Filogeografía<br />Jatziri Alejandra Calderón Chávez<br />
¿Qué es?<br />Subdisciplina de la biogeografía histórica.<br />Análisis espacial de los linajes génicos para elucidar patr...
¿Para qué?<br />Secuencias de colonización, diversificación y extinción de los linajes génicos.<br />Comparación: eventos ...
¿Qué ayudó?<br />DNA<br />Técnicas moleculares. <br />Teoría de la coalescencia (Kingman, 1982)<br />Bioinformática y herr...
ADNcp y ADNn.</li></li></ul><li>Conceptos<br />Coalescencia<br />Todos los alelos de un gen en una generación derivan (o “...
En cada dicotomía hay un polimorfismo (SNPs, longitud de micro y minisatélites, deleciones, inserciones).<br />
DNAmt<br />Molécula circular sin histonas.<br />Se hereda por vía materna.<br />De cientos a miles de mitocondrias con var...
Haplotipo<br />Combinación de alelos ligados a múltiples loci que se transmiten juntos. Conjunto de genes que determinan u...
Reloj molecular<br />Para evaluar las relaciones evolutivas entre diferentes alelos se estima en cuánto tiempo divergieron...
Métodos de análisis de datos<br />Cladístico de datos filogeográficos.<br />- Unidad terminal es un haplotipo<br />- Datos...
Estadístico de datos filogeográficos<br />Análisis cladístico anidado. Probar y detectar estadísticamente los mecanismos e...
WANg, i.j.,crawford, a.j. y e- Bermiingham. Phylogeographic of thepigmy rain frog (pristimantisridens) acrossthelowlandwet...
López de Heredia L. U. 2006. Filogeografía de los quercusesclerófilos (Q. ilex, Q. suber , y Q. coccifera) en el Mediterrá...
Contreras-díaz H.G. 2004. Filogeografía del género Pimelia (col., Tenebrionidae) en la isla de gran canaria: implicaciones...
COnclusiones<br />Engloba aspectos temporales (relaciones evolutivas) y espaciales (distribución geográfica).<br />La MUTA...
referencias<br />Vázquez-Domínguez, E., Castañeda-Rico, S., Garrido-Garduño, T. y T.A. Gutiérrez-García. 2002. Avances met...
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Filogeografía

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Presentación realizada por la alumna Jatziri Alejandra Calderón Chávez para la asignatura de Genética I.

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Filogeografía

  1. 1. Filogeografía<br />Jatziri Alejandra Calderón Chávez<br />
  2. 2. ¿Qué es?<br />Subdisciplina de la biogeografía histórica.<br />Análisis espacial de los linajes génicos para elucidar patrones y procesos históricos, evolutivos y ecológicos que determinan la distribución de la biota en el planeta. <br />
  3. 3.
  4. 4. ¿Para qué?<br />Secuencias de colonización, diversificación y extinción de los linajes génicos.<br />Comparación: eventos comunes de vicarianza o dispersión y a identificar causas geológicas, ecológicas o etológicas que pudieran haber influido en ellos.<br />
  5. 5. ¿Qué ayudó?<br />DNA<br />Técnicas moleculares. <br />Teoría de la coalescencia (Kingman, 1982)<br />Bioinformática y herramientas computacionales.<br />¿Con qué?<br /><ul><li>ADNmt.
  6. 6. ADNcp y ADNn.</li></li></ul><li>Conceptos<br />Coalescencia<br />Todos los alelos de un gen en una generación derivan (o “coalescen” hacia) un único alelo ancestral. Modelo de separación de linajes y deriva génica que se retrotrae en el tiempo, hasta un ancestro en común.<br />Genealogía de un gen en función<br />de parámetros demográficos.<br />Predicciones sobre los patrones<br />de variación genética, tiempo.<br />
  7. 7.
  8. 8. En cada dicotomía hay un polimorfismo (SNPs, longitud de micro y minisatélites, deleciones, inserciones).<br />
  9. 9. DNAmt<br />Molécula circular sin histonas.<br />Se hereda por vía materna.<br />De cientos a miles de mitocondrias con varias copias.<br />Un haplotipo propio.<br />Extenso polimorfismo y alta tasa de mutación. <br />No presenta recombinación.<br />Herencia casi exclusivamente<br />materna<br />
  10. 10. Haplotipo<br />Combinación de alelos ligados a múltiples loci que se transmiten juntos. Conjunto de genes que determinan un cierto fenotipo.<br /><ul><li>Filograma</li></ul>Hipótesis gráfica de las relaciones filogenéticas y temporales de los organismos, que refleja su historia evolutiva.<br />
  11. 11. Reloj molecular<br />Para evaluar las relaciones evolutivas entre diferentes alelos se estima en cuánto tiempo divergieron dos secuencias homólogas. <br />20 / 500 = 0.04(100) = 4%<br />
  12. 12. Métodos de análisis de datos<br />Cladístico de datos filogeográficos.<br />- Unidad terminal es un haplotipo<br />- Datos: secuencias de genes<br />- Filogramas<br />- Se superponen a la distribución geográfica a fin de interpretar el proceso evolutivo.<br />
  13. 13.
  14. 14. Estadístico de datos filogeográficos<br />Análisis cladístico anidado. Probar y detectar estadísticamente los mecanismos evolutivos responsables de la distribución espacial de los patrones de variación genética observada.<br />
  15. 15. WANg, i.j.,crawford, a.j. y e- Bermiingham. Phylogeographic of thepigmy rain frog (pristimantisridens) acrossthelowlandwetforests of isthmian central america. Molecular phylogenetis and evolution 47(2008): 992-1004<br />
  16. 16.
  17. 17. López de Heredia L. U. 2006. Filogeografía de los quercusesclerófilos (Q. ilex, Q. suber , y Q. coccifera) en el Mediterráneo occidental. Tesis doctoral. UPM.<br />Quién posee mayor diversidad genética.<br />Quién es más homogéneo en los marcadores nucleares.<br />Linajes organulares compartidos.<br />Patrón vicariante.<br />Refugios glaciares y colonización. Tiempos.<br />
  18. 18. Contreras-díaz H.G. 2004. Filogeografía del género Pimelia (col., Tenebrionidae) en la isla de gran canaria: implicaciones para su conservación. BOLN. ASOC. Esp. Ent., 28(1-2):217-239<br />
  19. 19. COnclusiones<br />Engloba aspectos temporales (relaciones evolutivas) y espaciales (distribución geográfica).<br />La MUTACIÓN es el puente entre genealogías y datos genéticos. <br />Árboles de genes producto, ofrecen una estimación a largo plazo del tamaño efectivo de las poblaciones, su tasa de mutación e intensidad de su flujo génico histórico.<br />
  20. 20.
  21. 21.
  22. 22. referencias<br />Vázquez-Domínguez, E., Castañeda-Rico, S., Garrido-Garduño, T. y T.A. Gutiérrez-García. 2002. Avances metodológicos para el estudio conjunto de la información genética, genealógica y geográfica en análisis evolutivos y de distribución. Revista Chilena de Historia Natural 82: 277-297.<br />Lanteri A.A. y V.A. Confalonieri. 2000. "FIlogeografía: objetivos, métodos y ejemplos," en Morrone JJ y Llorente Bousquets J (eds.) Una Perspectiva Latinoamericana de la Biogeografía. Las Presas de Ciencias, UNAM, México, D.F. <br />Morando, M. Árboles genealógicos, teoría de la coalescencia y el análisis de polimorfismos genéticos. Filogeografía estadística. Centro Nacional Patagónico-CONICET<br />

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