Successfully reported this slideshow.
Rete Regionale di Laboratori per gli Approcci di
Biologia dei Sistemi nelle Malattie Umane
(BISIMANE; cod.rete 44)
Coordin...
Le unità di ricerca
Unità di ricerca Responsabile
Piattaforma di Genomica Prof. Francesco Paolo Schena
Piattaforma di Tras...
Obiettivi della Rete
1. Mettere a disposizione dei centri di ricerca (pubblici e privati) e del
mondo produttivo industria...
Domanda di innovazione del sistema
produttivo
• Progetto FIRB RBAP11B2SX
(CAROMICS). Identificazione di
biomarkers sierici...
Attività/progetto/servizio 1.
Progetto FIRB RBAP11B2SX. Strategie innovative ad alta tecnologia per lo studio del
carcinom...
Immagini
Piattaforma di Trascrittomica, Policlinico, DETO-UNIBA
Piattaforma di Proteomica, Policlinico, UNIFG
SELDI-TOF/MS...
Immagini
Piattaforma di Metabolomica, Consorzio CARSO,
Valenzano, Bari
R.Ragone S.Piccinonna
Piattaforma di Biologia dei S...
Le attività svolte al 31/12/2013
Attività/progetto/servizio 1.
Progetto MR/K01353X/1. An integrative genomics approach for...
Immagini
Piattaforma di Genomica, Cons.CARSO, Valenzano, Bari
iSCAN iSQ
F.Sallustio S.Cox
Biobanca, Cons.CARSO, Valenzano,...
Le attività svolte al 31/12/2013
Attività/progetto/servizio 2.
Progetto RF/2009-1471624. Italian Multicenter Randomized Cl...
Immagini
Piattaforma di Genomica, Cons.CARSO, Valenzano, Bari
iSCAN iSQ
F.Sallustio – S.Cox
Piattaforma di Metabolomica, C...
Le attività svolte al 31/12/2013
Attività/progetto/servizio 3.
• Progetto PON REC 01-01958 PIVOLIO: Sono in corso gli stud...
Piattaforme di Metabolomica
L.Del Coco
Piattaforma di Metabolomica, 400 MHz – DiSTeBA, UNILE Piattaforma di Metabolomica, ...
Le attività svolte al 31/12/2013
Attività/progetto/servizio 4.
Progetto PON REC 3-00134 ONEV. Rafforzamento strutturale de...
Immagini
Piattaforma di Genomica, C.A.R.S.O.
iSCAN iSQ
F.Sallustio – S.Cox
Biobanca, C.A.R.S.O. GMP Facility, C.A.R.S.O.
S...
Le attività svolte al 31/12/2013
Progetto (St.3432) Individuazione di pattern genomici associati allo
stress ossidativo ed...
Le attività svolte al 31/12/2013
Progetto (RF-2009-1471624) Chronic rejection in kidney transplantation:
identification of...
Le attività svolte al 31/12/2013
Progetto PRIN 2008NY2B9T_001 Caratterizzazione genomica della risposta
T helper in corso ...
Le attività svolte al 31/12/2013
Progetto (245/RF-2009-1470765) Prevalence and impact on total mortality o
f chronic kidne...
Le attività svolte al 31/12/2013
Progetti • RICERCANDO 2010 (Società Italiana di Nefrologia):
“ Identificazione di biomarc...
Unità delle rete coinvolte
Piattaforma di Proteomica Bioagromed
Università di Foggia
MALDI/TOF/MS/MS Autofllex III Smatrbe...
Le attività svolte al 31/12/2013
Progetto (Ateneo 60%) Ruolo diagnostico del CA 15-3, CA 125 e della β2-
microglobulina ne...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA
Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati:
Sito...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA
Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati:
Sito...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA
Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati:
Sito...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA
Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it
Analisi deic...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA
Attività interna di Service:
Sito web della Rete: http://www.ca...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA
Attività interna di Service:
Sito web della Rete: http://www.ca...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA
Pubblicazioni
• Serino G, Sallustio F, Cox SN, Pesce F, Schena ...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA
Comunicazioni /Poster
• Poster: SN. Cox SN, Sallustio F, Serino...
• Poster: Serino G, Sallustio F, Curci C, Cox SN, Pesce F, De Palma G, Schena FP. Role of miRNA let-7b
in the Deregulation...
Attività promozionali svolte dal Consorzio C.A.R.S.O.
• PARTECIPAZIONE AD EVENTI
Festival dell’Innovazione – Bari 1 – 3 di...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI
TRASCRITTOMICA:
• Pubblicazione dei servizi offerti e dei relativi tarif...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI
TRASCRITTOMICA
Pubblicazioni
• Conserva F, Pontrelli P, Accetturo M, Cor...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI TRASCRITTOMICA
Comunicazioni / Poster
• SIN 2011 (PREMIO NATIONAL GRANT ...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI TRASCRITTOMICA
Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI PROTEOMICA
Pubblicazioni
• M. Papale…Gesualdo L. et al. Urine Proteome A...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI PROTEOMICA
Comunicazioni/Poster
• M. Papale….Ranieri E. et al. Combined ...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI PROTEOMICA
Comunicazioni / Poster
• ASN 2012. miRNA Microarray Expressio...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI METABOLOMICA
Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati:
...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI METABOLOMICA
Pubblicazioni
•Papadia P, Del Coco L, Muzzalupo I, Rizzi M,...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI METABOLOMICA
 Comunicazioni/Poster
 Caratterizzazione Geografica e Var...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOLOGIA DEI
SISTEMI.
Partecipazioni a Convegni e Congressi
• N. Ancona....
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOLOGIA DEI SISTEMI.
Partecipazioni a Convegni e Congressi
• P.F. Stifa...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOBANCA
Pubblicazioni
• Lucarelli G, Ditonno P, Bettocchi C, Vavallo A,...
Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOBANCA
Comunicazioni/Poster
• G. Lucarelli, M. Rutigliano, M. Fanelli,...
• Vavallo A, Forte S, Rutigliano M, Lucarelli G, Galleggiante V, Bettocchi C, Ditonno P, Ricapito V, Selvaggi FP, Battagli...
Attività programmate
- Progetto DIMOSTRATORE– Partecipano tutte le Piattaforme
FIRB RBAP11B2SX CAROMICS
- Progetti di rice...
- Depositi brevetti
Piattaforma di Genomica:
• PCT/IB2011/002637 “Combination of active ingredients for the
treatment of t...
METABOLOMICAPROTEOMICATRASCRITTOMICAGENOMICA
OMICHE E BIOLOGIA DEI SISTEMI (BISIMANE)
APPROCCIO INTEGRATO
PIATTAFORME Illu...
Contatti dei responsabili del Progetto BISIMANE
Prof. Francesco Paolo Schena paolo.schena@uniba.it
Prof. Loreto Gesualdo l...
