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Curso Padrões da Web Semântica e Dados Ligados - parte 3

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Terceira parte do curso sobre web semântica, RDF, OWL e dados ligados, ministrado no ILB em março de 2011

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Curso Padrões da Web Semântica e Dados Ligados - parte 3

  1. 1. Modelagem de Vocabulários e Ontologias em Linked Data Augusto Herrmann, SLTI/Ministério do Planejamento Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  2. 2. augusto.herrmann@planejamento.gov.br João Lima, Prodasen/Senado Federal joaolima@senado.gov.br Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  3. 3. Sobre esta apresentação Esta apresentação faz uso do software livre do W3C para apresentações em HTML, CSS e Javascript chamado Slidy. Para visualizar em tela cheia, pressione F11. Para avançar para o próximo slide, clique o mouse ou pressione a barra de espaços. Você também pode avançar e voltar usando as setas para esqueda e direita, bem como as telcas PgUp e PgDn. Home para o primeiro slide, End para o último. Para aumentar ou diminuir o tamanho, utilize “+“ e “-“ no teclado numérico. Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  4. 4. C mostra a lista de slide e F esconde ou exibe a barra inferior. Esta apresentação está disponibilizada sob uma licença Creative Commons. Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  5. 5. Onde procurar vocabulários? projeto Linking Open Vocabularies schemaweb (desatualizado!) schemapedia lista de vocabulários do wiki do semanticweb.org DERI Vocabularies vocab.org biblioteca de ontologias do Protégé Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  6. 6. Buscas de Vocabulários Sindice Talis Schema-Cache Swoogle Watson SWSE — Semantic Web Search Engine NCBO BioPortal (domínio da biologia) prefix.cc — busca de prefixos do DERI Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  7. 7. Vocabulários Importantes em Linked Data: DBpedia Ontology DBPedia iniciou-se com projeto de pesquisa da Freie-Universität Berlin dados extraídos da Wikipédia e estruturados por algoritmos e “templates” ontologia tem 272 classes e 1.300 propriedades quantidade aproximada de instâncias: 1.667.000 Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  8. 8. Vocabulários Importantes em Linked Data: CIDOC-CRM CIDOC-CRM oficialmente, 3 modelos distintos em RDF Schema (versão 5.0.2) initial codes, com rótulos em múltiplos idiomas (tem pt) initial codes seguidos de underscore (ex.: E55_) initial codes, seguidos do nome em inglês (ex.: E55.Type) implementação não-oficial da versão 5.0.2 em OWL DL, feita por pesquisadores da Universidade Erlangen- Nuremberg, atualizada em 2011 — URI http://erlangen- crm.org/current/ Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  9. 9. OWL 2, feita por Simon Reinhardt em 2009 — URI http://purl.org/NET/cidoc-crm/core# Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  10. 10. Vocabulários Importantes em Linked Data: FRBR FRBR Core e FRBR Extended versão do FRBRER em OWL-DL produzida por Ian Davis em 2005 — http://purl.org/vocab/frbr/core# e http://purl.org/vocab/frbr/extended# status não-oficial avaliada e elogiada pela IFLA em julho de 2008, com a ressalva de não corresponder exatamente ao FRBRER o mesmo relatório da IFLA recomendou a preparação para se modelar o FRBROO em RDF é usado pelo legislation.gov.uk Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  11. 11. “Ownership is important: FRBR core vs. FRBR-IFLA. Official owners should be quick in providing URIs, or else others will do it unofficially.” — Wiki do Grupo Incubador de Linked Data para Biblotecas no W3C “So after review and approval and the finding of a proper home, there will be an official RDF schema representing FRBR, authoritative and accurate, properly maintained, under version control, etc.” — do FRBR Blog, reportando-se sobre o encontro do grupo de revisão do FRBR, cocorrido durante a conferência IFLA 2008 em Quebec Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  12. 12. Vocabulários Importantes em Linked Data: Dublin Core Dublin Core http://purl.org/dc/terms/ → http://dublincore.org/2010/10 /11/dcterms.rdf# Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  13. 13. Vocabulários Importantes em Linked Data: SKOS SKOS — Simple Knowledge Organization System padrão do W3C Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  14. 14. Vocabulários Importantes em Linked Data: Wordnet Wordnet projeto da Universidade de Princeton Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  15. 15. Vocabulários Importantes em Linked Data: Umbel Umbel baseado no OpenCyc Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  16. 16. Vocabulários Importantes em Linked Data: WGS84 do W3C vocabulário de georreferenciamento ... Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  17. 17. Vocabulários Importantes em Linked Data: Geonames vocabulário de georreferenciamento ... Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  18. 18. Vocabulários Importantes em Linked Data: FOAF FOAF - Friend of a Friend representar pessoas e relacionamentos interpessoais modelagem simples (7 classes e 12 propriedades “core”) um dos vocabulários mais antigos (começou no ano 2000) possivelmente o mais utilizado vocabulário em Linked Data Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  19. 