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1 of 31
COMPARISON OF HUMAN
   AND SOIL CANDIDA
TROPICALIS ISOLATES WITH
REDUCED SUSCEPTIBILITY
   TO FLUCONAZOLE
  Yun-Liang Yang, Chih-Chao Lin, Te-Pin Chang, Tsai-Ling
 Lauderdale, Hui-Ting Chen,Ching-Fu Lee, Chih-Wen Hsieh,
              Pei-Chen Chen, Hsiu-Jung Lo
                                              Open Acces


                            Sebastian Quijano Mazo
                           Ana Milena Sanchez Henao
                               Medical Students
                                   3 semester
                               Molecular Biology
INTRODUCTION
CANDIDA
                                                         4-6 um
                                          Asexual
                    It is part of the     reproduction
                      normal flora
                           and
                    mucocutaneous
                      membranes
Gram strain are
gram-positive,
   aerobic                                          Have more or less
 metabolism is                                      100 species and
   primarily                   Are into imperfect   10 causes
                               fungies (            frequently
                               deuteromycota)       infections
                               of the type
           Is a gener of       blastomyceles
           unicelulars         and to the family
           fungies            criptococcacease
           yeast
CANDIDA TROPICALIS
       To infect it should be in yeast
        form
       Species are associated with
        vaginitis or bronchopulmonary
        candidiasis
       Colonies white and smooth,
        globoid or ovoid
       Produced true micelles
FLUCONAZOLE
                                                    Treatment and prevention
                               Antifungal           of superficial and systemic
                                                    fungal infections


                     Inhibits of the fungal cytochrome P450     This inhibition
                     1 α demethylase enzyme


                                                 prevents the conversion of
                                                lanosterol to ergosterol
incubation were considered
to have reduced susceptibility to azole
drugs.
                                               Is used to prevent or
                                               eliminate fungal growth
RELATION
C. tropicalis is a fungal type blastoconidia that
are in our organism for this reason they must
suffer adaptability to suit the environment in
which they live .



     to survive had increased tolerance to stimuli
     that is generated, They investigated the
     possibility of presence in soil of such C.
     tropicalis strains by pulsed field gel
     electrophoresis (PFGE),


           C. tropicalis exhibiting reduced susceptibility to
           fluconazole from the human hosts and
           environmental samples. Therefore, to prevent
           patients from acquiring C. tropicalis with
           reduced susceptibility to azoles, must be have
           a prudent use of them to increase the
           effectiveness of antifungal treatments
OBJETIVE
   Investigate the presence in soil of C.Tropicalis strains
    exhibiting reduced susceptibility to fluconazole and
    perform a comparison with the human strains
MATERIALES Y METODOS
Cepa
   Conjunto de especies bacterianas que comparten, al menos,
    una característica


                      •NHUE10     NHUE11
                      •NHUE28     NHUE27
           Cepa       •NHUE33     NHUE36
                      •NHUE40     NHUE42
           suelo      •NHUE48     NHUE52
                      •NHUE56



                     •YM990275    YM990659
                     •YM990490
          Cepas      •YM990537
                     •YM990579
         humanas     •YM990592
                     •YM990649
CEPA

       1 gr de suelo

      9 ml de agua esteril



                                    Incubación
                                    por 3 dias
0.2 ml de suspension se             a 24ºC
sembraron en YMA



                                 3 colonias fueron
                                 recogidas



                             Todas las cepas de levaduras fueron
                             identificadas por la secuencias del dominio
                             D1/D2 de los genes LSU rRNA
SUSCEPTIBILIDAD A LA DROGA

       El crecimiento de cada cepa fue medida por la placa de Biotrak
       II lector espectrofotométrico después de incubación a 24 h para
       35ºC y 48 h.



              El MIC de anfotericina B se define como el mínimo
            concentraciones del fármaco capaz de inhibir la célula
                                  crecimiento



        Por la susceptibilidad a la anfotericina B, los aislamientos con
        MIC § 2 mg / l fueron considerados resistentes y aquellos con
                       MIC -1 Mg / l fueron susceptibles
    La CIM para el fluconazol y voriconazol se define
    como la menor concentración capaz de la
    reducción de la turbidez de las células en más de
    un 50%

    Los aislamietos con fluconazol MICs $ 64 mg / L
    se consideraron como haber reducido
    susceptibilidad y # 8 mg / L susceptible

   Las cepas con CIM en el intervalo de 16-32 mg / L
    fueron consideradas sensibles a dosis dependiente
    (SDD).

