Successfully reported this slideshow.
We use your LinkedIn profile and activity data to personalize ads and to show you more relevant ads. You can change your ad preferences anytime.

0

Share

Download to read offline

Фокин А. Анализ и визуализация генных сетей

Download to read offline

Related Books

Free with a 30 day trial from Scribd

See all

Related Audiobooks

Free with a 30 day trial from Scribd

See all
  • Be the first to like this

Фокин А. Анализ и визуализация генных сетей

  1. 1. MirOB: инструмент анализа генных сетей для решения задач персонализированной медицины http://mirob.interactome.ru
  2. 2. Визуализция данных
  3. 3. Вначале была база данных
  4. 4. Надо бы это все визуализировать
  5. 5. Генная сеть TP53 на GraphViz
  6. 6. Много статичной и однородной информации на одном экране. Что делать?
  7. 7. Создали графическую и цветовую нотацию:
  8. 8. Опять инфохаос
  9. 9. Связали Ген-РНК-Белок-микроРНК в единые сущности
  10. 10. А что будет, если использовать открытые базы? данных?ç
  11. 11. Еще улучшили графическую нотацию
  12. 12. Информация об узле Информация о ребре
  13. 13. Информация о генной сети
  14. 14. Все равно все очень сложно и непонятно.
  15. 15. Фильтры Планируем добавить фильтры: ● Тканевая специфичность ● Cut-off по уровням экспрессии ● По сигнальным каскадам ● Другие
  16. 16. Колоректальный рак
  17. 17. Gene Ontology?
  18. 18. MirOB Ontology!
  19. 19. Cisplatin resistance gene network
  20. 20. Диаграмма уровней экспрессии микроРНК
  21. 21. Случайно уронили SNPPer
  22. 22. Лекартсва, действующие на мишени
  23. 23. MirOB -- инструмент анализа генных сетей http://mirob.interactome.ru
  24. 24. Что дальше ● Динамическая визуализация генных сетей ● Градации по экспрессионным уровням на генной сети ● Анализ “сырых” данных NGS в облаке ● GWAS анализ ● База данных генных сетей для совместного обсуждения ● Распределенные вычисления Полноценный workflow от загрузки любых данных, до понятного отчета.
  25. 25. Александр Фокин, CEO MirOB bifurc8@gmail.com http://mirob.interactome.ru +7 910 452 44 84

Views

Total views

490

On Slideshare

0

From embeds

0

Number of embeds

20

Actions

Downloads

13

Shares

0

Comments

0

Likes

0

×