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Ma vie, mon œuvre!

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Slides présentant mes activités de M1 et M2 à mon équipe, pour le début de ma thèse

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  • 1. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Lamellodiscus parasites de sparidés et quelques autres choses Timothée P OISOT Université de Montpellier, Faculté des Sciences – UMR CNRS 5554 “ISEM” 7 novembre 2008 Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 1 / 24
  • 2. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Le programme. . . • Immunocompétence et stress environnemental chez un poisson d’eau douce • Spéciations en cours chez Lamellodiscus, un genre de monogènes de Méditerranée • L’avancement de la thèse • Vos questions ! Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 2 / 24
  • 3. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Immunocompétence et stress environnemental Consequences of rapid water temperature increase on immunocompetence, somatic condition, and parasitism in the chub (Leuciscus cephalus), a freshwater cyprinid fishPoisot, Šimková, Hyrsl & Morand, en révision – J Fish biol Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 3 / 24
  • 4. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Quelques rappelsTrois impératifs • Immunocompétence (système immunitaire) • Survie (échappement aux prédateurs) • Condition somatique (physiologie) Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 4 / 24
  • 5. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Quelques rappelsTrois impératifs • Immunocompétence (système immunitaire) • Survie (échappement aux prédateurs) • Condition somatique (physiologie)Mais ! • La quantité totale d’énergie à allouer est limitée • Investissements antagonistes : trade-offs ? Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 4 / 24
  • 6. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Le modèle Parasitisme Température Immunocompétence Reproduction Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 5 / 24
  • 7. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Impact des changements rapides de température 1 Spleen Second principal component (23.7 %) 0.5 Parasitism 0 Lymphocytes Neutrophiles Gonads Respiratory burst Hepatopancreas -0.5 Lysozyme -1 -1 -0.5 0 0.5 1 First principal component (34.5 %) Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 6 / 24
  • 8. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Impact des changements rapides de température 1 Parasitism Respiratory burst Second principal component (18.7 %) 0.5 Lysozyme Hepatopancreas Neutrophiles 0 Lymphocytes Spleen -0.5 Gonads -1 -1 -0.5 0 0.5 1 First principal component (36.8 %) Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 6 / 24
  • 9. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Quelles mesures de l’immunocompétence ? 1.0 S q B q 0.5 M q Axis 2: 32.4 % Lym 0.0 q N q RB −0.5 q Lys q −1.0 −1.0 −0.5 0.0 0.5 1.0 Timothée P OISOT (ISEM) Axis 1: 43.2 % 7 novembre 2008 7 / 24
  • 10. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Quelles mesures de l’immunocompétence ? 1.0 B q S q 0.5 Axis 2: 20.5 % Lys N q q 0.0 Lym q RB q M q −0.5 −1.0 −1.0 −0.5 0.0 0.5 1.0 Timothée P OISOT (ISEM) Axis 1: 43 % 7 novembre 2008 7 / 24
  • 11. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Un effet attendu. . . Males Females 100 100 80 80 60 60 40 40 20 20 0 0 6.1°C 10.1°C 6.1°C 10.1°C Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 8 / 24
  • 12. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 . . . et un plus surprenant Males Females 35 35 30 30 25 25 20 20 15 15 10 10 5 5 0 0 6.1°C 10.1°C 6.1°C 10.1°C Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 9 / 24
  • 13. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Ce qu’on en retiendra. . . • Tendance à long terme = effets à court terme • Investissement dans les gonades investissement dans l’immunocompétence • Immunocompétence : phénomène trop complexe pour être réduit à un indicateur unique ! Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 10 / 24
