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Juan Ospina Bacteriólogo, Candidato a Magister en Ciencias en
Biomedicina Molecular. juando12358@gmail.com
Introducción
• El virus de la influenza porcina triple-recombinada, que contiene genes
humanos, de cerdos y el virus de la influenza aviar tipo A, ha sido
identificada en cerdos en los Estado Unidos (E.U) desde 1998.
• El 15 y el 17 de mayo de 2009, El CDC identificó 2 casos de infecciones
humanas por influenza A H1N1 de origen porcino (S-OIV) caracterizado
por una única combinación de genes segmentados del virus de la influenza
A que no habían sido identificados en humanos o cerdos.
• Desde el 5 de mayo de 2009 venían siendo identificados casos de
infecciones en humanos con el mismo virus en México, Canadá y otros
lugares.
• Este artículo ha reportaron los primeros 642 casos confirmados de
infecciones humanas por este virus en los E.U.
http://www.cdc.gov/h1n1flu/images.htm
1. Makoto Takeda, Andrew Pekosz, Kevin Shuck, Lawrence H. Pinto, and Robert A. Lamb. Influenza A Virus M2 Ion Channel Activity Is Essential for Efficient
Replication in Tissue Culture. JOURNAL OF VIROLOGY, 0022-538X/02/$04.000 DOI: 10.1128/JVI.76.3.1391–1399.2002 Feb. 2002, p. 1391–1399
Familia: Orthomyxoviridae
Genoma: 8 cadenas simples
RNA tasa mutación >1´000.000 DNA
HA: hemaglutinina
NA: neuraminidasa
NP: nucleoproteinas
M: proteínas de matriz
PA, PB1,PB2: ARN polimerasa
Amantadina
Influenza A (H1N1)
CICLO
CELULAR
INFLUENZA
A(H1N1)
Paciente 1
30/03/09 01/04/09 14/04/09
Niño de 10 años con
asma.
Comienza con tos,
fiebre y vomito
Fue recibido en la
unidad de cuidados
intensivos.
Recibió tratamiento
para sus síntomas.
El CDC identificó un
nuevo virus de la
influenza A (H1N1) de
origen porcino
Se recuperó una
semana después de
su tratamiento.
Se identificó un virus de la
influenza A a partir de una
muestra de nasofaringe a través
de un estudio que evaluaba una
nueva técnica experimental.
El CDC notificó al
departamento de salud
pública de california y se
inicio investigación
epidemiológica por parte
del estado y el
departamento de salud
pública oficial y oficiales de
salud animal.
El virus aislado contenía
una recombinaciones de
genes de 3 tipos de virus.
Los cuales circulaban en
América y Eurasia.
Con el uso de RT-PCR se
determino que era un virus de
influenza A no compatible con los
subtipos H1N1 y H3N2, H5N1
M Ginsberg, MD, J Hopkins, MPH, A Maroufi,
MPH, G Dunne. Et al. Infección por influenza
A porcina (H1N1) en dos niños --- sur de
California, marzo--abril de 2009
Paciente 2
28/03/09 30/03/09 17/04/09
Niña de 9 años sin
vinculo epidemiológico
con paciente 1.
Comenzó con tos y
fiebre
Ingresa
ambulatoriamente a
un proyecto de
estrecha vigilancia
epidemiológica de la
influenza.
El CDC recibe la
muestra e identifica
un nuevo virus de
influenza A (H1N1)
de origen porcino.
La paciente fue tratada con amoxicilina-clavulanato. Se recuperó sin problemas.
Se envío la muestra al centro de investigación de salud naval de San Diego, allí se
identifico virus de influenza A no subclasificado.
El genotipo del virus fue
similar al virus aislado de la
muestra del paciente 1.
Se reportan ambos casos a
la OMS de acuerdo a lo
provisto por El Reglamento
Sanitario Internacional
(IRH)
M Ginsberg, MD, J Hopkins, MPH, A Maroufi,
MPH, G Dunne. Et al. Infección por influenza
A porcina (H1N1) en dos niños --- sur de
California, marzo--abril de 2009
Paciente 1 y 2
Recomendaciones del CDC para considerar
infección por S-OIV.
