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006 anublo bacterial de la panicula del arroz - gustavo prado

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  • 1. Añublo Bacterial de la Panícula del Arroz (B. glumae) ( g ) Gustavo Prado Septiembre  21 de 2010 Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 2. Añublo Bacterial de la Panícula del Arroz Años 50” en Japón. 1995‐1996 :China, Taiwán, Corea, India, Filipinas y Tailandia.  1995 1996 :China Taiwán Corea India Filipinas y Tailandia 1996‐2005: Lousiana: y otras regiones arroceras del sur Estados Unidos.  2006  Panamá. 1989 Colombia (baja incidencia). 1989 Colombia (baja incidencia) 2007 Montería (Córdoba). 2009 (8 departamentos).   Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 3. Monteria - Colombia T° MAXIMAS Y MINIMAS 2005 T° MINIMA 2005 E HISTORICO 1993-2005 35.0 25,5 25,0 32.5 24,5 2005 30.0 PROM 1933-2005 24,0 °C T° MAXIMA °C 27.5 23,5 T° MINIMA 23,0 25.0 22,5 22.5 22,0 li o e o o ril ro zo o to re e e ni br er br ay Ab br e Ju os ub ar Ju m En br em m M M Ag ct vie 20.0 Fe ie ci O pt No Di Se Enero Febrero Marzo Abril Mayo Junio Julio Agosto Septiembre Octubre Noviembre Diciembre MES MES Fuente: FEDEARROZ Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 4. Monteria - Colombia BRILLO SOLAR 2005 E HISTORICO 1993-2005 PRECIPITACION 2005 8,0 250,0 7,0 200,0 H O R A S / D ÍA 6,0 2005 5,0 1993 - 2005 150,0 mm 2005 4,0 100,0 3,0 50,0 2,0 lio nio ri l o zo e o o to re e e er er br ay Ab br Ju br 0,0 os ar b Ju En br m tu M m ie/ M Ag vi e Fe Oc c ie pt ENE FEB MAR ABR MAY JUN JUL AGO SEP OCT NOV DIC Se No Di MES MES Fuente: FEDEARROZ Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 5. Detección de colonias bacterianas Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 6. Pruebas de patogenicidad Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 7. Estado de Plántula Decoloración de las hojas Pudrición de la vaina Muerte de la Planta Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 8. Prueba de patogenicidad en Panícula Espiguillas afectadas color pajizo Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 9. Pigmentación producida por Burkholderia glumae en medio King B (toxoflavin) Colonias deBurkholderia glumae en medio King B Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 10. Diagnóstico molecular de B. glumae Sayler et al, Plant Disease 90:603‐610 Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 11. Frecuencia de Burkholderia glumae en Colombia B. glumae Tipo de síntoma en  semillas   No muestras  (%) analizadas No. de muestras positivas  Semilla decolorada a 104 92 88 Semilla manchada b 47 7 15 Semilla asintomaticac S ill i i 193 68 35.2 3 2 Total 344 167 a Síntomas involucrados en la decoloración del grano causado por B. glumae. bSíntomas involucrados en el manchado del grano causado por otras especies (P. fuscovagiane,  A. avenae,  etc) CSin ningún tipo de síntoma aparente. Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 12. Frecuencia de especies de Burkholderia en  muestras de semillas de arroz  muestras de semillas de arroz B. glumae B. gladioli Tipo de síntoma en  No No No. de No. de muestras  No de muestras (%) (%) la semillas   muestras  muestras  muestras  positivas  analizadas analizadas positivas  Síntoma típico a 89 80 90 85 8 9.4 Síntoma atípico b p 45 7 15.5 34 2 5.8 Sin ningún tipo de  347 67 19.3 67 16 23.8 síntoma c Total 481 154 186 26 a Síntomas involucrados en la decoloración del grano causado por especies de Burkholderia a Síntomas involucrados en la decoloración del grano causado por especies de Burkholderia spp. spp bSíntomas involucrados en la decoloración del grano causado otras especies (P. fuscovagiane , A. avenae) CSin ningún tipo de síntoma aparente. Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 13. Inoculación en Panícula (Invernadero) Mayor agresividad B. glumae •Grano decolorado con manchas color chocolate definidas •Vaneamiento > 90% Menor agresividad B. l di li B gladioli •Grano decolorado con manchas color chocolate oscuras que pueden cubrir las glumas completamente l t t •Vaneamiento < 60 % Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 14. Estandarización en la identificación de  P. fuscovagianae, mediante PCR M 1 2 3 4 5 - Cebadores sintetizados por Onasanya y colaboradores (2010) 1kb plus (promega) Num Reg P fusco 1 3651‐1 Pos Para confirmar la identidad de las P. P fuscovaginae 2 4024‐5 Pos cepas de P. fuscovaginae aisladas de especie involucradas en semillas de arroz estas se mandaron 3 4187‐5T Pos a secuenciar 4 4178‐11 Pos el manchado y 5 Coctel Neg vaneamiento del grano Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 15. Especies de Pseudomonas que causan pudrición en la vaina  del arroz (Zeigler y Alvarez 1989) •Se han encontrado 4 especies de Pseudomonas causando: •Pudriciones en la vaina del arroz, grano manchado y esterilidad. •Pseudomonas fuscovaginae: Pudrición bacterial de la vaina del arroz •Pseudomonas syringae: Rayado bacterial •Pseudomonas avenae: Pudrición bacterial de la vaina •Burkholderia glumae: Pudrición bacterial del grano Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 16. Diagnóstico de bacterias en muestras del  Tolima  Especie No. de  Acidovorax avenae Pseudomonas  Burkholderia Burkholderia Tejido Registro colonias sub Avenae fuscovaginae glumae gladioli Raíz 3986 7 3 3990 6 1 3994 7 3997 6 4001 6 4005 6 4009 4 4012 4 4016 4 4019 4 4023 4 4027 6 13 4038 6 Total T t l 70 3 1 0 0 Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 17. Diagnóstico de bacterias en muestras del  Tolima  Tolima No.  