Your SlideShare is downloading. ×
Molbiol 2011-06-transcription-translation
Upcoming SlideShare
Loading in...5
×

Thanks for flagging this SlideShare!

Oops! An error has occurred.

×

Saving this for later?

Get the SlideShare app to save on your phone or tablet. Read anywhere, anytime - even offline.

Text the download link to your phone

Standard text messaging rates apply

Molbiol 2011-06-transcription-translation

158
views

Published on


0 Comments
0 Likes
Statistics
Notes
  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

No Downloads
Views
Total Views
158
On Slideshare
0
From Embeds
0
Number of Embeds
0
Actions
Shares
0
Downloads
2
Comments
0
Likes
0
Embeds 0
No embeds

Report content
Flagged as inappropriate Flag as inappropriate
Flag as inappropriate

Select your reason for flagging this presentation as inappropriate.

Cancel
No notes for slide
  • 11 Transcription Process Initiation, elongation and termination Structural features of a gene RNA polymerase Post transcriptional modification of mRNA Inhibitory drugs Define transcription Compare the process of transcription with that of DNA replication. Distinguish between the coding and template strand of DNA Describe the signals necessary for transcription Describe a promoter in terms of Position in a gene Numbering of nucleotides Sequence elements Bound proteins Describe the process of transcriptional initiation in terms of The effect on DNA structure The function of the sigma subunit Transcriptional regulation Distinguish between positive and negative forms of transcriptional control Describe the process of transcriptional termination both rho dependent and independent Identify the function of each RNA polymerase of eukaryotes Describe the structure of RNA polymerase II Describe how RNA polymerase II recognizes a promoter Describe two functions of TFIIH Describe the position and function of the TATA box Describe how the terminal nucleotide of a mature eukaryotic mRNA is generated Describe the mechanism of action of drugs that inhibit transcription including Actinomycin D, Rifampicin and Alpha amanitin.
  • DNA/RNA distinction – vicinal hydroxyls, RNA should be unstable in order to exercise control
  • Promoter includes sequence elements that bind RNA polymerase. Other control elements may be included within the promoter region that go by other names, such as operator Consensus sequences reflect evolutionary origin and also commonality in control. Two genes that are both needed under one set of circumstances may have very similar sequences in their promoters. This means their genes would transcribe RNA at similar times all other factors being equal.
  • Consensus sequences help locate where the subunits of RNA polymerase bind. Note AT rich region near where transcription bubble begins Torsion opens the local sequence at the AT rich region permitting sigma to bind and the helix to open near the start of transcription Consensus at –10 for proks resembles same for euks.
  • Sigma is carried by the holoenzyme, it does not locate the –10 and –35 regions on its own. RNA pol scans duplex DNA until a consensus sequence is reached that both the core enzyme and sigma recognize. They halt and form a closed complex. Then the duplex unwinds and an open complex forms – this Is the melted form with an initial bubble. Sigma is released and the core enzyme begins to polymerize at the +1 nucleotide
  • CAP binds DNA and locates a binding site for RNA polymerase. Increases eficiency of promotion. cAMP made in response to low glucose. Low glucose inacivates a negative control on adenylate cyclase. This makes cAMP and this binds the CAP binding site on the lac gene promoter. Lac is involved in converting lactose into galactose and glucose. Mutational effects?
  • http://bioweb.wku.edu/courses/biol22000/21TranscTermination/default.html
  • http://highered.mcgraw-hill.com/sites/0072507470/student_view0/chapter3/animation__how_translation_works.html
  • To describe how an aminoacyl tRNA synthetase recognizes its cognate tRNA To describe the ribosomal structure of both prokaryotes and eukaryotes in terms of the ribosomal subunits and their rRNA’s To describe the requirements of initiation, elongation and termination in terms of Necessary factors Behavior of the ribosomal subunits Sequential steps of each process To differentiate between Prokaryotic and Eukaryotic protein synthesis
  • Transcript

    • 1. Лекция 4-2 Наталья Володина
    • 2. Транскрипция
    • 3. Транскрипция, трансляция Альбертс глава 5
    • 4. Матрица
    • 5. Основы полимеризации
    • 6. Цепи ДНК
    • 7. РНК полимераза (прокариоты)
    • 8. Промотер
    • 9. Консервативные последовательности
    • 10. Инициация транскрипции
    • 11. Регуляция транскрипции у бактерий
    • 12. Негативная регуляция
    • 13. Терминация транскрипции 1
    • 14. 2 -  фактор
    • 15. Эукариотическая РНК полимераза
        • Полимераза I – синтезирует пре-рибосомные РНК
        • Полимераза II - мРНК
        • Полимераза III - тРНК и 5 S рибосомную РНК
    • 16.  
    • 17. Элонгация цепи, окончание транскрипции
    • 18.
      • Трансляция (синтез белка)
    • 19. Синтез белка
      • Инициация, элонгация и терминация
          • Активация тРНК присоединением соответствующей аминокислоты
          • Пост-трансляционная модификация – добавление липидов, сахаров, фосфатов, сульфатов и.т.д.
    • 20. Пептидная связь
        • Костяк белка
        • Функция белка определяется боковыми цепями аминокислот его составляющих
    • 21. Активация
      • Связь между анти-кодоном в тРНК и аминокислотой
    • 22. тРНК
      • Меньше 100 нт.
      • Минимум 32 тРНК
      • L- образная структура
    • 23. Инициация
      • Сборка рибосомы
        • 70 S из 30S and 50S субъединиц у прокариот
        • 40S + 60S = 80S у эукариот
          • Требует факторов инициации
          • Требует (ф)метионил-тРНК
    • 24. Комплекс инициации у прокариот
      • Требуются факторы инициации
      • Последовательность Шайна-Дальгарно (Shine-Dalgarno sequence,) — была описана австралийскими учеными Джоном Шайном и Линн Дальгарно и является сайтом связывания рибосом на молекуле мРНК прокариот, обычно на расстоянии около 10 нуклеотидов до стартового кодона AUG
    • 25. Эукариотическая инициация
      • Эукариотичеккая мРНК имеет специальные белки на 5 ’ и 3 ’ конце (связываются с 5’ CAP и 3’ poly A )
      • Первый AUG после CAP – начало трансляции
    • 26. Элонгация и терминация
      • Элонгация
          • Аминоацилированная тРНК устанавливается на рибосоме в месте кодона
          • Пептид переносится на эту тРНК
          • Цикл повторяется
      • Терминация
        • Стоп кодон соединяется со специальным белком вместо тРНК
    • 27. Процессинг
      • Начинается с момента синтеза белка
      • Требует специальных ферментов
      • Может происходить разрезание пептидной цепи с образованием конечного продукта (например, инсулин)
    • 28. Рибосома
      • Субъединицы состоят из рРНК и белков, соединяются только для трансляции
    • 29. Компоненты рибосомы
        • Малая субъединица
        • 16 S рРНК у прокариот и 18 S рРНК у эукариот
        • Ее последовательность используется для установления эволюционного родства между организмами
        • + белки
    • 30.  
    • 31. Компоненты рибосомы II
      • Большая субъединица (на примере прокариот)
        • 23 S rRNA
        • 5 S rRNA
        • 26 белков
    • 32. Бороздка между субъединицами
        • Место связи анти-кодон-кодон
        • Пептидная цепь выходит оттуда тоже
    • 33. Эукариотические рибосомы
      • 40S + 60S
        • 18S , 28S + 5.8S rRNA +5S