•Vivir en áreas con casos confirmados de S-OIV en humanos
•Historial de viaje a otras áreas o contacto con personas
infectadas provenientes de las mismas (7 días antes del
comienzo de los síntomas)
Frotis nasofaringe
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Definición de caso, virus de la influenza A (H1N1): Enfermedad
respiratoria aguda febril con confirmación para el virus S-OIV por Real
Time RT-PCR, cultivo viral o ambos.
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S.Merler, M. Ajelli, A. Pugliese, NM. Ferguson. Determinants of the
Spatiotemporal Dynamics of the
2009 H1N1 Pandemic in Europe: Implications for Real-
Time Modelling. September 2011 | Volume 7 | Issue 9 | e1002205
M Á Castro-Jiménez.J O Pabón, G J R. Benito, P.Domínguez. E p i d e
m i o lo g i c a n a ly s i s o f t h e l a bo r ato r y - co n f i rm e d
c a s e s o f i n f l u e n z a A(H1N1) v i n Co lom b i a. EUROSURVEI L
LANCE Vol . 14 · Issue 30 · 30 Jul y 2009 · www.eurosurveillance.org
Aislamientos virales
Un total de 49 aislamientos virales de muestras obtenidas de
pacientes con infección confirmada por el virus S-OIV en 13 estados
de E.U. crecieron en cultivo celular MDCK.
Secuenciación
Los amplicones para la secuenciación fueron generados por transcripción
reversa, seguido por amplificación por PCR para generar la doble hélice del
DNA con nuevos amplicones que cubran cada uno de los 8 segmentos del
genoma del virus de la influenza (200-250 nucleótidos)
Secuenciación de nucleótidos y
análisis filogenético
Software y análisis filogenético
La secuenciación se realizo con el programa BigDye Terminator v.3.1
y con el Sequencher Software Package versión 4.7. Todos los datos
secuenciados que fueron usados en este estudio están disponibles
en GenBank. Los análisis filogenéticos se encuentran en TreeView
versión 1.6.6
Real time RT-PCR
RT-PCR Real time PCR
Protocolo de la Real Time RT-PCR
para el virus de la influenza
porcina A(H1N1)
Panel primers de
oligonucleótidos
(Taqman®)
InfA
swInfA
swH1
OMS-CDC. Protocol of realtime RTPCR for swine influenza A(H1N1). 28 april 2009. revision 1, =30 April 2009.
Muestras aceptadas: LBA, AT,
Esputo, AóLNOF, HNOF,
2-4°C (<4)
ó (-70°C)
OMS-CDC. Protocol of realtime RTPCR for swine influenza A(H1N1). 28 april 2009. revision 1, =30 April 2009.
RESULTADOS
Del 15 de abril al 5 de mayo de 2009 se identificaron 642 casos de
infección humana por el virus S-OIV en 42 estados de los E.U.
Se reportaron también casos en México, Canadá y otros países.
381 (18%) de los 642 casos en E.U. tenían historia reciente de viajes
a México en los 7 días anteriores al inicio de los síntomas.
Al comienzo de la investigación se identificaron 4 grupos de
personas de escuelas y universidades con infección confirmada por
el virus S-OIV.
-Carolina del Sur (7 estudiantes)
-Delaware (22 estudiantes)
-Texas (5 estudiantes)
-New York (70 estudiantes)
HT Jordan, MD, MC Mosquera, MD; Swine Flu Investigation Team, New York City Dept of Health and Mental Hygiene, New
York. H Nair, PhD, AM France PhD, EIS officers, CDC. Swine-Origin Influenza A (H1N1) Virus Infections in a School --- New
York City, April 2009
JA Cordova, MD, M Hernandez, MD, PhD.Update: Novel Influenza A (H1N1) Virus Infection ---
Mexico, March--May, 2009. June 5, 2009 / 58(21);585-589.
Número acumulativo de
casos reportados de
H1N1 desde el 18 julio de
2009.
J. Lessler, T. dos Santos, X. Aguilera, PAHO Influenza. H1N1pdm in the Americas. Epidemics. 2010 September 1; 2(3): 132–138. doi:10.1016/j.epidem.2010.07.001.
