My NCBI - Pubmed-Individualisierung

PubMed-Individualisierung Erste Schritte 1. PubMed aufrufen (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed): 2. In der linken (blauen) Seitenliste quot;My NCBIquot; wählen 3. Im quot;sign inquot;-Rahmen quot;register for an accountquot; wählen

4. quot;Registerquot;-Fenster: Angaben eintragen (User Name, Password usw.), e-mail-Adresse ebenfalls eintragen (ist zwar fakultativ, ist jedoch für Funktionserweiterung wichtig)

5. Von jetzt an kann man jedes Mal, wenn man PubMed verwendet, quot;personalisiertequot; Funktionen verwenden, indem man sich anmeldet (login rechts oben). Zusätzliche Einstellungen 1. Eine ergänzende Personalisierung kann in quot;User Preferencesquot; erfolgen: zuerst quot;My NBCIquot; wählen 2. In der linken Liste unter quot;My NCBI Resourcesquot; quot;User Preferencesquot; wählen 3. Hier kann festgelegt werden, wie zu jeder einzelnen Referenz die Links zu weiteren Informationsquellen ausserhalb von PubMed (z.B. quot;booksquot; usw.) gezeigt werden. Normal handelt es sich um ein quot;JavaScript Menuquot;, das rechts neben dem Titel der Referenz erscheint 4. Hier kann auch die persönliche e-mail-Adresse geändert werden 5. Schliesslich kann in den Suchresultaten die Suchbegriffe mit verschiedenen Farben unterlegen (quot;highlightquot;) 6. Am Ende klickt man auf quot;okquot; und erhält die Resultate jetzt wie gewünscht.

Einrichten der individuellen Resultateauswahl (Filter) 1. Im Pubmed-Fenster rechts oben auf quot;My NCBIquot; klichen 2. Im neuen Fenster (My NCBI) in der linken (blauen) Seitenliste quot;Filtersquot; wählen 3. quot;Filter Selectionquot;: zuerst quot;Databasequot; wählen, normalerweise quot;PubMedquot; 4. Man kann bis 5 Filter wählen, sollte sich also gut überlegen, was wirklich nützlich ist und was nicht, also zuerst die verschiedenen Filter ansehen: quot;browsequot; 5. quot;LinkOutquot; und quot;Linksquot; normalerweise unberücksichtigt lassen 6. quot;Propertiesquot;: ansehen und auswählen:

Beispiel: nach Altersgruppe: quot;all childquot; wird alle Resultate von Artikeln bringen, die Kinder von der Geburt bis zum 18. Lebensjahr betreffen; Beispiel unten: Personen von min. 80 Jahren nach quot;clinical queriesquot;: hier werden Evidenz-basierte Studien ausgelesen nach Datum: z.B. quot;citations entered in the last 7 daysquot; bringt nur die ganz neuen Artikel nach Sprache: z.B. quot;germanquot;: wählt Texte in deutscher Sprache aus (Pubmed-Resultate erscheinen dennoch in englischer Sprache! Es geht um die Sprache des Originalartikels) usw. Achtung: wenn man jeweils ein Auswahlkriterium (durch Anklicken) gewählt hat, muss man anschliessend dazu noch das Kästchen neben quot;Add a result tab for all items that match this filterquot; anklicken. Am Schluss kann man im Fach quot;My Selectionsquot; ansehen, welche Filter man festgelegt hat. Die Auswahl lässt sich jederzeit ändern. Von jetzt an erhält man (unter der Voraussetzung, dass man sich angemeldet hat), die Suchresultate immer in verschiedenen quot;Tabsquot; sortiert, nämlich zuerst quot;allquot; und dann nach den individuell ausgesuchten Filtern. Suchstrategien individuell quot;automatisierenquot; 1. Wenn man plant, eine bestimmte Suche auch in Zukunft immer wieder durchzuführen, dann kann man sie im quot;My NCBIquot; ablegen, indem man die gewünschte Suche mit quot;save searchquot; (oben rechts neben der Suchfläche) speichert 2. Nach Anklicken von quot;save searchquot; öffnet sich ein kleines Fenster, in dem man festlegen kann, ob man die Suche lediglich aufbewahren will oder ob man sich neue Resultate jeweils per e-mail zustellen lassen will. Hier kann man übrigens auch einen eigenen Namen für die gewählte Suchstrategie eingeben (quot;enter a name for your searchquot;) 3. Wählt man die Option quot;e-mail updatesquot;, so öffnet sich ein neues Fenster. In diesem kann man festelegen, wie häufig quot;Updatesquot; zugestellt werden sollen, z.B. jeden ersten Samstag im Monat. Man kann auch festlegen, wieviel Info man erhalten möchte (z.B. quot;summaryquot; oder quot;abstractquot; sowie die Zahl der versendeten Referenzen, z.B. nur 5 oder bis zu 500). Als e- mail-Adresse wird die Adresse verwendet, die man initial beim Einrichten von quot;My NBCIquot; angegeben hat (lässt sich an dieser Stelle nicht ändern - wenn man ändern will, muss man dies in den quot;User Preferencesquot; tun. Von jetzt an erhält man nach den gewählten Kriterien regelmässig quot;Updatesquot; zu dieser Suchstrategie. Selbstverständlich lässt sich auch dies jederzeit ändern, löschen oder die Häufigkeit der e-mail-Meldungen ändern usw.

