Successfully reported this slideshow.
We use your LinkedIn profile and activity data to personalize ads and to show you more relevant ads. You can change your ad preferences anytime.

Андрей Гаража. Биоинформатика

  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

Андрей Гаража. Биоинформатика

  1. 1. Биоинформатика Анализ больших геномов и транскриптомов
  2. 2. Первичная структура <ul><ul><li>ДНК, РНК (4 буквы) </li></ul></ul><ul><ul><li>… AACTAATCCGTGACAAATTACCAGATTAATTTTGTAC … </li></ul></ul><ul><ul><li>Белки (20 букв) </li></ul></ul><ul><ul><li>… SNIEEVRARGGQLYVFADQDAGFVSSDNMHIIEMPH … </li></ul></ul>
  3. 3. Геном человека <ul><ul><li>длина ≈ 3.2 млрд. пар оснований </li></ul></ul><ul><ul><li>экзоны ≈ 1,5 % </li></ul></ul><ul><ul><li>гены ≈ 35% </li></ul></ul><ul><ul><li>области повторов >60% </li></ul></ul><ul><ul><li>отличие людей друг от друга ≈ 0. 1 % </li></ul></ul><ul><ul><li>отличие людей от шимпанзе ≈ 1.2 % </li></ul></ul>
  4. 4. Рост накопления данных
  5. 5. Постановка задачи 3, 2 млрд. 100-10000
  6. 6. Создание сервиса обработки данных >> GTACAACTAATCCGTGACAAATTACCAGATTAATTTTACTTTATTTCTTCAGGCCTGGGGTTTTTCGATGACTTCAAATTTGGGATCTTCAAATTTGAAGGTGGGAAATGTATTCATGTCTGCATTACCAAACATTTGCTTGAGCTTAAAAAGCTCCCTCTCCAGCTCTTGCTGATACTCTGAACTAGCATCAACAGGTCCTCCAGATGTCTGTCGCTTAGATTTGTATTCTCTAATCTTGTCCACAAAGAGTTTCTGTATAGGATCAAGTTCCTTATTAAATGCCACTGCTGTAACACCAATGTTCCTCCGCAAATGGACTGAGACGGCTGACCGAATGACAGAGGAGAACCTGAAGAGCCTCTGAAGAATCATGCTGATTCGGCCAAAGGTTAGTAGGTTTCCTCCAGATGTCTGTGTCCTCCAGATGTCTGTTCCTCCAGATG
  7. 7. Создание многопользовательского сервиса >> GTACAACTAATCCGTGACAAATTACCAGATTAATTTTACTTTATTTCTTCAGGCCTGGGGTTTTTCGATGACTTCAAATTTGGGATCTTCAAATTTGAAGGTGGGAAAT >> GTTTTTCGATGACTTCAAATTTGGGATCTTCAAATTTGAAGGTGGGAAATGTATTCATGTCTGCATTACCAAACATTTGCTTGAGCTTAAAAAGCTCCCTCTCCAGCT >> TGTATAGGATCAAGTTCCTTATTAAATGCCACTGCTGTAACACCAATGTTCCTCCGCAAATGGACTGAGACGGCTGACCGAATGACAGAGGAGAACCTGAAGAG
  8. 8. Спасибо за внимание! Андрей Гаража, МФТИ, ИБХ РАН [email_address]

×