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Las coenzimas

Las coenzimas son pequeñas moléculas orgánicas no proteicas que transportan
grupos químicos entre enzimas. A veces se denominan cosustratos. Estas moléculas
son sustratos de las enzimas y no forman parte permanente de la estructura
enzimática. Esto distingue a las coenzimas de los grupos prostéticos, que son
componentes no protéicos que se enlazan estrechamente a las enzimas, tales como
los centros hierro-azufre, la flavina o los grupos hemo. Tanto coenzimas como grupos
prostéticos pertenecen a un grupo más amplio, los cofactores, que son moléculas no
protéicas (por lo general, moléculas orgánicas o iones metálicos) que requieren las
enzimas para su actividad.

En el metabolismo, las coenzimas están involucradas en reacciones de transferencia
de grupos (como la coenzima A y la adenosina trifosfato (ATP)), y las reacciones
redox (como la coenzima Q10 y la nicotinamida adenina dinucleótido (NAD+)). Las
coenzimas se consumen y se reciclan continuamente en el metabolismo; un conjunto
de enzimas añade un grupo químico a la coenzima y otro conjunto de enzimas lo
extrae. Por ejemplo, las enzimas como la ATP sintasa fosforilan continuamente la
adenosina difosfato (ADP), convirtiéndola en ATP, mientras que enzimas como las
quinasas desfosforilan el ATP y lo convierten de nuevo en ADP.

Las moléculas de coenzima son a menudo vitaminas o se hacen a partir de vitaminas.
Muchas coenzimas contienen el nucleótido adenosina como parte de su estructura,
como el ATP, la coenzima A y el NAD+. Esta estructura común puede reflejar un
origen evolutivo como parte de los ribozimas en un antiguo mundo de ARN.
Tipos de coenzimas

VITAMINAS Y DERIVADOS


                                  Componente    Grupo químico
Coenzima           Vitamina                                             Distribución
                                  adicional     transferido


                                                                        Bacterias, arqueas
NAD+ y NADP+       Niacina (B3)   ADP           Electrones
                                                                        y eucariotas


                   Ácido
                                                Grupo acetilo y otros   Bacterias, arqueas
Coenzima A         pantoténico    ADP
                                                grupos acilo            y eucariotas
                   (B5)


                                                Grupos metilo,
Ácido              Ácido fólico   Residuos de                           Bacterias, arqueas
                                                formilo, metileno y
tetrahidrofólico   (B9)           glutamato                             y eucariotas
                                                formimino


Filoquinona (K1)
                                                                        Bacterias, arqueas
Menaquinona                                     Grupo carbonilo y
                   Vitamina K     Ninguno                               y eucariotas
(K2)                                            electrones
                                                                        * Sintética
Menadiona(K3)*


                                                                        Bacterias, arqueas
Ácido ascórbico    Vitamina C     Ninguno       Electrones
                                                                        y eucariotas


                   Riboflavina                                          Metanógenos y
Coenzima F420                     Aminoácidos   Electrones
                   (B2)                                                 algunas bacterias
NO VITAMINAS


Coenzima                     Grupo químico transferido   Distribución


Adenosina trifosfato (ATP)   Grupo fosfato               Bacterias, arqueas y eucariotas


S-Adenosil metionina         Grupo metilo                Bacterias, arqueas y eucariotas


3'-Fosfoadenosina-5'-
                             Grupo sulfato               Bacterias, arqueas y eucariotas
fosfosulfato


Coenzima Q                   Electrones                  Bacterias, arqueas y eucariotas


                             Átomo de oxígeno y
Tetrahidrobiopterina                                     Bacterias, arqueas y eucariotas
                             electrones


                             Diacilgliceroles y grupos
Citidina trifosfato                                      Bacterias, arqueas y eucariotas
                             lipídicos


Azúcares nucleótidos         Monosacáridos               Bacterias, arqueas y eucariotas


