Avances del CIAT en investigación en enfermedades

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Avances del CIAT en investigación en enfermedades

  1. 1. Avances del CIAT en investigación en enfermedades Patología de arroz Gloria Mosquera g.m.mosquera@cgiar.org Gustavo Prado g.prado@cgiar.org Taller FLAR Agosto 26-30 2013
  2. 2. Introducción Añublo del arroz (Pyricularia oryzae) Añublo bacterial de la panicula (Burkholderia glumae) Análisis de la diversidad de Pyricularia oryza Caracterización de genotipos con tolerancia a Burkholderia glumae
  3. 3. Los resultados que se presentan provienen de analisis hechos hasta Julio de 2013. Este es un trabajo hecho en colaboración con FEDEARROZ Los resultados de Altillanura corresponden al proyecto financiado por MADR a la alianza CIAT- CORPOICA Para tener en cuenta:
  4. 4. Distribución del cultivo de arroz en Colombia y ubicación de muestras colectadas de Pyricularia oryzae
  5. 5. Se analizaron 140 aislamientos , colectados de diferentes sitios del país y de diferentes genotipos, entre ellos variedades diferenciales y comercilaes de Colombia Cada aislamiento se inoculó sobre un grupo de 35 líneas monogénicas, cada una de las cuales posee un sólo gen de resistencia (JIRCAS 2008) Las inoculaciones se hicieron bajo condiciones controladas en casa de malla, utilizando un diseño experimental de parcelas divididas arregladas en bloques, donde la parcela principal estuvo representada por cada aislamiento y la subparcela por las líneas Las evaluaciones se realizaron a los 7 días después de la inoculación La respuesta de cada línea frente a cada aislamiento se categorizó utilizando la escala de evaluación desarrollada por JIRCAS (2008), en la cual sólo se considera el tipo de lesión, siendo 1 y 2 resistentes , 3, 4 y 5 susceptibles Desarrollo de un programa para el análisis de la información generada (M.C. Duque y Juan Bosco) Metodología
  6. 6. Estudios en añublo del arroz (Pyricularia oryzae) 1. Información de la variabilidad del patógeno a nivel departamento, país, región…(estudios en invernadero) 2. Monitoreo constante de estas poblaciones para detectar nuevas variantes (anualmente) Evaluación por tipo de lesión Inoculaciones artificiales en casa de malla
  7. 7. Departamento No. sitios No. Aislamientos No. De razas No encontradas en SR Meta 10 112 56 28 Casanare 4 9 7 3 Tolima 1 12 7 4 Valle del Cauca 1 5 1 0 Santander 1 1 1 1 Sucre 1 1 1 1 Se detectaron 64 razas El 50% de esta diversidad está presente en Santa Rosa Resultados
  8. 8. #ofraces Genotype Susceptibilidad de genotipos a las 64 razas 96.9% 12.5% 85.9% 85.9% 84.4% 78.1% Año de liberación FED50 1998 FED174 2006 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 75-1-127 FANNY FED50 FED174 K60 O. L5 2 55 14 8 6 6 Cont. Resultados
  9. 9. Efectividad de genes de resistencia para la población del patógeno encontrada 24 genes R representados en 35 líneas monogénicas
  10. 10. GENES Obs Race Pia Piz5 Pizt Pita Pib Pit Pish Pi1 Pi3 Pi5_t Pi7_t Pi9 Pi12t Pi19 Pikm Pi20 Pita2 Pita2 Pita Pii LTH Piks Pik Pikp Pikh Piz NR NS TOTAL 1 U00-i0-k000-z00-ta000 R R R R R R R R R R R R R R R R R R R R R R R R R R 26 0 26 2 U33-i0-k000-z01-ta431 S R R S S R S R R R R R S S R R R R S R S R R R R S 17 9 26 3 U33-i0-k004-z03-ta011 S S R S S R S R R R S R R S R R R R R R S R R R R S 17 9 26 4 U33-i0-k006-z01-ta411 S R R S S R S R R R S R S S R R R R R R S R R S R S 16 10 26 5 U33-i2-k000-z03-ta431 S S R S S R S R S R R R S S R R R R S R S R R R R S 15 11 26 6 U33-i2-k004-z01-ta431 S R R S S R S R S R S R S S R R R R S R S R R R R S 15 11 26 7 U33-i2-k006-z01-ta431 S R R S S R S R S R S R S S R R R R S R S R R S R S 14 12 26 8 U33-i3-k004-z03-ta431 S S R S S R S R S R S R S S R R R R S S S R R R R S 13 13 26 9 U33-i3-k006-z11-ta431 S R R S S R S R S R S S S S R R R R S S S R R S R S 12 14 26 10 U63-i0-k177-z01-ta423 S R R R S S R S R R S R S S S S R R S R S S S S S S 10 16 26 11 U63-i0-k177-z01-ta433 S R R S S S R S R R S R S S S S R R S R S S S S S S 9 17 26 12 U63-i0-k177-z01-ta633 S R R S S S R S R R S R S S S S R S S R S S S S S S 8 18 26 13 U63-i0-k177-z01-ta733 S R R S S S R S R R S R S S S S S S S R S S S S S S 7 19 26 14 U63-i7-k006-z05-ta421 S R S R S S R R S S S R S S R R R R S S S R R S R S 12 14 26 15 U63-i7-k100-z01-ta423 S R