Acidovorax de  avenae Pv.  Pseudomonas  Burkholderia Burkholderia Tejido Registro colonias Avenae fuscovaginae glumae gladioli Tallo 3988 6 4010 8 1 1 4013 6 4017 6 4020 5 6 4024 5 1 Total 36 1 1 1 0 Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 18. Diagnóstico de bacterias en muestras del  Tolima  Tolima No. de  Acidovorax avenae Pseudomonas  Burkholderia Burkholderia Tejido Registro colonias sub. Avenae fuscovaginae glumae gladioli Vaina 3987 6 2 3992 6 2 3996 5 3999 6 4003 3 4004 5 4011 6 4014 6 4018 6 4021 8 2 4025 5 1 12 4040 6 Total 68 3 0 4 0 Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 19. Diagnóstico de bacterias en muestras del Tolima (Semilla)  No. de  A. avenae B.   B.   No. de  A.avenae P.  B.  B.  Registro colon sub. Avenae P. fuscovaginae glumae gladioli Registro colon sub. Avenae fuscovaginae glumae gladioli 3993 6 2 4065 6 3989 8 2 1 4069 7 4000 6 2 4073 6 4 2 4008 6 3 4077 6 1 4015 7 3 2 4084 6 1 4022 6 2 4088 6 1 4026 7 5 4092 6 2 1 4030 8 4096 5 4037 7 5 4100 6 4044 5 3 4104 3 4048 5 1 4108 7 1 4052 8 4112 4 4056 7 4116 6 4060 7 1 4026 8 1 5 4061 6 Total 181 10 3 29 6 Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 20. Estrategias de un programa MIC ∆Capacitación ∆Resistencia genética ∆Buenas prácticas agronómicas ∆Control biológico ∆Control químico ?? Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 21. Añublo ub o bacterial Burkholderia glumae de la Panicula de arroz Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 22. Germoplasma de Arroz de América Latina Tolerante a  B.glumae Cons VARIEDAD Y/O LÍNEA INV. CAMPO‐2008 1 BAMOA A75 5 3 2 CULIACAN A82 5 3 3 INTI 5 7 4 IR36 4 3 5 ALTAMIRA 7 4 3 6 CHETUMAL A86 4 3 7 ORYZICA LLANOS 5 4 3 8 ICTA PAZOS 4 3 9 CR1707 4 3 10 ICTA MOTAGUA 5 3 11 INIAP 11 4 3 12 PANAMA 1048 5 7 13 PERLA 5 3 14 SAAVEDRA 5 3 15 JASMINE 85 5 1 16 SC 112 5 1 17 PAITITI (FL00144) 4 1 18 FEDEARROZ 809(CT9809) 5 3 19 FL03188‐7P‐5‐3P‐1P‐M 4 ?? 20 CT8008‐16‐24‐2P‐1X 4 1 21 FL03186‐1P‐4‐2P‐(P.NAL) 5 3 22 CR5272 5 1 23 Salahondita (Oryza latifolia) 4 ?? 24 NIPPONBARE 4 1 25 FEDEARROZ 50 5 3 26 COLOMBIA 21 6 3 Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 23. Nipponbare vs Coprosem 2 evaluación de la reacción a Burkholderia glumae Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 24. FLAR 80 materiales con tolerancia a B. glumae g Correlación con  datos d d de Inv. ∆45 con calificación 5 ∆11 con calificación 1  Invernadero con 11 aislamientos representativos de la población de la bacteria en Colombia Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 25. Nombre Comercial i.a Dosis por ha.  DESFAN 89 SL Extracto de semillas de  333 cc cítricos. PHYTON Sulfato de cobre. 0.4 L AGRYMICIN 16.5 WP Sulfato de estreptomicina y  333 gr oxitetraciclina.  KILOL DF 100 Extractos de semillas de  1.5 a 3.0 L cítricos. KASUMIN 2% Kasugamicina 2 a 2,5 L COBRETHANE 69 WP COBRETHANE 69 WP Mancozeb 50% Oxicloruro de 50% Oxicloruro de  2 a 3 Kg 2 a 3 Kg cobre 19%  Complejo ferrico 5%  Ingredientes inertes 20% STARNER WP Acido oxolinico Semilla solución al 5% Plantas solución al 0.1% Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 26. 1 Coprosem 2 3 Acido oxolínico 1g/L oxolínico, 1g/L 2 1= Acido oxolínico 4 2= Oxicloruro de cobre + mancozeb 3= Sulfato de estreptomicina + oxitetraciclina 4= Acodo 4 Acodo oxolínico + Oxicloruro de cobre + mancozeb + Oxicloruro de cobre + mancozeb Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 27. Control Químico B. gladioli P. fuscovaginae B. glumae A. Avenae sub.  A Avenae sub avenae Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 28. Tratamiento de semilla Control A. oxolínico Ox. de cobre +  mancozeb Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 29. CONCLUSIONES B. glumae ha adquirido gran importancia en LAC g q g p Es de gran importancia La caracterización de germoplasma y desarrollo  de materiales con tolerancia a este patógeno. de materiales con tolerancia a este patógeno Orientar a los productores hacia el uso de buenas prácticas agronómicas que permitan disminuir el impacto de la bacteria. que permitan disminuir el impacto de la bacteria Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza
  • 30. Agricultura Eco-Eficiente para Reducir la Pobreza