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Guia de estudio para el examen de admision

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Guia de estudio para el examen de admision Maestria en Ciencias en Ingenieria Bioquimica

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Guia de estudio para el examen de admision

  1. 1. BIOINGENIERÍA TEMARIO GUIA PARA EL EXAMEN DE ADMISIÓN DE LA MAESTRIA EN CIENCIAS EN INGENIERÍA BIOQUÍMICA (M. en B. Sergio Esteban Vigueras Carmona) TEMAS • Clasificación y metabolismo microbiano (Ref. 1) • Diseño de medios de cultivo (Ref. 1 y 4) • Balance de materia y energía en fermentadores (Ref. 2) • Cinética microbiana y enzimática (Ref. 3 y 6) • Reactores homogéneos y heterogéneos (Ref. 5) • Esterilización de medios de cultivo y aire (Ref. 3) • Dogma central de la biología molecular (Ref. 1 y 7) BIBLIOGRAFÍA 1. Madigan, Martinko y Parker, Brock: Biología de los Microorganismos, octava edición, Ed. Prentice Hall. 2. Bioreactions Engineering Principles. J. Nielsen & J. Villadsen. Ed. Pelnum Press. New York. 1994 3. Quintero, Ingeniería Bioquímica: teoría y aplicaciones, Ed. Alambra Mexicana, 1993. 4. Aiba S., Humphrey A. E. y Millis N. F. Biochemical engineering, segunda edición, New York y Londres, Academic Press, Inc, 1973. 5. Levenspiel O. The Chemical Reactor Omnibook, Chemical Engineering Department, Oregon State University, Library of congress Catalog Card Number: 79-88693, 1979. 6. Segel I. H., Biochemical Calculations, New York, John Wiley & sons, Inc., 1968. 7. Smith C.A. y Wood E. J., Biología molecular y biotecnología, (María Cristina Sanginés Franchini), México D.F., Addison Wesley Longman de México S.A de C.V., 1998.
  2. 2. BIOQUIMICA GENERAL TEMARIO GUIA PARA EL EXAMEN DE ADMISIÓN DE LA MAESTRIA EN CIENCIAS EN INGENIERÍA BIOQUÍMICA (Dr. Alfonso Totosaus & Dr. Ignacio García-Martínez) 1. Principios de bioquímica. Principios y perspectivas. La vida, los procariotas, eucariotas y el origen de la vida. Soluciones acuosas: Propiedades del agua. Ácidos, bases y reguladores. Principios de Termodinámica: Leyes de la termodinámica. Energía libre. Equilibrio químico. 2. Biomoléculas. Aminoácidos y Proteínas: Aminoácidos de las proteínas. Actividad óptica. Aminoácidos no estándares. Técnicas de purificación y caracterización de proteínas: Aislamiento, solubilidad, separación cromatográfica, electroforesis, ultra centrifugación. Estructura covalente de las proteínas: Determinación de la estructura primaria, modificación de las proteínas, evolución química, síntesis de polipéptidos. Estructura tridimensional de las proteínas: Estructura secundaria, proteínas fibrosas, proteínas globulares, estabilidad de las proteínas, estructura cuaternaria. Plegamiento de las proteínas, dinámica y evolución estructural de las proteínas: Plegamiento de las proteínas, dinámica proteica y evolución estructural. Función de las proteínas: Hemoglobina, estructura, mecanismo, hemoglobinas anormales, regulación alostérica. Azúcares y polisacáridos: Monosacáridos, polisacáridos, glicoproteínas. Lípidos y membranas: Clasificación y propiedades. Membranas biológicas, ensamble y blancos proteicos, proteínas unidas a lípidos y lipoproteínas. 3. Mecanismos de acción enzimática. Introducción a las enzimas: Perspectiva histórica. Especificidad por sustrato. Coenzimas. Regulación de la actividad enzimática. Nomenclatura. Velocidad de reacción enzimática Cinética química y enzimática. Inhibición, efecto del pH y la temperatura. Reacciones bisustrato. Catálisis enzimática: Mecanismo catalítico. 4. Metabolismo Introducción al metabolismo: Mecanismos de reacción orgánica. Termodinámica de los compuestos con grupos fosfatos. Reacciones de oxido-reducción. Termodinámica de la vida. Glicólisis: Vía, reacciones, fermentación. Control del flujo metabólico. Metabolismo de otras hexosas además de la glucosa. Metabolismo del glucógeno: Degradación y biosíntesis. Control del metabolismo del glucógeno. Enfermedades.
