Your SlideShare is downloading. ×
0
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
027   avances bacteria - ciat g prado
Upcoming SlideShare
Loading in...5
×

Thanks for flagging this SlideShare!

Oops! An error has occurred.

×
Saving this for later? Get the SlideShare app to save on your phone or tablet. Read anywhere, anytime – even offline.
Text the download link to your phone
Standard text messaging rates apply

027 avances bacteria - ciat g prado

808

Published on

Published in: Education
0 Comments
0 Likes
Statistics
Notes
  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

No Downloads
Views
Total Views
808
On Slideshare
0
From Embeds
0
Number of Embeds
0
Actions
Shares
0
Downloads
0
Comments
0
Likes
0
Embeds 0
No embeds

Report content
Flagged as inappropriate Flag as inappropriate
Flag as inappropriate

Select your reason for flagging this presentation as inappropriate.

Cancel
No notes for slide

Transcript

  • 1. AVANCES EN EL ESTUDIO DEL  AVANCES EN EL ESTUDIO DELVANEAMIENTO DEL ARROZ EN  COLOMBIA Fitopatología de  Arroz‐CIAT Agosto 30 de 2011 g
  • 2. Añublo bacterial de la panícula del arroz p Años 50” en Japón. 1995‐1996 :China, Taiwán, Corea, India, Filipinas y Tailandia.  1996 2005: Lousiana y otras regiones arroceras del sur  1996‐2005: Lousiana y otras regiones arroceras del surEstados Unidos.  2006  Panamá. 2010 Republica Dominicana recientemente en Costa Republica Dominicana, recientemente en Costa Rica, Nicaragua y Venezuela. 1989 Colombia (baja incidencia). 2007 Montería (Córdoba). 2011 (13 departamentos).  
  • 3. Periodo más susceptible a la infección  B. glumae Emergencia de la Panícula
  • 4. Condiciones de invernaderoNo es común en campo B. glumae 3‐5 DDI 14 DDI
  • 5. Detección de B. glumae y B. gladioli, mediante PCR  en zonas  arroceras de Colombia. PCR en zonas arroceras de Colombia Identificación  (PCR)1 Dpto Localidades B. glumae B. gladioli Antioquia 1 22/13 22/03 Atlántico 1 1/0 1/0 Bolívar 3 5/4 5/0 Casanare 1 7/5 7/0 Cauca C 1 1/0 1/0 Cesar 3 22/16 15/6 Córdoba 4 21/16 21/1 Huila 3 15/8 14/1 Meta 8 83/34 68/11 Santander 1 1/1 NT Sucre 1 5/2 5/0 Tolima 17 / 160/102 129/23 / Valle del Cauca 4 165/61 83/14 351/56  Total 48 488/259 (53.0%4) 1 Reacción en Cadena de la Polimerasa (15.9%4) .  2 No total de muestras  analizadas.  3 No de muestras positivas 4 Porcentaje de  muestras positivas por departamento,  para cada una de las especies
  • 6. Colonias típicas de Burkholderia p horas de incubación)Kim‐B, 48 h 0.6 mm de diámetro 1.6 mm de diámetro Elevación: Convexas Elevación: Pulvinatas Halo pronunciado Halo poco pronunciado Márgenes irregulares (mayoría de Márgenes regulares veces) Rango de producción de pigmento Producción de pigmento (no- (Amarillo pálido, ligeramente intenso, muy pigmentadas-pigmentadas (ligeramente intenso) intenso).
  • 7. Frecuencia de especies de Frecuencia de especies de Burkholderia en muestras de semillas de arroz  B. glumaed B. gladiolid No. de No. de No de Tipo de síntoma No de muestras muestras (%) muestras muestras (%)d positivas evaluadas evaluadas positivasGrano decolorado a 188 160 85.1 160 34 21.3Grano manchado b 87 26 29.9 78 11 14.1 Asintomáticas c 213 73 34.3 113 11 9.7 Total 488 256 351 56 a Síntomas típicos causados por Burkholderia . b Síntomas comúnmente causado por Pseudomonas fuscovaginae c Semilla sin síntomas evidentes d Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR)