Upcoming SlideShare
Loading in …5
×

RETI di LABORATORI - [Biotecnologie] BISIMANE

972 views

Published on

Published in: Science
  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

RETI di LABORATORI - [Biotecnologie] BISIMANE

  1. 1. Rete Regionale di Laboratori per gli Approcci di Biologia dei Sistemi nelle Malattie Umane (BISIMANE; cod.rete 44) Coordinatore scientifico Francesco Paolo Schena Consorzio CARSO Valenzano (Bari)
  2. 2. Le unità di ricerca Unità di ricerca Responsabile Piattaforma di Genomica Prof. Francesco Paolo Schena Piattaforma di Trascrittomica Prof. Loreto Gesualdo Piattaforma di Proteomica Prof. Elena Ranieri Piattaforma di Metabolomica Prof. Francesco Paolo Fanizzi Piattaforma di Biologia dei Sistemi Dr.Nicola Ancona Biobanca Prof. Michele Battaglia
  3. 3. Obiettivi della Rete 1. Mettere a disposizione dei centri di ricerca (pubblici e privati) e del mondo produttivo industriale i service di omiche forniti dalla rete (BISIMANE 44) 2. Realizzazione di un network informatico (rete GRID) tra i laboratori per lo scambio di dati ed elaborazione statistica (ONEV; PONa3-134) Settori di impatto 1. Centri di Ricerca (pubblici e privati) 2. Aziende Biotec 3. Aziende Farmaceutiche 4. Aziende dell’Agro-Alimentare
  4. 4. Domanda di innovazione del sistema produttivo • Progetto FIRB RBAP11B2SX (CAROMICS). Identificazione di biomarkers sierici ed urinari per la diagnosi precoce di carcinoma renale a cellule chiare. Imprese coinvolte: Biotec • Progetto PON 01-1958 (PIVOLIO). Identificazione del printing metabolomico degli oli extravergine di oliva prodotti nel territorio pugliese. Imprese coinvolte: Aziende olearie Offerta tecnologica della Rete • SERVICE svolto dalle piattaforme con prestazioni offerte da catalogo visionabile sui siti: DETO,UNIBA CARSO, Valenzano
  5. 5. Attività/progetto/servizio 1. Progetto FIRB RBAP11B2SX. Strategie innovative ad alta tecnologia per lo studio del carcinoma renale. Uso degli “OMICS” e della Biologia dei Sistemi per lo sviluppo dei nuovi biomarkers (CAROMICS). Risultati raggiunti: 1) Effettuate 104 nefrectomie per carcinoma renale (67 parziali e 37 radicali), da 22 feb 2012 al 31 dic 2013, di cui 54 con diagnosi istologica di RCC cellule chiare. 2) Raccolta e conservazione , da ciascun paziente, di tessuto renale sano, tessuto renale tumorale e di liquidi biologici (siero, plasma e urine pre e post-intervento). 3) Isolamento e caratterizzazione di cellule staminali normali (ARPCs) e tumorali (RCSCs) da 32 pazienti. 4) Studio del profilo di espressione genica ed identificazione dei marcatori di membrana in grado di discriminare le RCSCs rispetto alla controparte staminale sana (ARPCs). (Piattaforma di Genomica) 5) Studi del profilo di espressione proteica delle ARPCs e RCSCs 6) Studio del profilo metabolico delle ARPCs e RCSCs Imprese coinvolte Tipo di contatto Frequenza di contatto Nessuna Il contatto sarà attivato dopo i risultati definitivi PROGETTO DIMOSTRATORE
  6. 6. Immagini Piattaforma di Trascrittomica, Policlinico, DETO-UNIBA Piattaforma di Proteomica, Policlinico, UNIFG SELDI-TOF/MS DIGE Imaging System MALDI-TOF/MS/MS Piattaforma di Genomica, Cons.CARSO, Valenzano, Bari iSCAN iSQ F.Sallustio – S.Cox M.Accetturo M.Papale M.T.Rocchetti
  7. 7. Immagini Piattaforma di Metabolomica, Consorzio CARSO, Valenzano, Bari R.Ragone S.Piccinonna Piattaforma di Biologia dei Sistemi, CNR-ISSIA-Bari MT.Creanza Biobanca, Policlinico, DETO-UNIBA M.Rutigliano Piattaforma di Metabolomica, UNILE L.Del Coco
  8. 8. Le attività svolte al 31/12/2013 Attività/progetto/servizio 1. Progetto MR/K01353X/1. An integrative genomics approach for non –invasive biomarkers discovery in IgA nephropathy (UK – Italy). Risultati raggiunti. Individuazione di 20 variabili geniche in pazienti con IgA Nefropatia Ricadute industriali • Coinvolgimento di aziende Biotech Altri risultati Imprese coinvolte Tipo di contatto Frequenza di contatto Nessuna PROGETTI CHE UTILIZZANO LE PIATTAFORME OMICHE DELLA RETE BISIMANE
  9. 9. Immagini Piattaforma di Genomica, Cons.CARSO, Valenzano, Bari iSCAN iSQ F.Sallustio S.Cox Biobanca, Cons.CARSO, Valenzano, Bari G.De Palma
  10. 10. Le attività svolte al 31/12/2013 Attività/progetto/servizio 2. Progetto RF/2009-1471624. Italian Multicenter Randomized Clinical Trial on Subclinical Acute Rejection in Kidney transplant. Risultati raggiunti. Arruolamento di 110 pazienti con trapianto renale Ricadute industriali • Coinvolgimento di aziende Biotech Altri risultati Imprese coinvolte Tipo di contatto Frequenza di contatto Nessuna
  11. 11. Immagini Piattaforma di Genomica, Cons.CARSO, Valenzano, Bari iSCAN iSQ F.Sallustio – S.Cox Piattaforma di Metabolomica, Consorzio CARSO, Valenzano, Bari R.Ragone S.Piccinonna Biobanca, Cons.CARSO, Valenzano, Bari G.De Palma
  12. 12. Le attività svolte al 31/12/2013 Attività/progetto/servizio 3. • Progetto PON REC 01-01958 PIVOLIO: Sono in corso gli studi omici per caratterizzare l’imprinting metabolomico di 4 oli extravergine di olive monovarietali: 1. 1. Cima di Mola 2. 2. Coratina 3. 3. Ogliarola 4. 4. Peranzana Ricadute industriali. Proteggere e promuovere un prodotto più qualificato. Evidenziare le proprietà anti-infiammatorie Altri risultati Imprese coinvolte Tipo di contatto Frequenza di contatto OLIVETI TERRA DI BARI- BITONTO Partecipazione al progetto Periodica e subordinata al progetto. BASILE - ANDRIA Partecipazione al progetto Periodica e subordinata al progetto.
  13. 13. Piattaforme di Metabolomica L.Del Coco Piattaforma di Metabolomica, 400 MHz – DiSTeBA, UNILE Piattaforma di Metabolomica, 500 MHz – Consorzio CARSO R.Ragone S.Piccinonna
  14. 14. Le attività svolte al 31/12/2013 Attività/progetto/servizio 4. Progetto PON REC 3-00134 ONEV. Rafforzamento strutturale delle piattaforme omiche e formazione dei ricercatori. Costituzione della rete GRID per il trasferimento dei risultati tra le piattaforme Risultati raggiunti . Collaborazione con le altre Reti di Laboratorio: BIOPOP, LIFE, LABERPAR, TEGUVA, NABIDIT (Rete delle reti) Ricadute industriali • Coinvolgimento di aziende Biotec in campo umano, animale e vegetale Altri risultati Imprese coinvolte Tipo di contatto Frequenza di contatto
  15. 15. Immagini Piattaforma di Genomica, C.A.R.S.O. iSCAN iSQ F.Sallustio – S.Cox Biobanca, C.A.R.S.O. GMP Facility, C.A.R.S.O. Stabulario per animali germ-free, C.A.R.S.O. Piattaforma di Metabolomica, C.A.R.S.O. R.Ragone S.Piccinonna Piattaforma di Metabolomica, DiSTeBA - UNILE L.Del Coco
  16. 16. Le attività svolte al 31/12/2013 Progetto (St.3432) Individuazione di pattern genomici associati allo stress ossidativo ed alla microinfiammazione, significativamente modulati dal trattamento con eritropoietina in pazienti portatori di trapianto renale e con insufficienza renale cronica. Prospettive future per la farmacogenomica dell’eritropoietina Risultati raggiunti Ricadute industriali Definizione di un assay di PCR-multiplex di predizione della risposta farmacologica all’EPO individuare un gruppo di pazienti poco responsivi da monitorare nel tempo e da sottoporre a un trattamento farmacologico personalizzato o multifarmacologico. Altri risultati Imprese coinvolte Tipo di contatto Frequenza di contatto Amgen Dompè Monitoraggio e discussione risultati semestrale Attività/progetto/servizio 5
  17. 17. Le attività svolte al 31/12/2013 Progetto (RF-2009-1471624) Chronic rejection in kidney transplantation: identification of new dignostics targets Risultati raggiunti Ricadute industriali Definizione di un pannello di biomarcatori (geni e/o microRNA) per la diagnosi non invasiva di rigetto cronico in seguito a trapianto renale. Altri risultati Attività/progetto/servizio 6
  18. 18. Le attività svolte al 31/12/2013 Progetto PRIN 2008NY2B9T_001 Caratterizzazione genomica della risposta T helper in corso di rigetto cronico di trapianto renale Risultati raggiunti Ricadute industriali Definizione di un pannello di biomarcatori (geni e/o microRNA) per la diagnosi non invasiva di rigetto cronico in seguito a trapianto renale. Altri risultati Attività/progetto/servizio 7
