Vigilancia centinela de virus respiratorio chavez-09-feb-11

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  • * 07/16/96 * ##
  • Vigilancia centinela de virus respiratorio chavez-09-feb-11

    1. 1. VIGILANCIA CENTINELA DE INFLUENZA Y OTRO VIRUS RESPIRATORIOS Gloria Chauca, Maria Gamero, Jane Ríos, Merly Sobero, Juan Pérez,Patricia Aguilar, Josefina García, Mónica Nieto, Ruth Centeno, Sonia Ampuero, Alberto Laguna, Eric Halsey, Edward Chávez, Víctor Ocaña, Centro Salud Militar Trujillo
    2. 2. METODOS DE IDENTIFICACION• Cultivo celular: CPE y IFA• PCR/Secuenciamiento
    3. 3. FLUJOGRAMAAislamiento viral de una línea celular Extracción de RNA RT-PCR FLU A FLU B Purificación de ADN Secuenciamiento Subtipo
    4. 4. LÍNEA CELULAR MDCK• Células de riñón canino (Madin- Darby Canine Kidney)• Aislamiento virus de influenza A y B• ECP: Forma de vacuolización y degeneración celular
    5. 5. LÍNEA CELULAR VERO• Células de riñón de mono verde africano• Aislamiento de Adenovirus, VRS, Herpes, Enterovirus• ECP: Formación de sincitios y destrucción celular
    6. 6. LÍNEA CELULAR LLCMK2• Células de riñón de mono Rhesus• Aislamiento de Parainfluenza, Influenza, Metapneumovirus• ECP: celulas pequeñas redondas granulares y refringentes, sin grandes sincitios en muchos casos
    7. 7.   ABRIL JUNIO AGOSTO ESTUDIO DE INFLUENZA – - PERU MAYO LABORATORIO NMRCD - LIMA, PERU AÑO 2008Total De Sujetos Enrolados 58 1 1No. De Sujetos Con Muestra Procesada 56 1 1No. De Sujetos Con Cultivo Viral Pendiente* 2 0 0 Positivos: 43 1 0 Adenovirus FLU A 42 1 FLU A-HSV FLU A-Para FLU 1 FLU B HSV 1 FLU 1 RSV Negativo 13 1 Genotipificación FLU A & B Total 42 1 FLU A 42 1 A/H1 28 1 A/H3 Genotipificación no realizada 14 FLU B 0 0 Genotipificación no realizada*Resultado De Prueba Rápida En Muestra Con Cultivo Viral 2 0Pendiente FLU A 2 FLU B Negativo No resultado
    8. 8.  ESTUDIO DE INFLUENZA – - PERUREPORTE DE RESULTADOS AÑO 2009 DIC-ENE FEBRERO MARZO ABRILTOTAL SUJETOS ENROLADOS 14 16 16 31No. de sujetos con muestra procesada 14 0 16 31No de sujetos con cultivo viral pendiente* 0 16 0 0 Positivos: 5 0 12 16 Adenovirus-Enterovirus 0 1 Adenovirus-Enterovirus 70/71 0 Adenovirus-HSV 0 2 Adenovirus-Para Flu 3 0 Adenovirus 0 Enterovirus-Coxsakie B 0 11 Enterovirus 70/71 0 4 Flu A 0 10 Flu B-Adenovirus 0 Flu B 5 HMPV 0 HSV 0 Para Flu 1 0 Para Flu 2 0 Para Flu 3 0 Negativo 9 0 15 Total muestras positivas Influenza A & B 5 12 15 Total muestra genotipificadas 3 0 3 Flu A 0 0 3 H1N1 0 Flu B 3 Illinois 0 Mississippi 0 Nevada 3 Texas 0 Washington 0*Resultado de prueba rápida en muestras con cultivo viralpendiente 0 16 FLU A 0 4 0 FLU B 0 Negativo 0 12 No resultado 0
