Réseaux d'information sur la biodiversité - situation outils et perspectives
Upcoming SlideShare
Loading in...5
×
 

Réseaux d'information sur la biodiversité - situation outils et perspectives

on

  • 616 views

Présentation donnée dans le cadre du cours de biogéographie (Chantal De Ridder, ULB)

Présentation donnée dans le cadre du cours de biogéographie (Chantal De Ridder, ULB)

Statistics

Views

Total Views
616
Views on SlideShare
616
Embed Views
0

Actions

Likes
0
Downloads
25
Comments
0

0 Embeds 0

No embeds

Accessibility

Categories

Upload Details

Uploaded via as Adobe PDF

Usage Rights

© All Rights Reserved

Report content

Flagged as inappropriate Flag as inappropriate
Flag as inappropriate

Select your reason for flagging this presentation as inappropriate.

Cancel
  • Full Name Full Name Comment goes here.
    Are you sure you want to
    Your message goes here
    Processing…
Post Comment
Edit your comment

Réseaux d'information sur la biodiversité - situation outils et perspectives Réseaux d'information sur la biodiversité - situation outils et perspectives Presentation Transcript

  • Réseaux d’information sur la biodiversité Situation, outils et perspectives Bruno Danis, Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique #biodiversityaqMonday 19 December 11
  • Menu du jour • décrire la vie sur Terre • la biodiversité informatique • le cas de l’Antarctique • applications: biogéographie, conservation • défis et perspectivesMonday 19 December 11
  • Décrire la vieMonday 19 December 11
  • Biogéographie • Etude des distributions des organismes vivants et des écosystèmes connexes; • les rélations géographiques de ces organismes avec leur environment au cours du temps • QUOI? OU? QUAND?Monday 19 December 11
  • Biodiversité La biodiversité est la diversité naturelle des organismes vivants. Elle sapprécie en considérant la diversité des écosystèmes, des espèces, des populations et celle des gènes dans lespace et dans le temps, ainsi que lorganisation et la répartition des écosystèmes aux échelles biogéographiques. (Wikipedia)Monday 19 December 11
  • Biodiversité La variabilité des organismes vivants de toute origine y compris, entre autres, les écosystèmes terrestres, marins et autres écosystèmes aquatiques et les complexes écologiques dont ils font partie; cela comprend la diversité au sein des espèces et entre espèces ainsi que celle des écosystèmes. (Convention on Biodiversity)Monday 19 December 11
  • Mesurer la biodiversité • pas de mesure unique • utilisation d’indices • processus complexes, dynamiques, dans l’espace et le tempsMonday 19 December 11
  • Etat des lieux • 1,75 M d’espèces décrites • 3,6 - 100 M d’espèces en tout • période d’extinction massive • perte de services écosystémiquesMonday 19 December 11
  • Aspects politiques • CBD 1992: MEA, CHM, GBIF • Pas d’agence mondiale pour la biodiversité (vs FAO, OMS) • IMOSEB => IPBES (sous UNEP) • SPIMonday 19 December 11
  • Le besoin d’information • recherche scientifique • conservation • gestion • => besoin d’un accès direct aux données primaires sur la biodiversité • => besoin d’un panel d’outils • la visualisation de la biodiversitéMonday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • original slide: Huw GriffithsMonday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • “best&viewed&when&enlarged&to&a&1.55meter&diameter”Monday 19 December 11
  • addMonday 19 December 11
  • h8p://flare.prefuse.org/demo/Monday 19 December 11
  • Les Réseaux d’informationMonday 19 December 11
  • L’évolution du webMonday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Web2.0 Web participatif, social et intelligence collective. Markus AngermeierMonday 19 December 11
  • original slide: Mark Parsons Notre vision: Les données sont ouvertes, liées, utiles, et sauves Copyright: © Christian MorelMonday 19 December 11
  • original slide: Mark Parsons Ouvertes Open Data is a philosophy and practice requiring that certain data are freely available to everyone, without restrictions from copyright, patents or other mechanisms of control.—WikipediaMonday 19 December 11
  • original slide: Mark Parsons Liées The term Linked Data is used to describe a method of exposing, sharing, and connecting data via dereferenceable URIs on the Web.—WikipediaMonday 19 December 11
  • original slide: Mark Parsons Utiles Documentées, et utilisable dans un certain contexte d’analyseMonday 19 December 11
  • original slide: Mark Parsons Interopérables La standardisation des données et des métadonnées permet aux systèmes d’échanger de l’information, de manière optimaleMonday 19 December 11
