Successfully reported this slideshow.
We use your LinkedIn profile and activity data to personalize ads and to show you more relevant ads. You can change your ad preferences anytime.

Ontologias en BioInformatica | BioInformaticsGRX

66 views

Published on

Es un universo completo el conjunto de fenómenos biológicos y todos los niveles en que se pueden explicar. Desde los 95 en adelante, todo el conocimiento de la biología molecular comenzó a anotarse en grandes bases de datos. Hoy en día son esenciales en la práctica habitual de la bioinformática. Sin necesidad de saber sobre la enfermedad de la que te mandan un MicroArray de expresión génica eres capaz de conocer como está afectando al paciente. Todo esto es gracias a las ontologías y a los muchos métodos que las rodean. Saber sobre ellas y la matemática que requieren ante cada investigación donde se usen, es clave para obtener unas conclusiones ilustrativas. En esta charla se presentarán algunas ontologías, métodos, herramientas, y ejemplos de uso para que por vuestro propio pie o con nuestra ayuda sepáis usarlas.

Nos gustaría añadir como agradecimientos, a la Universidad de Granada, en especial, a la Facultad de Ciencias por prestar los espacios, así como la colaboración con la Sectorial de Alumnos de Biología.

¡Sigue a BioInformaticsGRX!
Instagram: https://www.instagram.com/bioinformat...
Twitter: https://twitter.com/bioinfGRX
Facebook: https://www.facebook.com/groups/bioin...
(Recomendado) Telegram: https://t.me/bioinformaticsGRX
Web: https://bioinformaticsgrx.es

Published in: Data & Analytics
  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

Ontologias en BioInformatica | BioInformaticsGRX

  1. 1. CICLO DE CHARLAS DE BIOINFORMÁTICA #BioinformaticsGRX
  2. 2. LAS ONTOLOGÍAS EN BIOINFORMÁTICA
  3. 3. Del griego: “οντος - λογια” “onto - logía” - EVIDENCIA CIENTIFICA (ARTÍCULOS) - PREDICCIÓN COMPUTACIONAL (“CONVENIENCIA GEOGRÁFICA”) - CURACIÓN MANUAL - CURACIÓN AUTOMÁTICA O SEMI - FORMATOS: - OWL - OBO - CSV/TSV ¿DSV?
  4. 4. CARACTERÍSTICAS 1. Relacionadas su mayoría con genes. 2. Pero también se aplican para otras entidades i.e. miRNAs. 3. Reflejan una realidad del sistema bajo estudio. 4. Suelen ser gráfos jerárquicos dirigidos acíclicos o BDs 5. Relativas a:
  5. 5. TOPGO GO SLIM
  6. 6. TSV/CSV TOPGO
  7. 7. OWL TOPGO
  8. 8. OBO TOPGO
  9. 9. TOPGO
  10. 10. $
  11. 11. $
  12. 12. $
  13. 13. $ KEGGDB
  14. 14. $ KEGGGRAPH
  15. 15. CASO DE USO SNPs/CNVs/INDELs
  16. 16. • Florencio Pazos, Adrian Garcia-Moreno, Juan C. Oliveros. (2018). Automatic detection of genomic regions with informative epigenetic patterns. BMC Genomics. In the press. Brain
  17. 17. • Florencio Pazos, Adrian Garcia-Moreno, Juan C. Oliveros. (2018). Automatic detection of genomic regions with informative epigenetic patterns. BMC Genomics. In the press. Cancer
  18. 18. • Florencio Pazos, Adrian Garcia-Moreno, Juan C. Oliveros. (2018). Automatic detection of genomic regions with informative epigenetic patterns. BMC Genomics. In the press. Fetal
  19. 19. PARA LOS MATEMÁTICOS Fisher Test’s Like (Hypergeometric, binomial…) Kolmogorov-Smirnov (GSEA), Gentleman’s Category, t-test Goeman’s globaltest, GlobalAncova

  20. 20. CONCLUSIONES
  21. 21. ¡Somos asociación! Charlas introductorias sobre todas las áreas Charlas avanzadas y técnicas con empresas e investigadores ¡Y más! Talleres, cursos, proyectos, hackatones... Únete para seguir apoyandonos y tendrás ventajas exclusivas
  22. 22. ¡Muchas gracias por asistir! t.me/bioinformaticsGRX @bioinfGRX https://github.com/bioinformaticsGRX bioinformaticsgrx.slack.com (con invitación) Dónde encontrarnos: @bioinfGRX bioinformaticsgrx@gmail.com

×