  • 14. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Introducing. . . Lamellodiscus Plathelminthe, Neodermata, Monogenea, Diplectanidae • Parasites de vertébrés aquatiques • Cycle de vie direct • Taux de spécificité important Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 11 / 24
  • 15. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Lamellodiscus parasites de sparidés Desdevises et coll. (2002, Evolution) L. elegans L. coronatus L. furcosus F. echeneis L. mormyri L. verberis L. drummondi L. virgula L. impervius L. parisi L. mirandus L. gracilis L. bidens L. hilii L. knoeppfleri L. ergensi L. fraternus L. ignoratus L. baeri L. erythrini Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 12 / 24
  • 16. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Lamellodiscus parasites de sparidés Desdevises et coll. (2002, Evolution) L. elegans S. cantharus L. coronatus B. boops L. furcosus S. salpa F. echeneis L. mormyri L. mormyrus L. verberis D. sargus L. drummondi D. cervinus L. virgula O. melanura L. impervius L. parisi D. puntazzo L. mirandus D. annularis L. gracilis D. vulgaris L. bidens S. aurata L. hilii L. knoeppfleri P. acarne L. ergensi P. bogaraveo L. fraternus D. dentex L. ignoratus L. baeri P. pagrus L. erythrini P. erythrinus Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 12 / 24
  • 17. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Lamellodiscus parasites de sparidés Desdevises et coll. (2002, Evolution) L. elegans S. cantharus L. coronatus B. boops L. furcosus S. salpa F. echeneis L. mormyri L. mormyrus L. verberis D. sargus L. drummondi D. cervinus L. virgula O. melanura L. impervius L. parisi D. puntazzo L. mirandus D. annularis L. gracilis D. vulgaris L. bidens S. aurata L. hilii L. knoeppfleri P. acarne L. ergensi P. bogaraveo L. fraternus D. dentex L. ignoratus L. baeri P. pagrus L. erythrini P. erythrinus Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 12 / 24
  • 18. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Hypothèses évolutivesSpéciation par host–switch Spéciation indépendante • Connu pour Gyrodactylus (e.g. • Connu pour Dactylogyrus Huyse et coll. 2005) (Šimková et coll. 2004) • Supposé important pour • Jamais étudié pour Lamellodiscus (Desdevises et Lamellodiscus coll. 2002) Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 13 / 24
  • 19. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Morphométrie Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 14 / 24
  • 20. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Morphométrie Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 14 / 24
  • 21. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Séquençage18S (SSU) ITS 1 5.8S 500pb Taille variable COI 300pb Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 15 / 24
  • 22. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Spéciations entre les hôtes ? Poisot & Desdevises, en révision, Parasitology 4 4 2 2 0 0 −2 −2 −4 −4 −6 D. sargus D. vulgaris O. melanura D. sargus D. vulgaris Lamellodiscus elegans Lamellodiscus kechemirae 2 4 0 2 −2 0 −4 −2 −6 −4 −8 −6 D. puntazzo D. sargus D. vulgaris L. mormyrus S. salpa D. puntazzo D. sargus D. vulgaris Lamellodiscus ignoratus Lamellodiscus ergensi Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 16 / 24
  • 23. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Spéciations intra-hôte ? Le cas de Lamellodiscus elegans sur Diplodus sargus D. sargus 8 44 D. sargus 8 53 D. sargus 8 2.0 Hosts 1, 8 and 9 99 D. sargus 8 62 1.5 37 D. sargus 1 D. sargus 1 1.0 D. sargus 9 44 85 D. sargus 9 0.5 39 D. sargus 92nd axis: 9.28 % 90 D. sargus 9 D. sargus 7 11 0.5 D. sargus 2 31 D. sargus 7 7 D. sargus 2 100 12 D. sargus 2 Hosts 2, 3, 6 and 7 14 1.5 D. sargus 7 8 D. sargus 7 43 D. sargus 7 D. sargus 3 2.5 63 68 D. sargus 3 38 D. sargus 6 48 57 6 5 4 3 2 1 0 1 2 3 4 D. sargus 3 D. sargus 6 1st axis: 74.5 % Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 17 / 24