  • original slide: Mark Parsons Sauves Safe from hackers, from obsolescence, from undocumented change, from loss, and from the ravages of time.Monday 19 December 11
  • original slide: Vishwas Chavan Les données primaires sur la biodiversité un enregistrement digital détaillant l’instance d’un organisme: “quoi, où, quand, comment, par qui?” concernant une occurenceMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas Chavan Importance des données Policy development and decision making (at local, national, regional, and global levels) Données sur la biodiversité Monitoring of status Conservation and trends of and sustainable biodiversity use of (sound science) biodiversityMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas Chavan Applications des données primaires • Prédire les effets des changements climatiques • Analyser et prédire la dispersion des maladies sur les humains, les cultures, ... • Choix de nouvelles zones protégées • Suivi des espèces invasives et prédiction des voies d’invasion • Fournir de l’information aux preneurs de décision • Fournir des données aux communautés scientifiquesMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas Chavan www.GBIF.org • Global Biodiversity Information Facility • organisation intergouvernementale (depuis 2002) • développer une infrastructure informatique globale pour une circulation efficace des données sur la biodiversité • portail de données • standards et outils • formation • réduction de la fracture numérique • rapatriement des donnéesMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas Chavan Le portail de données du GBIF Seamless integration of data from many sources Searches Taxonomic Geographic, by country, region, or bounding-box By dataset or a combination of these http://data.gbif.org/Monday 19 December 11
  • original slide: Peter Desmet 313&M&records h8p://eol.org/pages/1/mapsMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas Chavan Utilisateurs de GBIF  Scientists, experts  Government officials at all levels  Education at all levels  NGOs and the general public These needs are highly varied, but can be met by open access to the same datasets The same data can be analysed differently for different usesMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas Chavan Intégration des données World Database on Primary Biodiversity Protected Areas Data >60,000 >181 M specimen protected areas and observation data MadagascarSpain Species geo-referenced data. taxonomic resolution Visualisation on WDPA site (intelligence) Protected GBIF GBIF Each Protected areas data geo- Area polygon referenced processed…. Spain 271 2.2 M 51% Madagascar 72 0.35 M 61% Data processing from the two databasesMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas ChavanMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas ChavanMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas ChavanMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas ChavanMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas ChavanMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas Chavan Moving towards… global integration ? Threatened Spp.; Red List Spp. Migratory Spp. Invasives, crop wild relatives, medicinals, etc.Monday 19 December 11
  • Cartographier les vecteurs original slide: Vishwas Chavan de maladie  Aedes albopictus “Asian Tiger Mosquito”  Invader - fastest spreading mosquito in the world  Aggressive daytime biter and pest  Known to transmit Dengue, La Crosse, St. Louis, Eastern Equine, Ross River, Rift Valley, and West Nile VirusesMonday 19 December 11
  • original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus – native range Modeled native range in Asia from specimens & observations (ENM)Monday 19 December 11
  • original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus:potential USA invasion Projected Asian niche onto present USA to create invasion risk-map.Monday 19 December 11
  • original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus:actual USA invasion (by county)Monday 19 December 11
  • original slide: Vishwas ChavanAedes albopictus:world risk-map (present)Monday 19 December 11
  • original slide: Vishwas Chavan Impact des changements climatiques Sterculiaceae (Meliaceae, Dipterocapaceae)Monday 19 December 11
  • original slide: Vishwas Chavan Impact des changements climatiques ! Allfamilies and genera suffer habitat loss; ! Some do gain habitat potential, but this requires migration and suitable habitat (for forests) at destination; ! Important implications for REDD and other CC adaptation/mitigation programmesMonday 19 December 11