  19. 19. Le attività svolte al 31/12/2013 Progetto (245/RF-2009-1470765) Prevalence and impact on total mortality o f chronic kidney disease in patients with ty pe 2 diabetes in Apulia Region. Risultati raggiunti Ricadute industriali Definizione di un pannello di biomarcatori (geni e/o microRNA) per la diagnosi non invasiva di nefropatia diabetica. Altri risultati Imprese coinvolte Tipo di contatto Frequenza di contatto Attività/progetto/servizio 8
  20. 20. Le attività svolte al 31/12/2013 Progetti • RICERCANDO 2010 (Società Italiana di Nefrologia): “ Identificazione di biomarcatori affidabili di nefropatia diabetica mediante strategie di analisi proteomica complementari” (UO coordinator M. Papale) • RF 2009 (Min. Sanità) (RF-2009-1470765): “Prevalenza ed impatto sulla mortalità totale della malattia cronica renale in pazienti con diabete mellito di tipo 2 in Puglia” (UO coordinator L. Gesualdo Risultati raggiunti: 1. Identificazione di un pattern proteomico urinario della nefropatia diabetica (ND) 2. Identificazione di un pattern di ubiquitinazione proteica nella ND 3. Sequenziamento, mediante AUTOFLEX III (Bisimane), di alcune proteine ubiquitinate escrete nelle urine dei pazienti ND e nelle cellule renali cresciute in iperglicemia 4. Inserire i risultati eventualmente prodotti dalla unità di trascrittomica DETO Ricadute industriali • Proof of concept per deposito brevetto internazionale di un kit utile per la diagnosi e il monitoraggio del danno renale nel diabete mellito di tipo II Altri risultati • Incremento delle conoscenze sulla patofisiologia del danno renale nel diabete di tipo 2 Imprese coinvolte Tipo di contatto Frequenza di contatto Apuliabiotech SCARL Trasferimemnto tecnologico semestrale Attività/progetto/servizio 9
  21. 21. Unità delle rete coinvolte Piattaforma di Proteomica Bioagromed Università di Foggia MALDI/TOF/MS/MS Autofllex III Smatrbeam (Bisimane) Piattaforma di Trascrittomica, UNIBA Inserire un box per L’unità di trascrittomica DETO che collabora allo svolgimento del progetto RF2009
  22. 22. Le attività svolte al 31/12/2013 Progetto (Ateneo 60%) Ruolo diagnostico del CA 15-3, CA 125 e della β2- microglobulina nel Carcinoma Renale a cellule chiare UO coordinator Prof. M. BATTAGLIA Risultati raggiunti: 1) Identificazione del ruolo di tre diverse proteine sieriche (CA 15-3, CA 125 e β2- microglobulina) in pazienti affetti da RCC a cellule chiare e l’associazione tra i livelli di questi marcatori e le caratteristiche clinico-patologiche della malattia. Ricadute industriali Altri risultati Attività/progetto/servizio 10
  23. 23. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati: Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it Piattaforma di Genomica(1) • Service di analisi di Gene Expression in pazienti con fibrosi cistica con e senza trattamento farmacologico per Fondazione Ricerca Fibrosi Cistica Onlus –Verona • Service di analisi di Gene Expression in pazienti con glioblastoma per S.C. Genetica ed Epigenetica dei Tumori- IRCCS Azienda Ospedaliera Universitaria San Martino – IST Istituto Nazionale per la Ricerca sul Cancro - Genova- • Service di Analisi di Metilazione su cellule immortalizzate di glioblastoma per S.C. Genetica ed Epigenetica dei Tumori- IRCCS Azienda Ospedaliera Universitaria San Martino – IST Istituto Nazionale per la Ricerca sul Cancro - Genova-
  24. 24. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati: Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it Piattaforma di Genomica(2) • Service di Analisi di Metilazione su cellule di glioblastoma modificate geneticamente per S.C. Genetica ed Epigenetica dei Tumori- IRCCS Azienda Ospedaliera Universitaria San Martino – IST Istituto Nazionale per la Ricerca sul Cancro - Genova- • Service di Analisi di Metilazione su pazienti di glioblastoma per S.C. Genetica ed Epigenetica dei Tumori- IRCCS Azienda Ospedaliera Universitaria San Martino – IST Istituto Nazionale per la Ricerca sul Cancro - Genova- • Service di Genotyping per Analisi di genotipizzazione di varie razze di pecore per IZS – Foggia
  25. 25. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati: Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it Piattaforma di Genomica (3) • n° 3 Service di analisi di Gene Expression di cellule da topi knock-out per geni correlati all’osteosarcoma per Sezione di Anatomia Umana e Istologia, Dipartimento di Scienze Mediche di Base, UNIBA. • Service di analisi di Gene Expression su PBMCs di pazienti affetti da angioedema ereditario per Sezione di Nefrologia, DETO, UNIBA.
  26. 26. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it Analisi deicostiedeiricavi2012-2013perattivitàdiserviceoffertaaterzi Entrate Uscite Ricavi € 56139.46 € 44905.08 € 11234.37
  27. 27. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA Attività interna di Service: Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it Piattaforma di Genomica (1) • Analisi di Gene Expression su cellule CD14+ di pazienti affetti da IgA Nefropatia • Analisi di Gene Expression su cellule CD4+ di pazienti affetti da IgA Nefropatia • Analisi di Gene Expression su PBMCs di pazienti affetti da IgA Nefropatia • Analisi di Gene Expression su tessuto renale di pazienti trapiantati con rigetto cronico (progetto RAS) • Analisi di Gene Expression su tessuto renale di pazienti trapiantati (progetto RAS) • Analisi di Gene Expression su cellule staminali/progenitrici renali danneggiate con cisplatino e/o in cocoltura con cellule epiteliali tubulari • Analisi di Gene Expression su cellule staminali/progenitrici renali in condizioni ipossiche e/o in cocoltura con cellule epiteliali tubulari • Analisi di genotyping di pazienti affetti da IgA Nefropatia
  28. 28. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA Attività interna di Service: Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it Piattaforma di Genomica(2) • Analisi di Gene Expression su cellule staminali tumorali renali ricavate da pazienti con RCC • Analisi di exome sequencing di pazienti affetti da IgA Nefropatia • Analisi di Metilazione su cellule CD4+ di pazienti affetti da IgA Nefropatia • Analisi di Metilazione su PBMCs di pazienti affetti da IgA Nefropatia • Analisi di Metilazione su cellule staminali/progenitrici renali in condizioni ipossiche e/o in cocoltura con cellule epiteliali tubulari
  29. 29. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA Pubblicazioni • Serino G, Sallustio F, Cox SN, Pesce F, Schena FP. Abnormal miR-148b expression promotes aberrant glycosylation of IgA1 in IgA nephropathy. J Am Soc Nephrol. 23: 814-24, 2012 • S.N. Cox, F. Sallustio, G. Serino, A. Loverre, F. Pesce, M. Gigante, G. Zaza, P.F. Stifanelli, N. Ancona, F.P. Schena. Activated innate immunity and the involvement of CX3CR1-fractalkine in promoting hematuria in patients with IgA nephropathy. Kidney Int. 82:548-560, 2012. • Sallustio F, Costantino V, Cox SN, Loverre A, Divella C, Rizzi M, Schena FP. Human renal stem/progenitor cells repair tubular epithelial cell injury through TLR2-driven inhibin-A and microvesicle-shuttled decorin. Kidney Int. 83: 392-403, 2013. • Sallustio F, Serino G, Costantino V, Curci C, Cox SN, De Palma G, Schena FP. miR-1915 and miR-1225-5p regulate the expression of CD133, PAX2 and TLR2 in adult renal progenitor cells. PLoS One. 8: e68296, 2013. Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it