R R S S R R S S R R S S R S R R S S S S R R R S 13 13 26 16 U63-i7-k106-z07-ta632 S S S S S S R R S S S R S R R S R S S S S S R S R S 8 18 26 17 U63-i7-k107-z01-ta431 S R R S S S R R S S S R S S R R R R S S S S S S R S 10 16 26 18 U63-i7-k107-z03-ta431 S S R S S S R R S S S R S S R R R R S S S S S S R S 9 17 26 19 U63-i7-k107-z07-ta733 S S S S S S R R S S S R S S R S S S S S S S S S R S 5 21 26 20 U63-i7-k127-z01-ta431 S R R S S S R S S S S R S S R R R R S S S S S S R S 9 17 26 21 U63-i7-k127-z03-ta423 S S R R S S R S S S S R S S R S R R S S S S S S R S 8 18 26 22 U63-i7-k147-z01-ta431 S R R S S S R R S S S R S S R R R R S S S S S S S S 9 17 26 23 U63-i7-k167-z03-ta431 S S R S S S R S S S S R S S R R R R S S S S S S S S 7 19 26 24 U63-i7-k177-z01-ta423 S R R R S S R S S S S R S S S S R R S S S S S S S S 7 19 26 25 U63-i7-k177-z01-ta433 S R R S S S R S S S S R S S S S R R S S S S S S S S 6 20 26 26 U63-i7-k177-z03-ta403 S S R R S S R S S S S R S S S S R R R S S S S S S S 7 19 26 27 U63-i7-k177-z03-ta423 S S R R S S R S S S S R S S S S R R S S S S S S S S 6 20 26 28 U63-i7-k177-z03-ta433 S S R S S S R S S S S R S S S S R R S S S S S S S S 5 21 26 29 U63-i7-k177-z07-ta431 S S S S S S R S S S S R S S S R R R S S S S S S S S 5 21 26 30 U63-i7-k177-z13-ta433 S S R S S S R S S S S S S S S S R R S S S S S S S S 4 22 26 31 U73-i0-k100-z07-ta733 S S S S S S S R R R R R S S R S S S S R S S R R R S 10 16 26 32 U73-i0-k107-z03-ta433 S S R S S S S R R R S R S S R S R R S R S S S S R S 10 16 26 33 U73-i0-k177-z01-ta733 S R R S S S S S R R S R S S S S S S S R S S S S S S 6 20 26 34 U73-i0-k177-z11-ta733 S R R S S S S S 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S S S R S 3 23 26 58 U73-i7-k167-z03-ta431 S S R S S S S S S S S R S S R R R R S S S S S S S S 6 20 26 59 U73-i7-k177-z03-ta423 S S R R S S S S S S S R S S S S R R S S S S S S S S 5 21 26 60 U73-i7-k177-z03-ta431 S S R S S S S S S S S R S S S R R R S S S S S S S S 5 21 26 61 U73-i7-k177-z03-ta433 S S R S S S S S S S S R S S S S R R S S S S S S S S 4 22 26 62 U73-i7-k177-z03-ta531 S S R S S S S S S S S R S S S R S R S S S S S S S S 4 22 26 63 U73-i7-k177-z07-ta431 S S S S S S S S S S S R S S S R R R S S S S S S S S 4 22 26 64 U73-i7-k177-z07-ta733 S S S S S S S S S S S R S S S S S S S S S S S S S S 1 25 26 Reacción de cada gen R frente a cada raza Razas afectando FED50 y FED174 Ninguna de las variedades posee el gen de resistencia Pi-9
  11. 11. Variedad Raza No. Código de raza Pi40 Sitio de origen de la raza FED174 12 U63-i0-k177-z01-ta633 R R R Santa Cruz 33 U73-i0-k177-z01-ta733 R R R Santa Rosa, Santa Cruz 34 U73-i0-k177-z11-ta733 R R R Pompeya 42 U73-i3-k177-z07-ta733 R R S Santa Rosa 64 U73-i7-k177-z07-ta733 S S S Santa Rosa 19 U63-i7-k107-z07-ta733 S S S Cosargo FED50 38 U73-i3-k106-z07-ta733 R R S Santa Rosa 48 U73-i7-k106-z07-ta733 R R S Nuchia, Cosargo, Lobitos 51 U73-i7-k107-z07-ta733 S S S Ibague, Santa Rosa, La Libertad, Cosargo, Carimagua, Lobitos 53 U73-i7-k126-z07-ta733 S S S Santa Rosa 57 U73-i7-k127-z07-ta733 S S S Ibague,Tauramena, Santa Rosa, 19 U63-i7-k107-z07-ta733 S S S Cosargo 42 U73-i3-k177-z07-ta733 R R S Santa Rosa 64 U73-i7-k177-z07-ta733 S S S Santa Rosa Hay nuevos genes útiles para las variedades?
  12. 12. Caracterización genética de 19 razas de Pyricularia oryzae rep-PCR pot2
  13. 13. Para Añublo Bacterial de la Panícula Burkholderia glumae Azucena x IR64 T S Líneas avanzadas SSD Caracterización de progenitores en condiciones controladas Caracterización de la población bajo condiciones de campo (2013)Evaluación en dos semestres)
  14. 14. Conclusiones Considerar otros sitios además de SR para la caracterización de germoplasma por su reacción a Pyricularia oryzae Identificar las mejores combinaciones de genes de resistencia que permitan obtener materiales con resistencia durable a este patógeno Los análisis genéticos preliminares indican en este momento que el mejoramiento para resistencia a Pyricularia oryzae debe estar basado en la identificación de genes de avirulencia (Avr) y no en grupos genéticos Avanzar en la identificación de genes de resistencia al añublo bacterial de la panicula
  15. 15. Nuestro equipo de Patología Nuestros Colaboradores: FEDEARROZ, FLAR, MADR M.C. Duque Juan Bosco

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