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Présentation de stage

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Présentation de stage

  1. 1. Introduction aux caractéristiques visuellesidentifiables à partir d’une trace biologique Geneviève Blais Supervisée par Dr Tatiana Scorza
  2. 2. Plan de l’exposéIntroduction Différentes méthodes d’identificationLes STR (Single Tandem Repeat) Obtention d’un profil génétique Analyse d’un profil génétiqueLes SNP (Single Nucleotide Polymorphism) Identification génétique par les SNP Variations physiques possibles avec les SNP Techniques de détection des SNP
  3. 3. IntroductionEmpreintes digitales commepolymorphismeQue faire lorsqu’on ne trouvepas d’empreintes?Identification d’un suspect àpartir d’une trace biologique Sang Salive Sperme Sécrétions Halder et al, 2008
  4. 4. Introduction (suite)Polymorphisme de longueur: les STRSTR (Short Tandem Repeat) 2 à 5 nucléotides 5 à 50 répétitionsObtention d’un profil Banque nationale de données génétiques Référence du suspect par mandat (sang ou salive)Que faire lorsqu’un profil est nul ou partiel?Nouvelle technologie: les SNP (Single Nucleotide Polymorphism)
  5. 5. Introduction (suite)Polymorphisme de séquence: les SNP (Single Nucleotide Polymorphism)BGA (Bio Geographical Ancestry): différencier l’ethnie Africains Américains Asiatiques de l’Est EuropéensÉtudes toujours en cours Pigmentation des yeux Pigmentation de la peau Pigmentation des cheveuxBut: Déterminer l’utilité d’une méthode complémentaire aux STR avec l’éventuelle méthode discriminatoire avec les SNP
  6. 6. Les STR: obtention d’un profilPrélèvement, extraction etpurification de la trace biologiqueAmplification par PCR mulptiplexavec la Taq polyméraseChoix de 13 STRÉlectrophorèse capillaire (tensionde 1 kilovolt)Transfert des bandes en pics par Coquoz, 2003un logiciel informatique
  7. 7. Les STR: obtention d’un profilSTR = séquences répétées entandem, polymorphisme delongueurDifférentes tailles de STR pourdifférentes bandes demigration Coquoz, 2003Quelle bande correspond àquel STR?Utilisation de 4 à 5 couleurs defluorochromes fixés auxamorcesAnalyse d’un profil génétique Coquoz, 2003
  8. 8. Les STR: analyse d’un profilChaque ligne correspond à uncolorant fluorescentÉchelle de référence en rougeProfil génétique d’unesuspecte Chromosome XAllèles des STR identifiés parle nombre de répétitions 2 numéros pour le génotype 15/17 pour vWA 16/16 pour D3S1358 Profil complet Cas réel d’homicide, 2007, LSJML
  9. 9. Les SNP: identification par les SNP En 2006, 5 millions de caractérisés Retrouvés environ toutes les 500 bases Polymorphisme limité à 4 allèles Pouvoir d’identification plus élevé si 30 à 80 SNP à l’étudeKeyser et Petkovsi, 2006 Tests validés en sciences judiciaires Mini séquençage avec ADNmt Chromosome Y Marqueurs pour cheveux roux
  10. 10. Les SNP: variations physiques possiblesProfil partiel ou nulMéthode ultime: portrait robot avec l’ADNNouvelle technologie pratiquée (ADN non codante) Orientation géo-génétique (BGA, Bio Geographical Ancestry) Renseigne sur la région géographique d’appartenanceAutres études en cours (ADN codante) Couleur de l’iris: SNP visés dans les gènes HERC2 et OCA2 Couleur de la peau: SNP visés dans les gènes OCA2 et TYR
  11. 11. Les SNP: techniques de détection des SNP Analyse et lecture des SNP complexe Différentes méthodes utilisées pour identifier les SNP Puces à ADN Électrophorèse MALDI-TOF Sanger, UK Puces à ADN (Illumina) 1 million de SNP par puce 30 millions de puits Marqueurs par fluorescence Recherches toujours en cours pour l’identification par marqueurs visuels Illumina, USA
  12. 12. ConclusionMéthode avec les STR Établie, validée et fonctionelle en sciences judiciaires Banque nationale de données génétiques établie Permet l’analyse de plusieurs marqueurs à la fois Échec possible lors de profils partiels ou nulsMéthode avec les SNP Utilisée aux États-Unis et en Europe Complémentaire aux STR lors de profils partiels avec BGA Coûts éventuels pour transférer les STR en SNP au niveau de la BanqueValidation obligatoire pour utilisation des SNP en milieu judiciaireÉtudes éventuelles sur le rapprochement des amorces plus prochede la séquence à isoler en PCR
  13. 13. Remerciements Merci à: Martine Lapointe, Spécialiste en ADNFrançois Julien, Spécialiste en ADN – Scènes de crimes Références majeures:Coquoz R. 2003. Preuves par l’ADN. La génétique au service de la justice. ScienceDirect Pubmed
  14. 14. Questions?

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