                                                         Algunas bacterias y la mayoría de
Glutatión                    Electrones
                                                         eucariotas


Coenzima M                   Grupo metilo                Metanógenos


Coenzima B                   Electrones                  Metanógenos


Metanofurano                 Grupo formilo               Metanógenos


Tetrahidrometanopterina      Grupo metilo                Metanógenos
Funciones de las coenzimas
La principal función de las coenzimas es actuar como intermediarios metabólicos.
Elmetabolismo conlleva una amplia gama de reacciones químicas, pero la mayoría
corresponden a unos tipos básicos de reacciones que implican la transferencia de
grupos funcionales. Esta química común permite a las células utilizar un pequeño
conjunto de intermediarios metabólicos para transportar grupos químicos entre las
diferentes reacciones . Estos intermediarios en la transferencia de grupos son las
coenzimas.

Cada clase de reacción de transferencia de grupo se lleva a cabo por una coenzima
particular, que es el sustrato de un conjunto de enzimas que la producen, y un
conjunto de enzimas que la consumen. Un ejemplo de esto son las deshidrogenasas,
que utilizan la nicotinamida adenina dinucleótido (NADH) como cofactor. Aquí,
cientos de enzimas diferentes eliminan los electrones de sus sustratos y reducen el
NAD+ a NADH. Esta coenzima reducida es entonces un sustrato para cualquiera de las
reductasas presentes en la célula que necesitan reducir sus sustratos.

Las coenzimas se reciclan continuamente, por lo tanto, como parte del
metabolismo. A modo de ejemplo, la cantidad total de ATP en el cuerpo humano es
aproximadamente 0,1 moles. Este ATP se ve constantemente degradado en ADP, y
luego se convierte de nuevo en ATP. Así, en un momento determinado, el importe
total de ATP más ADP se mantiene relativamente constante. La energía utilizada por
las células humanas requiere la hidrólisis de 100 a 150 moles de ATP diario que es
alrededor de 50 a 75 kg. Típicamente, un ser humano usará su peso corporal de ATP
en el transcurso del día. Esto significa que cada molécula de ATP se recicla de 1000
a 1500 veces al día.

El principal papel de las vitaminas es actuar como coenzimas en el organismo,
aunque las vitaminas tienen otras funciones en el cuerpo. Las coenzimas también se
fabrican a partir de nucleótidos, como la adenosina trifosfato (que es el
transportador bioquímico de los grupos fosfato), o la coenzima A (que transporta
grupos acilo). La mayoría de las coenzimas se encuentran en una enorme variedad de
especies, y algunas son universales para todas las formas de vida. Una excepción a
esta amplia distribución es un grupo único de coenzimas que evolucionaron en
metanógenas, y que se limitan al grupo de las arqueas.
Coenzimas NAD+ y NADH
La nicotinamida adenina dinucleótido (abreviado NAD+,
y también llamada difosfopiridina nucleótido y Coenzima
I), es una coenzima que se encuentra en todas las células
vivas. El compuesto es un dinucleótido, ya que consta de
dos nucleótidos unidos a través de sus grupos fosfato con
un nucleótido que contiene un anillo adenosina y el otro
que contiene nicotinamida.

En el metabolismo, el NAD+ participa en las reacciones
redox (oxidorreducción), llevando los electrones de una
reacción a otra. La coenzima, por tanto, se encuentra en
dos formas en las células: NAD+ y NADH. El NAD+, que es
un agente oxidante, acepta electrones de otras
moléculas y pasa a ser reducido, formándose NADH, que               Coenzima NAD

puede ser utilizado entonces como agente reductor para
donar electrones. Estas reacciones de transferencia de electrones son la principal
función del NAD+. Sin embargo, también es utilizado en otros procesos celulares, en
especial como sustrato de las enzimas que añaden o eliminan grupos químicos de
las proteínas, en modificaciones post-traduccionales. Debido a la importancia de
estas funciones, las enzimas que intervienen en el metabolismo del NAD+ son
objetivos para el descubrimiento de medicamentos.