   Los aislamientos con CMI de 2 mg / L se conoce
    como SDD.
PFGE
Es una técnica diseñada especialmente para la
separación de ADN de alto peso molecular           (>100
kb). PFEG opera alternando dos diferentes campos
eléctricos sobre una matriz de agarosa; de esta manera
es posible alterar la migración del ADN hacia diferentes
direcciones facilitando la separación de dos grandes
moléculas de ADN.
7 humanas + 11 suelo = 18 total



              Todos mostraron
              susceptibilidad
              reducida a fluconazol



                  Pulsos alternos en un ángulo de 120
                  grados en un 5-50 s pulso-tiempo de
                            gradiente de 20 h




 Una escalera de Salmonella             El coeficiente de Dice se utilizó
se usó como marcador del               para analizar las similitudes de los
peso                                   patrones de bandas. La par no
 molecular                             ponderado método grupo utilizando
                                       medias aritméticas
                                       (UPGMA) se utilizó para el análisis
                                       de conglomerados.
SECUENCIA
   18 cepas exhiben sensibilidad reducida a
    fluconazol

   El ADN fragmentos de seis genes: ICL1, MDR1,
    SAPT2, SAPT4, XYR1 y ZWF1a se secuenciaron
    para los análisis. Las secuencias resultantes se
    alinearon con BioNumerics 3,0 y se compararon
    con los de la base de datos de C. tropicalis para
    obtener los identificadores
CURVAS DE CRECIMIENTO
 Bioscreen C
se utiliza para volver a evaluar el crecimiento de
  diferentes aislamientos

   Aproximadamente 16104 células en 200 ml de
    medio RPMI 1640 se cultivaron en ausencia o en la
    presencia de diferentes drogas, incluyendo el
    fluconazol, fluquinconazol,penconazol,
    tebuconazol, y tridimenol, en 35ºC
CURVAS DE CRECIMIENTO
   Las neoplasias de células se determinaron
    cada 15 minutos.

   Debido a la solubilidad de fluquinconazol, la
    concentración más alta de este fármaco en el
    presente estudio fue 16 mg /L en lugar de 64 mg / L

   2 veces
RESULTADOS
   Se analizaron 56 aislados de 26 muestras de suelo
    de 477 muestras recogidas de los suelos entre
    2006 y 2008 en Taiwán

   Suelo contaminado de petróleo, campo de
    agricultura, suelo pantanoso y bosques

   Para diferenciar las múltiples cepas de una
    muestra se tomaron 3 colonias individuales
    representativas para el estudio
RESULTADOS
   10 solo tenia 1 aislado de C. tropicalis

   8 tenían 2 aislados de C. tropicalis

   5 tenían 3 aislados de C. tropicalis

   2 tenían 4 aislados de C. tropicalis

   1 tenia 7 aislados de C. tropicalis
RESULTADOS
   Todos fueron susceptibles a amfotericin B

   Se uso fluconazol en 18 muestras

   De estas 18, 17 recibieron voriconazol después de
    48 h

   Para determinar si los aislados con susceptibilidad
    reducida de muestras de suelo se relacionaban
    genéticamente con las humanas se uso PFGE
RESULTADOS
   18 muestras: 11 del suelo y 7 humanas

   11 de suelo: 6 susceptibilidad reducida y 5
    susceptibles

   7 humanas: todos susceptibilidad reducida

   Humanas: YM990275, 490, 537, 579, 592, 649 y
    659
RESULTADOS
DISCUSSION
Was said by                                      They said                                                 Right or wrong

. Cheng MF, Yu KW, Tang RB, Fan YH, Yang
YL, et al. 10. Pfaller MA, Jones RN, Doern GV,
                                                 Candida tropicalis is one of the most
                                                 frequently isolated nonalbicans
                                                                                                           
Sader HS, Messer SA, et al. Lord AT,.            Candida species from patients


Barchiesi F, Calabrese D, Sanglard D,
Falconi DF, Caselli F, et al. Calvet HM,
                                                 Furthermore,
                                                 C. tropicalis develops drug resistance in
                                                                                                           
Yeaman MR, Filler SG                             the presence of fluconazole
                                                 much more rapidly than other Candida
                                                 species

28. Cowen LE (2001) Predicting the
emergence of resistance to antifungal drugs.
                                                 In fungi, drug resistance
                                                 is more likely to be the outcome of
                                                                                                           
FEMS Microbiol Lett 204: 1–7.                    sequential accumulation of
29. Cowen LE, Sanglard D, Calabrese D,           adaptive mutations in the chromosomes
Sirjusingh C, Anderson JB, et al.