    9. 9. CENTRO MEDICO MILITAR TRUJILLO 2009 2010 ESTUDIO DE INFLUENZA - PERU - NMRCD JUL AGO SEP OCT NOV DIC TOTAL ENE FEBTotal sujetos enrolados 184 221 388 308 382 279 1762 73 149 Cultivo viral: Total muestras procesadas 70 2 80 37 107 207 503 63 52 Muestras con cultivo viral pendiente* 114 219 308 271 275 72 1259 10 97 Positivos 49 1 43 20 69 138 320 32 15 Adenovirus 2 0 0 0 0 2 0 1 Adenovirus - HSV 0 0 0 0 0 0 0 1 Coxsackie B 1 0 0 0 0 1 0 0 Coxsackie B - HSV 0 0 0 0 1 1 0 0 Echovirus 0 0 0 68 1 69 0 0 Enterovirus 2 1 0 0 0 129 132 31 1 Enterovirus - FLU A 0 42 19 0 0 61 0 0 Enterovirus - HSV 0 0 0 0 5 5 0 0 FLU A 42 0 0 0 0 42 0 0 FLU A - HSV 1 0 0 0 0 1 1 0 FLU A - Para FLU 2 0 0 0 0 0 0 0 0 FLU A - RSV 0 0 0 0 0 0 0 0 FLU B 0 0 0 0 1 1 0 1 HMPV 0 1 1 1 0 3 0 0 HSV 1 0 0 0 0 1 0 3 HSV - RSV 0 0 0 0 0 0 Para FLU 1 0 0 0 1 1 0 Para FLU 2 0 0 0 0 0 2 Para FLU 3 0 0 0 6 RSV 0 0 0 0 No Aislamiento viral 21 1 37 17 38 69 183 31 37 *Resultado de prueba rapida en muestras con 219 308 271 275 1259 10 viral pendiente 114 72 97 Influenza A 47 96 157 143 143 25 611 1 10 Influenza B 0 1 1 1 0 0 3 0 1 Positivo 3 4 2 1 1 1 12 0 0 Negativo 64 118 145 123 128 46 624 9 82 Sin resultado 0 0 3 3 3 0 9 0 4 Influenza A(H1N1)v (RT-PCR): Positivo 85 77 82 39 28 6 317 5 17 Negativo 71 77 82 45 26 12 313 9 131 Pendiente 28 67 224 224 328 261 1132 59 1 Bocavirus (RT-PCR): Positivo 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Negativo 0 1 75 2 2 0 80 0 0 Pendiente 184 220 313 306 380 279 1682 73 149
    10. 10. ESTUDIO DE INFLUENZA - PERUREPORTE DE RESULTADOS DESDE EL 05 DE NOVIEMBRE DEL 2010 AL 06 DE DICIEMBRE DEL 2010LABORATORIO NMRCD, LIMA-PERU Total PERU Count % Arequipa Junin Cusco Lima Callao Piura Ucayali Madre De Dios La Libertad Tumbes Iquitos Yurimaguas Total 1190 100.0 3 117 58 15 13 234 26 16 92 159 347 110 Numero de Pacientes con Cultivo Viral: 961 80.8 0 117 57 4 5 163 26 16 68 87 308 110 Positivos 547 56.9 0 82 22 1 1 102 15 1 32 38 196 57 Negativos 414 43.1 0 35 35 3 4 61 11 15 36 49 112 53 En Proceso 229 19.2 3 0 1 11 8 71 0 0 24 72 39 0 Numero de virus aislados (cultivo): Adenovirus 20 3.7 0 3 0 0 0 5 1 1 0 5 3 2 Enterovirus 2 0.4 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 FLU A 330 60.3 0 49 7 1 1 45 13 0 16 11 132 55 FLU B 171 31.3 0 27 13 0 0 45 0 0 16 17 52 1 HMPV 1 0.2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 Para FLU 1 15 2.7 0 0 0 0 0 5 1 0 0 3 6 0 Para FLU 2 2 0.4 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Para FLU 3 10 1.8 0 1 2 0 0 2 0 0 0 2 3 0 Para FLU 4 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 Co-Infecciones: Adenovirus - FLU A 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 Adenovirus - FLU B 1 0.2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 Adenovirus - Para FLU 2 1 0.2 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Adenovirus - Para FLU 4 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 Enterovirus - Para FLU 1 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 gPCR-RT Total muestras procesadas 448 37.6 3 16 6 15 13 129 3 1 89 8 154 11 FLU A 197 44.0 0 12 6 5 8 81 0 0 35 0 42 8 H1N1 (SW) pandémico 9 4.6 0 0 3 0 2 0 0 0 4 0 0 0 FLU A Estacional H1 0 0.0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 FLU A Estacional H3 188 95.4 0 12 3 5 6 81 0 0 31 0 42 8 FLU B 91 20.3 0 2 0 0 0 22 0 1 17 2 47 0 Negativo 160 35.7 3 2 0 10 5 26 3 0 37 6 65 3
