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La ricerca bibliografica con PubMed
 

La ricerca bibliografica con PubMed

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    La ricerca bibliografica con PubMed La ricerca bibliografica con PubMed Presentation Transcript

    • La ricerca bibliografica con PubMed Carmela Palazzi B.U. Area Medica a.a. 2010/2011 carmela.palazzi@unimore.it 1
    • Gli strumenti per la ricerca bibliografica • Per sapere “che cosa è• Per sapere “dove posso trovare?”, cioè in presenza di stato scritto su?” , cioè per redigere una bibliografia, una bibliografia, utilizzo utilizzo – banche dati full text – banche dati: PubMed, – Cataloghi: OPAC, cataloghi Scifinder collettivi, ACNP – motori di ricerca Ricerca • Per integrare la bibliografia nella bibliografica redazione del mio lavoro utilizzo - Sw di formattazione carmela.palazzi@unimore.it bibliografica 2
    • La ricerca bibliografica con PubMedObiettivi del modulo:• Cos’è PubMed• Come si usano i termini Mesh per recuperare le citazioni• Come si imposta una strategia di ricerca da Home Page: Details, Limits, Advanced search, History, Single citation matcher• La gestione dei risultati (Display settings, Send to, Clipboard, E-mail)• Gli operatori booleani• I servizi personalizzati: il link a sfx carmela.palazzi@unimore.it 3
    • Cos’è PubMed• E’ una banca dati bibliografica, cioè un archivio strutturato di riferimenti bibliografici, interrogabile secondo varie modalità• E’ gestita dal National Center for Biotechnology Information (NCBI) presso la National Library of Medicine la biblioteca medica più grande del mondo carmela.palazzi@unimore.it 4
    • PubMed: accesso e contenuti• Accesso gratuito online dal 1997.• Oltre 20 milioni di citazioni di articoli scientifici di ambito biomedico, e di scienze affini, dal 1949 fino ad oggi. Le citazioni sono: – MEDLINE, per la maggior parte [PubMed - indexed for MEDLINE] – Fornite direttamente dall’editore [PubMed - as supplied by publisher] – In fase di eleborazione [PubMed - in process] – Una piccola parte rimanda al NCBI Books database. carmela.palazzi@unimore.it 5
    • L’indirizzo di PubMed• Dall’Home page della Biblioteca Medica cliccare sul link PubMed• Dall’Home Page della BSI cliccare su Banche Dati, Trova risorse, digitare PubMed e cliccareÈ un indirizzo personalizzato per il nostro Ateneo• Grazie al software SFX si vedono i serviziassociati ad ogni citazione.• Quando disponibile, è segnalato l’accesso al full text dell’articolo carmela.palazzi@unimore.it 6
    • Accesso a Pubmed carmela.palazzi@unimore.it 7
    • Il riferimento bibliografico• Un riferimento bibliografico, o citazione, rappresenta un articolo di rivista ed è suddiviso in campi in base alle informazioni contenute: es. titolo, autore, lingua. Ogni campo costituisce un punto di accesso all’informazione. carmela.palazzi@unimore.it 8
    • Esempio di riferimento bibliografico TITOLO DELL’ARTICOLO[Surgical treatment of diaphyseal fractures of the forearm during pre-adolescent age]Guzzanti V, Di Lazzaro A, Lembo A, Gigante A.Arch Putti Chir Organi Mov. 1991;39(1):93-100. Italian. ANNO AUTORI VOLUME TITOLO RIVISTA FASCICOLO carmela.palazzi@unimore.it 9
    • Come si interroga la banca datiSolo in lingua inglese• Tramite il Mesh database (1), cioè l’insieme delle parole chiave• Direttamente dall’home page, stringa di ricerca base (2)• Tramite advanced search (3) carmela.palazzi@unimore.it 10
    • L’Home page di PubMed Ricerca avanzata Limiti (filtri)Box di ricerca Altri strumenti Altri database carmela.palazzi@unimore.it 11
    • Il MeSH databaseMeSH = Medical Subject Headings, cioè parole chiave.L’insieme dei termini MeSH costituisce il MeSH Database: – un vocabolario controllato di descrittori biomedici che identificano i soggetti di ogni articolo e sono utilizzati per indicizzarlo, dando uniformità e coerenza alle descrizioni – ha struttura gerarchica ad alberoSi accede al Mesh Database dalla Home page di PubMed. carmela.palazzi@unimore.it 12
    • Accesso al MeSH Database carmela.palazzi@unimore.it 13