5% ≥ 51 años
40% pacientes
entre 10-18 años
3 meses-81 años
Fiebre 94%
Tos 92%
Dolor de garganta 66%
Vómito 25%
Diarrea 25%
Rasgos clínicos y demográficos
19 meses 51 años
Rango edades
Recuperación
18/22; 82%
Condición
crítica
2/22; 9%
Muertes
2/22; 9%
• 14/22; (74%) pacientes
fueron tratados con
oltamivir.
• Pacientes que fallecieron;
bebe con miastenia grave
y mujer embarazada 33
años
• Pacientes que
evolucionaron a una
condición crítica; niño
23 meses, mujer de 30
años.
http://www.cdc.gov/h1n1flu/images.htm
ANÁLISIS DE LABORATORIO
• Todos los 642 aislamientos clínicos iniciales recibidos
por el CDC y analizados por Real Time RT-PCR fueron
confirmados como S-OIV.
• Combinación genética de
segmentos del virus de la
influenza nunca antes vista.
• 2 ≠ nucleótidos y 1 ≠ en
amino ácidos entre el paciente
1 y 2.
• Todos los aislamientos fueron
susceptibles a zanamivir y
oseltamivir.
Origen cepa A/California/04/2009
Resistencia a
bloqueadores
M2
(adamantanes)
Gen M
A/California/04/2009
Gen M
Linaje de virus de
cerdos de Eurasia.
Aislamientos
del brote
PB1
PB2
PA
NP
NS
Linaje porcino
Americano.
PB1
PB2
PA
NP
NS
99%
100%
Discusión
Hasta el 5 mayo de 2009
642 casos de infección
en humanos por un
nuevo virus de influenza
A de origen porcino
(H1N1) se identificaron
en E.U. México, Canadá y
otros lugares.
25 y 26 de Abril
OMS y posteriormente
U.S. declaran el brote
como una emergencia de
salud publica.
29 de Abril
La OMS eleva la
pandemia de nivel 4 a 5.
indicando que la
transmisión del virus de
persona a persona
estaba ocurriendo al
menos en 2 países de la
región.
Mayor amenaza
de pandemia
desde el virus de
la influenza A
(H3N2) en 1968.
Discusión
Gripe
estacional
Influenza A
(H1N1)
≤
18
años
•60% de
infectados
•Mas
susceptibles
a ser
infectados
por S-OIV
•Sesgo, mas
jóvenes
analizados?
Ancianos
•Transmisión
social
retrasada.
•Protección
cruzada con
vacuna de
influenza
1976?
Diseminación a través de
aerosoles y pequeñas
partículas.
Cuando la persona
infectada tose, es alto el
riesgo de transmisión a
través de fómites.
Debería investigarse la
transmisión oro-fecal, ya
que un alto porcentaje de
pacientes presentaban
diarrea.
Periodo de incubación
es aproximadamente
de 2-7 días.
FACTORES DE RIESGO
INFLUENZA ESTACIONAL
E INFLUENZA S-OIV.
 Niños menores de 5 años
 Adultos mayores de 65 años
 Niños y adultos con enfermedad
crónica subyacente.
 Mujeres embarazadas
o 12/22 pacientes hospitalizados
presentaban alguno de estos
factores de riesgo, pero ninguno
fue mayor de 65 años.
Recomendaciones del CDC
•Desarrollo del panel de detección Real time RT-PCR, FDA Bioshield 2004 autoriza su uso.
•Los médicos ante la sospecha enviaban muestra de nasofaringe a laboratorios de salud publica.
Real time RT-PCR
•2 antivirales disponibles; oseltamivir (neuraminidasa), rimantidina y amantidina (adamantanes)
Antivirales
•pacientes hospitalizados o con complicaciones por la infección S-OIV, terapia con Oseltamivir.
•Terapia con oseltamivir para menores de 1 año y quimioprofilaxis en mayores de 3 meses
Tratamiento
•Personal de la salud; bata, guantes, mascarilla, gafas, tapabocas N95.