En los organismos, el NAD+ puede ser sintetizado desde cero (de novo) a partir de
losaminoácidos triptófano o ácido aspártico. Alternativamente, los componentes de
las coenzimas se obtienen a partir de los alimentos, como
la vitamina llamada niacina. Compuestos similares son liberados por las reacciones
que descomponen la estructura del NAD+. Estos componentes preformados pasan
luego a través de una ruta que los recicla de vuelta a la forma activa. Algunos
NAD+ también se convierten en nicotinamida adenina dinucleótido fosfato (NADP+),
cuya química es similar a la de la coenzima NAD+, aunque tiene diferentes funciones
en el metabolismo.

BIOSÍNTESIS

El NAD+ se sintetiza a través de dos rutas metabólicas: en una ruta de novo a partir
de aminoácidos, o en rutas de rescate mediante el reciclado de componentes
preformados como nicotinamida convertida de nuevo a NAD+.
Producción de novo


La mayoría de los organismos
sintetizan NAD+ a partir de
componentes simples. El conjunto
específico de reacciones varía
entre los organismos, pero una
característica común es la
generación de ácido quinolínico
(QA) a partir de un aminoácido, ya
sea triptófano (Trp) en los                 Algunas rutas metabólicas que sintetizan y consumen NAD+
                                           en los vertebrados. Las abreviaturas se definen en el texto.
animales y algunas bacterias, o
bien ácido aspártico en algunas
bacterias y plantas. El ácido quinolínico se convierte en ácido nicotínico
mononucleótido (NaMN) mediante transferencia de un grupo fosforibosa. Un grupo
adenilato se transfiere entonces para formar ácido nicotínico adenina dinucleótido
(NaAD). Por último, el grupo ácido nicotínico del NaAD es amidado a un grupo
nicotinamida (Nam), formando nicotinamida adenina dinucleótido.

En un nuevo paso, algunos NAD+ se convierten en NADP+ mediante la NAD+ kinasa,
que fosforila el NAD+. En la mayoría de los organismos, esta enzima utiliza ATP como
fuente del grupo fosfato, aunque en las bacterias tales como Mycobacterium
tuberculosis y en las arqueas comoPyrococcus horikoshii, el polifosfato inorgánico es
una alternativa como donante de fosfato.


FUNCIONES

La nicotinamida adenina dinucleótido tiene varias funciones esenciales en el
metabolismo. Actúa como coenzima en las reacciones redox, como donante de
grupos ADP-ribosa en las reacciones de ADP-ribosilación, como precursor del segundo
mensajero de la molécula cíclica de ADP-ribosa, así como sustrato para las ADN
ligasas bacterianas y un grupo de enzimas llamadas sirtuinas, que usan NAD+ para
eliminar los grupos proteícos acetilo.

Oxidoreductasas

La principal función del NAD+ en el metabolismo es la transferencia de electrones de
una reacción redox a otra. Este tipo de reacción es catalizada por un gran grupo de
enzimas llamadas oxidoreductasas. Los nombres correctos para estas enzimas
contienen los nombres de sus sustratos: por ejemplo, la NADH-ubiquinona
oxidoreductasa cataliza la oxidación del NADH por la coenzima Q. Sin embargo, estas
enzimas son también conocidas como deshidrogenasas o reductasas, por lo que la
NADH-ubiquinona oxidoreductasa también suele ser llamada NADH deshidrogenasa o,
a veces, coenzima Q reductasa.