  3. 3. Transporte a través de membranas: Termodinámica del transporte. Cinética y mecanismo de transporte. Transporte activo dirigido por ATP y gradiente de protones. Ciclo del ácido cítrico: Resumen. Fuente metabólica del Acetil-CoA. Enzimas de la vía. Regulación. Naturaleza anfibólica de la ruta. Transporte de electrones y fosforilación oxidativa: La mitocondria. Transporte de electrones. Fosforilación oxidativa. Control de la producción del ATP. Otras vías del metabolismo de carbohidratos: Gluconeogénesis. Ruta del glioxilato. Biosíntesis de oligosacáridos y glicoproteinas. Ruta de las pentosas fosfato. Fotosíntesis: Cloroplastos. Reacciones luminosas. Reacciones en ausencia de luz. Metabolismo de lípidos: Digestión, absorción y transporte de lípidos. Oxidación de ácidos grasos. Biosíntesis de ácidos grasos. Regulación del metabolismo de lípidos. Colesterol. Fosfolípidos y glicolípidos. Metabolismo de aminoácidos: Desaminación. Ciclo de la urea. Degradación de aminoácidos. Precursores. Metabolismo de nucleótidos: Estructura química de nucleótidos, nucleósidos y bases. Síntesis y degradación. BIBLIOGRAFÍA BÁSICA Campbell, Mary K. y Farrell, S. O. (2004). Bioquímica. México; Thomson. Lehninger, A. L., Nelson, D.L., Cox, M. M. y Cuchillo, C. M. (2005). Principios de Bioquímica. Barcelona: Ediciones. Omega. Voet, D. y Voet, J. G. (2006). Bioquímica. México: Thomson.
  4. 4. ESTADISTICA TEMARIO GUIA PARA EL EXAMEN DE ADMISIÓN DE LA MAESTRIA EN CIENCIAS EN INGENIERÍA BIOQUÍMICA 1. Concepto de variable aleatoria: discretas y continuas 2. Medidas de tendencia central y de dispersión: media, mediana, moda, varianza y desviación estándar 3. El teorema de límite central 4. Distribuciones de probabilidad: binomial, Poisson, t de Student, chi-cuadrada y normal. 5. Intervalos de confianza 6. Prueba de hipótesis Bibliografía sugerida: - Daniel. W. W. 2002. Bioestadística, base para el análisis de las ciencias de la salud. Cuarta edición en español. Ed. Limusa-Wiley, México. - Jonson, R. 1990. Estadística elemental. Grupo Editorial Iberoamérica, México. - Pagano, M. y Gauvreau, K. 2001. Fundamentos de bioestadística. Segunda edición. Ed. Thomson learning, México. - Velasco, S. G. y Wisniewski, P.M. 2001. Probabilidad y estadística para ingeniería y ciencias. Ed. Thomson learning, México. - Prat, B.A., Tort-Martorell, L.X., Grima, C.P. y Pozueta, F.L. 2000. Métodos estadísticos, control y mejora de la calidad. Ed. Alfaomega, México.