19. Vocabulários Importantes em Linked Data: SIOC SIOC - Semantic Interlinked Online Communities representar postagens de blogs, microblogs, fóruns, etc. Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  20. 20. Vocabulários Importantes em Linked Data: DOAP DOAP - Description of a Project metadados sobre projetos Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  21. 21. Vocabulários Importantes em Linked Data: Good Relations Good Relations vocabulário para o domínio de comércio eletrônico Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  22. 22. Vocabulários Importantes em Linked Data: OAI-ORE OAI-ORE Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  23. 23. Vocabulários Importantes em Linked Data: VANN / VOID VANN ... VOID ... Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  24. 24. Metodologias de Construção de Ontologias baseado na revisão bibliográfica de Luana Faria Sales (UFF, 2006): Bouald et al (1994, 1995) TOVE — Grunninger e Fox (1995) &mdash “competency question” ENTERPRISE — Uschold e King (1995) identificar o propósito identificar nível de formalidade necessário Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  25. 25. identificar escopo construção da ontologia avaliação / ciclo da revisão acompanhamento KBSI IDEF5 — Slatery (1997) Methontology — Fernandez, Gomez-Perez e Juristo (1997) Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  26. 26. Metodologias de Construção de Ontologias Infosleuth — Hwang (1999) ABC Model — Dan Brickley, Hunter e Lagoze (1999) OntoKnowledge — Kletz, Maedache e Volz (2000) Noi e McGuinnes (2001) — construção da hierarquia de classes: bottom up top down combinação dos dois processos Sure, Staab e Studer (2002)Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  27. 27. Almeida (2003) Pinto e Martins (2004) Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  28. 28. Boas Práticas em modelagem do wiki vocamp.org (resumo de Noi e McGuinness - http://protege.stanford.edu/publications /ontology_development/ontology101-noy-mcguinness.html): definições escopo propósito pergunta-requisito (“competency questions”) obtenha o conhecimento do domínio reaproveite vocabulários existentes escrevaLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  29. 29. lista ou diagrama de classes ecolha das propriedades — quais terão literais como objeto e quais terão URIs teste o modelo com as perguntas-requisito Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  30. 30. “Competency Questions” — Exemplo de Choi et al: Competency questions Concepts Relationships Basic Find structural and identification information for a small molecule of Structural information; Identification information; Small molecule Small molecule has structure; Small molecule has identification information Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  31. 31. Competency questions Concepts Relationships interest Find all physical properties for a small molecule of interest Physical property; Small molecule Small molecule has physical properties Find all small molecules which target a protein of interest Protein; Target; Small molecule Small molecule targets protein Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  32. 32. Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  33. 33. “Competency Questions” — Exemplo continuação: Competency questions Concepts Relationships Complex Find the names and subcellular locations of proteins that are targeted by a specific small molecule Subcellular location; Protein; Target; Small molecule Small molecule targets protein; Protein has identifying information name; Protein localized to subcellular location Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  34. 34. Competency questions Concepts Relationships For a given protein, find its subcellular locations and infer more general location information based on Gene Ontology, and find small molecules which target the protein Protein; Subcellular location; Gene Ontology; Small molecule; Target Protein localized to subcellular location; Small molecule targets protein Find drug-like small molecules with Lipinski’s Rule of Five Small molecule; Drug-like Small molecule has attribute drug-likeness Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  35. 35. Competency questions Concepts Relationships molecule Find all proteins targeted by a specific small molecule, and identify pathways associated with those proteins Protein; Target; Small molecule; Pathway; Protein Protein part of pathway Find all small molecules that target proteins located in a specific location according to Gene Small molecule; Target; Protein; Gene Ontology Small molecule targets protein; Protein localized to subcellular location Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  36. 36. Competency questions Concepts Relationships Ontology Find all proteins that are associated with a specific KEGG pathway, and find the small molecules that target these proteins Protein; Pathway; Small molecule; Target; Protein Protein part of pathway; Small molecule targets protein Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  37. 37. Dúvidas ou Perguntas Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática
  38. 38. Exercícios: 1. Ligações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesLigações com Ontologias ExistentesBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoBoas Práticas e Modelagem para ReusoPráticaPrática

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