  • 8. Comparación de la secuencia de B. gladioli con  secuencias disponibles en el GenBank utilizandosecuencias disponibles en el GenBank utilizando  BLASTN. No de Accesión Homología (Acc. No) Cepa (publicada GenBank) El análisis de secuencia de los productos de PCR de 4 cepas B gladioli, 98%(EF552070.1) 3704-18 JF323578mostro homologías (98‐100%) con otras secuencias de B. gladioli ya h l í (98 100%) i d l di li 99%(EF552070.1) 4228-2 JF323579reportadas en el Genbank. 98%(EF552070.1) 4194-4 JF323580 100%(EF552070.1) 3848s-5 JF323581
  • 9. Pruebas de patogenicidad 4 panículas por cepa 4 panículas por cepa 5mL por panícula Cultivo puro p OD=0,2 (10‐8 Ufc/ml) OD 0,2  (10 8 Ufc/ml) ‐Conteo de granos  enfermos y totales y ‐Porcentaje de granos  enfermos24h de Incubación en  14 DDI (B. glu) Cámara de inoculación 30 DDI (B. gla) 
  • 10. Reproducción de síntomas en invernadero  p en etapa de floración. B. glumae B. gladioli 14 DDI  30 DDI   COL XXI
  • 11. Vaneamiento > 90% B. glumae Vaneamiento < 30 % Vaneamiento < 30 %B. gladioli Grano decolorado con manchas color chocolate oscuras que pueden cubrir las glumas completamente
  • 12. Efecto de la infección por B. glumae y B. gladioli en el rendimiento  B gladioli en el rendimiento (Condiciones de invernadero) Daño  Peso de semilla  Contenido de Humedad   Especie Cepa Rango de pigmento (%) (100 granos) (14%) (0.05gr)B. glumae 3200‐12 Ligeramente intenso 93.8 a  0.58 b 0.60 b  3704‐18 Amarillo pálido 73.1 bc 2.1 a 1.91 a 4228‐2 Muy intenso 55.7 c 2.2 a 2.26 aB. gladioli 4194‐4 Muy intenso y 79.6 ba 2.37 a 2.44a 3848s‐5 Ligeramente intenso 78.7 ba 2.26 a 2.31a Control (Col XXI) 0 2.36 a 2.46a Letras distintas en una misma columna indican diferencias entre los promedios, según la prueba de Duncan (p<0.05). 2 y 4 semanas después de la inoculación de  B. glumae y B. gladioli, respectivamente.
  • 13. EVALUACION DEL COMPORTAMIENTO DECULTIVARES DE ARROZ ANTE EL AÑUBLOBACTERIAL DE LA PANICULA CAUSADAPOR Burkholderia glumae EN COLOMBIA
  • 14. Materiales y métodos→Siete genotipos de arroz seleccionadospor su reacción a B. glumae en condiciones de campo  g p(Montería).→Nueve cepas de B. glumae representativas de las →N d B l t ti d ldiferente grupos genéticos encontrados en estudios previos de diversidad de la bacteria. →Se inocularon 4 panículas por genotipo con 3 repeticiones en el tiempo.  p p→Las evaluaciones se hicieron a los 14 DDI, teniendo que para calcular el  % de daño  se  relaciono el No. de  l l l %d d ñ l i lN dsemillas afectadas / No. de semillas totales. 
  • 15. Respuesta de 7 genotipos de arroz  evaluados en campo para B. glumae l d B l (Montería, 2010).Evaluación en  Incidencia (%) Reacción Cultivar campo  1 1‐10 Tolerante Fed. 733, LV 1063 (Mocarí), SC112 3 11‐20 Tolerante Oryzica 1 FL0268‐2P‐6  5 21‐30 Intermedia (Línea avanzada) 7 31‐6 Susceptible 9 >60 Susceptible Fed 2000, Col XXI Escala de evaluación adaptada p p para Burkholderia glumae en arroz (Pérez, 2008).