    11. 11. ESTUDIO DE INFLUENZA - PERU REPORTE DE RESULTADOS DESDE EL 06 DE DICIEMBRE DEL 2010 AL 05 DE ENERO DEL 2011 LABORATORIO NAMRU-6, LIMA-PERU Total PERU Madre de Count % Arequipa Callao Junin Cusco Iquitos Lima Piura Puno Trujillo Tumbes DiosTotal 780 100.0 31 14 13 30 302 39 83 2 4 50 212 Numero de Pacientes con Cultivo Viral: 717 91.9 31 10 0 30 281 36 76 0 0 46 207 Positivos 422 58.9 13 3 0 13 180 12 55 0 0 21 125 Negativos 295 41.1 18 7 0 17 101 24 21 0 0 25 82 En Proceso 63 8.1 0 4 13 0 21 3 7 2 4 4 5 Numero de virus aislados (cultivo): Adenovirus 10 2.4 0 0 0 0 0 5 1 0 0 0 4 Enterovirus 2 0.5 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 FLU A 311 73.7 4 3 0 11 147 5 42 0 0 9 90 FLU B 90 21.3 7 0 0 2 31 1 12 0 0 12 25 HMPV 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 Para FLU 1 6 1.4 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 4 Para FLU 2 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 Para FLU 3 4 0.9 1 0 0 0 0 2 0 0 0 0 1 RSV 1 0.2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Co - Infecciones: Adenovirus - FLU A 1 0.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 Adenovirus - Para FLU 3 1 0.2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 Enterovirus - FLU A 2 0.5 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 PCR - RT Total muestras procesadas 466 59.7 3 14 13 3 283 10 73 2 4 50 11 FLU A 264 56.7 0 8 10 3 175 2 47 0 0 16 3 H1N1 (SW) pandémico 1 0.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 FLU A Estacional H1 0 0.0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 FLU A Estacional H3 263 99.6 0 8 10 3 175 2 47 0 0 15 3 FLU B 71 15.2 0 0 1 0 43 0 10 0 2 14 1 Negativo 131 28.1 3 6 2 0 65 8 16 2 2 20 7
    12. 12. ESTUDIO DE INFLUENZA - PERU REPORTE DE RESULTADOS DESDE EL 06 DE ENERO DEL 2011 AL 31 DE ENERO DEL 2011 LABORATORIO NAMRU-6, LIMA-PERU Total PERU Count % Junin Loreto Lima Callao Piura Madre de Dios Puno La Libertad Tumbes YurimaguasTotal 411 100.0 115 95 7 6 74 24 9 53 26 2 Numero de Pacientes con Cultivo Viral: 360 87.6 115 63 4 4 60 24 9 53 26 2 Positivos 191 53.1 78 36 1 4 28 6 3 21 14 0 Negativos 169 46.9 37 27 3 0 32 18 6 32 12 2 En Proceso 51 12.4 0 32 3 2 14 0 0 0 0 0 Numero de virus aislados (cultivo): ADENOVIRUS 2 1.0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 ENTEROVIRUS 8 4.2 0 0 0 0 4 0 1 2 1 0 FLU A 119 62.3 62 10 1 4 17 3 2 12 8 0 FLU B 52 27.2 9 25 0 0 6 2 1 4 5 0 HMPV 3 1.6 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 PARA FLU 1 2 1.0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 PARA FLU 2 3 1.6 2 0 0 0 1 0 0 0 0 0 PARA FLU 3 7 3.7 5 0 0 0 1 0 0 1 0 0 PARA FLU 4 1 