Colaboración entre PDI (1): Estadística y Gráficos Científicos con R.

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A menudo el personal docente e investigador (PDI) de los centros de investigación utiliza software propietario para sus modelos, cálculos estadísticos y visualización de datos científicos (Matlab, Mathematica, Statistica, SPSS...). A medio o largo plazo a menudo se acaba buscando la colaboración con otros docentes e investgadores en areas de trabajo afines, o el alumnado necesita realizar cálculos estadísticos y gráficos fuera del aula o una vez acabada la carrera, lo que suele suponer que se tengan que comprar licencias de software (¿o se pirateen, a veces?) para poder usarlo. Una de las alternativas libres con enormes ventajas a medio y largo plazo, así como con un enorme potencial y crecimiento en la última década ha sido el software R (http://www.r-project.org).

Así, en esta comunicación se abordan brevemente algunas ventajas e inconvenientes del uso de R para facilitar la colaboración entre PDI (actual y futuro), a partir de la experiencia concreta del autor de la comunicación. Se muestran algunas aplicaciones gráficas para interaccionar con R, y se citan algunas de las alternativas actuales libres. La comunicaicón está destinada a alumnado y profesorado que no conozca practicamente R aún, y que use alternativas propietarias para sus tareas de investigación y docencia.

Más en http://www.ub.edu/gclub/jornadespl2009

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Colaboración entre PDI (1): Estadística y Gráficos Científicos con R.

  1. 1. Estadística y gráficos con R Colaboración entre PDI (1) * PDI = Personal Docente e Investigador Dr. Xavier de Pedro Dep. de Física Aplicada y Óptica y Grupo por el Conocimiento Libre en la UB (gclUB) Universidad de Barcelona http://www.ub.edu/gclub
  2. 2. 2
  3. 3. R: ¿Qué es? Programa para Estadística y gráficos científicos Alternativa libre al “S” (y Matlab, SPSS...) Importa fácilmente de Excel, .csv, ... Gran número de extensiones Funciona por comandos, y algunas Interfícies Gráficas de Usuario (“GUI's”) http://cran.r-project.org 3
  4. 4. R: ¿Qué es? (ii) Ejemplo: uso por consola 4
  5. 5. R: ¿Qué es? (iii) Ejemplo: script .r de http://ommel.sf.net con las equivalencias de scripts .m y .r 5
  6. 6. Cálculos estadísticos y programación Documentos base: Introducción a R (2000): A. y S. González http://cran.r-project.org/doc/contrib/R-intro-1.1.0-espanol.1.pdf R para principiantes (2002). E. Paradis http://cran.r-project.org/doc/contrib/rdebuts_es.pdf Conversión de lenguajes Matlab/Octave | Python | R http://mathesaurus.sourceforge.net/matlab-python-xref.pdf 6
  7. 7. Gráficos Libros: R Graphics (2005) P. Murrel http://www.stat.auckland.ac.nz/~paul/RGraphics/rgraphics.html The GGobi Book (2007): Interactive and Dynamic Graphics for Data Analysis: with examples using R and Ggobi. Springer. D. Cook & D. F. Swayne. http://www.ggobi.org/book/ Galeria colaborativa de gráficos 7
  8. 8. Gráficos (ii) Galeria colaborativa de gráficos: http://addictedtor.free.fr/graphiques/ 8
  9. 9. GUI's (i): GNU/Linux RKWard http://rkward.sf.net 9
  10. 10. GUI's (ii): Windows (A) SciViews http://www.sciviews.org (B) RKWard (Junio'09) (B1) sobre WinKDE (.exe) winkde.org + rkward.sf.net ó (B2) via “andLinux” (.deb) http://andlinux.org 10
  11. 11. GUI's (iii): Multiplataforma Java (Jaguar) y R GUI (Rcmdr, PMG, ...) PMG = Poor Man GUI (RGTK2 (gWidgets) 11
  12. 12. Instalación de paquetes Listado enorme, y creciendo año tras año 12
  13. 13. Iniciativas en REDIRIS IRIS-LIBRE: Proyecto “eReros” “Promocionar el uso de R en las Universidades españolas y colaboración entre usuarios” https://forja.rediris.es/pipermail/ereros-general/ Web preparada y congreso en preparación Propuestas: Cluster alta disponibilidad para cálculos mayores Formación de R via CENATIC-CRUE en unis Desarrollo 2009: alternativa a otras aplicaciones comerciales (stata, statgraphics, sas, ...) 13
  14. 14. Alternativas a R Libres vs. versión propietaria GNU Octave Matlab, http://www.gnu.org/software/octave/ Mathematica GNU PSPP SPSS http://gnu.org/software/pspp/ Scilab Matlab, http://scilab.org Mathematica Sage Magma, Maple, http://sagemath.org Mathematica and Matlab 14
  15. 15. Gracias Presentación en: http://www.ub.edu/gclub/jornadespl2009 Referencia: Colaboración entre PDI (1): Estadística y Gráficos con R. 2009. Xavier de Pedro. VIII Jornades de Programari Lliure. 1 - 4 Juliol. Free Software, Open Source i Coneixement Lliure. http://jornadespl.org 15

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