, 15 octobre 2020

2. Volet 2 : Etude des trayons surnuméraires
Stage d’Amaury Duflos
(UniLaSalle, 2019)

3. Qu’est-ce qu’un trayon surnuméraire ?
 Polythélie : présence d’un ou plusieurs
trayons supplémentaires, reliés par
un canal auxiliaire à la citerne principale
ou à une citerne surnuméraire
 2 types : liés à un développement
différent pendant la vie embryonnaire
 Trayons non fonctionnels
 Trayons fonctionnels : éjection du lait
Existe dans les deux sexes, chez tous les mammifères, avec
des fréquences variables

4. Fréquence dans la population caprine
française
0
0.5
1
1.5
2
2.5
3
3.5
4
Alpines Saanen Alpins Saanen
Pourcentage
Tr. Surnuméraires
(Fonct. + N fonct.)
Non fonctionnels
Fonctionnels
Femelles Mâles
Population : animaux pointés par Capgènes de 1995 à 2019 (n=618 782)
=> Probablement sous-estimé

5. Problématique
 Aspect sanitaire : réservoir de germes et risque
d’infection
 Aspect bien-être animal : ablation par certains
éleveurs
 Aspect économique : difficulté de traite, réforme
des chèvres
 Aspect génétique : perte de charge au niveau du
schéma de sélection et réduction du progrès
génétique
Pourcentage de jeunes boucs éliminés
Alpins 8,5%
Saanen 4,7%
Martin, 2016

6. Evolution au cours du temps
=> Diminution des fréquences au cours du temps
0
0.5
1
1.5
2
2.5
3
3.5
4
4.5
1995 1997 1999 2001 2003 2005 2007 2009 2011 2013 2015 2017
Pourcentage
Millésimes des chèvres
Evolutions des fréquences par millésimes
Fonct+Non Fonct Tr Non Fonct Tr Fonct

7. Analyses descriptives
99% des boucs (avec au moins 100 filles) ont des
filles porteuses de trayons surnuméraires dans leur
descendance
78% des élevages sont concernés avec un
pourcentage de chèvres porteuses parfois élevé
0
100
200
300
400
500
0,008
0,023
0,038
0,053
0,068
0,083
0,098
0,113
0,128
0,143
0,158
0,173
0,188
0,203
0,218
0,233
Fréquence / élevage de chèvres avec trayon(s) surnuméraire(s)
Nombredecheptels

8. Etude du déterminisme génétique
Détection de QTL (Martin, 2016) : pas de gène à effet
majeur sur Fonct + Non Fonct
Déterminisme de type polygénique
Héritabilités faibles :
Corrélation génétique Tr Fonct/Tr Non Fonct = 0,29
Pas de lien génétique avec les autres postes de
morphologie mammaire
Tr. Non Fonct. Tr Fonct. Tr F + Tr NF
Alpine 0,07 0,05 0,08
Saanen 0,05 0,06 0,08
=> Permet d’envisager la mise en place d’une évaluation génétique

9. Performance : présence/absence d’un ou plusieurs
trayons surnuméraires chez les chèvres
3 caractères : fonctionnels / non fonctionnels /
fonctionnels + non fonctionnels
Génotypes des boucs d’IA
Utilisation d’un modèle linéaire
Mise en place d’une évaluation
génomique

10. Mise en place d’une évaluation
génomique
Evolution du pourcentage de filles porteuses de trayons fonctionnels
par classe d’index des pères
Pères avec au minimum 100 filles
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
<-0,075 [-0,075;-0,05[ [-0,05;-0,025[ [-0,025;0[ [0;0,025[ >0,025
Pourcentagemoyendefilles
porteuses
Classes d'index des pères

11. Conclusions
 Des résultats à confirmer
Limites :
 Variable binaire alors que les méthodes utilisées suppose que la
variable est linéaire
 Fréquence faible
 Collecte non exhaustive
 Définition du caractère : Fonctionnel/non fonctionnel, 1 ou plusieurs
trayons surnuméraires
 Cas particulier d’anomalie génétique :
 Pas de gène majeur donc pas de test ADN de dépistage possible
 Mise en place d’une évaluation génétique

12. Merci pour votre attention