  30. 30. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA Comunicazioni /Poster • Poster: SN. Cox SN, Sallustio F, Serino G, Loverre A, Pesce F, Stifanelli P, Ancona N, Schena FP. Coinvolgimento dell’immunità innata e dell’asse CX3CR1-FKN nel promuovere l’ematuria macroscopica in pazienti affetti da IgA nefropatia. 52th National Congress of the Società Italiana di Nefrologia, September 21-24, 2011, GIN, VOL S53, P.S8 • Oral communication: Serino G, Sallustio F, Cox SN, Pesce F, Schena FP. miR-148b modula l’espressione del gene core 1, β1,3- galactosiltransferasi 1 spiegando l’alterata glicosilazione delle IgA1 nella IgA nefropatia. 52th National Congress of the Società Italiana di Nefrologia, September 21-24, 2011, GIN, VOL S53, P.S6 • Costantino V., Sallustio F., Cox S.N, Loverre A., Schena F.P.: Le cellule progenitrici adulte renali contribuiscono al riparo del danno renale acuto mediante la secrezione di specifici fattori paracrini(secretoma). 52° Congresso Nazionale SIN - Genova 21-24 Settembre 2011: PUBLISHED IN: G Ital Nefrol 2011; 28 (S53): S2. ISSN 0393-5590 • Sallustio F., Costantino V., Cox S.N., Loverre A., Rizzi M. Schena F.P.: Adult Renal Progenitor Cells Revert Acute Renal Tubular Cells Injury by Means of TLR2-Driven Specific Paracrine Factors. 44th Annual Meeting Of The American Society Of Nephrology Philadelphia, Pa. November 8 – 13, 2011. PUBLISHED IN: J Am Soc Nephrol 22, 2011: 615A • Oral communication: Serino G, Sallustio F, Cox SN, Pesce F, Schena FP. miR-148b upregulation modulating core 1, β1,3- galactosyltransferase 1 expression explains the abnormal glycosylation process of IgA1 in IgA nephropathy. 44th Annual Meeting of the American Society of Nephrology Philadelphia, PA November 8-13, 2011 • ●Poster: SN. Cox SN, Sallustio F, Serino G, Loverre A, Pesce F, Stifanelli P, Ancona N, Zaza G, Schena FP. Activated innate immunity and involvement of the CX3CR1-FKN axis in promoting hematuria in IgA nephropathy. 44th Annual Meeting of the American Society of Nephrology Philadelphia, PA November 8-13, 2011. • Poster: Cox SN, Sallustio F, Serino G, Loverre A, Pesce F,Gigante M, Zaza G, Stifanelli P, Ancona N, Schena FP. Altered antigen handling and involvement of the CX3CR1-FKN axis in promoting hematuria in IgA nephropathy patients. 49th ERA-EDTA Congress, Paris May 24-27, 2012. • Oral communication: Pesce F, Cox SN, Serino G, Sallustio F, Froguel P, Schena FP, Falchi M. Linkage Analysis detects two additional regions in familial IgA nephropathy. 49th ERA-EDTA Congress, Paris May 24-27, 2012. • Oral communication: Serino G, Sallustio F, Cox SN, Pesce F, Schena FP. miR-148b upregulation modulating core 1, β1,3- galactosyltransferase 1 expression explains the abnormal glycosylation process of IgA1 in IgA nephropathy. 49th ERA-EDTA Congress, Paris May 24-27, 2012. • Poster: Serino G, Sallustio F, Pesce F, Cox SN, De Palma G, Schena FP. Serum miR-148b as a Novel Non-Invasive Biomarker of IgA Nephropathy (IgAN). 45th Annual Meeting of the American Society of Nephrology. San Diego, CA, USA, October 30– November 4, 2012 • Poster: Schena FP on behalf of the Italian Group of Renal Transplantomics. Histology and trascriptomics in one core of FFPE renal biopsy from patients with renal graft. 4th International conference on Trasplantomics and Biomarker in organ transplantation. Cambridge, UK, April 4 –6, 2013. Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it
  31. 31. • Poster: Serino G, Sallustio F, Curci C, Cox SN, Pesce F, De Palma G, Schena FP. Role of miRNA let-7b in the Deregulation Process of IgA1 Glycosylation in IgA Nephropathy. 46th Annual Meeting of the American Society of Nephrology. Atlanta, GA, USA, November 5-10, 2013 • Poster: Cox SN, Serino G, Sallustio F, Pesce F, Schena FP. Altered Monocyte Expression and Expansion of CD14+CD16+ Subset in IgA Nephropathy Patients. 46th Annual Meeting of the American Society of Nephrology. Atlanta, GA, USA, November 5-104, 2013 • Poster: Sallustio F, Cox SN, Serino G, Pesce F, De Palma G, Falchi M, Schena FP. Genome-Wide Scan of Copy Number Variations (CNVs) Identifies a Variable Region at 3p21.1 Regulating the TLR9 Expression in Familial IgA Nephropathy Patients. 46th Annual Meeting of the American Society of Nephrology. Atlanta, GA, USA, November 5-104, 2013 • Oral communication: C. Curci, F. Sallustio, G De Palma, M. Fiorentino, M. Rossini, L. Gesualdo, M. Quaglia, C. Bozzola, P. Stratta, S. Zanini, L. Furian, P. Rigotti, V. Pietroni, F. Citterio, L. Biancone, E. Gallo, G.P. Segoloni, F.P. Schena. Istologia e trascritto mica su biopsie renali FFPE in pazienti con trapiant odi rene. 37th National Congress of the Società Italiana Trapianti D’Organo, Bari, October 24-26, 2013. • Oral communication: Sallustio F, Serino G, Curci C, Cox SN, De Palma G, Schena FP I miR-1915 e miR-1225-5p regolano l'espressione di CD133, PAX2 e TLR2 nelle cellule progenitrici adulte renali. 54th National Congress of the Società Italiana di Nefrologia, September 25-28, 2013, GIN, VOL S61, P.61 • Oral communication: Cox SN, Serino G, Sallustio F, Pesce F, Schena FP. Aberrante espressione genica dei monociti isolati da pazienti affetti da IgA Nefropatia. 54th National Congress of the Società Italiana di Nefrologia, September 25-28, 2013, GIN, VOL S61, P.61 • Poster: Pesce F, Cox SN, Serino G, Sallustio F, Schena FP, Falchi M. Identification of quantitative trait loci for deglycosylated IgA1 serum levels in familial IgA Nephropathy. 50th ERA-EDTA Congress, Istanbul May 18-21, 2013. • Poster: Sallustio F, Serino G, Curci C, Cox SN, De Palma G, Schena FP. miR-1915 and miR-1225-5p Regulate The Expression of CD133, PAX2 and TLR2 in Adult Renal Progenitor Cells. 50th ERA-EDTA Congress, Istanbul May 18-21, 2013. Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it
  32. 32. Attività promozionali svolte dal Consorzio C.A.R.S.O. • PARTECIPAZIONE AD EVENTI Festival dell’Innovazione – Bari 1 – 3 dicembre 2010 Festival dell’Innovazione – Bari 22 – 24 maggio 2013 • PRESENZE SU QUOTIDIANI E RIVISTE Stil’è n. 9 luglio 2011 pag. 97 Il Sole 24 ore 23 settembre 2013 • PRESENZA TELEVISIVA Rai Tre Buongiorno Regione – Presentazione del Progetto PIVOLIO – 12 maggio 2011 Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it
  33. 33. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI TRASCRITTOMICA: • Pubblicazione dei servizi offerti e dei relativi tariffari sul sito del Dipartimento dell’Emergenza e Trapianti di Organi dell’Università di Bari: (http://www.uniba.it/ricerca/dipartimenti/deto/servizi/trascrittomica-e-genomica) • Coinvolgimento dei rappresentanti locali di varie aziende nella promozione a livello locale dei servizi svolti Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it/
  34. 34. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI TRASCRITTOMICA Pubblicazioni • Conserva F, Pontrelli P, Accetturo M, Cordisco G, Fiorentino L, Federici M, Grandaliano G, Di Paolo S, Gesualdo L. Kidney microRNA Profiling of Human Diabetic Nephropathy. Sottomesso alla rivista PLoS ONE. In revisione. • Rascio F, Pontrelli P, Accetturo M, Gigante M, Castellano G, Gigante M, Stallone G, Zito A, Zaza G, Ditonno P, Battaglia M, Gesualdo L, Grandaliano G. An interferon-alpha signature characterizes chronic antibody-mediated rejection in kidney transplantation. Sottomesso alla rivista J Am Soc Neph. In revisione. Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it/
  35. 35. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI TRASCRITTOMICA Comunicazioni / Poster • SIN 2011 (PREMIO NATIONAL GRANT ERA-EDTA). Caratterizzazione del profilo trasrittomico nei linfomonociti periferici di trapiantati renali con rigetto cronico anticorpo-mediato (RCAM). Rascio F., Accetturo M., Tataranni T., Pontrelli P., Zito A., Zaza G., Schena F.P., Gesualdo L., Grandaliano G. • ASN 2012. Transcriptomic Profile of Pherioheral blood mononuclear cells (PBMCs) in renal Chronic antibody-mediated rejection (CAMR) Pontrelli P, Rascio F, Accetturo M, Gigante M, Stallone G, Zito A, Gigante M, Castellano G, , Gesualdo L, Grandaliano G • ASN 2013. miRNA Profiling in Human Diabetic Nephropathy Conserva F, Pontrelli P, Accetturo M, Cordisco G, Di Palma AM, Grandaliano G*, Gesualdo L • SIN-Al 2013. Caratterizzazione dei miRNA espressi a livello renale in corso di Nefropatia Diabetica Conserva Francesca, Pontrelli Paola, Accetturo Matteo, Cordisco Giorgia, Annarita Oranger, Di Palma Anna Maria, Grandaliano Giuseppe*, Gesualdo Loreto • AME 2013. Caratterizzazione dei miRNA espressi a livello renale in corso di Nefropatia Diabetica Conserva Francesca, Paola Pontrelli, Matteo Accetturo, Giorgia Cordisco, Loredana Fiorentino*, Massimo Federici*, Giuseppe Grandaliano§, Salvatore di Paolo#, Loreto Gesualdo • ERA-EDTA 2013. Integrated messanger Rna and microRna profiles suggest an inteferon alpha signature in chronic antibody- mediated rejection (CAMR) of kidney transplantation. Pontrelli P, Rascio F, Accetturo M, Castellano G, Gigante M, Fiorentino M, Zito A, Zaza G, Stallone G, Gesualdo L, Grandaliano G • SIN-Al 2013. Individuazione di patterns trascrittomici modulati dal trattamento con eritropoietina in pazienti con trapianto renale Accetturo M, Montemurno E, Fiorentino M, Pontrelli P, Zaza G, Castellano G, Pertosa GB, Grandaliano G, Gesualdo L • SITO 2013. Individuazione di patterns trascrittomici modulati dal trattamento con eritropoietina in pazienti con trapianto renale: prospettive future per la farmacogenomica dell’eritropoietina Accetturo M, Montemurno E, Fiorentino M, Pontrelli P, Zaza G, Castellano G, Pertosa GB, Grandaliano G, Gesualdo L Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it/
