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Mc jacquemot piv2017_c

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Gestion des données scientifiques en imagerie in vivo – Journée scientifique organisée par PIV le 7 décembre 2017 au PARCC-HEGP
Marie-Christine Jacquemot
OPIDOR

Published in: Health & Medicine
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Mc jacquemot piv2017_c

  1. 1. OPIDoR, des services pour faciliter l’adoption des bonnes pratiques de gestion des données de la recherche Marie-Christine Jacquemot-Perbal, Inist-CNRS marie-christine.jacquemot@inist.fr
  2. 2. 1 « Open science for innovation and discovery » 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 Open Access Open Data Open Reproducible Science Open Science Tools By G.emmerich (Own work) CC BY-SA 3.0
  3. 3. 2 Principes pour une gestion bénéfique des données « FAIR Data principles »  « Findable » : facile à trouver par l’utilisation e , des métadonnées riches et le signalement dans un catalogue  « Accessible »: grâce aux identifiants par des . aux métadonnées  « Interoperable »: par l’application de l’utilisation de vocabulaires et des références vers autres données/métadonnées  « Reusable » : réutilisable grâce à une , accompagnée si nécessaire d’informations sur la , avec l’utilisation de standards communautaires et de Wilkinson et al. (2016) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4792175/ 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 Approuvés par la Commission européenne, G20, RDA, NIH, ELIXIR, Organization for Human Brain Mapping
  4. 4. 3 « Linked research objects » pour améliorer la réutilisation et la découverte 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 Research object Research object Methods/ protocols Data Data Softwares PID PID PID PID PID Workflows PID PID Persistent identifiers Methods/ protocols Data Provenance Softwares PID PID PID PID PID workflow PID PID PID Provenance Metadata Metadata Publication PID
  5. 5. Construire un écosystème propice au partage et à la réutilisation Engagement des acteurs et Harmonisation des pratiques Agences de financement Instances gouvernantes Organismes de recherche Universités Chercheurs Professionnels IST Archivistes Informaticiens Data librarians Data scientists Editeurs Fournisseurs d’infrastructure Cadre éthique et juridique Data & metadata peer-reviewing Environnement pédagogique Métriques
  6. 6. 5 Développement d’outils : un petit aperçu 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 RDA Metadata Standards Directory Linked Open Vocabulary
  7. 7. Data management plan « Data management plan as a key element of good data management » a DMP should include information on: • the handling of research data during and after the end of the project • what data will be collected, processed and/or generated • which methodology and standards will be applied • whether data will be shared/made open access and • how data will be curated and preserved (including after the end of the project). Source: Guidelines on FAIR Data Management in Horizon 2020 (European Commission, 2016, v3.0) Document dynamique : initié en amont du projet (de préférence dès le montage du projet) et continuellement mis à jour tout au long du projet Incitation voire obligation par : agences de financement de la recherche, organismes de recherche Pas seulement un formulaire administratif mais aussi un inventaire des données du projet de recherche Une représentation du cycle de vie Source : Université de Sydney 7/12/20176 MC Jacquemot-Perbal - PIV2017
  8. 8. 7 Modèle(s) de DMP  Structuration selon cycle de vie des données ou principes FAIR  Adaptation en fonction :  Financeur, organisation de recherche  Discipline/domaine, infrastructure, entrepôt  Actuellement, pas de modèle standard mais des éléments communs  Thèmes révisés DCC et UC3 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 Data description Data format Data volume Data collection Metadata documentation Ethics & privacy Intellectual property rights Storage & security Data sharing Data repositories Preservation Roles & responsabilities Budget Related policies
  9. 9. Acteurs impliqués dans la gestion des données DMP = opportunité pour établir un dialogue nécessaire pour la bonne conduite du projet Rencontre entre scientifiques, informaticiens, professionnels de l’information/data librarians (documentalistes, bibliothécaires, archivistes) => répartition des rôles et responsabilités Anticiper => identification et échange avec les services intervenant à différents stades du cycle de vie des données Scientifiques Informaticiens Data librarians 7/12/20178 MC Jacquemot-Perbal - PIV2017
  10. 10. 9 DMP OPIDoR 7/12/2017 DMP pour une Optimisation du Partage et de l’Interopérabilité des Données de la Recherche MC Jacquemot-Perbal - PIV2017
  11. 11. 10 Un service ouvert pour l’ESR 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017  Hébergé à l’Inist-CNRS, sur un serveur sécurisé (pas une archive)  Confidentialité : pas d’accès aux DMPs  Réutilisation du code open source de DMPonline développé par le Digital Curation Center  Maintenance corrective et évolutive de l’application : adaptation aux besoins de la communauté  Mise à disposition d’une instance de production et d’une instance « bac à sable »  Assistance conseil pour l’élaboration de DMPs et de modèles de DMPs info-opidor@inist.fr Assistance, conseils https://dmp.opidor.fr/ Instance de production
  12. 12. 11 Un outil collaboratif 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 Partage de DMPs avec des collaborateurs, personnels d’appui Echange de commentaires, questions
  13. 13. 12 7/12/2017 Un outil pédagogique
  14. 14. 13 Application des politiques de données 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 Ajout de modèles pour une organisation, une discipline, …
  15. 15. 14 Un vecteur d’harmonisation des pratiques 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 Ajout de recommandations • Standards, ontologies, identifiants, entrepôts, licences, réglementations, … • Liens vers des ressources, contacts A différents niveaux • Institutionnel, infrastructure, entrepôt … • Disciplines/domaine • CIL • PSSI
  16. 16. ADMP IG FAIR DMP Développements informatiques Retours utilisateurs/administrateurs Conseils DMP Modèle DMP Assistance technique Implémentation modèle DMP ESR Communauté internationale Propose des fonctionnalités Participe aux réflexions des WG 15 Evolution de DMP OPIDoR 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017
  17. 17. Evolutions techniques DMPRoadmap Amélioration des fonctionnalités • Internationalisation • API, … Standardisation de la structure du DMP Harmonisation par discipline DMP Common group Standards WG (RDA) • Développer un modèle informationnel commun qui rendra le DMP exploitable par les machines et interopérables “Domain Protocols for Research Data Management” • Modèle de DMP pour un domaine particulier Autres produits de la recherche à gérer Logiciels/codes et autres matériels • Software management plan • Outputs management plan : données, logiciels, matériels (anticorps, lignées cellulaires, réactifs) 16 Perspectives 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017
  18. 18. 17 Intégration dans le workflow de recherche : une illustration 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 Système d’informations administratives Plateforme d’acquisitionPlateforme de calcul Archivage Financeurs Entrepôts Annuaire de données Plateforme de gestion de projet Service stockage, sécurité des données Services d’appui (juridique, valorisation, accompagnement) Coordination, alimentation semi-automatique, réutilisation des informations => Qualité des données, inventaire dynamique
  19. 19. Catalogue pour une Optimisation du Partage et de l’Interopérabilité des Données de Recherche https://cat.opidor.inist.fr/ infocatopidor@inist.fr 18
  20. 20. 19 Cat OPIDoR Un catalogue référençant les services français dédiés aux données de la recherche 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017
  21. 21. 20 Identifier des services 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 Contribuer et ajouter vos services Type de services Stade du cycle de vie Domaine/discipline Localisation
  22. 22. 21 Portail OPIDoR 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 opidor.fr
  23. 23. 22 Ressources d’apprentissage : DoRANum 7/12/2017MC Jacquemot-Perbal - PIV2017 doranum.fr
  24. 24. Merci de votre attention 23

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