  • 16. 9 cepas de B. glumae representativas  de la diversidad genética encontrada  de la diversidad genética encontrada en Colombia Grupo  No Registro Dpto Localidad Variedad genético 1 3862‐3 Meta Santa Rosa RD‐FLAR 28 Meta 2 3864‐4 3864 4 Meta Santa Rosa Santa Rosa RD‐FLAR 68 RD FLAR 68 Llano Fedearroz  3 3880‐7 Cesar Tamalameque Mixto 2000 Fedearroz  4 3459‐4 Bolívar María la baja Mixto 473 Fedearroz 5 3200‐12 Córdoba La victoria Norte 2000 Fedearroz  6 3866B‐10 Santander Cúcuta Mixto 733 Cimarron  7 3722‐1 Tolima Guamo Centro Barinas 8 3861‐2 Meta Santa Rosa RD‐FLAR 18 Llano Fedearroz  9 3650‐3 Córdoba Lorica Norte 733 Centro Llanos Bravo, D. 2010. Tesis Mixto Meta NorteRepresentación tridimensional de los grupos de la población de B. glumae con la técnicarep‐PCR, a partir del ACM.
  • 17. Condiciones de invernaderoTemperatura y Humedad Relativa Temperatura y Humedad Relativa Temperatura promedio de 24°C (rango 22‐27°C) Humedad relativa promedio de 75% (rango 71‐95%)
  • 18. Promedio del porcentaje de  daño causado por  las nueve (9) cepas de B. glumae, sobre  siete  las nueve (9) cepas de B. glumae, sobre siete (7) cultivares de arroz.  Letras distintas indican diferencias entre los promedios, según la prueba de Duncan (p<0.05).
  • 19. Síntoma en invernadero a partir de la inoculación en panícula   causados por B . glumae  inoculado con B . glumae (3864-4) Inoculado con agua estéril.
  • 20. Reacción de los genotipos de arroz  frente a cada cepa de B. glumae. se  frente a cada cepa de B glumae se incluyen Jupiter y LM1 100 90 G3: SC 112 80 70 G5: LV 1063 60 G6: Fed. 733 50 G28: FL0268 40 30 G78: Oryzica 1 20 10 0 3862‐3 (1) 3862 3 (1) 3864‐4(2) 3864 4(2) 3880‐7(3) 3880 7(3) 3459‐4(4) 3459 4(4) 3200‐12(5) 3866B‐10(6) 3722‐1(7) 3200 12(5) 3866B 10(6) 3722 1(7) 3861‐2(8) 3861 2(8) 3650‐3(9) 3650 3(9) G3 G5 G6 G28 Fed. 2000 Col XXI G78 Jupiter LM‐1
  • 21. ConclusionesLas temperaturas y la H.R. con las que se manejo este ensayo fueron similares a las reportadas en condiciones de campo. p pLos genotipos que mostraron tolerancia en condiciones de campo son altamente susceptibles bajo condiciones controladas de invernadero.La variedad Jupiter y la línea LM1 mostraron reacciones contrastantes  (Susceptible y Tolerante) entre replicas, contrario a lo mostrado por los genotipos indica que mostraron ser altamente susceptibles a la mayoría de las cepas inoculadas en  ptodas las repeticiones. 
  • 22. Actividades en cursoJupiter, LM1, y Nipponbare  serán inoculadas con un  p , , y ppnúmero mayor de cepas.Otros genotipos japónica serán también incluidos para evaluar si inconsistencias susceptibilidad/tolerancia son obtenidos en estos cultivares al igual que Jupiter, LM1, y obtenidos en estos cultivares al igual que Jupiter LM1 yJupiter.Adicionalmente se esta determinando las posibles causas de la falta de correlación entre evaluación de campo Vs invernadero.
  • 23. Q Qué se debe tener en cuenta?Otros patógenos asociados al vaneamiento del cultivo en Colombia y tal vez en otros países de ALC.La inestabilidad climática esta favoreciendo el desarrollo de estos otros patógenos.de estos otros pató enos
  • 24. AGRADECIMIENTOS  AGRADECIMIENTOS→FLAR→FEDEARROZ‐ Cuota de Fomento Arrocero 

×