  36. 36. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI TRASCRITTOMICA Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati: Sito web della Rete: http:// Service esterno per altri Enti Anno Entrate € Introiti € Note 2012 15400 9356,534 2013 20122,3 In corso (Pagamento a service completato) TOT 35522,3 9356,534 Service esterno per Università di Bari Anno Entrate € Introiti € Note 2011 8057,67 1779,827 2011 1500 1500 2013 4942,06 1000 TOT 14499,73 4279,827 Ricerca interna Anno Progetto Note 2010 Cellule staminali renali 2011 Nefropatia Diabetica 2011 Rigetto cronico umorale 2012 Rigetto cronico umorale 2013 Rigetto cronico umorale (sottopopolazioni PBMCs) 2013 Anemia 2013 Neoplasie post-trapianto TOT
  37. 37. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI PROTEOMICA Pubblicazioni • M. Papale…Gesualdo L. et al. Urine Proteome Analysis May Allow Non- Invasive Differential Diagnosis of Diabetic Nephropathy. DIABETES CARE 33: 2409-2415, 2010 • M.T. Rocchetti...L. Gesualdo et al. Association of Urinary Laminin G-Like 3 and Free K Light Chains with Disease Activity and Histological Injury in IgA Nephropathy. ClinJASN 8: 1115–1125, 2013. • M. Papale et al. Clinical proteomics: the potentiality of urine analysis for understanding Diabetic Nephropathy EMJ Neph. 1: 32-39, 2013 • M. Papale…Gesualdo L. et al Proteomics and Diabetic Nephropathy: what we learned from a decade of clinical proteomics studies? JNephrol, in press Sito web della Rete: http://
  38. 38. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI PROTEOMICA Comunicazioni/Poster • M. Papale….Ranieri E. et al. Combined analysis of tissue and urine proteome allowed to identify RC-specific urinary biomarkers; 53 Congresso SIN - Milano 2012; • M. Papale…..Ranieri E. et al. Cross-comparison between tissue and urine proteomics allowed to identify RCC-specific urinary biomarkers; ERA-EDTA XLVIII Congress Prague (Czech Republic) June 23-26 2011; • MT Rocchetti, … L Gesualdo et al. Urine proteome analysis reveals perlecan LG3 peptide and kappa free light chains as potential non-invasive progression markers of IgA nephropathy. 53°Congresso della Società Italiana di Nefrologia (SIN). Milano 3-6 Ottobre 2012 • MT Rocchetti, … L Gesualdo et al. Decrease of Perlecan LG3 peptide and free k-light chains urine excretion in Iga nephropathy: new insights for a non-invasive diagnosis of IgAN49th ERA-EDTA. Paris 24-27 Maggio 2012 • MT Rocchetti, …L Gesualdo, et al. Urine proteome analysis: an attempt to biomarker discovery for the non-invasive diagnosis of IgA nephropathy. 52th SIN. Genova, 21-24 Settembre 2011. • Papale M. ….Gesiualdo L. et al. Ruolo delle proteine ubiquitinate nella nefropatia diabetica (ND) 12 AME congress , Bari 2013 • Papale M. ….Gesualdo L. et al. The progression of renal damage in Type 2 Diabetes Mellitus (T2D) correlates with the increased excretion of ubiquitinated proteins: report of a proteomic study; ERA-EDTA XLX congress Istambul (Turkey) 2013 • Pontrelli P…M. Papale, Gesualdo L. et al. L’iperglicemia stimola l’ubiquitinazione in lisina-63 mediata da ube2v1 nella nefropatia diabetica; 53 Congresso nazionale SIN; Milano 2012; • Pontrelli P, ….Papale M. …Gesualdo L. et al. Hyperglycemia stimulates ubiquitin-conjugating enzyme e2 variant 1 (ube2v1) mediated lysine 63 ubiquitination in Diabetic Nephropathy (DN); ERA-EDTA XLIX Congress Paris (France) 2012 • Papale M. et al. Contribution of urine proteome analysis for non-invasive differential diagnosis of diabetic nephropathy 12 Italian Proteomic Association (ItPA) congress, Florence 2010 • MT Rocchetti, … G. Grandaliano et al. Il fosfoproteoma dei linfomonociti periferici (LMP): uno strumento innovativo per lo studio del rigetto cronico anticorpo-mediato (RCAM); 37 Congresso Nazionale SITO, Bari 2013. • MT Rocchetti, … G. Grandaliano. et al. Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) phosphoproteome analysis: A new tool to investigate antibody-mediated chronic graft rejection; ERA-EDTA XLX congress, Istambul (Turkey) 2013. • MT Rocchetti, … G. Grandaliano et al. Il fosfoproteoma dei linfomonociti periferici (LMP): uno strumento innovativo per lo studio del rigetto cronico anticorpo-mediato (RCAM); 54 Congresso nazionale SIN, Firenze 2013. • MT Rocchetti, … G. Grandaliano et al. Phosphoproteome analysis of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) to investigate antibody-mediated chronic graft rejection; 1st Meeting on OMICS, Bari 2013. • MT Rocchetti, … G. Grandaliano et al. Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) phosphoproteome analysis to investigate antibody-mediated chronic graft rejection; ASN Kidney Week 2013 Sito web della Rete: http://
  39. 39. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI PROTEOMICA Comunicazioni / Poster • ASN 2012. miRNA Microarray Expression Profiling in Human Diabetic Nephropathy Conserva F, Pontrelli P, Accetturo M, Cordisco G, Di Palma AM, Grandaliano G*, Gesualdo L • SIN 2012. Ruolo dell’interferone alfa nella risposta immune in corso di rigetto cronico anticorpo-mediato (RCAM) Rascio F, Pontrelli P, Accetturo M, Gigante M, Zito A, Stallone G, Gigante M, Schena A, Castellano G, Schena FP, Gesualdo L, Grandaliano G. • SITO 2012. Ruolo dell’interferone alfa nella risposta immune in corso di rigetto cronico anticorpo-mediato (RCAM) Rascio F, Pontrelli P, Accetturo M, Gigante M, Zito A, Stallone G, Gigante M, Schena A, Castellano G, Schena FP, Gesualdo L, Grandaliano G. • ERA-EDTA 2012. Characterization of the transcriptomic profile of pheripheral lymphomonocytes in renal chronic antibody-mediated rejection (CAMR) Rascio F, Pontrelli P, Accetturo M, Gigante M, Gigante M, Tataranni T, Zito A, Schena A, Schena FP, Stallone G, Gesualdo L, Grandaliano G • SIN 2013 (Selected as Best Poster). Caratterizzazione dei miRNA espressi a livello renale in corso di Nefropatia Diabetica Conserva F, Pontrelli P, Accetturo M, Cordisco G, Oranger AR, Di Palma AM, Grandaliano G*, Gesualdo L • 1st Meeting on OMICS towards the Systems Biology Approach in Renal Disease and Transplantation 2013 Transcriptomic profiling of patients with renal transplant under erythropoietin (EPO) treatment Accetturo M, Montemurno E, Fiorentino M, Pontrelli P, Zaza G, Castellano G, Pertosa GB, Grandaliano G, Gesualdo L. Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it/
  40. 40. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI METABOLOMICA Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati: Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it Attività 2010 - 2013  2010: Analisi metabolomica di urine di pazienti affetti da IgA Nefropatia (in collaborazione con Unità di ricerca di metabolomica dell’Università di Verona, Prof. H. Molinari, Prof. M. Assfalg);  2011: Analisi metabolomica di oli di oliva extravergini italiani (pugliesi) e non italiani (Tunisia, Spagna, Grecia), committente Olearia Basile snc Bari;  2012: Analisi metabolomica di oli extravergini di oliva pugliesi provenienti da alberi secolari (collaborazione con CRA, Centro di Ricerca per l’Olivicoltura e l’Industria Olearia, Rende, CS);  2013: Analisi metabolomica di vini monovarietali autoctoni pugliesi, forniti dal CRA-UTV (Unità di ricerca per l’uva da tavola e la vitivinicoltura in ambiente mediterraneo), Turi (BA).
