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Microbial diversity and ecology: Microbial evolution

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Microbial diversity and ecology: Microbial evolution

  1. 1. LS2026 Microbiology 微生物學 陳俊堯 老師 生命科學系 D928 cychen@mail.tcu.edu.tw
  2. 2.  Chemoheterotroph  Chemolithotroph  Photoheterotroph  Photolithotroph 2
  3. 3.  根據 DNA 相似程度區分  Prokaryotes  Archaea 古菌界  Bacteria 細菌界  Eucarya 真核界 3
  4. 4.  Eukaryote = archaea + 產能的 bacteria (mitochondria) + 利用光的 cyanobacteria (cyanobacteria) 4 http://learn.genetics.utah.edu/content/cells/organell
  5. 5.  外型很相似,不能像動植 物那樣用外型區分。  先來看看傳統方法,再來 看現代方法。 5 blog.qatestlab.com
  6. 6.  形態:細胞是球菌或桿菌, 大小, 菌落顏色, 形狀等。  生理活性:能不能利用 glucose, 需不需要氧氣, 會 不會還原 nitrate, 能不能氧化鐵。  缺點:會受到趨同演化的影響 6 classroom.sdmesa.ed
  7. 7.  利用 DNA 序列來推算演化關係,當做分類的依據。 7 betastuffs.blogspot.com
  8. 8.  所有微生物都有的基因  演化速度不能太快  突變累積速度維持一致 8 威 蝦 米 哩
  9. 9.  rRNA 是組成 ribosome 的零件之一  Ribosome 有 small 和 large subunits 9 serc.carleton.edu
  10. 10. 1 http://www.insectscience.org/10.159/  原核:16S rRNA gene  真核:18S rRNA gene  合稱 small subunit RNA (ssRNA) 人氣 基因
  11. 11.  所有微生物都有的基因  演化速度不能太快  突變累積速度維持一致 1 有 沒 有 哩
  12. 12.  誰需要鑑定細菌?  病原菌鑑定  環境微生物鑑定  食品微生物鑑定 1 www.healthcarerelocationservices.com
  13. 13.  以 PCR 放大 16S rRNA 基因序列  進行 DNA 定序  對得到的序列跟資料庫 進行比對 1
  14. 14.  利用傳統鑑定方法當做 確認的工具。 1
  15. 15. 1 Deep-branching lineage Bacteria Archaea Eucarya
  16. 16. Euryarchaeota Crenarchaeota Korarchaeota Nanoarchaeota Thaumarchaeota
  17. 17.  Deep- branching lineages  Gram positive bacteria  Gram negative bacteria
  18. 18.  Deinococcus  Chloroflexi  Actinobacteria  Firmicutes  Cyanobacteria  Bacteroidetes  Spirochaetes  Proteobacteria

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