Cuando están enlazados a una proteína, el
NAD+ y el NADH suelen mantenerse en un
motivo estructural conocido como pliegue
Rossmann. El nombre proviene de Michael
Rossmann, que fue el primer científico en
darse cuenta de lo común que es esta
estructura dentro de las proteínas enlazadas a
nucleótidos. Este pliegue contiene tres o más
hebras beta paralelas enlazadas mediante dos
hélices alfa en el orden beta-alfa-beta-alfa-
beta. Esto forma una hoja beta flanqueada por
una capa de hélices alfa a cada lado. Debido a
que cada pliegue Rossmann enlaza un
nucleótido, los dominios de enlace para el
dinucleótido NAD+ consisten de dos pares de       El pliegue de Rossmann en la zona de la lactato
pliegues Rossmann, con cada pliegue                deshidrogenasa de Cryptosporidium parvum,
                                                 con el NAD+ en rojo, las láminas beta en amarillo
enlazando un nucleótido dentro del cofactor.                y las hélices alfa en púrpura.
Sin embargo, este pliegue no es universal
entre las enzimas dependientes de NAD, ya
que se ha descubierto recientemente que una clase de enzimas bacterianas
involucradas en el metabolismo de los aminoácidos se enlazan a la coenzima pero
carecen de esta forma de pliegue.

Cuando se enlaza al sitio activo de una oxidoreductasa, el anillo nicotinamida de la
coenzima se coloca de modo que pueda aceptar un hidruro del otro sustrato. Ya que
el carbono C4 que acepta el hidrógeno es proquiral, esto puede ser explotado en la
cinética de enzimas para dar información sobre el mecanismo enzimático. Esto se
hace mediante la mezcla de una enzima con un sustrato que tiene átomos de
deuterio sustituidos por los hidrógenos, de tal forma que la enzima reducirá el
NAD+ mediante la transferencia de un deuterio en lugar de un átomo de hidrógeno.
En este caso, una enzima puede producir uno de los dos estereoisómeros de NADH.
En algunas enzimas, el hidrógeno se transfiere desde el plano superior del anillo de
nicotinamida (las oxidoreductasas clase A), mientras que en otras enzimas (las
oxidoreductasas de clase B) la transferencia se produce desde abajo.
A pesar de esta similitud en la forma en que las
                             proteínas se unen a las coenzimas, las enzimas casi
                             siempre muestran un alto nivel de especificidad, ya sea
                             por el NAD+ o el NADP+. Esta especificidad refleja las
                             distintas funciones metabólicas de las dos coenzimas, y
                             es el resultado de diferentes clases de residuos de
                             aminoácidos en los dos tipos de sitios de unión al
                             coenzima. Por ejemplo, en el sitio activo de las enzimas
      Aspecto del NAD en 3D. dependientes de ADP, se forma un enlace iónico entre
                             una cadena lateral de aminoácidos básico y el grupo
                             fosfato ácido del NADP+. Por el contrario, en las enzimas
dependientes de NAD, la carga en este bolsillo se invierte, impidiendo el enlace del
NADP+. Sin embargo, hay algunas excepciones a esta regla general, y enzimas como
la aldosa reductasa, glucosa-6-fosfato deshidrogenasa, y la metilentetrahidrofolato
reductasa pueden utilizar ambas coenzimas en algunas especies.

Papel en el metabolismo redox


Las reacciones redox catalizadas por
oxidoreductasas son vitales en todo el
metabolismo, pero una esfera
particularmente importante es la liberación
de energía de los nutrientes. Los compuestos
reducidos, como laglucosa, se oxidan,
liberando así la energía. Esta energía se
transfiere al NAD+ mediante reducción a
NADH, como parte de la glucolisis y el ciclo
del ácido cítrico (ciclo de Krebs). En
eucariotas, los electrones transportados por
el NADH que se produce en el citoplasma
mediante glucolisis son transferidos al
                                                        Esquema del metabolismo redox
interior de la mitocondria por lanzaderas
mitocondriales, como la lanzadera malato-
aspartato. El NADH es oxidado a su vez por la cadena de transporte de electrones,
que bombea protones a través de la membrana y genera ATP a través de la
fosforilación oxidativa. Estos sistemas de lanzadera también tienen la misma función
de transporte en los cloroplastos.