  41. 41. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI METABOLOMICA Pubblicazioni •Papadia P, Del Coco L, Muzzalupo I, Rizzi M, Perri E, Cesari G, Simeone V, Mondelli D, Schena FP, Fanizzi FP. Multivariate analysis of 1H-NMR spectra of genetically characterized extra virgin olive oils and growth soil correlations. J Am Oil Chem Soc 88, 1463-1475 (2011) • Del Coco L, Schena FP, Fanizzi FP. 1H Nuclear Magnetic Resonance Study of Olive Oils Commercially Available as Italian Products in the United States of America. Nutrients 4, 343-355 (2012) • Del Coco L, Assfalg M, D’Onofrio M, Sallustio F, Pesce F, Fanizzi FP, Schena FP. A proton nuclear magnetic resonance-based metabolomic approach in IgA nephropathy urinary profiles. Metabolomics 9, 740-751 (2013) • Del Coco L, Perri E, Cesari G, Muzzalupo I, Zelasco S, Simeone V, Schena FP, Fanizzi FP. NMR-based metabolomic approach for EVOO from secular olive trees of Apulia region. Eur J Lipid Sci Technol 115, 1043–1052 (2013) Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it
  42. 42. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI METABOLOMICA  Comunicazioni/Poster  Caratterizzazione Geografica e Varietale di Oli Extra Vergini di Oliva Monovarietali Pugliesi mediante Analisi NMR e Multivariata. • Papadia P, Del Coco L, Muzzalupo I, Rizzi M, Perri E, Cesari G, Simeone V, Mondelli D, Schena FP, Fanizzi FP (comunicazione orale) • Workshop: Applicazioni della Risonanza Magnetica nella Scienza degli Alimenti, GIDRM, Roma, 27-28 Maggio 2010  Influenza della modalità di lavorazione delle olive nella discriminazione varietale di oli extra vergini di oliva mediante spettroscopia NMR. • Del Coco L, Papadia P, Bilancia MT, Summo C, Caponio F, Rizzi M, Schena FP, Fanizzi FP (poster) • Workshop: Applicazioni della Risonanza Magnetica nella Scienza degli Alimenti, GIDRM, Roma, 27-28 Maggio 2010  NMR per la caratterizzazione geografica e varietale di olio di oliva extravergine pugliese. • Fanizzi FP, Del Coco L, Papadia P, Perri E, Zelasco S, Cesari G, Muzzalupo I, Rizzi M, Simeone V, Mondelli D, Schena FP (comunicazione orale) • Workshop: GDRM Applicazioni della Risonanza Magnetica nella Scienza degli Alimenti, Roma 28-29 Maggio 2012  Caratterizzazione di oli extravergini di oliva e relative paste e sanse mediante spettroscopia NMR. • Fanizzi FP, De Pascali SA, Del Coco L, Iacovelli V, Cesari G, Muzzalupo I, Portoghese M, Gaimari M, Meneghesso M, Bianchi D, Schena FP (poster) • Workshop: GDRM Applicazioni della Risonanza Magnetica nella Scienza degli Alimenti, Roma 28-29 Maggio 2012 Sito web della Rete: http://
  43. 43. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOLOGIA DEI SISTEMI. Partecipazioni a Convegni e Congressi • N. Ancona. Dall’Intelligenza Artificiale alla Systems Medicine. BiP-Day 2013 - Prima Giornata della Bioinformatica Pugliese, 5 Dicembre 2013. Bari. Comunicazione Orale. • T.M. Creanza. Systems Biology for understanding complex human diseases. Matlab and Simulink conference 2013, 6 Novembre 2013, Roma. Comunicazione Orale. • P.F. Stifanelli, T.M. Creanza, R. Anglani, V.C. Liuzzi, S. Mukherjee and N. Ancona, A comparative study of Gaussian Graphical Model approaches for genomic data, Il Nuovo Cimento C, 35: 119-127, 2012. • P.F. Stifanelli, T.M. Creanza, R. Anglani, V.C. Liuzzi, S. Mukherjee, N. Ancona, A comparative study of covariance selection models for the inference of gene regulatory networks, Journal of Biomedical Informatics, 46: 894–904, 2013. • F. Valerio, M. Di Biase, L. Caputo, T. M. Creanza, N. Ancona, A. Visconti, P. Lavermicocca, Effect of Lactobacillus brevis-based bioingredient and bran on microbiological, physico-chemical and textural quality of yeast-leavened bread during storage, Innovative Food Science and Emerging Technologies, INNFOO– 01059, No of Pages 7, in PRESS. Sito web della Rete: http://
  44. 44. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOLOGIA DEI SISTEMI. Partecipazioni a Convegni e Congressi • P.F. Stifanelli, T.M. Creanza, R. Anglani, V.C. Liuzzi, S. Mukherjee, and N. Ancona. A comparative study of Gaussian Graphical Model approaches for genomic data. In Structural Biology and Bioinformatics. 1st International Workshop on Pattern Recognition in Proteomics, 13 Settembre 2011, Ravenna - Italia. Comunicazione orale. • R. Anglani, T. M. Creanza, V. C. Liuzzi, P. F. Stifanelli, R. Maglietta, A. Piepoli, S. Mukherjee, P. F. Schena, N. Ancona. Topological Study of Coexpression Network in Neoplastic Tissues. EMBnet. journal 18 (A), pp 127. BITS2012, Ninth Meeting of Bioinformatics Italian Society, 3 Maggio 2012, Catania - Italia. Comunicazione Poster. • T. M. Creanza, R. Maglietta, V. C. Liuzzi, R. Anglani, P. F. Stifanelli, A. Piepoli, S. Mukherjee, F. P. Schena, N. Ancona. A microRNA-mRNA Integrated Pathway Analysis: An Application To Colorectal Cancer, EMBnet. journal 18 (A), pp 129. BITS2012, Ninth Meeting of Bioinformatics Italian Society, 3 Maggio 2012, Catania - Italia. Comunicazione Poster. • T. M. Creanza, V. C. Liuzzi, R. Maglietta, R. Anglani, P. F. Stifanelli, A. Piepoli, S. Mukherjee, F. P. Schena, N. Ancona. Comparative study of microRNA pathway analysis methodologies in colorectal cancer. WCSB2012, 9th International Workshop on Computational Systems Biology, 4 Giugno 2012, Ulm - Germania. Comunicazione Poster. • O. Palmieri, F. Bossa, T.M. Creanza, T. Latiano, G. Corritore, F. Bossa, D. Scimeca, G. Biscaglia, V.C. Liuzzi, R. Anglani, M. Carella, V. Annese, A. Andriulli, A. Latiano. Dissecting the role of Unfolded Protein Response pathway in Inflammatory Bowel Disease: In silico mRNA-miRNA co-expression analysis. ECCO2013, 8th ECCO DigestScience Workshop, 16 Febbraio 2013, Vienna - Austria. Comunicazione Orale. • O. Palmieri, T. M. Creanza, G. Corritore, T. Latiano, N. Buccianti, D. Scimeca, G. Biscaglia, V. C. Liuzzi, R. Anglani, G. Martino, M. Carella, V. Annese, A. Andriulli, A. Latiano. Dissecting the role of Unfolded Protein Response pathway in Inflammatory Bowel Disease: In silico mRNA-miRNA co-expression analysis. Digestive Disease Week, 18-21 maggio 2013, Orlando – Florida. Comunicazione Orale. • O. Palmieri, T. M. Creanza, F. Bossa, D. Scimeca, G. Biscaglia, G. Corritore, T. Latiano, R. Anglani, M. Carella, N. Ancona, V. Annese, A. Andriulli, A. Latiano. Dissecting The Trascriptome And Mirnome In Inflammatory Bowel Disease: In Silico Mrna-Microrna Co-Expression Analysis. Congresso Nazionale IG – IBD, 7-9 Novembre 2013, Padova. Comunicazione Orale. Sito web della Rete: http://