  5. 5. MICROBIOLOGÍA TEMARIO GUIA PARA EL EXAMEN DE ADMISIÓN DE LA MAESTRIA EN CIENCIAS EN INGENIERÍA BIOQUÍMICA INTRODUCCIÓN A LA MICROBIOLOGIA INDUSTRIAL Desarrollo histórico de la Microbiología Industrial. Productos y procesos microbianos de interés industrial. Grupos microbianos de interés para la industria. Esquema general de los procesos de fermentación industrial. 1.- Estructura y Función de los organelos. Estructuras membranales y transporte. Permeabilidad. Movimiento a través de la membrana. Compartimientos intracelulares y distribución de proteínas. Núcleo. Retículo endoplásmico. Peroxisomas. Mitocondrias. Cloroplastos. Endocitosis y secreción. Aparato de Golgi. Endosomas. Lisosomas. Mitocondrias, cloroplastos y conversión de energía. 2.- Aspectos Diversidad microbiana. Microorganismos procarióticos, eucarióticos, arqueobacterias, comparación estructural y funcional. Microorganismos heterótrofos y autótrofos; aerobios y anaerobios. Microorganismos anaerobios facultativos, quimiolitotróficos. Microorganismo fijadores de nitrógeno libres y simbióticos. 3.- Cinética de crecimiento microbiano. Métodos de determinación del crecimiento microbiano. Curvas de crecimiento. Determinación de parámetros cinéticos. Rendimientos celulares. BIBLIOGRAFIA.
  6. 6. J.M., Parker J. (2003) Brock Biology of Microorganisms. 10a ed. Prentice Hall International, Inc. New Jersey, E.U. Tortora G.J., Funke B.R., Case C.L. (2001) Microbiology, an introduction, 7a ed. Addison Wesley Logman, E.U. Allen, M. M. «Cyanobacterial cell inclusions». Annual Review of Microbiology 38:1-25, 1984. Considera los efectos de la privación de nutrientes y de la nutrición sobre los carboxisomas, vacuolas de gas, inclusiones lipidicas y otras inclusiones celulares. Ferris, F. G., y T. J. Beveridge. «Functions of bacterial cell surface structure». BioScience 35:172-177, 1985. Thomas, L. The Lives of a Cell Notes of a Biology Watcher. New York: Viking Press, 1974. Ensayos profundos y entretenidos, por un médico e investigador, que incluyen algunos sobre la evolución de las células eucarióticas y la importancia de los microbios. Unwin, N. y R. Henderson. «The structure of proteins in biological membranes». Scientific American, 250(2):78-94, febrero 1984. Ingraham, J. L.; Maaloe, O. y Niedhardt, F. C. 1983. Growth of the bacterial cell. Sunderland, Mass: Sinauer. Kolter, R. 1992. Life and death in stationary phase. ASM News 58:75-79 Marr, A. G. 1991. Growth rate of Escherichia coli. .Microbiological Reviews 55:3l6-33. Mynell, G. G., y Mynell, E. 1970. Theory and practice in experimental bacteriology. New York: Cambridge University Press. MANUAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY. 2ª Ed. Demain, A.L. y Davies. J.E. (1999). ASM Press. PRINCIPLES OF FERMENTATION TECHNOLOGY. 2ª ed. Stanbury, Whitaker & Hall. (1998). Butterworth-Heinemann BASIC BIOTECHNOLOGY. 2ªEd. Ratledge,C. y Kristiansen, B.. (2001).Cambridge University Press. BIOTECNOLOGÍA, TRATADO DE MICROBIOLOGÍA APLICADA. Crueger, W. y Crueger, A. (1989). Acribia. BIOTECNOLOGÍA, PRINCIPIOS BIOLÓGICOS. Trevan, M.D., Boffey, S. Goulding, K.H. y Stanbury, P. (1990).Acribia. PRINCIPIOS DE INGENIERIA DE LOS BIOPROCESOS. Pauline M. Doran (1998) Acribia. BIOCHEMICAL ENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY HANDBOOK. B.Atkinson 2º ed (1991) Stockton Press. MICROBIAL PHYSIOLOGY. Moat, A.G. y Foster, J.W. 3ª ed. (1995). John Wiley and Sons. BIOLOGÍA MOLECULAR Y BIOTECNOLOGÍA. Walker, J.M. 3ª ed. (1997). Acribia.

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