¿Cuál es la estabilidad
relevante de las proteínas?
 R. Godoy-Ruiz, J.M. Sánchez-Ruiz,
           I.E. Sánchez


         ...
Sí, pero ¿a quién
                             le importa?




Dobson and Karplus 1999
Proteínas de 2 estados


                E.T.


   ΔGfolding
                       ΔGunfolding

ΔGequilibrium
Proteínas de 2 estados


                            E.T.


        ΔGfolding
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Proteínas de 2 estados


                            E.T.


        ΔGfolding
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Proteínas de 2 estados

     Folding
(Shakhnovich 1996)          E.T.


         ΔGfolding
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Cómo medir presiones evolutivas
        (Steipe 1994)
• Las proteínas homólogas comparten
  similares requerimientos evolu...
Proteínas de 2 estados




Estabilidad      Folding          Unfolding 

          22 proteínas, 583 mutaciones
Proteínas de 2 estados




Estabilidad      Folding          Unfolding 

          22 proteínas, 583 mutaciones
Proteínas de 2 estados




Estabilidad      Folding          Unfolding 

          22 proteínas, 583 mutaciones
Efecto de las mutaciones en distintas
   condiciones de desplegamiento

                Fisiológicas       No fisiológicas...
Proteínas de 3 estados


 ΔGIU
                   ΔGNU
        ΔGNI


               Estabilidad termodinámica
           ...
Proteínas de 3 estados


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                                         ΔGNU
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Proteínas de 3 estados




N vs. U       N vs. I              I vs. U 

        4 proteínas, 61 mutaciones
Proteínas de 3 estados




N vs. U       N vs. I              I vs. U 

        4 proteínas, 61 mutaciones
Proteínas de 3 estados




N vs. U       N vs. I              I vs. U 

        4 proteínas, 61 mutaciones
Conclusiones
 • Proteínas de 2 estados

Estabilidad    Folding        Unfolding 

 • Proteínas de 3 estados

  N vs. U ...
Laboratorio de
                    fisiología proteica
             www.proteinphysiologylab.tk

Universidad de Buenos Air...
Folding 
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¿Cuál es la estabilidad relevante de las proteínas?

  1. 1. ¿Cuál es la estabilidad relevante de las proteínas? R. Godoy-Ruiz, J.M. Sánchez-Ruiz, I.E. Sánchez Laboratorio de fisiología proteica
  2. 2. Sí, pero ¿a quién le importa? Dobson and Karplus 1999
  3. 3. Proteínas de 2 estados E.T. ΔGfolding ΔGunfolding ΔGequilibrium
  4. 4. Proteínas de 2 estados E.T. ΔGfolding ΔGunfolding ΔGequilibrium Estabilidad termodinámica (Steipe 1994)
  5. 5. Proteínas de 2 estados E.T. ΔGfolding ΔGunfolding ΔGequilibrium Estabilidad cinética Estabilidad termodinámica (Godoy-Ruiz 2006) (Steipe 1994)
  6. 6. Proteínas de 2 estados Folding (Shakhnovich 1996) E.T. ΔGfolding ΔGunfolding ΔGequilibrium Estabilidad cinética Estabilidad termodinámica (Godoy-Ruiz 2006) (Steipe 1994)
  7. 7. Cómo medir presiones evolutivas (Steipe 1994) • Las proteínas homólogas comparten similares requerimientos evolutivos • Cada posición del alineamiento evoluciona de forma independiente • Las distribuciones de residuos han alcanzado el equilibrio $ fracciónAla22 ' Leu22Ala FamiliaX ) ""G evolución = #RTln& & ) % fracciónLeu22 ( FamiliaX !
  8. 8. Proteínas de 2 estados Estabilidad  Folding  Unfolding  22 proteínas, 583 mutaciones
  9. 9. Proteínas de 2 estados Estabilidad  Folding  Unfolding  22 proteínas, 583 mutaciones
  10. 10. Proteínas de 2 estados Estabilidad  Folding  Unfolding  22 proteínas, 583 mutaciones
  11. 11. Efecto de las mutaciones en distintas condiciones de desplegamiento Fisiológicas No fisiológicas Unfolding  5 proteínas, 139 mutaciones
  12. 12. Proteínas de 3 estados ΔGIU ΔGNU ΔGNI Estabilidad termodinámica (Steipe 1994)
  13. 13. Proteínas de 3 estados ΔGIU ΔGNU ΔGNI Estabilidad termodinámica (Steipe 1994) Estabilidad respecto al intermedio (Sancho 2002)
  14. 14. Proteínas de 3 estados N vs. U  N vs. I  I vs. U  4 proteínas, 61 mutaciones
  15. 15. Proteínas de 3 estados N vs. U  N vs. I  I vs. U  4 proteínas, 61 mutaciones
  16. 16. Proteínas de 3 estados N vs. U  N vs. I  I vs. U  4 proteínas, 61 mutaciones
  17. 17. Conclusiones • Proteínas de 2 estados Estabilidad  Folding  Unfolding  • Proteínas de 3 estados N vs. U  N vs. I  I vs. U  • ¡Queda mucho por explorar!
  18. 18. Laboratorio de fisiología proteica www.proteinphysiologylab.tk Universidad de Buenos Aires, FCEyN, Departamento de Química Biológica Diego U. Ferreiro, Ignacio E. Sánchez Objetivo: integrar información de secuencia, estructura y función para entender cómo las proteínas responden de forma compleja a estímulos.
  19. 19. Folding 

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