. Chen FJ, Lo HJ (2003) 34. McDonald LC,
Chen FJ, Lo HJ, Yin HC, Lu PL, et al.
                                                  The observation that azole-resistant Aspergillus
                                                 fumigatus isolates recovered from soil and compost        
(2001)35. Yang YL, Lauderdale TL, Lo HJ          were genetically related to clinical resistant isolates
                                                 suggests the existence of an environmental route
(2004) 36. Akins RA (2005) 37. White TC, Marr
                                                 for developing drug resistance in fungi. Similar to
KA, Bowden RA (1998) 38. Yang YL,
                                                 some antibiotic resistance in bacteria, fluconazole
                                                 resistance in fungi also involves step-wise mutations
                                                 affecting more than one


Muller FM, Staudigel A, Salvenmoser S,
Tredup A, Miltenberger R, et al
                                                 Previous study has shown that in human
                                                 immunodeficiency virus infected patients, C.              
                                                 albicans and other yeast species were cross-
                                                 resistant to medical and agricultural azole drugs
CONCLUSIONS
   Isolates with reduced suceptibility grow better under
    influence of azole drugs

   The human isolates share an electroforetic pattern
    with soil isolates with reduced suceptibility

   The suceptibles one didn’t have similar
    electroforetic patterns with soil or human isolates
    with reduced suceptibility
CONCLUSIONES
   All humans strains shown reduced suceptibility to
    fluconazole

   Don't do treatments with long exposures to azoles
    because it can cause a reduced suceptibility to the
    treatment and bad results to it
MAPA




Ana Sanchez
Comparison of Human and Soil Candida tropicalis
                                                    Isolates with Reduced Susceptibility to
                                                                  Fluconazole




                                                            Aislamientos


      Humanos
                                                                                                                                Del suelo



Con susceptibilidad reducida al                         Con susceptibilidad reducida al
         fluconazol                                              fluconazol                                                Susceptibles al fluconazol




  Mismo patrón                                    Crecimiento luego de
                             97% de similitud                                      Resistentes a
  electroforético                                  exposición a droga           fluconazol y azoles




                                                                                                       Inhibición de               No comparten patrón
                                                                                                  crecimiento por azoles              electroforético




                                                   Manejo prudente de azoles en clínica y
                                                                agricultura
 Sebastian Quijano
Candida

