My NCBI - Pubmed-Individualisierung - Presentation Transcript
PubMed-Individualisierung
Erste Schritte
1. PubMed aufrufen (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed):
2. In der linken (blauen) Seitenliste \"My NCBI\" wählen
3. Im \"sign in\"-Rahmen \"register for an account\" wählen
4. \"Register\"-Fenster: Angaben eintragen (User Name, Password usw.), e-mail-Adresse ebenfalls
eintragen (ist zwar fakultativ, ist jedoch für Funktionserweiterung wichtig)
5. Von jetzt an kann man jedes Mal, wenn man PubMed verwendet, \"personalisierte\"
Funktionen verwenden, indem man sich anmeldet (login rechts oben).
Zusätzliche Einstellungen
1. Eine ergänzende Personalisierung kann in \"User Preferences\" erfolgen: zuerst \"My NBCI\"
wählen
2. In der linken Liste unter \"My NCBI Resources\" \"User Preferences\" wählen
3. Hier kann festgelegt werden, wie zu jeder einzelnen Referenz die Links zu weiteren
Informationsquellen ausserhalb von PubMed (z.B. \"books\" usw.) gezeigt werden. Normal
handelt es sich um ein \"JavaScript Menu\", das rechts neben dem Titel der Referenz erscheint
4. Hier kann auch die persönliche e-mail-Adresse geändert werden
5. Schliesslich kann in den Suchresultaten die Suchbegriffe mit verschiedenen Farben
unterlegen (\"highlight\")
6. Am Ende klickt man auf \"ok\" und erhält die Resultate jetzt wie gewünscht.
Einrichten der individuellen Resultateauswahl (Filter)
1. Im Pubmed-Fenster rechts oben auf \"My NCBI\" klichen
2. Im neuen Fenster (My NCBI) in der linken (blauen) Seitenliste \"Filters\" wählen
3. \"Filter Selection\": zuerst \"Database\" wählen, normalerweise \"PubMed\"
4. Man kann bis 5 Filter wählen, sollte sich also gut überlegen, was wirklich nützlich ist und
was nicht, also zuerst die verschiedenen Filter ansehen: \"browse\"
5. \"LinkOut\" und \"Links\" normalerweise unberücksichtigt lassen
6. \"Properties\": ansehen und auswählen:
Beispiel:
nach Altersgruppe: \"all child\" wird alle Resultate von Artikeln bringen, die Kinder von der
Geburt bis zum 18. Lebensjahr betreffen; Beispiel unten: Personen von min. 80 Jahren
nach \"clinical queries\": hier werden Evidenz-basierte Studien ausgelesen
nach Datum: z.B. \"citations entered in the last 7 days\" bringt nur die ganz neuen Artikel
nach Sprache: z.B. \"german\": wählt Texte in deutscher Sprache aus (Pubmed-Resultate
erscheinen dennoch in englischer Sprache! Es geht um die Sprache des Originalartikels)
usw.
Achtung: wenn man jeweils ein Auswahlkriterium (durch Anklicken) gewählt hat, muss man
anschliessend dazu noch das Kästchen neben \"Add a result tab for all items that match this
filter\" anklicken.
Am Schluss kann man im Fach \"My Selections\" ansehen, welche Filter man festgelegt hat. Die
Auswahl lässt sich jederzeit ändern. Von jetzt an erhält man (unter der Voraussetzung, dass man
sich angemeldet hat), die Suchresultate immer in verschiedenen \"Tabs\" sortiert, nämlich zuerst
\"all\" und dann nach den individuell ausgesuchten Filtern.
Suchstrategien individuell \"automatisieren\"
1. Wenn man plant, eine bestimmte Suche auch in Zukunft immer wieder durchzuführen,
dann kann man sie im \"My NCBI\" ablegen, indem man die gewünschte Suche mit \"save
search\" (oben rechts neben der Suchfläche) speichert
2. Nach Anklicken von \"save search\" öffnet sich ein kleines Fenster, in dem man festlegen kann,
ob man die Suche lediglich aufbewahren will oder ob man sich neue Resultate jeweils per
e-mail zustellen lassen will. Hier kann man übrigens auch einen eigenen Namen für die
gewählte Suchstrategie eingeben (\"enter a name for your search\")
3. Wählt man die Option \"e-mail updates\", so öffnet sich ein neues Fenster. In diesem kann
man festelegen, wie häufig \"Updates\" zugestellt werden sollen, z.B. jeden ersten Samstag im
Monat. Man kann auch festlegen, wieviel Info man erhalten möchte (z.B. \"summary\" oder
\"abstract\" sowie die Zahl der versendeten Referenzen, z.B. nur 5 oder bis zu 500). Als e-
mail-Adresse wird die Adresse verwendet, die man initial beim Einrichten von \"My NBCI\"
angegeben hat (lässt sich an dieser Stelle nicht ändern - wenn man ändern will, muss man
dies in den \"User Preferences\" tun.
Von jetzt an erhält man nach den gewählten Kriterien regelmässig \"Updates\" zu dieser
Suchstrategie. Selbstverständlich lässt sich auch dies jederzeit ändern, löschen oder die
Häufigkeit der e-mail-Meldungen ändern usw.