Dado que tanto las formas oxidadas como reducidas de nicotinamida adenina
dinucleótido se utilizan en estos conjuntos de reacciones enlazadas, la célula
mantiene aproximadamente concentraciones iguales de NAD+ y NADH. Una
proporción alta de NAD+/NADH permite a este coenzima actuar como agente
oxidante y como reductor. En contraste, la función principal del NADP+ es como
agente reductor en el anabolismo, estando la coenzima implicada en rutas como la
síntesis de ácidos grasos y la fotosíntesis. Dado que el NADPH es necesario para
conducir las reacciones redox como un fuerte agente reductor, la proporción
NADP+/NADPH se mantiene muy baja.

Aunque es importante en el catabolismo, el NADH se utiliza también en las
reacciones anabólicas, como la gluconeogénesis. Esta necesidad de NADH en el
anabolismo plantea un problema creciente para los procariotas que crecen en
nutrientes que liberan sólo una pequeña cantidad de energía. Por ejemplo, las
bacterias nitrificantes como Nitrobacter oxidan el nitrito a nitrato, lo que libera
energía suficiente para bombear los protones y generar ATP, pero no la suficiente
como para producir NADH directamente. Como el NADH sigue siendo necesario para
las reacciones anabólicas, estas bacterias utilizan una nitrito oxidoreductasa para
producir la suficiente fuerza motriz de protones como para ejecutar parte de la
cadena de transporte de electrones en sentido inverso, generando NADH.

Funciones no redox

La coenzima NAD+ se consume también en las reacciones de transferencia de ADP-
ribosa. Por ejemplo, las enzimas llamadas ADP-ribosiltransferasas añaden la fracción
ADP-ribosa de esta molécula a las proteínas, en una modificación postraduccional
llamada ADP-ribosilación. Esta reacción implica la adición de un solo grupo ADP-
ribosa (mono-ADP-ribosilación), o la transferencia de ADP-ribosa a las proteínas en
cadenas largas ramificadas (poli-ADP-ribosilación). La mono-ADP-ribosilación se
identificó por primera vez como el mecanismo de un grupo de toxinas bacterianas,
en particular la toxina del cólera, pero también participan en la señalización celular
normal. La poli-ADP-ribosilación es llevada a cabo por las polimerasas poli-(ADP-
ribosa). La estructura de poli-(ADP-ribosa) está implicada en la regulación de varios
eventos celulares, y es más importante en el núcleo celular, en procesos como la
reparación del ADN o el mantenimiento del telómero mantenimiento. Además de
estas funciones dentro de la célula, se ha descubierto recientemente un grupo de
ADP-ribosiltransferasas extracelulares, pero sus funciones aún no están claras.
Otra función de esta coenzima en la
señalización celular es como precursor de
la ADP-ribosa cíclica, que se produce a
partir de NAD+ por ADP-ribosil ciclasas,
como parte de un sistema de segundo
mensajero. Esta molécula actúa en la
señalización de calcio mediante la
liberación de calcio de las reservas
intracelulares. Esto lo hace mediante el           Estructura de la ADP-ribosa cíclica
enlace y apertura de una clase de canales
de calcio llamados receptores de
rianodina, que se encuentran en las membranas de los orgánulos como el retículo
endoplasmático.

El NAD+ también es consumido por las sirtuinas, que son deacetilasas dependientes
de NAD, como la Sir2. Estas enzimas actúan mediante la transferencia de un grupo
acetilo de sus proteínas sustrato a la fracción ADP-ribosa del NAD+; esto rompe la
coenzima y libera nicotinamida y O-acetil-ADP-ribosa. Las sirtuinas parecen estar
implicadas en la regulación de la transcripción a través de histonas deacetilantes y
alteración de la estructura del nucleosoma. Aunque las proteínas no histonas pueden
ser desacetilizadas también por las sirtuinas. Esta actividad de las sirtuinas es
especialmente interesante debido a su importancia en la regulación del
envejecimiento.

