Data Mining applied to Medicine

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This official master degree is directed to professionals and workers of medical centers, biotechnologists, doctors or staff of calculation centers of hospitals that fulfill the profile of investigator that needs to improve their knowledge to properly analyze medical data.

More specifically, the program is structured with the objective that the student:
1. Learns the acquisition process and storage of medical data.
2. Knows the legislation and the legal restrictions in medical data processing.
3. Acquires the research dynamic in the medical field and other experimental sciences.
4. Studies mechanisms of data analysis from the statistical and the data mining fields.
5. Is able to design problems of data mining.
6. Is able to understand the results of a methodological process of data analysis.
7. Is able to use software tools in order to make the knowledge extraction process automatic

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Data Mining applied to Medicine

  1. 1. MDMMMinería de datos aplicada a la medicina Si quieres, en La Salle puedes Dr. Albert Fornells Herrera Coordinador afornells@salle.url.edu http://www.salle.url.edu/~afornells Skype: afornells.salle
  2. 2. ÍndiceCampus laSalle BarcelonaDe dónde venimos, dónde estamos y a dónde vamosMáster en minería de datos aplicada a la medicinaEjemplos de proyectosBecas 2
  3. 3. Campus laSalle Barcelona • Campus con 5 edificios. • 4000 estudiantes. • Más de 100 años formando profesionales altamente cualificados. Espíritu emprendedor Prestigio e Metodología innovación diferencial La Salle Technova Laboratorios e Barcelona infraestructuras Grupos de Carácter investigación internacional 3
  4. 4. ¿El tiempo lo cura ‘todo’? 4
  5. 5. Ahora, ¿sabemos + o -? Interpretación Sabiduría (Conocimiento + experiencia) Identificación Conocimiento (Información + reglas)Valor Integración Información (Data + Contexto) Manipulación Datos Volumen 5
  6. 6. Minería de datos La minería de datos es el proceso de extraer patrones ocultos y establecer relaciones de grandes conjuntos de datos para transformar los datos en conocimiento. Producción Análisis ¿Qué tipo de problemas problema resuelve la minería de datos?  Asociación: Buscar relaciones entre variables.  Clasificación: Asignar Análisis categorías en grupos Evaluación predefinidos. datos  Clustering: Agrupar los datos en grupos sin saber la clasificación previa.  Regresión: Buscar una Preproceso función que modele los datos. Modelado datos  …. 6
  7. 7. Objetivo El alumno disponga de recursos técnicos para extraer conocimiento original, útil y de valor añadido de datos procedentes del campo de las ciencias de la salud y otras ciencias experimentales. Al acabar el máster el alumno será capaz de: Aplicar Utilizar Diseñar yConocer la tipología de mecanismos de herramientas abordar los datos médicos análisis de de minería de experimentos datos datos 7
  8. 8. Perfiles entrada y salida Perfil entrada Salida profesional Centros de investigación de ciencias de la salud Centros médicos Centros de cálculo hospitalarios Biólogos y biotecnólogos Servicios informáticos hospitalarios Centros de cálculo de hospitales Programa de doctorado Ingenieros informáticos Proyectos de las ciencias salud. 8
  9. 9. Elementos diferenciales Único Experiencias & Enfoque práctico de Networking los conocimientosTFM en proyectos Apoyo de Grupos Carrera profesional reales de investigación 9
  10. 10. Plan de estudios• Gestión de bases de datos • Minería de datos médicas • Herramientas de• Procesamiento de imágenes minería de datos digitales Datos Minería de médicos datos Experiencias Métodos de & análisis • Análisis estadístico Networking científicos de datos• Divulgación científica • Análisis estadístico de• Seminarios TIC y salud resultados• Experiencias y networking • Visualización de datos• Trabajo Final de Máster multidimensionales 10
  11. 11. ColaboradoresConsulta el portal web para conocer a los nuevos colaboradores 11
  12. 12. Calendario Créditos: 60 créditos ECTS. Duración: Octubre 2011 hasta el Julio 2012. – Lunes a Jueves 18:30-21:30 – Semestre 1 (30 créditos) – Semestre 2 (30 créditos) Impartición: Castellano. Formato: Presencial en el campus LaSalle Barcelona. 12
  13. 13. Cáncer de mama El cáncer de mama es la principal causa de muerte por cáncer en mujeres entre 15-54 años Si su impacto puede reducirse con una detección precoz, ¿dónde está el problema? – Los síntomas no suelen ser claramente visibles hasta etapas avanzadas. – No existe un patrón objetivo de el porque ni el cuando ni sobre que quien. Las campañas de mamografías promovidas por las administraciones tienen como objetivo detectar las anormalidades en las primeras fases. – Aún así, no hay recursos suficientes fruto del elevado potencial número de pacientes. ¿Cómo podemos contribuir a ayudar a los expertos? – Las herramientas de apoyo a la toma de decisiones son capaces de ofrecer soporte al experto en su día a día. – Proponemos el uso de herramientas para recuperar históricos de mamografías similares a la actual que está diagnosticando el experto. – ¿En qué les beneficia? Mamografías con anormalidades similares, posiblemente tendrán evoluciones y diagnósticos similares. 13