  • Autres réseaux • OBIS • ALA • EOL • ANTABIF • => tous interconnectés, forment un écosystème interopérable • => multiplication des contextesMonday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • www. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow Le cas de l’AntarctiqueMonday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow Changes in the Earth system have been observed. These are mainly (but not exclusively) due to changes in Greenhouse gas concentrations Source: IPCC 2007Monday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow Such changes can only be explained by including both anthropogenic (human) and natural forcings Source: IPCC 2007Monday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow Surface temperature of the Earth until 2100 if greenhouse gas concentrations double. Based on a weighted average of the IPCC CMIP3 models. Source: John Turner (BAS)Monday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow GOUVERNANCE DE L’ANTARCTIQUE • Pas de gouvernement central • Régime juridique défini par l’ATS (1959) • Système du Traité Antarctique • Traité • Comités consultatifs • Secrétariat • CCAMLR • Protocole de MadridMonday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow LE TRAITE ANTARCTIQUE • Antarctica shall be used for peaceful purposes only (Art. I) • Freedom of scientific investigation in Antarctica and cooperation toward that end … shall continue (Art. II) • Scientific observations and results from Antarctica shall be exchanged and made freely available (Art. III) • All areas of Antarctica, including all stations, installations and equipment within those areas … shall be open at all times to inspection (Art.VII)Monday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow L’ANTARCTIQUE DANS LE SYSTEME TERREMonday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow Summer&DJF& Autumn&MAM& WinterJJA SpringSON In the future the whole of the Antarctic Region is predicted to warm: 3.4°C by 2100 Source: John Turner (BAS)Monday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM (1) Ice Sheets and Sea Level Rise Sea Level Rise by 2100: ➡18-59 cm (IPCC 2007) ➡up to140 cm (ACCE 2009) ➡75-190 cm (Rahmstorf 2010) ➡90-160 cm (SWIPA 2011) “Ice sheets will be the dominant contributor to sea level rise in the 21st century” (Rignot et al, 2011)Monday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM (3) The Oceans: Global Overturning Circulation Driven by sinking of dense cold waters at both poles - Redistributes heat around the globe (e.g. keeps western Europe ~5 °C warmer)Monday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM (3) The Oceans: Melting Glaciers Low pressure cell (ASL) forces warm subsurface water to well up and penetrate under ice shelf ‘Warm’ ocean melts Pine Island Glacier from beneathMonday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow THE POLAR REGIONS IN THE EARTH SYSTEM (3) The Oceans: Ocean AcidificationMonday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow ANTARCTIC ECOSYSTEMS Shifts in Penguin Populations on the Western Antarctic Peninsula are Attributed to Changes in Precipitation Patterns and Sea Ice. McClintock et al. (2008)Monday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow ANTARCTIC ECOSYSTEMS Change per decade ove r t wofo ld d ecrease u p to twof old decrease less than 5% cha nge up to twofo ld increa se ove r t wofo ld increase Atkinson et al (2004) As sea ice decreases krill population decreases and salp population increases...Monday 19 December 11
  • original slide: Mike Sparrow ANTARCTIC ECOSYSTEMS AND PEOPLE Economic and Strategic Interests in the AntarcticMonday 19 December 11
  • Biodiversité Antarctique• Haute adaptation à un environnement extrême• Haut niveau d’endémisme (>50% des espèces)• Essentiellement marine (78% vivent sur le fond)• >8000 espèces connuses. Estimations: autour de 20.000• Sous-étudié (surtout les zones abyssales)• Probablement très sensible aux changements climatiques• Besoin de systèmes d’information performant et dédiéMonday 19 December 11
  • SCAR-MarBIN Marine Biodiversity Information Network • Année Polaire Internationale 2007/08 • Census of Antarctic Marine Life (CAML) • Ocean Biogeographic Information System (OBIS) • Financement: Politique Scientifique Belge (BELSPO) • Accès aux données sur la biodiversité marineMonday 19 December 11
  • ANTABIF Antarctic Biodiversity Information Facility • SCAR-MarBIN • Global Biodiversity Information Facility (GBIF) • Financement: Politique Scientifique Belge (BELSPO) et contributions internationales • types de données: taxonomie et biogeographie • biodiversité marine, terrestre et limnétiqueMonday 19 December 11