Otras enzimas dependientes de NAD son las ADN ligasas bacterianas, que unen dos
extremos de ADN mediante el uso de NAD+ como sustrato para donar un grupo
adenosina monofosfato (AMP) al fosfato 5' de un extremo de ADN. Este intermediario
es atacado luego por el grupo hidroxilo 3' del otro extremo de ADN, formando un
nuevo enlace fosfodiéster. Esto contrasta con las ADN ligasas eucarióticas, que
utilizan el ATP para formar intermediarios ADN-AMP.
Coenzima A (CoA)
La coenzima A (CoA) es una coenzima de
transferencia de grupos acilo que participa en
diversas rutas metabólicas (ciclo de Krebs,
síntesis y oxidación deácidos grasos). Se deriva
de una vitamina: el ácido pantoténico
(vitamina B5), y es una coenzima libre. Su
aislamiento se produjo en 1951 por el
bioquímico alemán (y premio Nobel) Feodor
Lynen, en forma de acetil-coenzima A a partir
de células de levadura.

Su parte reactiva es la función tiol (-SH) de la
tioetanolamina, que se simboliza a menudo                       Coenzima A

como HS-CoA (o CoA-SH). Por lo tanto, la
reacción con un ácido carboxílico forma un enlace aciltioéster rico en energía.

Fuentes alimenticias de esta coenzima son: despojos, setas, carne y yema de huevo.

Reacción: CoA-SH + R-COOH => S-CoA-CO-R (+ H2O)




BIOSÍNTESIS

La molécula de coenzima A consta de varios componentes: un nucleótido (adenosina
difosfato, ADP), una vitamina (ácido pantoténico, vitamina B5) y
un aminoácido (cisteína). Se sintetiza en un proceso de cinco etapas a partir del
pantotenato:

1. El pantotenato se fosforila a 4'-fosfopantotenato mediante la enzima pantotenato
kinasa.
2. Una cisteína es añadida al 4'-fosfopantotenato mediante la enzima
fosfopantotenoilcisteína sintetasa, para formar 4'-fosfo-N-pantotenoilcisteína (PPC).
3. La PPC se descarboxila a 4'-fosfo-panteteína mediante la fosfopantotenoilcisteína
descarboxilasa.
4. La 4'-fosfo-panteteína es adenililada para formar defosfo-CoA mediante la enzima
fosfopanteteína adenilil transferasa.
5. Por último, la defosfo-CoA es fosforilada a CoA (coenzima A) utilizando ATP,
mediante la enzima defosfo-CoA kinasa.
FUNCIÓN

Puesto que la coenzima A es químicamente un tiol, puede reaccionar con los ácidos
carboxílicos para formar tioésteres, funcionando así como un transportador de
grupos acilo. Asiste en la transferencia de ácidos grasos desde el citoplasma a las
mitocondrias. Una molécula de coenzima A que transporta un grupo acetilo se
conoce como acetil-CoA. Cuando no lleva grupo acilo generalmente se denomina
CoASH o HSCoA.

Grupos acilo transportados por el Coenzima A

* Acetil-CoA
* Propionil-CoA
* Acetoacetil-CoA
* Cumaril-CoA (utilizado en la biosíntesis de flavonoides)
* Derivados acilo de ácidos dicarboxílicos:
o Malonil-CoA
o Succinil-CoA
o Hidroximetilglutaril-CoA (utilizado en la biosíntesis de isoprenoides)
o Pimelil-CoA (utilizado en la biosíntesis de biotina)
* Butiril-CoA

Adenosina trifosfato (ATP)

La adenosina trifosfato (abreviado ATP, y también
llamada adenosín-5'-trifosfato o trifosfato de
adenosina) es una molécula utilizada por todos los
organismos vivos para proporcionar energía en las
reacciones químicas. También es el precursor de una
serie de coenzimas esenciales como el NAD+ o
la coenzima A. El ATP es uno de los cuatro
                                                            Fórmula estructural del ATP
monómeros utilizados en la síntesis de ARN celular.
Además, es una coenzima de transferencia de grupos
fosfato que se enlaza de manera no-covalente a las enzimas quinasas (co-sustrato).