•Aislamiento para casos positivos en cuarto cerrado con presión negativa
•Lavado frecuente de las manos con agua y jabón
•La identificación de casos geográficamente dispersos sugiere la facilidad de contagio a través de
viajes por aire y tierra.
Personal de salud y pacientes
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Pandemia de Influenza A(H1N1)

  • 1. Juan Ospina Bacteriólogo, Candidato a Magister en Ciencias en Biomedicina Molecular. juando12358@gmail.com
  • 2. Introducción • El virus de la influenza porcina triple-recombinada, que contiene genes humanos, de cerdos y el virus de la influenza aviar tipo A, ha sido identificada en cerdos en los Estado Unidos (E.U) desde 1998. • El 15 y el 17 de mayo de 2009, El CDC identificó 2 casos de infecciones humanas por influenza A H1N1 de origen porcino (S-OIV) caracterizado por una única combinación de genes segmentados del virus de la influenza A que no habían sido identificados en humanos o cerdos. • Desde el 5 de mayo de 2009 venían siendo identificados casos de infecciones en humanos con el mismo virus en México, Canadá y otros lugares. • Este artículo ha reportaron los primeros 642 casos confirmados de infecciones humanas por este virus en los E.U.
  • 3. http://www.cdc.gov/h1n1flu/images.htm 1. Makoto Takeda, Andrew Pekosz, Kevin Shuck, Lawrence H. Pinto, and Robert A. Lamb. Influenza A Virus M2 Ion Channel Activity Is Essential for Efficient Replication in Tissue Culture. JOURNAL OF VIROLOGY, 0022-538X/02/$04.000 DOI: 10.1128/JVI.76.3.1391–1399.2002 Feb. 2002, p. 1391–1399 Familia: Orthomyxoviridae Genoma: 8 cadenas simples RNA tasa mutación >1´000.000 DNA HA: hemaglutinina NA: neuraminidasa NP: nucleoproteinas M: proteínas de matriz PA, PB1,PB2: ARN polimerasa Amantadina Influenza A (H1N1)
  • 5. Paciente 1 30/03/09 01/04/09 14/04/09 Niño de 10 años con asma. Comienza con tos, fiebre y vomito Fue recibido en la unidad de cuidados intensivos. Recibió tratamiento para sus síntomas. El CDC identificó un nuevo virus de la influenza A (H1N1) de origen porcino Se recuperó una semana después de su tratamiento. Se identificó un virus de la influenza A a partir de una muestra de nasofaringe a través de un estudio que evaluaba una nueva técnica experimental. El CDC notificó al departamento de salud pública de california y se inicio investigación epidemiológica por parte del estado y el departamento de salud pública oficial y oficiales de salud animal. El virus aislado contenía una recombinaciones de genes de 3 tipos de virus. Los cuales circulaban en América y Eurasia. Con el uso de RT-PCR se determino que era un virus de influenza A no compatible con los subtipos H1N1 y H3N2, H5N1 M Ginsberg, MD, J Hopkins, MPH, A Maroufi, MPH, G Dunne. Et al. Infección por influenza A porcina (H1N1) en dos niños --- sur de California, marzo--abril de 2009
  • 6. Paciente 2 28/03/09 30/03/09 17/04/09 Niña de 9 años sin vinculo epidemiológico con paciente 1. Comenzó con tos y fiebre Ingresa ambulatoriamente a un proyecto de estrecha vigilancia epidemiológica de la influenza. El CDC recibe la muestra e identifica un nuevo virus de influenza A (H1N1) de origen porcino. La paciente fue tratada con amoxicilina-clavulanato. Se recuperó sin problemas. Se envío la muestra al centro de investigación de salud naval de San Diego, allí se identifico virus de influenza A no subclasificado. El genotipo del virus fue similar al virus aislado de la muestra del paciente 1. Se reportan ambos casos a la OMS de acuerdo a lo provisto por El Reglamento Sanitario Internacional (IRH) M Ginsberg, MD, J Hopkins, MPH, A Maroufi, MPH, G Dunne. Et al. Infección por influenza A porcina (H1N1) en dos niños --- sur de California, marzo--abril de 2009
  • 7. Paciente 1 y 2 Recomendaciones del CDC para considerar infección por S-OIV. •Vivir en áreas con casos confirmados de S-OIV en humanos •Historial de viaje a otras áreas o contacto con personas infectadas provenientes de las mismas (7 días antes del comienzo de los síntomas) Frotis nasofaringe Laboratorio de salud publica. RT-PCR Virus de la influenza A sin subclasificar al CDC Definición de caso, virus de la influenza A (H1N1): Enfermedad respiratoria aguda febril con confirmación para el virus S-OIV por Real Time RT-PCR, cultivo viral o ambos.
