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Micosylva - Diversité et rôles des champignons dans les écosystèmes

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Impact de la gestio forestière sur la diversité fongique
Marc BUEE
UMR Interactions Arbres-Microoroganismes
Centre INRA de Nancy Champenoux

Published in: Government & Nonprofit
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Micosylva - Diversité et rôles des champignons dans les écosystèmes

  1. 1. * buee@nancy.inra.fr PDF Compressor Pro
  2. 2. © Apple PDF Compressor Pro
  3. 3. © Apple PDF Compressor Pro
  4. 4. © Apple PDF Compressor Pro
  5. 5. Biodiversité et fonctions écosystémiques (processus écologiques)/productivité IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Nombre d’espèces Fonctionsécosystémiques Nombre d’espèces Fonctionsécosystémiques Rôle de la biodiversité PDF Compressor Pro
  6. 6. Rôle de la biodiversité: Conséquences d’une perte de diversité IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes * Perte de diversité génétique (augmentation de la sensibilité aux pathogènes) P. infestens, mildiou de la pomme de terre (1845) : 1 million de morts en Irlande (origine : 2 lignées introduites en 1570 par les espagnols). Or, il s’agit d’une reproduction clonale via les tubercules… La rouille du peuplier (M. larici-populina) et le cultivar « Beaupré »… Il n’y a pas que les champignons pathogènes… AFOCEL PDF Compressor Pro
  7. 7. IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Diversité fongique, les espèces mutualistes (symbiotiques) et saprophytes… PDF Compressor Pro
  8. 8. IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Diversité fongique, les espèces mutualistes http://www.wsl.ch/Im/publications Cèpes, bolets, amanites, meuniers, trompettes de la mort, chanterelles… sont des champignons symbiotiques Plusieurs milliers d’espèces de champignons ectomycorhiziens pour quelques espèces végétales ligneuses (97% de la ressource forestière française = 20 espèces) PDF Compressor Pro
  9. 9. IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes © FM La symbiose ectomycorhizienne : une interaction harmonieuse Mycorhize PDF Compressor Pro
  10. 10. En forêt, un monde oublié… © FM IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes PDF Compressor Pro
  11. 11. Pinus Roots Extramatrical hyphae Ectomycorhiza Mycelial cords IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes PDF Compressor Pro
  12. 12. © Horton & Bruns IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Un seul arbre peut être en interaction avec des dizaines d’espèces de champignons ectomycorhiziens… PDF Compressor Pro
  13. 13. PDF Compressor Pro
  14. 14. IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Gestion forestière et diversité fongique Effet de l’enrésinement (inventaire mycologique) PDF Compressor Pro
  15. 15. Influence de l’essence forestière (conifères et feuillus) sur la communauté fongique (site de Breuil) Distribution of 333 macrofungal morphotypes according to their trophic status. EMF : ectomycorrhizal fungi ; ASF: saprophitic fungi living on AI horizon ; CSF : cones decaying fungi ; DLWSF : wood decaying fungi living on dead or living wood; DWSF : wood decaying fungi living on dead branches, stumps or trunks ; FHSF : litter decaying fungi living on F and H layers; FSF : saprophitic fungi living on dead sporophores ; ; GSF : saprophitic fungi associated with gramineous ; MSF : saprophitic fungi associated with moss; NSF : needle decaying fungi ; PEMF : pseudo ectomycorrhizal fungi; PFLS : parasitic fungi living on sporophores; PFR : parasitic fungi living on roots; RESF : saprotrophic fungi living on resinous exudates; TSF : wood decaying fungi living on small twigs on the ground. ECM ASF TSF NSF PFR RESF PEMFPFLS MSF FSF GSF FHSF CSF DLWSF DWSF IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Buée et al. (2011) PDF Compressor Pro
  16. 16. IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Buée et al. (2011) Influence de l’essence forestière (conifères et feuillus) sur la communauté fongique (site de Breuil) Correspondence analysis (COA). Representation according to axis 1 and 2, showing the effects of treatments on fungal community composition. Effet de l’hôte (conifère vs feuillu) sur assemblage des espèces Impact modéré sur la richesse fongique, suite à l’enrésinement PDF Compressor Pro