0.5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Co - Infecciones: ADENOVIRUS-FLU A 2 1.0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 ENTEROVIRUS-FLU A 2 1.0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 FLU A-PARA FLU 2 1 0.5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 FLU A-PARA FLU 4 1 0.5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 PCR - RT Total muestras procesadas 129 31.4 13 67 6 6 18 3 4 7 5 0 FLU A 25 19.4 10 6 0 4 0 0 0 3 2 0 H1N1 (SW) pandémico 2 8.0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 FLU A Estacional H1 0 0.0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 FLU A Estacional H3 23 92.0 10 4 0 4 0 0 0 3 2 0 FLU B 22 17.1 1 18 0 0 1 0 2 0 0 0 Negativo 82 63.6 2 43 6 2 17 3 2 4 3 0
    13. 13. BROTE DE INFLUENZA B CUARTEL DE CHOCOPE – AGOS10 Es ta bl Nomb Sex Ini ci o de Ra pi tTes t_ResProvi nci a Eda d Code Date PLACE FLU_A FLU_B SW-FLU FLU A_H3 FLU A_H1 eci mi e res y VALDI o enfermeda ul tTRUJILLO nto de C.M.M. Apel l i 19. VIEZO UNKA d M 21-a go-10 FLU B OBT9157 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. HO/IT 18. ASENC M 24-a go-10 NEGATIVO OBT9158 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. IO/ME KASHK 19. M 25-a go-10 FLU B OBT9159 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. UM/Y PUOP 18. M 20-a go-10 FLU B OBT9160 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. A/HU YAMPI 19. M 21-a go-10 FLU B OBT9161 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. ES/PU 18. REYES M 25-a go-10 FLU B OBT9162 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. /COLO 18. ABAN M 21-a go-10 FLU B OBT9163 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. TO/CH 21. TEJIN/ M 20-a go-10 FLU B OBT9164 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. UHUA 18. PIZAN M 21-a go-10 FLU B OBT9165 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. GO/T VELDA 18. M 21-a go-10 NEGATIVO OBT9166 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. /RICO SABOC 20. M 23-a go-10 NEGATIVO OBT9167 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve nega ti veTRUJILLO C.M.M. AY/PA 30. GUILL M 21-a go-10 NEGATIVO OBT9168 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve nega ti veTRUJILLO C.M.M. EN/RI RODRI 18. M 23-a go-10 NEGATIVO OBT9169 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve nega ti veTRUJILLO C.M.M. GUEZ ARSE/ 18. M 21-a go-10 NEGATIVO OBT9170 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve PositiveTRUJILLO C.M.M. ARREL 21. PITUC M 21-a go-10 NEGATIVO OBT9171 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve nega ti veTRUJILLO C.M.M. /TAIS 19. M 24-a go-10 NEGATIVO OBT9172 07/09/2010 CHOCOPE-TRUJILLO negati ve nega ti ve
    14. 14. NOMENCLATURA DEL VIRUS DE INFLUENZA A/Brisbane/59/07(H1N1)TIPO DE VIRUSREGION GEOGRAFICA DE ORIGENN° DE LINAJEAÑO DE AISLAMIENTOTIPO ENTIGENICO

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