Bioinfo - Grad - 7

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Bioinfo - Grad - 7

  1. 1. + Bioinformática Mapeamento e Montagem de Transcritoma Gabriel da Rocha Fernandes Universidade Católica de Brasília gabrielf@ucb.br - fernandes.gabriel@gmail.com
  2. 2. + Objetivos 2 nMontar os reads em transcritos (sem genoma referência) nIdentificar novos transcritos (genoma referência) nQuantificar a expressão dos genes.
  3. 3. + Ferramentas nMontagem de novo n Trinity n Oases (Velvet) nMapeamento n Bowtie n BWA n Maq n TopHat 3
  4. 4. + Do que preciso para o mapeamento nGenoma Referência: n Fasta (mapeamento) n GenBank ou GFF (quantificação) 4
  5. 5. + Splicing alternativo 5
  6. 6. + Fusão Genica 6
  7. 7. + Quantificando 7

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