  • Antarctic Biodiversity Information Networks • Antarctic Node for OBIS • Antarctic Node for GBIF • Data management component for new SCAR PPGs: ANT-ECO, ANT-ERA • Biodiversity component of SOOS • Antarctic Node for GEO-BONMonday 19 December 11
  • Philosophie • Construire un réseau (écosystème) d’information • Accès ouvert et gratuit aux données et aux technologies • Exposer les données et métadonnées • Rester à l’écoute de la communauté • Adopter les meilleurs standards • Servir la science, la conservation, la gestion Riddle, M. Australian Antarctic DivisionMonday 19 December 11
  • Portails de données • En ligne depuis Oct 2005 • open access • 935,000 visiteurs • 8,400,000 hits • 60,000,000 dld records • Citations: 183Monday 19 December 11
  • Taxonomie • Le premier RAMS • Panel de 60+ éditeurs • WoRMS, CoL and EoL • 17,098 taxa (RAMS) • RAS en construction • 24,248 taxa (RAS)Monday 19 December 11
  • Biogeographie • 1,288,441 entrées • 198 datasets • 5,235 taxa • OBIS, GBIF • Téléchargeable • WebGIS • WebservicesMonday 19 December 11
  • Aperçu du portail de donnéesMonday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • FonctionnalitésMonday 19 December 11
  • biodiversity.aq • organisé en sous-domaines: “.aq” = Antarctica • www.biodiversity.aq • data.biodiversity.aq • ipt.biodiversity.aq • afg.biodiversity.aq • scratchpads.biodiversity.aq • ogc.biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • www. biodiversity.aq • site généraliste • news • contact • sponsors • governance • flux RSS: blog, PIC, photostream, slideshare, MendeleyMonday 19 December 11
  • www. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • data. biodiversity.aq • trouver les données primaires • visualiser les occurrences sur une carte interactive • accéder aux données taxonomiques • télécharger les données • accéder aux statistiques d’utilisation • envoyer du feedback • accéder à la doc techniqueMonday 19 December 11
  • data. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • ipt. biodiversity.aq • préparer et nettoyer les données • publier les données primaires • publier les metadonnées • pousser les données et métadonnées vers ANTABIF & GBIF • générer et soumettre une publication scientifique “Data Paper”Monday 19 December 11
  • ipt. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • Flux de données (votre point de vue) Your data DwC-A IPT ANTABIF standardize upload publish publish Data PaperMonday 19 December 11
  • afg. biodiversity.aq • Aide à l’identification • Plateforme de publication/partage pour des guides de terrains personnalisés • Images de haute qualité • Descriptions d’experts • Construit à la volée, depuis différents sources • Génération d’un pdfMonday 19 December 11
  • afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • afg. biodiversity.aq afg.biodiversity.aq Antarctic Field GuidesMonday 19 December 11
  • afg. biodiversity.aq afg.biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • afg. biodiversity.aqMonday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • L’Atlas biogéographique atlas.biodiversity.aq atlas.scarmarbin.be • Versions papier et digitale • “Remake” d’un classique (Hedgepeth 1969) • Générer des cartes thématiques • Générer des cartes prédictives • Construire une plateforme interactive • Génération dynamique du contenuMonday 19 December 11
  • Hedgpeth&1969’s&FolioMonday 19 December 11
  • Mashing&(and&sharing)&data&layers Slope Bathymetry Chlorophyll Distance to the continent Distance to bird colonies Distance to ice Distance to shelf Distance to canyon Floor temperature ...Monday 19 December 11
  • Monday 19 December 11
  • Identifier les lacunesMonday 19 December 11
  • Evaluer notre ignorance • “Nettoyage” de toute la base de donnée • Données bathymétriques ajoutées à toutes les entrées benthiques • comptage des espèces vs stations pour les phylums majeurs (nematoda, mollusca, cnidaria, echinodermata, chordata, arthropoda & annelida) • comptage des espèces vs stations pour les groupes majeurs (poissons, oiseaux et mammifères, pélagique et benthiques) • Analyse bathymétrique. Stations & espèces benthiques en fonction de la profondeur.Monday 19 December 11
  • Ensemble des donnéesMonday 19 December 11
  • Toutes les espècesMonday 19 December 11
  • NematodaMonday 19 December 11
  • AnnelidaMonday 19 December 11
  • CnidariaMonday 19 December 11
  • EchinodermataMonday 19 December 11
  • MolluscaMonday 19 December 11
  • ChordataMonday 19 December 11
  • ArthropodaMonday 19 December 11