    • Struttura del MeSH DatabaseI termini MeSH sono legati tra loro da tre tipi di relazioni:• Preferenziale: per risolvere problemi di sinonimia. Ad ogni concetto corrisponde un solo termine• Gerarchica: i descrittori sono disposti in una struttura ad albero, che va dal generale al particolare. Dato un termine è possibile comprendere nella ricerca tutto ciò che segue. Questa funzione si chiama esplosione. L’esplosione è automatica.• Affinità: accanto ad un descrittore sono segnalati altri descrittori che esprimono concetti per qualche motivo ad esso collegatiI termini MeSH possono essere qualificati, cioè specificati, dasubheading. carmela.palazzi@unimore.it 14
    • Come si usa il MeSH databaseImmettendo un termine nella stringa di ricerca del MeSHdatabase è possibile verificare se il termine è MeSH e quindi:• leggerne la definizione• selezionare le qualificazioni (subheading)• selezionarlo, decidendo – se il descrittore deve essere principale – se includere i termini più specifici• considerare altri eventuali termini di ricerca (see also)• vedere la sua posizione nell’albero del MeSHPer attivare la ricerca “add to search builder”, sulla destra.Una volta terminata la costruzione della strategia di ricerca cliccare su “search PubMed”. carmela.palazzi@unimore.it 15
    • definizione Costruire la ricercaScegliere qualificativo (subheading) utilizzando il search builder Decidere se deve essere un descrittore principale e se includere o no i descrittori MeSH sottostanti carmela.palazzi@unimore.it 16
    • Interrogazione dall’Home page• Inserire i termini nella stringa di ricerca. In mancanza di specifica vengono collegati tutti con “AND”• Il completamento automatico fa riferimento a ricerche effettuate da altri in banca dati• Grazie al processo di mappatura viene recuperato anche tutto ciò che è stato indicizzato con la corrispondente parola chiave: vedi “search details” in fondo alla colonna di destra. carmela.palazzi@unimore.it 17
    • Verificare sempre i search details per vedere come è stata interpretata la ricercacarmela.palazzi@unimore.it 18
    • LimitsSono filtri che aiutano a circoscrivere la ricerca• Date – Seleziono il lasso di tempo di cui mi interessano le pubblicazioni• Languages – seleziono solo le lingue di cui mi interessano le pubblicazioni• Type of article – seleziono solo uno specifico tipo di pubblicazione (es. clinical trial)• Subsets – seleziono solo un ambito specifico (es. dental journals)• Altri limiti: Sex, Ages, Text options … carmela.palazzi@unimore.it 19
    • carmela.palazzi@unimore.it 20
    • Interrogazione tramite Advanced searchL’Advanced search si attiva sopra lastringa di ricerca base.Con search builder posso specificarei campi in cui fare la ricerca: author,date, Journal, publication, cliccando divolta in volta su add to search box einfine cliccando su search carmela.palazzi@unimore.it 21
    • Accesso ad advanced searchcarmela.palazzi@unimore.it 22
    • 3. Clicco Search per lanciare la ricerca1. Scelgo il campo incui voglio cercare il termine 2. Clicco Add to search box per costruire la mia ricerca carmela.palazzi@unimore.it 23
    • Dove si memorizzano le ricerche: HistoryLe strategie di ricerca sonoautomaticamente salvate, per 8 ore,nello spazio Search History a cui siaccede da advanced search.Cliccando su search historyinstructions si ha una chiaraspiegazione del funzionamento. carmela.palazzi@unimore.it 24
    • carmela.palazzi@unimore.it 25
    • Ricerca per campi con il Single Citation MatcherE’ possibile effettuare una ricerca per campianche da Single citation matcher, nonsolo tramite Search Builder.Al Single Citation Matcher si accede dallaHome Page di PubMed, è il primo deiPubMed Tools.Non è necessario compilare tutti i campiimpostati. carmela.palazzi@unimore.it 26
    • Accesso al Single Citation Matchercarmela.palazzi@unimore.it 27
    • La gestione dei risultati: il riferimento bibliograficoIl risultato di una ricerca è costituito da riferimentibibliografici, che si presentano per default informato summary. Un riferimento contiene: • il titolo dell’articolo in inglese • i nomi degli autori • i dati bibliografici che identificano l’articolo, • la segnalazione della lingua dell’articolo, se diversa dall’inglese, • il link related citations, cioè gli articoli con i quali esiste un’affinità di contenuto. carmela.palazzi@unimore.it 28