  • 8. Historia de viajes S.Merler, M. Ajelli, A. Pugliese, NM. Ferguson. Determinants of the Spatiotemporal Dynamics of the 2009 H1N1 Pandemic in Europe: Implications for Real- Time Modelling. September 2011 | Volume 7 | Issue 9 | e1002205 M Á Castro-Jiménez.J O Pabón, G J R. Benito, P.Domínguez. E p i d e m i o lo g i c a n a ly s i s o f t h e l a bo r ato r y - co n f i rm e d c a s e s o f i n f l u e n z a A(H1N1) v i n Co lom b i a. EUROSURVEI L LANCE Vol . 14 · Issue 30 · 30 Jul y 2009 · www.eurosurveillance.org
  • 9.
  • 10. Aislamientos virales Un total de 49 aislamientos virales de muestras obtenidas de pacientes con infección confirmada por el virus S-OIV en 13 estados de E.U. crecieron en cultivo celular MDCK. Secuenciación Los amplicones para la secuenciación fueron generados por transcripción reversa, seguido por amplificación por PCR para generar la doble hélice del DNA con nuevos amplicones que cubran cada uno de los 8 segmentos del genoma del virus de la influenza (200-250 nucleótidos) Secuenciación de nucleótidos y análisis filogenético Software y análisis filogenético La secuenciación se realizo con el programa BigDye Terminator v.3.1 y con el Sequencher Software Package versión 4.7. Todos los datos secuenciados que fueron usados en este estudio están disponibles en GenBank. Los análisis filogenéticos se encuentran en TreeView versión 1.6.6
  • 11. Real time RT-PCR RT-PCR Real time PCR
  • 12. Protocolo de la Real Time RT-PCR para el virus de la influenza porcina A(H1N1) Panel primers de oligonucleótidos (Taqman®) InfA swInfA swH1 OMS-CDC. Protocol of realtime RTPCR for swine influenza A(H1N1). 28 april 2009. revision 1, =30 April 2009. Muestras aceptadas: LBA, AT, Esputo, AóLNOF, HNOF, 2-4°C (<4) ó (-70°C)
  • 13. OMS-CDC. Protocol of realtime RTPCR for swine influenza A(H1N1). 28 april 2009. revision 1, =30 April 2009.
  • 14. RESULTADOS Del 15 de abril al 5 de mayo de 2009 se identificaron 642 casos de infección humana por el virus S-OIV en 42 estados de los E.U. Se reportaron también casos en México, Canadá y otros países. 381 (18%) de los 642 casos en E.U. tenían historia reciente de viajes a México en los 7 días anteriores al inicio de los síntomas. Al comienzo de la investigación se identificaron 4 grupos de personas de escuelas y universidades con infección confirmada por el virus S-OIV. -Carolina del Sur (7 estudiantes) -Delaware (22 estudiantes) -Texas (5 estudiantes) -New York (70 estudiantes) HT Jordan, MD, MC Mosquera, MD; Swine Flu Investigation Team, New York City Dept of Health and Mental Hygiene, New York. H Nair, PhD, AM France PhD, EIS officers, CDC. Swine-Origin Influenza A (H1N1) Virus Infections in a School --- New York City, April 2009
  • 15.
  • 16.
  • 17. JA Cordova, MD, M Hernandez, MD, PhD.Update: Novel Influenza A (H1N1) Virus Infection --- Mexico, March--May, 2009. June 5, 2009 / 58(21);585-589.