  17. 17.  Influence des facteurs du milieu sur la composition en espèces (“time consuming”, macromycètes, saisonnier…) Carpophores = premiers indicateurs de la diversité fongique IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes PDF Compressor Pro
  18. 18.  Influence des facteurs du milieu sur la “fructification” (indicateur de quelle diversité?)  Représentation biaisée de la communauté fongique Egli et al. IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Carpophores = premiers indicateurs de la diversité fongique PDF Compressor Pro
  19. 19. IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Buée et al. (2009) Influence de l’essence forestière (conifères et feuillus) sur la communauté fongique (site de Breuil) Analyse moléculaire à partir de l’ADN du sol Courbes de rarefactions (6 essences). Entre 25,680 & 35,600 sequences ont été générées par placette, correspondant à 580 -1,000 OTUs (3% sequence dissimilarity). Peuplement originel: TSF hêtre… PDF Compressor Pro
  20. 20. Paramètres édaphiques (pH, C, N, P) Température Précipitations N atmosphérique Humidité du sol Multiplicité des variables explicatives Hôte, succession IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes PDF Compressor Pro
  21. 21. 40 m 50 m Eclaircie Témoin IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes PDF Compressor Pro
  22. 22. Fréquence relative 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 1 C. cristata, 2 C. geophilum, 3 Hebeloma sps., 4 Russula sp.1, 5 Lactarius subdulcis, 6 Tomentella sp.1 (F. spinulosa), 7 Tomentella sp. 2, 8 Russula sp.2, 9 Cortinarius sp.1, 10 Russula sp.3, 11 Tomentella sp.3, 12 Tomentella sp.4, 13 Inocybe sps., 14 L. amethystina, 15 Russula sp.4, 16 Lactarius sp.1, 17 Cortinarius sp.2, 18 Tuber sp., 19 F. tubulosa (Thelephoraceae), 20 F. setifera, 21 Scleroderma sp., etc., 35 autres (32 espèces) Eclaircie Témoin IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Plus de 60 espèces ectomycorhiziennes (800 m2) associées au hêtre A travers l’observation des apex, pas d’effet sur la richesse… PDF Compressor Pro
  23. 23. IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes 22% 6% 7% 4% 10% 10% 3% 1% 4% 4% 29% Autres 7% 17% 19% 7% 5% 2% 7% 5% 2% 7% 22% Autres HIVER décembre 2001- mars 2002 ETE juin 2002 - août 2002 -> Adaptation aux contraintes saisonnières (diversité fonctionnelle) PDF Compressor Pro
  24. 24. Determination de 8 activités fongiques pour la mobilisation des éléments du sol (C & N) Buée et al. 2005, 2007 Courty et al. 2005 Control ECM Traitment ECM n=21 n=21 Hydrolytic and oxidative enzymes activities (chitinase, laccase, proteases, cellobiohydrolase, etc.) Fluorometric and colorimetric substrates Measurement of the ectomycorrhizal tips surface area (Win Rhizo software) IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes PDF Compressor Pro
  25. 25. UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Litière Organo- minéral Barre = 10 cm 0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 Leucine Glucuronidase Xylosidase Cellobiohydrolase Chitinase ß-glucosidase Phosphatase laccase Cortinarius anomalus Lactarius quietus Diversité spatiale et redondance fonctionnelle ou complémentarité Courty et al. 2006 PDF Compressor Pro
  26. 26. Soil nu débris de bois T. badia T. botryoides L. quietus L’effet niche : adaptation et spécialisation fonctionnelle (chitinase sur bois mort) IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes N-acetyl-glucosaminidase activity a a b c * Bois mort colonisé par Armillaria et Megacollybia. * Buée et al. 2007 PDF Compressor Pro
  27. 27. IFR 110 - UMR INRA/UHP 1136 Interactions Arbres/Micro-organismes Gestion forestière et services écosystémiques Gérer, c’est aussi maintenir une diversité biologique (ressources patrimoniales, mais aussi diversité/complémentarité et redondance fonctionnelle)… tout en valorisant les services écosystémiques, comme les actions centrées sur les ressources commercialisables (ex: micosylva (+)) Nombre d’espèces Fonctionsécosystémiques -> Maintenir les liens avec la recherche: savoir estimer au plus juste la biodiversité et richesse en espèces. Estimer/mesure les conséquences fonctionnelles PDF Compressor Pro
  28. 28. Merci pour votre attention PDF Compressor Pro

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