    • Esempio di riferimento bibliografico TITOLO DELL’ARTICOLO[Surgical treatment of diaphyseal fractures of the forearm during pre-adolescent age]Guzzanti V, Di Lazzaro A, Lembo A, Gigante A.Arch Putti Chir Organi Mov. 1991;39(1):93-100. Italian. ANNO AUTORI VOLUME TITOLO RIVISTA FASCICOLO carmela.palazzi@unimore.it 29
    • Display settings: le opzioni di visualizzazione• Per default vengono mostrati i primi 20 risultati• Si sfogliano le pagine tramite previous e next• Da Display settings si scelgono: – i formati di visualizzazione, – il numero di riferimenti per pagina – il criterio di display• Sulla destra sono disponibili sottoinsiemi di ricerca: – articoli con Free Full Text – articoli di tipo Review – altre possibilità carmela.palazzi@unimore.it 30
    • Per modificare i criteri di visualizzazione carmela.palazzi@unimore.it 31
    • La gestione dei risultati: Send toI riferimenti bibliografici selezionati possonoessere:• Inviati ad un file• Inviati ad un indirizzo e-mail• Inviati nella propria collezione di citazioni• Inviati nello spazio ClipboardLa clipboard è uno spazio personale in cuipossono essere custoditi, per 8 ore, i riferimentibibliografici selezionati. carmela.palazzi@unimore.it 32
    • carmela.palazzi@unimore.it 33
    • La gestione dei risultati: Clipboard• Clipboard serve per depositare temporaneamente i riferimenti scelti, fino ad un massimo di 500.• Per mandare i riferimenti in clipboard: – selezionarli cliccando sul quadratino bianco che appare sopra al numero progressivo – premere send to …Clipboard• Per accedere a clipboard: – cliccare sulla scritta che appare in alto a destra• Da Clipboard con send to posso scegliere dove inviare i riferimenti carmela.palazzi@unimore.it 34
    • Dopo aver selezionato i riferimenti cliccare Add to Clipboardcarmela.palazzi@unimore.it 35
    • Lo spazio clipboard si crea quando si mandano i primi riferimenti Quando incontro un riferimento che ho messoQuando un riferimento èClipboard appare questa scritta in in clipboard appare questa scritta rossa carmela.palazzi@unimore.it 36
    • Utilizzo Send to per gestire i risultati che voglio conservarecarmela.palazzi@unimore.it 37
    • Send to e-mail• Per mandare le citazioni tramite e-mail: – selezionarle cliccando sul quadratino bianco che appare sopra al numero progressivo – premere send to email – compilare con il nome del destinatario – cliccare su E-mail altrimenti la mail non parte carmela.palazzi@unimore.it 38
    • 1. Seleziono Send to E-mail 2. Clicco E-mailcarmela.palazzi@unimore.it 39
    • Operatori booleani - UtilizzoPer delimitare o allargare l’argomento diuna ricerca si ricorre a:• intersezione – AND• esclusione – NOT• somma – ORdi due o più ricerche, utilizzando glioperatori booleani carmela.palazzi@unimore.it 40
    • Operatori booleaniAND ricerca i record che contengono entrambi itermini di ricerca.NOT ricerca i record che contengono solo il primo termine di ricerca.OR ricerca i record che contengono entrambi i termini o almeno uno dei due.Gli operatori booleani devono essere scritti tra i 2 termini di ricerca che si vogliono mettere in relazioneIn assenza di operatori i termini di ricerca sono collegati con AND carmela.palazzi@unimore.it 41
    • ANDDato un insieme A e un insieme B ciò che mi interessa èl’insieme C in cui sono presenti A e B A C B carmela.palazzi@unimore.it 42
    • NOTDato un insieme A e un insieme B ciò che mi interessaè l’insieme A NOT B in cui B è escluso da A A not B B carmela.palazzi@unimore.it 43
    • ORDato un insieme A e un insieme B ciò che mi interessa èsia A che B quindi l’insieme A OR B che corrisponde allasomma dei due A OR B carmela.palazzi@unimore.it 44
    • SFXPer visualizzare i servizi disponibili partendodalla citazione precisa di un articolo:• Da display scegli il formato abstract.• Clicca su SFX . Risultato: – collegamenti a full-text, – document delivery, – cataloghi, ecc. carmela.palazzi@unimore.it 45
    • SFXcarmela.palazzi@unimore.it 46
    • carmela.palazzi@unimore.it 47