  • 18. Número acumulativo de casos reportados de H1N1 desde el 18 julio de 2009. J. Lessler, T. dos Santos, X. Aguilera, PAHO Influenza. H1N1pdm in the Americas. Epidemics. 2010 September 1; 2(3): 132–138. doi:10.1016/j.epidem.2010.07.001.
  • 19. 5% ≥ 51 años 40% pacientes entre 10-18 años 3 meses-81 años Fiebre 94% Tos 92% Dolor de garganta 66% Vómito 25% Diarrea 25% Rasgos clínicos y demográficos
  • 20. 19 meses 51 años Rango edades
  • 21. Recuperación 18/22; 82% Condición crítica 2/22; 9% Muertes 2/22; 9% • 14/22; (74%) pacientes fueron tratados con oltamivir. • Pacientes que fallecieron; bebe con miastenia grave y mujer embarazada 33 años • Pacientes que evolucionaron a una condición crítica; niño 23 meses, mujer de 30 años.
  • 23. • Todos los 642 aislamientos clínicos iniciales recibidos por el CDC y analizados por Real Time RT-PCR fueron confirmados como S-OIV.
  • 24. • Combinación genética de segmentos del virus de la influenza nunca antes vista. • 2 ≠ nucleótidos y 1 ≠ en amino ácidos entre el paciente 1 y 2. • Todos los aislamientos fueron susceptibles a zanamivir y oseltamivir.
  • 26. Resistencia a bloqueadores M2 (adamantanes) Gen M A/California/04/2009 Gen M Linaje de virus de cerdos de Eurasia. Aislamientos del brote PB1 PB2 PA NP NS Linaje porcino Americano. PB1 PB2 PA NP NS 99% 100%
  • 27. Discusión Hasta el 5 mayo de 2009 642 casos de infección en humanos por un nuevo virus de influenza A de origen porcino (H1N1) se identificaron en E.U. México, Canadá y otros lugares. 25 y 26 de Abril OMS y posteriormente U.S. declaran el brote como una emergencia de salud publica. 29 de Abril La OMS eleva la pandemia de nivel 4 a 5. indicando que la transmisión del virus de persona a persona estaba ocurriendo al menos en 2 países de la región. Mayor amenaza de pandemia desde el virus de la influenza A (H3N2) en 1968.
  • 28. Discusión Gripe estacional Influenza A (H1N1) ≤ 18 años •60% de infectados •Mas susceptibles a ser infectados por S-OIV •Sesgo, mas jóvenes analizados? Ancianos •Transmisión social retrasada. •Protección cruzada con vacuna de influenza 1976?
  • 29. Diseminación a través de aerosoles y pequeñas partículas. Cuando la persona infectada tose, es alto el riesgo de transmisión a través de fómites. Debería investigarse la transmisión oro-fecal, ya que un alto porcentaje de pacientes presentaban diarrea. Periodo de incubación es aproximadamente de 2-7 días. FACTORES DE RIESGO INFLUENZA ESTACIONAL E INFLUENZA S-OIV.  Niños menores de 5 años  Adultos mayores de 65 años  Niños y adultos con enfermedad crónica subyacente.  Mujeres embarazadas o 12/22 pacientes hospitalizados presentaban alguno de estos factores de riesgo, pero ninguno fue mayor de 65 años.
  • 30. Recomendaciones del CDC •Desarrollo del panel de detección Real time RT-PCR, FDA Bioshield 2004 autoriza su uso. •Los médicos ante la sospecha enviaban muestra de nasofaringe a laboratorios de salud publica. Real time RT-PCR •2 antivirales disponibles; oseltamivir (neuraminidasa), rimantidina y amantidina (adamantanes) Antivirales •pacientes hospitalizados o con complicaciones por la infección S-OIV, terapia con Oseltamivir. •Terapia con oseltamivir para menores de 1 año y quimioprofilaxis en mayores de 3 meses Tratamiento •Personal de la salud; bata, guantes, mascarilla, gafas, tapabocas N95. •Aislamiento para casos positivos en cuarto cerrado con presión negativa •Lavado frecuente de las manos con agua y jabón •La identificación de casos geográficamente dispersos sugiere la facilidad de contagio a través de viajes por aire y tierra. Personal de salud y pacientes