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  • 1. COMPARISON OF HUMAN AND SOIL CANDIDA TROPICALIS ISOLATES WITH REDUCED SUSCEPTIBILITY TO FLUCONAZOLE Yun-Liang Yang, Chih-Chao Lin, Te-Pin Chang, Tsai-Ling Lauderdale, Hui-Ting Chen,Ching-Fu Lee, Chih-Wen Hsieh, Pei-Chen Chen, Hsiu-Jung Lo Open Acces Sebastian Quijano Mazo Ana Milena Sanchez Henao Medical Students 3 semester Molecular Biology
  • 3. CANDIDA 4-6 um Asexual It is part of the reproduction normal flora and mucocutaneous membranes Gram strain are gram-positive, aerobic Have more or less metabolism is 100 species and primarily Are into imperfect 10 causes fungies ( frequently deuteromycota) infections of the type Is a gener of blastomyceles unicelulars and to the family fungies  criptococcacease yeast
  • 4. CANDIDA TROPICALIS  To infect it should be in yeast form  Species are associated with vaginitis or bronchopulmonary candidiasis  Colonies white and smooth, globoid or ovoid  Produced true micelles
  • 5. FLUCONAZOLE Treatment and prevention Antifungal of superficial and systemic fungal infections Inhibits of the fungal cytochrome P450 This inhibition 1 α demethylase enzyme prevents the conversion of lanosterol to ergosterol incubation were considered to have reduced susceptibility to azole drugs. Is used to prevent or eliminate fungal growth
  • 6. RELATION C. tropicalis is a fungal type blastoconidia that are in our organism for this reason they must suffer adaptability to suit the environment in which they live . to survive had increased tolerance to stimuli that is generated, They investigated the possibility of presence in soil of such C. tropicalis strains by pulsed field gel electrophoresis (PFGE), C. tropicalis exhibiting reduced susceptibility to fluconazole from the human hosts and environmental samples. Therefore, to prevent patients from acquiring C. tropicalis with reduced susceptibility to azoles, must be have a prudent use of them to increase the effectiveness of antifungal treatments
  • 7. OBJETIVE  Investigate the presence in soil of C.Tropicalis strains exhibiting reduced susceptibility to fluconazole and perform a comparison with the human strains
  • 8. MATERIALES Y METODOS Cepa  Conjunto de especies bacterianas que comparten, al menos, una característica •NHUE10 NHUE11 •NHUE28 NHUE27 Cepa •NHUE33 NHUE36 •NHUE40 NHUE42 suelo •NHUE48 NHUE52 •NHUE56 •YM990275 YM990659 •YM990490 Cepas •YM990537 •YM990579 humanas •YM990592 •YM990649
  • 9. CEPA 1 gr de suelo 9 ml de agua esteril Incubación por 3 dias 0.2 ml de suspension se a 24ºC sembraron en YMA 3 colonias fueron recogidas Todas las cepas de levaduras fueron identificadas por la secuencias del dominio D1/D2 de los genes LSU rRNA
  • 10. SUSCEPTIBILIDAD A LA DROGA El crecimiento de cada cepa fue medida por la placa de Biotrak II lector espectrofotométrico después de incubación a 24 h para 35ºC y 48 h. El MIC de anfotericina B se define como el mínimo concentraciones del fármaco capaz de inhibir la célula crecimiento Por la susceptibilidad a la anfotericina B, los aislamientos con MIC § 2 mg / l fueron considerados resistentes y aquellos con MIC -1 Mg / l fueron susceptibles
  • 11. La CIM para el fluconazol y voriconazol se define como la menor concentración capaz de la reducción de la turbidez de las células en más de un 50%  Los aislamietos con fluconazol MICs $ 64 mg / L se consideraron como haber reducido susceptibilidad y # 8 mg / L susceptible  Las cepas con CIM en el intervalo de 16-32 mg / L fueron consideradas sensibles a dosis dependiente (SDD).  Los aislamientos con CMI de 2 mg / L se conoce como SDD.
  • 12. PFGE Es una técnica diseñada especialmente para la separación de ADN de alto peso molecular (>100 kb). PFEG opera alternando dos diferentes campos eléctricos sobre una matriz de agarosa; de esta manera es posible alterar la migración del ADN hacia diferentes direcciones facilitando la separación de dos grandes moléculas de ADN.
  • 13. 7 humanas + 11 suelo = 18 total Todos mostraron susceptibilidad reducida a fluconazol Pulsos alternos en un ángulo de 120 grados en un 5-50 s pulso-tiempo de gradiente de 20 h Una escalera de Salmonella El coeficiente de Dice se utilizó se usó como marcador del para analizar las similitudes de los peso patrones de bandas. La par no molecular ponderado método grupo utilizando medias aritméticas (UPGMA) se utilizó para el análisis de conglomerados.