El ATP fue descubierto en 1929 por Karl Lohmann. En 1941, Fritz Albert Lipmann
propuso el ATP como principal molécula de transferencia de energía en la célula.
PROPIEDADES Y ESTRUCTURA


                                 El ATP es un nucleótido trifosfato que se compone de
                                 adenosina (adenina y ribosa, como β-D-ribofuranosa) y
                                 tres grupos fosfato. Su fórmula molecular es
                                 C10H16N5O13P3. La estructura de la molécula consiste en
                                 una base purina (adenina) enlazada al átomo de
                                 carbono 1' de un azúcar pentosa. Los tres grupos
                                 fosfato se enlazan al átomo de carbono 5' de la
                                 pentosa. Los grupos fosforilo, comenzando con el
                                 grupo más cercano a la ribosa, se conocen como
                                 fosfatos alfa (α), beta (β) y gamma (γ).
      Estructura en 3D del ATP
                            El ATP es altamente soluble en agua y muy estable en
                            soluciones de pH entre 6.8 y 7.4, pero se hidroliza
rápidamente a pH extremo. Por consiguiente, se almacena mejor como una sal
anhidra.

La masa molecular del ATP es de 507,181 g/mol y su acidez es de 6.5. Es una
molécula inestable y tiende a ser hidrolizada en el agua. Si el ATP y el ADP se
encuentran en equilibrio químico, casi todos los ATP se convertirán a ADP. Las
células mantienen la proporción de ATP a ADP en el punto de diez órdenes de
magnitud del equilibrio, siendo las concentraciones de ATP miles de veces superior a
la concentración de ADP. Este desplazamiento del equilibrio significa que la
hidrólisis de ATP en la célula libera una gran cantidad de energía. Al ATP se le llama
a veces "molécula de alta energía", aunque esto no es correcto, ya que una mezcla
de ATP y ADP en equilibrio en el agua no puede hacer un trabajo útil. El ATP no
contiene "enlaces de alta energía", y cualquier otra molécula inestable serviría como
una forma de almacenar energía si la célula mantuviera su concentración lejos del
equilibrio.

El ATP tiene múltiples grupos ionizables con diferentes constantes de disociación del
ácido. En solución neutra, el ATP está ionizado y existe principalmente como ATP4-,
con una pequeña proporción de ATP3-. Como tiene varios grupos cargados
negativamente en solución neutra, puede quelar metales con una afinidad muy
elevada. El ATP existe en la mayoría de las células en un complejo con Mg2+.
FUNCIONES

Fuente de energía

El ATP es la principal fuente de energía para la mayoría de las funciones celulares.
Esto incluye la síntesis de macromoléculas como el ADN, el ARN y las proteínas.
También desempeña un papel fundamental en el transporte de macromoléculas a
través de las membranas celulares, es decir, en la exocitosis y endocitosis.

Debido a la presencia de enlaces ricos en energía (entre los grupos fosfato son los
enlaces anhídrido del ácido), esta molécula se utiliza en los seres vivos para
proporcionar la energía que se consume en las reacciones químicas. De hecho, la
reacción de hidrólisis de la adenosina trifosfato en adenosina difosfato y fosfato es
una reacción exergónica donde la variación de entalpía libre estándar es igual a -
30,5 kJ/mol:




Por el contrario, la reacción de síntesis de la adenosina trifosfato a partir de
adenosina difosfato y fosfato es una reacción endergónica donde la variación de
entalpía libre estándar es igual a +30,5 kJ/mol:




La reacción de hidrólisis del ATP en adenosín monofosfato (y pirofosfato) es una
reacción exergónica donde la variación de entalpía libre estándar es igual a -42
kJ/mol:




La energía se almacena en los enlaces entre los grupos fosfato.