  14. 14. Proyecto HRIMAC TIC2002-04160-C02-02 Objetivo: Desarrollo de una herramienta de recuperación inteligente de imágenes mamográficas por contenido Digitalizar, segmentar yCapturar mamografía Recuperar historiales Soporte al diagnóstico extraer características 14
  15. 15. Melanoma Según la American Cancer Society, el melanoma es el cáncer de piel más mortal (alrededor 22%). – El melanoma aparece cuando los melanocitos se convierten en células cancerígenas. Epidermis Hypodermis Dermis El principal factor de riesgo es la radiación solar, y la patología se ha incrementado en los últimos años, fruto sobretodo, de los nuevos hábitos de exposición solar Como el resto de cánceres, su diagnostico no es trivial y detectarlo en las etapas iniciales es crucial para minimizar los impactos. ¿Cómo podemos ayudar a los expertos? – Mediante herramientas que les ayuden a entender la enfermedad. 15
  16. 16. Cáncer de melanoma TIN2006-15140-C03-03 Objetivo: Utilizar técnicas de minería de datos para crear herramientas de análisis que aporten un valor añadido a los expertos x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x Caracterización de la Identificación Protocolos enfermedad de pautas de actuación 16
  17. 17. Becas y ayudas Préstamos Renta Universidad para estudiantes de másters oficiales – Ministerio de Educación Préstamos para facilitar la financiación de las enseñanzas universitarias de máster oficial y/o de doctorado que se impartan en España o las equivalentes en los países del Espacio Europeo de Educación Superior, Estados Unidos de América y Canadá, mediante una ayuda inicial así como, en su caso, facilitar una renta mensual a los estudiantes que lo deseen. Programa de Prestamos Universitarios de Postgrado (PREPOST) - AGAUR Pago de la matrícula del doctorado, máster o postgrado mediante un préstamo. De manera opcional, existe la posibilidad de obtener una disposición mensual de carácter compensatorio al estudio, durante el período que duren los estudios. www.beslasalle.net/financiacion Financiación a través de créditos (convenio con La Caixa y Santander Central Hispano) Ayudas oficiales del Ministerio y la Generalitat y los que se pueden conseguir en La Salle a través de convenios con entitats bancàries. 17
  18. 18. Becas y ayudas Becas La Salle América Latina Becas de colaboración para que alumnos latinoamericanos puedan cursar presencialmente estudios de Máster en La Salle - Universidad Ramon Llull. Becas y Ayudas para postgrado en España de estudiantes iberoamericanos - Fundación Carolina Becas para ciudadanos mejicanos para estudiar postgrados en el extranjero – Conacyt (Méjico) Becas para Extranjeros para Estudios de Postgrado, Doctorado e Investigación en Universidades españolas - Ministerio de Asuntos Exteriores y de Cooperación (MAEC) Becas del MAEC y de la Agencia Española de Cooperación Internacional para el Desarrollo (AECID) para ciudadanos extranjeros de estudio en España. Becas para ciudadanos latinoamericanos para la realización de estudios en España – ALBAN Becas de la Unión Europea para estudiantes de nacionalidad no europea, para la realización de estudios en Europa - PLOTEUS Becas para estudios de máster en España - Fundación FORD (latinoamérica) Becas para estudiantes estrangeros. 18
  19. 19. Becas y ayudas Becas predoctorales La Salle – Coordinación de Investigación La Salle Contratación a cargo de proyecto de investigación para estudiantes pre doctorales- Grupos de Investigación La Salle Becas de Formación de Personal Investigador - MICINN Becas de Formación de Personal Universitario - Ministerio de Educación Becas y contratos predoctorales (Formación de Investigadores – FI) - AGAUR Ayudas Torres Quevedo - MICIIN Ayudas a empresas para la contratación de personal investigador dentro del programa Talento empresa (TEM-DGR 2009) - Modalidad A. AGAUR Developing Global Scientists and Engineers (International Research Experiences for U.S. Students -IRES) - NSF Becas para la etapa predoctoral. 19
  20. 20. Gracias por vuestra atención Dr. Albert Fornells Herrera Coordinador afornells@salle.url.edu http://users.salleurl.edu/~afornells Skype: afornells.sallePara más información  Web del máster http://www.salle.url.edu/mdmm  Health blog - http://blogs.salleurl.edu/health 20

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