PubMed-Suchresultate individuell aufbewahren
Neu kann man die Resultate einer Suche in „MyNCBI“ auch aufbewahren. Dazu legt man eine
sogenannte „Collection“ an. Hier die einzelnen Schritte:
1. Sicherstellen, dass man eingewählt („logged in“) ist
2. Suche in PubMed durchführen
3. Resultate, die man aufbewahren möchte, bezeichnen (wenn man dies nicht tut, werden in
den folgenden Schritten alle (max. 500) Suchresultate einbezogen)
4. Die bezeichneten (bzw. alle bis zu 500) Suchresultate in das Clipboard übertragen: „send to
clipboard“.
Wenn der „Clipboard-Tab“ mit einem * bezeichnet ist, weiss man, dass das Clipboard Daten
enthält.
5. In das Clipboard wechseln, dort allenfalls nochmals einzelne Resultate markieren (wenn man
nicht alle aufbewahren will) und dann „send to My NCBI Collections“ wählen.
Jetzt werden die Daten aus dem Clipboard für den individuellen Anwender permanent
aufbewahrt. Man kann eine neue „Collection“ erstellen oder die Daten aus dem Clipboard
einer schon früher erstellten „Collection“ anfügen. Die Collections sollten mit einem Namen
versehen werden (der sich später auch wieder ändern lässt).
Zu den Collections gibt es eine instruktive QuickTour auf der PubMed-Site:
http://www.nlm.nih.gov/bsd/viewlet/myncbi/collections_viewlet_swf.html
Ergänzungen
NCBI Search Toolbar
An der Adresse http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/toolbar/ kann man sich eine \"Toolbar\" für
den Webbrowser beschaffen: diese Search Toolbar ermöglicht die Suche direkt aus dem
Browser (ohne dass PubMed primär aufgerufen werden muss). Erhältlich für MS Internet
Explorer und Firefox.
Für den Firefox-Browser gibt es zudem die Möglichkeit, die Searchbar (rechts oben) auch für
PubMed zu programmieren. Das entsprechende PlugIn holt man sich bei
http://mycroft.mozdev.org/ (nach \"PubMed\" suchen, \"NCBI PubMed\" wählen). Das PlugIn
installiert sich selbst.
Ein weiteres sehr praktisches PlugIn führt zu LEO, dem deutsch-englischen Wörterbuch
(ebenfalls bei Mycroft zu finden, wo es noch unglaublich viele weitere PlugIns gibt).
Suche optimieren - geeignete englische Begriffe finden - MeSH-Browser
verwenden
Wenn man mit der medizinischen Terminologie in englischer Sprache nicht gut vertraut ist,
lohnt es sich eventuell, ein Online-Wörterbuch (z.B. LEO: http://dict.leo.org/) zu konsultieren,
bevor man die Suche in PubMed durchführt.
Beispiel: \"Herzinsuffizienz\" wird nicht als \"heart insufficiency\" und eher ungebräuchlich als
\"cardiac insufficiency\" übersetzt. In LEO findet man aber auch den gebräuchlichen Begriff
\"congestive heart failure\".
Ist man immer noch nicht sicher, so kann man den (englischen) Begriff in den MeSH-Browser
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=mesh) eingeben. An dieser Adresse findet
man auch sehr gutes \"Tutorials\", wie man mit dem MeSH-Browser umgehen kann.
MeSH bedeutet \"Medical Subject Headings\". MeSH entsprechen den von der amerikanischen
National Library of Medicine (also auch in PubMed) verwendeten Begriffen, die das sogen.
\"kontrollierte Vokabular\" der Datenbank bilden.
Die Verwendung eines MeSH in der Suche stellt sicher, dass man die Datenbank optimal
\"ausschöpft\".
Was bedeuten die Bildchen neben den Referenzen?
Mit diesem Symbol sind Referenzen gekennzeichnet, zu denen kostenlos Volltexte
abgerufen werden können. Durch Anklicken dieses Symbols gelangt man in das Abstract des
Artikels und von dort aus kann man sich zum Volltext \"weiterverbinden\"
Auch dieses Symbol bedeutet \"Gratis-Volltext im Internet\", zusätzlich handelt es sich
aber um einen Text, der in der \"PubMed Central\"-Bibliothek publiziert wurde
Dieses Symbol bedeutet: Abstract in PubMed vorhanden. Ob es im Internet auch einen
Volltext dieses Artikel gibt, muss man auf der Abstract-Seite selbst nachsehen. Wenn ein
Volltext verfügbar ist, muss dieser jedoch in der Regel bezahlt werden, ausser man hätte ein
Abonnement für die entsprechende Zeitschrift.
Mit diesem Symbol sind Referenzen gekennzeichnet, zu denen in PubMed kein Abstract
vorhanden ist. Klickt man auf dieses Symbol, so kommt man in ein Fenster, das vereinzelt
(besonders bei neueren Publikationen) doch noch die Möglichkeit bietet, zum Originalartikel
zu gelangen.
PubMed bietet auf ihrer Website mehrere, sehr gut gestaltete „QuickTours“ an, mit denen man
schnell lernen kann, wie man z.B.
- nach einem Autor sucht
- die MeSH-Datenbank verwendet
- die verschiedenen Funktionen von MyNCBI einsetzt.
Adresse: http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
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