  • 24. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Spéciations intra-hôte ? Le cas de Lamellodiscus elegans sur Diplodus sargus D. sargus 8 44 D. sargus 8 53 D. sargus 8 Hosts 1, 8 and 9 99 D. sargus 8 62 37 D. sargus 1 D. sargus 1 0.15 D. sargus 9 44 85 D. sargus 9 39 D. sargus 9 90 D. sargus 9Distribution D. sargus 7 0.10 11 D. sargus 2 31 D. sargus 7 7 D. sargus 2 100 12 D. sargus 2 Hosts 2, 3, 6 and 7 14 0.05 D. sargus 7 8 D. sargus 7 43 D. sargus 7 D. sargus 3 63 68 D. sargus 3 0.00 38 D. sargus 6 48 57 −6 −4 −2 0 2 4 D. sargus 3 D. sargus 6 Value on first axis of PCA Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 17 / 24
  • 25. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Vers une nouvelle phylogénie (18S) Poisot, Verneau et Desdevises (en préparation) L. impervius L. parisi 1.00 (0.87) L. mirandus 1.00 (0.82) L. gracilis 0.64 L. hilii 0.99 (0.87) L. bidens L. ignoratus 1 L. ignoratus 0.79 0.60 L. falcus 0.77 L. falcus L. knoeppfleri E L. tomentosus 0.92 (0.72) L. kechemirae 0.79 L. sanfillipoi 0.93 1.00 (0.73) L. fraternus 0.94 L. ergensi L. ergensi L. erythrini 0.93 (0.76) L. baeri 0.91 L. neifari 2 0.66 1.00 L. neifari L. neifari • “Éspèces” paraphylétiques L. neifari L. ignoratus L. diplodi 0.64 L. ignoratus L. ignoratus 0.94 L. ignoratus 0.78 1.00 L. ignoratus 1.00 L. confusus L. abbreviatus L. abbreviatus L. virgula 1.00 (1.00) L. obeliae L. verberis MCO L. mormyri LDB 0.89 L. elegans MVB 0.94 L. elegans 1.00 (100) L. elegans 1.00 0.57 L. elegans L. drummondi L. furcosus 0.99 (0.80) L. coronatus 1.00 (0.86) L. furcosus 0.95 (0.95) L. furcosus L. echeneis D. aequans Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 18 / 24
  • 26. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Vers une nouvelle phylogénie (18S) Poisot, Verneau et Desdevises (en préparation) L. impervius L. parisi 1.00 (0.87) L. mirandus 1.00 (0.82) L. gracilis 0.64 L. hilii 0.99 (0.87) L. bidens L. ignoratus 1 L. ignoratus 0.79 0.60 L. falcus 0.77 L. falcus L. knoeppfleri E L. tomentosus 0.92 (0.72) L. kechemirae 0.79 L. sanfillipoi 0.93 1.00 (0.73) L. fraternus 0.94 L. ergensi L. ergensi L. erythrini 0.93 (0.76) L. baeri 0.91 L. neifari 2 0.66 1.00 L. neifari L. neifari • “Éspèces” paraphylétiques L. neifari L. ignoratus 0.64 L. diplodi L. ignoratus • Pas de congruence entre L. ignoratus 0.94 1.00 1.00 0.78 L. ignoratus L. ignoratus L. confusus morphologie et génétique L. abbreviatus L. abbreviatus L. virgula 1.00 (1.00) L. obeliae L. verberis MCO L. mormyri LDB 0.89 L. elegans MVB 0.94 L. elegans 1.00 (100) L. elegans 1.00 0.57 L. elegans L. drummondi L. furcosus 0.99 (0.80) L. coronatus 1.00 (0.86) L. furcosus 0.95 (0.95) L. furcosus L. echeneis D. aequans Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 18 / 24
  • 27. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Lamellodiscus “ergensi”, “ignoratus”, ... L. ignoratus 1 L. ignoratus 0.60 L. falcus 0.77 L. falcus L. knoeppfleri E • Le groupe “ignoratus” n’est L. tomentosus 0.92 (0.72) 0.79 L. kechemirae L. sanfillipoi pas monophylétique 0.93 1.00 (0.73) L. fraternus 0.94 L. ergensi L. ergensi L. erythrini 0.93 (0.76) L. baeri 0.91 L. neifari 2 L. neifari L. neifari 0.66 1.00 L. neifari L. ignoratus L. diplodi 0.64 L. ignoratus L. ignoratus 0.94 L. ignoratus 0.78 1.00 L. ignoratus 1.00 L. confusus L. abbreviatus L. abbreviatus Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 19 / 24
  • 28. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Lamellodiscus “ergensi”, “ignoratus”, ... L. ignoratus 1 L. ignoratus 0.60 L. falcus 0.77 L. falcus L. knoeppfleri E • Le groupe “ignoratus” n’est L. tomentosus 0.92 (0.72) 0.79 L. kechemirae L. sanfillipoi pas monophylétique 0.93 1.00 (0.73) 0.94 L. fraternus L. ergensi • Deux LITUs, falcus (1) and L. ergensi 0.93 (0.76) L. erythrini L. baeri abbreviatus (2) 0.91 L. neifari 2 L. neifari L. neifari 0.66 1.00 L. neifari L. ignoratus L. diplodi 0.64 L. ignoratus L. ignoratus 0.94 L. ignoratus 0.78 1.00 L. ignoratus 1.00 L. confusus L. abbreviatus L. abbreviatus Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 19 / 24