PubMed-Suchresultate individuell aufbewahren Neu kann man die Resultate einer Suche in „MyNCBI“ auch aufbewahren. Dazu legt man eine sogenannte „Collection“ an. Hier die einzelnen Schritte: 1. Sicherstellen, dass man eingewählt („logged in“) ist 2. Suche in PubMed durchführen

3. Resultate, die man aufbewahren möchte, bezeichnen (wenn man dies nicht tut, werden in den folgenden Schritten alle (max. 500) Suchresultate einbezogen) 4. Die bezeichneten (bzw. alle bis zu 500) Suchresultate in das Clipboard übertragen: „send to clipboard“. Wenn der „Clipboard-Tab“ mit einem * bezeichnet ist, weiss man, dass das Clipboard Daten enthält. 5. In das Clipboard wechseln, dort allenfalls nochmals einzelne Resultate markieren (wenn man nicht alle aufbewahren will) und dann „send to My NCBI Collections“ wählen. Jetzt werden die Daten aus dem Clipboard für den individuellen Anwender permanent aufbewahrt. Man kann eine neue „Collection“ erstellen oder die Daten aus dem Clipboard einer schon früher erstellten „Collection“ anfügen. Die Collections sollten mit einem Namen versehen werden (der sich später auch wieder ändern lässt).

Zu den Collections gibt es eine instruktive QuickTour auf der PubMed-Site: http://www.nlm.nih.gov/bsd/viewlet/myncbi/collections_viewlet_swf.html Ergänzungen NCBI Search Toolbar An der Adresse http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/toolbar/ kann man sich eine quot;Toolbarquot; für den Webbrowser beschaffen: diese Search Toolbar ermöglicht die Suche direkt aus dem Browser (ohne dass PubMed primär aufgerufen werden muss). Erhältlich für MS Internet Explorer und Firefox. Für den Firefox-Browser gibt es zudem die Möglichkeit, die Searchbar (rechts oben) auch für PubMed zu programmieren. Das entsprechende PlugIn holt man sich bei http://mycroft.mozdev.org/ (nach quot;PubMedquot; suchen, quot;NCBI PubMedquot; wählen). Das PlugIn installiert sich selbst. Ein weiteres sehr praktisches PlugIn führt zu LEO, dem deutsch-englischen Wörterbuch (ebenfalls bei Mycroft zu finden, wo es noch unglaublich viele weitere PlugIns gibt). Suche optimieren - geeignete englische Begriffe finden - MeSH-Browser verwenden Wenn man mit der medizinischen Terminologie in englischer Sprache nicht gut vertraut ist, lohnt es sich eventuell, ein Online-Wörterbuch (z.B. LEO: http://dict.leo.org/) zu konsultieren, bevor man die Suche in PubMed durchführt. Beispiel: quot;Herzinsuffizienzquot; wird nicht als quot;heart insufficiencyquot; und eher ungebräuchlich als quot;cardiac insufficiencyquot; übersetzt. In LEO findet man aber auch den gebräuchlichen Begriff quot;congestive heart failurequot;.

Ist man immer noch nicht sicher, so kann man den (englischen) Begriff in den MeSH-Browser (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=mesh) eingeben. An dieser Adresse findet man auch sehr gutes quot;Tutorialsquot;, wie man mit dem MeSH-Browser umgehen kann. MeSH bedeutet quot;Medical Subject Headingsquot;. MeSH entsprechen den von der amerikanischen National Library of Medicine (also auch in PubMed) verwendeten Begriffen, die das sogen. quot;kontrollierte Vokabularquot; der Datenbank bilden. Die Verwendung eines MeSH in der Suche stellt sicher, dass man die Datenbank optimal quot;ausschöpftquot;. Was bedeuten die Bildchen neben den Referenzen? Mit diesem Symbol sind Referenzen gekennzeichnet, zu denen kostenlos Volltexte abgerufen werden können. Durch Anklicken dieses Symbols gelangt man in das Abstract des Artikels und von dort aus kann man sich zum Volltext quot;weiterverbindenquot; Auch dieses Symbol bedeutet quot;Gratis-Volltext im Internetquot;, zusätzlich handelt es sich aber um einen Text, der in der quot;PubMed Centralquot;-Bibliothek publiziert wurde Dieses Symbol bedeutet: Abstract in PubMed vorhanden. Ob es im Internet auch einen Volltext dieses Artikel gibt, muss man auf der Abstract-Seite selbst nachsehen. Wenn ein Volltext verfügbar ist, muss dieser jedoch in der Regel bezahlt werden, ausser man hätte ein Abonnement für die entsprechende Zeitschrift. Mit diesem Symbol sind Referenzen gekennzeichnet, zu denen in PubMed kein Abstract vorhanden ist. Klickt man auf dieses Symbol, so kommt man in ein Fenster, das vereinzelt (besonders bei neueren Publikationen) doch noch die Möglichkeit bietet, zum Originalartikel zu gelangen. PubMed bietet auf ihrer Website mehrere, sehr gut gestaltete „QuickTours“ an, mit denen man schnell lernen kann, wie man z.B. - nach einem Autor sucht - die MeSH-Datenbank verwendet - die verschiedenen Funktionen von MyNCBI einsetzt. Adresse: http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html

My NCBI - Pubmed-Individualisierung

by etzel on Mar 18, 2008

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