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Presentacion de taller 2015 1.pdf

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Diapositivas de la presentación oral del Taller "Cienciometría, Información e Informática para Ciencias Biológicas" el día 02 de julio de 2014 en el Anfiteatro Alfredo Barrera de la Facultad de Ciencias, UNAM

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Presentacion de taller 2015 1.pdf

  1. 1. Taller: Cienciometría, información e informática para Ciencias Biológicas Profesores: Dra. Layla Michán Aguirre M. en C. Patricia Magaña Rueda Biól. Diana Ramírez Álvarez Biól. Eduardo Alvarez López
  2. 2. Disciplina científica especializada en caracterizar, estudiar, recolectar, sistematizar, preservar, curar, recuperar, clasificar, evaluar, procesar, compartir, usar, publicar, visualizar y analizar cualitativa y cuantitativamente por procesos computacionales la literatura biológica, los datos y los conocimientos asociados a ésta, de manera innovadora y óptima para la obtener nuevo conocimiento, resolver problemas y tomar decisiones. Informática Biológica
  3. 3. Meta-análisis Manejo Recuperación Búsqueda Métodos Análisis de las Ciencias Biológicas Impacto de la revolución digital en biología Difundir •Estructura •Desarrollo •Tendencias •Métodos •Patrones •Relaciones Herramientas electrónicasBibliometría Análisis de redes Minería de textos Semántica Teorías
  4. 4. Estudios métricos de la información
  5. 5. Objetivo general El estudiante realizará una investigación de informática basado en el análisis cuantitativo y cualitativo de literatura biológica y los metadatos asociados para resolver un problema biológico en el área de biomedicina o biodiversidad, durante 2 años (4 niveles) de taller.
  6. 6. Nivel I. Web para Bibliografía Nivel III. Meta-análisis de literatura Nivel II. Colecciones bibliográficas Nivel IV. Tesis
  7. 7. Nivel Criterios I y II 95% Asistencia indispensable para presentar los exámenes 40% Dos exámenes parciales: uno teórico y uno práctico 40% Trabajo final (Revisión escrita y presentación oral del trabajo) 20% Tareas III 95% Asistencia indispensable para presentar los exámenes 30% Dos exámenes parciales: uno teórico y uno práctico 50% Trabajo final: tema de tesis tentativo (Revisión escrita y presentación oral del trabajo) 20% Tareas IV 95% Asistencia indispensable para presentar los exámenes 20% Dos exámenes parciales: uno teórico y uno práctico 60% Trabajo final: avance de tesis (pregunta documental, evaluación de colecciones, hipótesis, método establecido, resultados) 20% Presentación oral de los avances de tesis (Incluyendo resultados) Evaluación
  8. 8. PROYECTOS ACTUALES
  9. 9. Biodiversidad
  10. 10. Creacion de colecciones de literatura en biodiversidad Conceptualización colecciones Estandarización y curación de información biodiversidad Establecimiento de metadatos Objetos digitales Análisis de la información en biodiversidad Estudios métricos de la información Obtención de indicadores bibliométricos Tendencias de investigación en biodiversidad Biodiversidad
  11. 11. Biomedicina
  12. 12. Estructuración de información biomédica Creación de tesauros Creación de catálogos Estándares en biomedicina Bases de datos biomédicas Creación de colecciones biomédicas Ciberinfraestructura en las bases de datos biomédicas Biomedicina
  13. 13. ➢ Creación de tesauros farmacológicos. ➢ Identificación y modificación de plantilla de estándares para curación de datos farmacológicos. ➢ Diseño de estructura para datos farmacológicos. ➢ Adecuación de estándares internacionales a plantillas y catalogación de datos farmacológicos. ➢ Curación de datos biomédicos. ➢ Elaboración de vocabularios controlados para reacciones adversas y efectos secundarios para creación de calculadoras de posología. ➢ Análisis y tendencias de la literatura especializada en biomedicina. ➢ Análisis y recuperación de información de bases de datos biomédicas. ➢ Generación de competencias informacionales para profesionales, académicos y comunidad que utiliza información para ciencias biomédicas. Biomedicina
  14. 14. ➢ Revisión de temas fármaco-fisio-cardiovasculares ➢ Revisión de patentes para cardiología ➢ Revisión bibliográfica sobre fármaco-fisio-cardiovasculares ➢ Revisión sobre la Superfamilia Conoidea ➢ Revisión de ○ Conotoxinas (Conidae) ○ Augertoxinas (Terebridae) ○ Turritoxinas (Turridae) ➢ Revisión bibliográfica sobre venenos de animales marinos ➢ Revisión de trabajos sobre Venómica de animales marinos ➢ Revisión bibliográfica de polimorfismos (SNP´s) mexicanos ○ Base de datos bibliográfica y SNP´s en cáncer Biomedicina
  15. 15. Mineria de textos Se refiere al proceso de derivar información de alta calidad a partir de texto, por medio de la detección de tendencias y patrones cualitativa y cuantitativamente en documentos.
  16. 16. Mineria de textos Obtención de patrones de reacciones adversas entre medicamentos oncológicos Minería de términos estructurados farmacológicos para la determinación de interacciones Descubrimiento de conocimiento basado en literatura de recursos no maderables de importancia forestal en México Análisis de la colección bibliográfica de la RSMHN por medio de la minería de textos
  17. 17. Semántica terminología estructura INTEROPERABLES Integración de la información Integración de la terminología
  18. 18. Semántica Las redes de relaciones como fuente de conocimiento, recuperado por web. ● Capa XML: se encuentra en el nivel inferior y es la que permitirá estructurar los datos. ● Capa RDF: es la capa siguiente, tiene a su cargo la definición de la semántica de los datos. ● Capa Ontology: luego viene la capa que define las relaciones entre los recursos. ● Capa Logical: es la capa superior y define las reglas y mecanismos para hacer inferencias sobre los datos. ● Capas Proof y Trust: ejecutan y evalúan juntas las reglas de la capa lógica para determinar la fiabilidad del recurso. Aquí es donde interviene la firma digital, el concepto de comercio seguro. TOMADO DE. Interacciones.com.ar, (2003). Web semántica, ontologias y rdf | Interacciones. [en línea] Disponible en: http://www.interacciones.com.ar/web-semantica-ontologias-y-rdf/ [Consultado 11 mayo 2014].
  19. 19. Resultados En proceso de titulación 9 tesistas CIIB 2 tesistas en colaboración Actualmente 6 publicaciones CIIB 5 publicaciones en colaboración
  20. 20. Apoyos Proyecto PAPIME “Web 2.0 y 3.0 para el dominio de la literatura biológica” Proyecto CONACYT “El impacto de las Tecnologías de la Información y la Comunicación (TICs) en las Ciencias Biológicas 1980-2011”
  21. 21. Reunion informativa Día: Lunes 04 de agosto de 2014 Hora: 10:00 am Lugar: Laboratorio CIIB Edificio B de Biología Tercer Piso
  22. 22. Contacto Dra. Layla Michán Aguirre laylamichan@ciibunam.com M. en C. Patricia Magaña Rueda patricia@ciibunam.com Biól. Diana Ramírez Álvarez coordinacionbiodiversidad@ciibunam.com Biól. Eduardo Alvarez López eduardoalvarez@ciibunam.com Edificio B de Biología Tercer Piso Tel. 56228222 ext. 44707 http://ciib.unam.mx:8080/

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