  • Résumé • La couverture spatiale & taxonomique varie fortement en fonction du groupe considéré • Certains taxa majeurs sont “manquants”: Eponges, Isopodes, Pycnogonides, Bryozoaires, Decapodes, Crinoides & Brachiopodes • Zones sous- ou non-échantillonnées: ouest de la mer de Weddell, mer d’Amundsen, zones abyssalesMonday 19 December 11
  • BenthosMonday 19 December 11
  • BenthosMonday 19 December 11
  • PelagosMonday 19 December 11
  • Oiseaux et MammifèresMonday 19 December 11
  • PoissonsMonday 19 December 11
  • Conclusions • Distorsion vers les zones peu profondes, les stations de recherche et les trajectoires de navires de recherche • Ensemble du jeu de données: les observations d’oiseaux et de mammifères dominent l’analyse de l’effort d’échantillonnage • Les données benthiques déterminent les schémas d’ensemble de la richesse spécifique • Co-occurrence entre les “hotspots” de données benthiques et la présence de stationsMonday 19 December 11
  • Notre ignorance est abyssaleMonday 19 December 11
  • Conclusions • La distorsion due à la variabilité de l’effort d’échantillonnage est responsable d’un grand nombre de patrons observés • Distorsion massive due à un sous-échantillonnage du profond • Certaines zones et taxa, bien représentés, sont utilisables pour des analyses ultérieuresMonday 19 December 11
  • Identifier les lacunes 2,8 espèces d’isopodes sont décrites chaque année De Broyer C & Danis B, DSRII 2011 600+ ont été découvertes durant ANDEEP 214 années pour tout décrire!Monday 19 December 11
  • Biodiversité et changement climatiqueMonday 19 December 11
  • original slide: Huw Griffiths Sea-ice change Colonies: declining growing or stable Parkinson, 2002Monday 19 December 11
  • original slide: Huw Griffiths ≤50% decrease in krill population © I. Arndt, source: AWI 1976 - 2003 Over 2-fold decrease / 10 years Over 2-fold increase / 10 years Atkinson et al 2004Monday 19 December 11
  • original slide: Huw Griffiths Bracegirdle, 2008Monday 19 December 11
  • original slide: Huw Griffiths Ocean warming COPE or ADAPT MOVE • deeper • further South EXTINCTION +0.05°C / year Meredith & King 2005Monday 19 December 11
  • original slide: Huw Griffiths Changes in species composition - 2050 Cheung et al 2009Monday 19 December 11
  • original slide: Huw Griffiths Southern Ocean Continuous Plankton Recorder Stress: 0.05 Sea Ice Zone: January 2005 2008 5 mm 2003 6 2007 1998 2000 0.5 mm 1993 2001 2006 Pre-2000: 2004 large zooplankton (krill) Post-2000: small zooplankton (Oithona) 1991 2002 Hosie, pers. com.Monday 19 December 11
  • InfluencerMonday 19 December 11
  • CCAMLR • Convention for the Conservation of Antarctic Marine Living Resources • fait partie du système du Traité Antarctique • “to conserve marine life of the Southern Ocean” • s’applique à toutes les ressources marine vivantes entre le continent et le front polaireMonday 19 December 11
  • “Bio”regionalisation • nécessaire afin d’entreprendre la désignation d’un système d’AMPs • données physiques et environnementales • concentration de chlorophylle BIO • il fallait un peu de “bio” quand même... REGIONAL ISATION OF THE SOUTHERN OCEAN REPORT OF EXPERTS WORKSHOP (HOBART, SEPTEMBER 2006) aMonday 19 December 11
  • Mettre du ‘bio’ dans la bioregionalisation • utiliser la biodiversité afin de rendre les processus de bioregionalisation et la désignation d’AMP cohérents? • connaît-on réellement la biodiversité Antarctique? • Travail principalement sur les shelfs • avons-nous suffisamment de connaissances? • Beaucoup de travaux sont (toujours) en coursMonday 19 December 11
  • PerspectivesMonday 19 December 11
  • Le futur (proche) Expansion/évolution des capacités Interopérabilité Exploration des données Intégration des données génétiques Outils d’aide à l’identification Implication de la communauté Implication des citoyensMonday 19 December 11
  • Perspectives Héritage digital du CAML et de l’API Etat de l’environnement Antarctique, Etat 0 Nouvelle biorégionalisation, aires marines protégées Le lien entre plusieurs disciplines Consolidation de la communauté du SCAR Un changement de culture Conservation informée et adaptative Optimisation des efforts de recherche Rose A. DZMBMonday 19 December 11
  • Défis • Science faisant un usage intensif des données • Déluges de données • Fracture numérique • Intégration des autres types de données • Données noire et données orphelines • Changement de cultureMonday 19 December 11
  • PIC Les Polar Information CommonsMonday 19 December 11
  • Remerciements • Huw Griffiths, BAS • Mike Sparrow, SCAR • Mark Parsons, NSIDC • Sergio Alvarez,Vizzuality • Vishwas Chavan, GBIF • Peter Desmet, CanadensysMonday 19 December 11
  • #biodiversityaq image&©&NY&Times&Monday 19 December 11