  • 14. SECUENCIA  18 cepas exhiben sensibilidad reducida a fluconazol  El ADN fragmentos de seis genes: ICL1, MDR1, SAPT2, SAPT4, XYR1 y ZWF1a se secuenciaron para los análisis. Las secuencias resultantes se alinearon con BioNumerics 3,0 y se compararon con los de la base de datos de C. tropicalis para obtener los identificadores
  • 15. CURVAS DE CRECIMIENTO  Bioscreen C se utiliza para volver a evaluar el crecimiento de diferentes aislamientos  Aproximadamente 16104 células en 200 ml de medio RPMI 1640 se cultivaron en ausencia o en la presencia de diferentes drogas, incluyendo el fluconazol, fluquinconazol,penconazol, tebuconazol, y tridimenol, en 35ºC
  • 16. CURVAS DE CRECIMIENTO  Las neoplasias de células se determinaron cada 15 minutos.  Debido a la solubilidad de fluquinconazol, la concentración más alta de este fármaco en el presente estudio fue 16 mg /L en lugar de 64 mg / L  2 veces
  • 17. RESULTADOS  Se analizaron 56 aislados de 26 muestras de suelo de 477 muestras recogidas de los suelos entre 2006 y 2008 en Taiwán  Suelo contaminado de petróleo, campo de agricultura, suelo pantanoso y bosques  Para diferenciar las múltiples cepas de una muestra se tomaron 3 colonias individuales representativas para el estudio
  • 18. RESULTADOS  10 solo tenia 1 aislado de C. tropicalis  8 tenían 2 aislados de C. tropicalis  5 tenían 3 aislados de C. tropicalis  2 tenían 4 aislados de C. tropicalis  1 tenia 7 aislados de C. tropicalis
  • 19. RESULTADOS  Todos fueron susceptibles a amfotericin B  Se uso fluconazol en 18 muestras  De estas 18, 17 recibieron voriconazol después de 48 h  Para determinar si los aislados con susceptibilidad reducida de muestras de suelo se relacionaban genéticamente con las humanas se uso PFGE
  • 20. RESULTADOS  18 muestras: 11 del suelo y 7 humanas  11 de suelo: 6 susceptibilidad reducida y 5 susceptibles  7 humanas: todos susceptibilidad reducida  Humanas: YM990275, 490, 537, 579, 592, 649 y 659
  • 21.
  • 22.
  • 23.
  • 26. Was said by They said Right or wrong . Cheng MF, Yu KW, Tang RB, Fan YH, Yang YL, et al. 10. Pfaller MA, Jones RN, Doern GV, Candida tropicalis is one of the most frequently isolated nonalbicans  Sader HS, Messer SA, et al. Lord AT,. Candida species from patients Barchiesi F, Calabrese D, Sanglard D, Falconi DF, Caselli F, et al. Calvet HM, Furthermore, C. tropicalis develops drug resistance in  Yeaman MR, Filler SG the presence of fluconazole much more rapidly than other Candida species 28. Cowen LE (2001) Predicting the emergence of resistance to antifungal drugs. In fungi, drug resistance is more likely to be the outcome of  FEMS Microbiol Lett 204: 1–7. sequential accumulation of 29. Cowen LE, Sanglard D, Calabrese D, adaptive mutations in the chromosomes Sirjusingh C, Anderson JB, et al. . Chen FJ, Lo HJ (2003) 34. McDonald LC, Chen FJ, Lo HJ, Yin HC, Lu PL, et al. The observation that azole-resistant Aspergillus fumigatus isolates recovered from soil and compost  (2001)35. Yang YL, Lauderdale TL, Lo HJ were genetically related to clinical resistant isolates suggests the existence of an environmental route (2004) 36. Akins RA (2005) 37. White TC, Marr for developing drug resistance in fungi. Similar to KA, Bowden RA (1998) 38. Yang YL, some antibiotic resistance in bacteria, fluconazole resistance in fungi also involves step-wise mutations affecting more than one Muller FM, Staudigel A, Salvenmoser S, Tredup A, Miltenberger R, et al Previous study has shown that in human immunodeficiency virus infected patients, C.  albicans and other yeast species were cross- resistant to medical and agricultural azole drugs
  • 27. CONCLUSIONS  Isolates with reduced suceptibility grow better under influence of azole drugs  The human isolates share an electroforetic pattern with soil isolates with reduced suceptibility  The suceptibles one didn’t have similar electroforetic patterns with soil or human isolates with reduced suceptibility
  • 28. CONCLUSIONES  All humans strains shown reduced suceptibility to fluconazole  Don't do treatments with long exposures to azoles because it can cause a reduced suceptibility to the treatment and bad results to it
  • 30. Comparison of Human and Soil Candida tropicalis Isolates with Reduced Susceptibility to Fluconazole Aislamientos Humanos Del suelo Con susceptibilidad reducida al Con susceptibilidad reducida al fluconazol fluconazol Susceptibles al fluconazol Mismo patrón Crecimiento luego de 97% de similitud Resistentes a electroforético exposición a droga fluconazol y azoles Inhibición de No comparten patrón crecimiento por azoles electroforético Manejo prudente de azoles en clínica y agricultura Sebastian Quijano