Successfully reported this slideshow.
We use your LinkedIn profile and activity data to personalize ads and to show you more relevant ads. You can change your ad preferences anytime.

Ngs 6

227 views

Published on

  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

Ngs 6

  1. 1. Шестое домашнее задание Граф де Брюйна 2 1. Упрощение графа Используя программу из задания №5, попробуйте две наиболее простые стратегии очистки графа от мусора: ● отбрасывание всех типов (тупиковых ребер с небольшим покрытием и небольшой длиной) ● отбрасывание всех низкопокрытых и коротких ребер Оцените, какой подход лучше, то есть письменно приведите краткое обоснование. 2. Оценка качества ассемблера Оцените полученные вами контиги, используя QUAST (/storage/labnas/NGS/6/ quast/). Тоже хотелось бы краткий отчет своими словами. Данные: Папка: /storage/labnas/NGS/6/ Данные: s_6.first1000.fastq s_6.first10000.fastq s_6.first100000.fastq Соответствующие им геномы: MG1655-K12.first1K.fasta MG1655-K12.first10K.fasta MG1655-K12.first100K.fasta

×