  45. 45. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOBANCA Pubblicazioni • Lucarelli G, Ditonno P, Bettocchi C, Vavallo A, Rutigliano M, Galleggiante V, Larocca A, Castellano G, Gesualdo L, Grandaliano G, Selvaggi FP, Battaglia M. DIAGNOSTIC AND PROGNOSTIC ROLE OF PRE-OPERATIVE CIRCULATING CA 15-3, CA 125 AND BETA-2 MICROGLOBULIN IN RENAL CELL CARCINOMA Disease Markers 2014 (in press) • Lucarelli G, Rutigliano M, Bettocchi C, Palazzo S, Vavallo A, Galleggiante V, Trabucco S, Di Clemente D, Selvaggi FP, Battaglia M, Ditonno P. SPONDIN-2, A SECRETED EXTRACELLULAR MATRIX PROTEIN, IS A NOVEL DIAGNOSTIC BIOMARKER FOR PROSTATE CANCER. J Urol. 2013 Dec;190(6):2271-7. • Lucarelli G, Fanelli M, Larocca AM, Germinario CA, Rutigliano M, Vavallo A, Selvaggi FP, Bettocchi C, Battaglia M, Ditonno P. SERUM SARCOSINE INCREASES THE ACCURACY OF PROSTATE CANCER DETECTION IN PATIENTS WITH TOTAL SERUM PSA LESS THAN 4.0 NG/ML. Prostate. 2012 Nov;72(15):1611-21. • Lucarelli G, Ditonno P, Bettocchi C, Spilotros M, Rutigliano M, Vavallo A, Galleggiante V, Fanelli M, Larocca AM, Germinario CA, Maiorano E, Selvaggi FP, Battaglia M. SERUM SARCOSINE IS A RISK FACTOR FOR PROGRESSION AND SURVIVAL IN PATIENTS WITH METASTATIC CASTRATION-RESISTANT PROSTATE CANCER. Future Oncol. 2013 Jun;9(6):899-907. •Muscarella LA, D'Agruma L, la Torre A, Gigante M, Coco M, Parrella P, Battaglia M, Carrieri G, Carella M, Zelante L, Fazio VM, Gesualdo L, Ranieri E. VHL GENE ALTERATIONS IN ITALIAN PATIENTS WITH ISOLATED RENAL CELL CARCINOMAS. Int J Biol Markers. 2013 Jun 28;28(2):208-15. • de Martino M, Gigante M, Cormio L, Prattichizzo C, Cavalcanti E, Gigante M, Ariano V, Netti GS, Montemurno E, Mancini V, Battaglia M, Gesualdo L, Carrieri G, Ranieri E.JAK3 IN CLEAR CELL RENAL CELL CARCINOMA: MUTATIONAL SCREENING AND CLINICAL IMPLICATIONS. Urol Oncol. 2013 Aug;31(6):930-7. •Fuzio P, Ditonno P, Rutigliano M, Battaglia M, Bettocchi C, Loverre A, Grandaliano G, Perlino E. REGULATION OF TGF-Β1 EXPRESSION BY ANDROGEN DEPRIVATION THERAPY OF PROSTATE CANCER. Cancer Lett. 2012 May 28;318(2):135-44. •Fuzio P, Ditonno P, Lucarelli G, Battaglia M, Bettocchi C, Senia T, Perlino E. ANDROGEN DEPRIVATION THERAPY AFFECTS BCL-2 EXPRESSION IN HUMAN PROSTATE CANCER. Int J Oncol. 2011 Nov;39(5):1233-42. Sito web della Rete: http://
  46. 46. Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOBANCA Comunicazioni/Poster • G. Lucarelli, M. Rutigliano, M. Fanelli, A. Larocca, A. Vavallo, C. Germinario, F.P. Selvaggi, C. Bettocchi, M. Battaglia, P. Ditonno. “Serum sarcosine is more accurate than PSA in low-risk prostate cancer detection”84 Congresso nazionale S.I.U.,2011 • Galleggiante V, Rutigliano M, Sallustio F, Lucarelli G, Bettocchi C, Ditonno P, Vavallo A, Battaglia M. “Carcinoma renale: la possibile deregolazione trascrizionale di cellule staminali/progenitrici adulte renali porta all’oncogenesi?”84 Congresso nazionale S.I.U., 2011 • Galleggiante V, Rutigliano M, Sallustio F, Lucarelli G, Ricapito V, Bettocchi C, Vavallo A, Selvaggi FP, Battaglia M. “Identificazione e caratterizzazione delle cellule staminali tumorali del carcinoma renale a cellule chiare: risultati preliminari”13 Congresso nazionale SUN, 2011 • G. Lucarelli, M. Rutigliano, Galleggiante V, Vavallo A, C. Bettocchi, F.P. Selvaggi, P. Ditonno, M. Battaglia. “Serum sarcosine increase the accuracy of prostate cancer detection in low range PSA (<4 ng/ml)” 13 Congresso nazionale SUN, 2011 • Lucarelli G, Larocca A, Fanelli M, Germinario C, Rutigliano M, Vavallo A, Bettocchi C, Selvaggi F P, Battaglia M, Ditonno P. “SERUM SARCOSINE INCREASES THE ACCURACY OF PROSTATE CANCER DETECTION IN LOW RANGE PSA”European Urology Supplements, Mar 2011, Vol 10, Issue 2: 205, 26th Annual EAU Congress, Vienna, 2011 • Vavallo A, Lucarelli G, Tedeschi M, Impedovo SV, Rutigliano M, Bettocchi C, Selvaggi FP, Battaglia M, Ditonno P.”DIABETES MELLITUS IS A RISK FACTOR FOR RECURRENCE AND MORTALITY IN PATIENTS WITH RENAL CELL CARCINOMA” European Urology Supplements, Mar 2011, Vol 10, Issue 2: 139-140, 26th Annual EAU Congress, Vienna, 2011 • Galleggiante V, Rutigliano M, Sallustio F, Lucarelli G, Bettocchi C, Ditonno P, Vavallo A, Battaglia M. “RENAL CELL CARCINOMA: DOES TRANSCRIPTIONAL DEREGULATION OF ADULT RENAL STEM/PROGENITOR CELLS LEAD TO ONCOGENESIS?”Anticancer Research, May 2011, Vol 31, Issue 5: 1893-1894, 21 Congresso Nazionale S.I.Ur.O, 2011. • Rutigliano M, Lucarelli G, Vavallo A, Tedeshi M, Palazzo S, Bettocchi C, Selvaggi FP, Ditonno P, Battaglia M. “ASSOCIATION OF N-ACETYLTRANSFERASE 2 POLYMORPHISM WITH RISK FACTORS IN UROTHELIAL CANCER”Anticancer Research, May 2011, Vol 31, Issue 5: 1892-1893, 21 Congresso Nazionale S.I.Ur.O, 2011. • Vavallo A, Lucarelli G, Rutigliano M, Spilotros M, Simone S, Impedovo S, Palazzo S, Bettocchi C, Loverre A, Cariello M, Grandaliano G, Battaglia M, Ditonno P.“DIABETES MELLITUS IN RENAL CELL CARCINOMA: ROLE OF OGG1 AND TUBERIN”Anticancer Research, May 2011, Vol 31, Issue 5:1898-1899, 21 Congresso Nazionale S.I.Ur.O, 2011. • Lucarelli G, Forte S, Vavallo A, Rutigliano M, Galleggiante V, Bettocchi C, Selvaggi FP, Ditonno P, Battaglia M.”THE DIAGNOSTIC ROLE OF CA 15-3, CA 125 AND BETA2-MICROGLOBULIN IN RENAL CELL CARCINOMA.”Anticancer Research, May 2012, Vol 32, Issue 5: 1930, 22 Congresso Nazionale S.I.Ur.O, 2012 Sito web della Rete: http://