  • 29. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Lamellodiscus “ergensi”, “ignoratus”, ... L. ignoratus 1 L. ignoratus 0.60 L. falcus 0.77 L. falcus L. knoeppfleri E • Le groupe “ignoratus” n’est L. tomentosus 0.92 (0.72) 0.79 L. kechemirae L. sanfillipoi pas monophylétique 0.93 1.00 (0.73) 0.94 L. fraternus L. ergensi • Deux LITUs, falcus (1) and L. ergensi 0.93 (0.76) L. erythrini L. baeri abbreviatus (2) 0.91 L. neifari L. neifari 2 • Des individus dans le clade 0.66 1.00 L. neifari L. neifari “ergensi” (E) L. ignoratus L. diplodi 0.64 L. ignoratus L. ignoratus 0.94 L. ignoratus 0.78 1.00 L. ignoratus 1.00 L. confusus L. abbreviatus L. abbreviatus Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 19 / 24
  • 30. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Lamellodiscus “ergensi”, “ignoratus”, ... L. ignoratus 1 L. ignoratus 0.60 L. falcus 0.77 L. falcus L. knoeppfleri E • Le groupe “ignoratus” n’est L. tomentosus 0.92 (0.72) 0.79 L. kechemirae L. sanfillipoi pas monophylétique 0.93 1.00 (0.73) 0.94 L. fraternus L. ergensi • Deux LITUs, falcus (1) and L. ergensi 0.93 (0.76) L. erythrini L. baeri abbreviatus (2) 0.91 L. neifari L. neifari 2 • Des individus dans le clade 0.66 1.00 L. neifari L. neifari “ergensi” (E) L. ignoratus • Diversité intra-LITU pour falcus L. diplodi 0.64 L. ignoratus L. ignoratus 0.94 1.00 1.00 0.78 L. ignoratus L. ignoratus et abbreviatus ≈ diversité L. confusus L. abbreviatus L. abbreviatus intra-spécifique Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 19 / 24
  • 31. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Lamellodiscus “ergensi”, “ignoratus”, ... L. ignoratus 1 L. ignoratus 0.60 L. falcus 0.77 L. falcus L. knoeppfleri E • Le groupe “ignoratus” n’est L. tomentosus 0.92 (0.72) 0.79 L. kechemirae L. sanfillipoi pas monophylétique 0.93 1.00 (0.73) 0.94 L. fraternus L. ergensi • Deux LITUs, falcus (1) and L. ergensi 0.93 (0.76) L. erythrini L. baeri abbreviatus (2) 0.91 L. neifari L. neifari 2 • Des individus dans le clade 0.66 1.00 L. neifari L. neifari “ergensi” (E) L. ignoratus • Diversité intra-LITU pour falcus L. diplodi 0.64 L. ignoratus L. ignoratus 0.94 1.00 1.00 0.78 L. ignoratus L. ignoratus et abbreviatus ≈ diversité L. confusus L. abbreviatus L. abbreviatus intra-spécifique • Évolution morphologique = évolution moléculaire : pression de sélection forte ! Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 19 / 24
  • 32. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Stress, parasites et variabilité spatio-temporelle Patrons d’évolution et de coévolutionRéponse adaptative d’une bactérie à deux types de stress : phages etenvironnementApprocheCouplage modélisation – expérimentation Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 20 / 24
  • 33. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Expérience piloteCompétition bactéries co évoluées – bactéries seules Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 21 / 24
  • 34. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Expérience “spécificité”Évolution de la spécificité des phages au cours du temps Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 22 / 24
  • 35. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Sensibilité à la présence de phages Coll. Tom Bell ? • Bacteria + phages, then removal of the phages • Bacteria + dead phages • Bacteria + pieces of phages • Bacteria + debris of other bacteria killed by phages • Bacteria + debris of other bacteria killed by any other stress Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 23 / 24
  • 36. Introduction Leuciscus cephalus Lamellodiscus Pseudomonas – φ2 Merci de votre attention Timothée P OISOT (ISEM) 7 novembre 2008 24 / 24

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