  47. 47. • Vavallo A, Forte S, Rutigliano M, Lucarelli G, Galleggiante V, Bettocchi C, Ditonno P, Ricapito V, Selvaggi FP, Battaglia M.“Ruolo diagnostico del CA 15-3, CA 125, e della beta2-microglobulina nel carcinoma renale a cellule chiare ”85° Congresso nazionale S.I.U, 2012 • Lucarelli G, Vavallo A, Rutigliano M, Bettocchi C, Spilotros M, Selvaggi FP, Battaglia M, Ditonno P.“La sarcosina sierica è un fattore di rischio per la progressione e la sopravvivenza di pazienti con carcinoma prostatico ormono-refrattario in trattamento con docetaxel”85° Congresso nazionale S.I.U, 2012 • Vavallo A, Lucarelli G, Rutigliano M, Galleggiante V, Bettocchi C, Selvaggi FP, Battaglia M, Ditonno P. “ La sarcosina sierica è aumentata nei pazienti con carcinoma prostatico ed è un fattore di rischio per progressione e morte nella malattia metastatica ormonorefrattaria”XV° Congresso Nazionale della Società Urologia Nuova,2013 • Lucarelli G, Rutigliano M, Galleggiante V, Vavallo A, Palazzo S, Martino P, Di Lorenzo V, Palumbo F, Ricapito V, Bettocchi C, Selvaggi FP, Battaglia M, Ditonno P. “ Spondin2 (SPON2) è un biomarker diagnostico più specifico per il carcinoma della prostata”XV° Congresso Nazionale della Società Urologia Nuova, 2013 • Lucarelli G, Galleggiante V, Rutigliano M, Ditonno P, Bettocchi C, Vavallo A, Selvaggi FP, Battaglia M. “ Isolamento e catatterizzazione delle cellule staminali tumorali del carcinoma renale a cellule chiare”XV° Congresso Nazionale della Società Urologia Nuova,2013 • Rutigliano M, Vavallo A, Galleggiante V, Lucarelli G, Matera M, Campagna M, Palumbo F, Selvaggi FP, Ditonno P, Battaglia M, Bettocchi C. “Isolamento di cellule epiteliali uroteliali EPCAM+ per rigenerazione di tessuto uroteliale in vitro”XV° Congresso Nazionale della Società Urologia Nuova, 2013 • M. Rutigliano, A. Vavallo, V. Galleggiante, G. Lucarelli, F. Giangrande, M. Matera, M. Campagna, D. Di Clemente, F. Palumbo, P. Ditonno, M. Battaglia, C. Bettocchi “Nuova metodica di isolamento di cellule epiteliali uroteliali EpCAM+ per rigenerazione tissutale in vitro”86° Congresso nazionale S.I.U., 2013 • V. Galleggiante, M. Rutigliano, G. Lucarelli, P. Ditonno, C. Bettocchi, A. Vavallo, M. Campagna, F. Selvaggi, M. Battaglia “Identificazione e caratterizzazione delle cellule staminali tumorali nel carcinoma renale a cellule chiare: ctr2 come marcatore putatativo di cellule staminali tumorali”86° Congresso nazionale S.I.U, 2013 • G. Lucarelli, M. Rutigliano, V. Galleggiante, A. Vavallo, C. Bettocchi, S. Palazzo, M. Matera, G. Di Cosmo, O. Colamonico, M. Ancona, M. Campagna, F. Selvaggi, P. Ditonno, M. Battaglia “Spondin 2 - una proteina della matrice extracellulare- è un nuovo marcatore del carcinoma prostatico”86° Congresso nazionale S.I.U., 2013 Sito web della Rete: http://
  48. 48. Attività programmate - Progetto DIMOSTRATORE– Partecipano tutte le Piattaforme FIRB RBAP11B2SX CAROMICS - Progetti di ricerca – Piattaforma di Genomica PON REC 01-01958 PIVOLIO PON REC 03-00134 ONEV - Progetti di ricerca – Piattaforma di Trascrittomica Giovani Ricercatori (GR-2009-1608662): Therapeutic Inhibition of Classical and Lectin Pathways of Complement to Prevent Local and Systemic effects of Renal Ischemia Reperfusion Injury Progetto AIRC 2012: Neoplasie post-trapianto Progetto in collaborazione con l’Amgen Dompè per lo studio di pattern trascrittomici modulati dall’uso dell’eritropoietina in pazienti sottoposti a trapianto renale -Progetti di ricerca – Piattaforma di Proteomica RICERCANDO 2010 (Società Italiana di Nefrologia): “Identificazione di biomarcatori affidabili di nefropatia diabetica mediante strategie di analisi proteomica complementari” (UO coordinator M. Papale) RF 2009 Min. Sanità: Chronic rejection in kidney transplantation: identification of new diagnostics targets (UO coordinator G. Grandaliano) RF 2009 (Min. Sanità): “Prevalenza ed impatto sulla mortalità totale della malattia cronica renale in pazienti con diabete mellito di tipo 2 in Puglia” (UO coordinator L. Gesualdo) - Progetti di ricerca – Piattaforma di Metabolomica PON REC 01-01958 PIVOLIO
  49. 49. - Depositi brevetti Piattaforma di Genomica: • PCT/IB2011/002637 “Combination of active ingredients for the treatment of the acute kidney injury ” • PCT/IB2011/002494 “Method and kit for the diagnosis of IgA- Nephropathy” - Rapporti con Aziende: Piattaforma di Genomica e Metabolomica - ApuliaBiotec. Bari - Oliveti Terra di Bari. Bitonto - Basile. Andria
  50. 50. METABOLOMICAPROTEOMICATRASCRITTOMICAGENOMICA OMICHE E BIOLOGIA DEI SISTEMI (BISIMANE) APPROCCIO INTEGRATO PIATTAFORME Illumina Agilent Autoflex Bruker
  51. 51. Contatti dei responsabili del Progetto BISIMANE Prof. Francesco Paolo Schena paolo.schena@uniba.it Prof. Loreto Gesualdo loreto.gesualdo@uniba.it Prof. Elena Ranieri e.ranieri@unifg.it Prof. Francesco Paolo Fanizzi fp.fanizzi@unisalento.it Prof. Michele Battaglia michele.battaglia@uniba.it Dr. Nicola Ancona ancona@ba.issia.cnr.it Contatti dei responsabili delle Piattaforme del Progetto BISIMANE Piattaforma di Genomica e Metabolomica Dr.F.Sallustio fabio.sallustio@uniba.it Dr.ssa SN.Cox sharoncox@libero.it Dr.ssa R. Ragone rosaragone@yahoo.it Dr.ssa S.Piccinonna sara.piccinonna@libero.it Piattaforma di Trascrittomica Dr.M.Accetturo matteo.accetturo@uniba.it Piattaforma di Proteomica Dr.M.Papale massimo.papale@unifg.it Dr.ssa Maria Teresa Rocchetti mariateresa.rocchetti@unifg.it Piattaforma di Metabolomica Dr.ssa L.Del Coco lauradelcoco@gmail.com Piattaforma di Biologia dei Sistemi Dr.ssa MT.Creanza creanza@ba.issia.cnr.it BioBanca Dr.ssa M.Rutigliano monica.rutigliano@virgilio.it

×