Sin embargo, hay un nivel de entalpía a sobrepasar antes de liberar esta energía
(estado de transición). Esto explica por qué la hidrólisis de los enlaces pirofosfato no
sucede todo el tiempo. Las enzimas son capaces de reducir ese umbral de entalpía
para utilizar la energía liberada.

Si la energía se almacena en los enlaces anhídridos, podríamos preguntarnos cuál es
el interés de los seres vivos para sintetizar la molécula en su conjunto y no sólo el
pirofosfato libre. La razón es, probablemente, la capacidad de las enzimas para
reconocer el ATP, más fácil de hidrolizar específicamente que los pirofosfatos libres,
que son muy similares a todos los grupos fosfatos presentes en las biomoléculas.
El ADP puede ser fosforilado por la cadena respiratoria de las mitocondrias y los
procariotas, o por los cloroplastos de las plantas, para restaurar el ATP. La coenzima
ATP/ADP es un proveedor de energía universal, y es la principal fuente de energía
directamente utilizable por la célula. En los seres humanos, el ATP constituye la
única energía utilizable por el músculo.

En la síntesis del ácido nucleico ARN, el ATP es uno de los cuatro nucleótidos
incorporados directamente en las moléculas por las enzimas ARN polimerasas. La
energía que conduce esta polimerización procede de la ruptura del pirofosfato (dos
grupos de fosfato). El proceso es similar en la biosíntesis de ADN, salvo que el ATP se
reduce al desoxirribonucleótido dATP, antes de su incorporación en el ADN.

El ATP está críticamente involucrado en el mantenimiento de la estructura celular,
facilitando el montaje y desmontaje de elementos del citoesqueleto. En un proceso
similar, el ATP es necesario para el acortamiento de los filamentos de actina y
miosina necesarios para la contracción muscular. Este último proceso es una de las
principales necesidades energéticas de los animales y es esencial para la locomoción
y la respiración.

Señalización extracelular

El ATP, el ADP o la adenosina son reconocidos por los receptores purinérgicos. En los
seres humanos, esta señalización tiene un importante papel tanto en el sistema
nervioso central como en el periférico. La liberación de ATP de las sinapsis, los
axones y la neuroglía activa los receptores de membrana purinéricos conocidos como
P2. Los receptores P2Y son metabotrópicos, es decir, modulan el calcio intracelular
y, a veces, los niveles de AMP cíclico.

Señalización intracelular

Es utilizado por las quinasas como la fuente de grupos fosfato en sus reacciones de
transferencia de fosfato. La actividad de las quinasas sobre los sustratos como las
proteínas o los lípidos de la membrana son una forma común de transducción de
señales. La fosforilación de una proteína por una quinasa puede activar esta
cascada.

La adenilato ciclasa también usa el ATP y lo transforma en AMP cíclico (AMPc), una
molécula segundo mensajero que está involucrada en el desencadenamiento de las
señales de calcio mediante la liberación de calcio intracelular. Esta forma de
transducción de señales es particularmente importante en la función cerebral,
aunque está involucrada en la regulación de multitud de otros procesos celulares.
Síntesis de desoxirribonucleótidos

En todos los organismos conocidos, los desoxirribonucleótidos que componen el ADN
se sintetizan por la acción de enzimas ribonucleótido reductasas (RNR). Estas
enzimas reducen el grupo hidroxilo 2' en el azúcar ribosa, que pasa a ser
desoxirribosa, formando un desoxirribonucleótido (dATP). Todas las enzimas
ribonucleótido reductasas usan un radical sulfidrilo común en un mecanismo de
reacción que depende de los residuos cisteína, que se oxidan para formar enlaces
disulfuro en el curso de la reacción. Las enzimas RNR son recicladas mediante
reacción con tiorredoxina o glutaredoxina.




ALMACENAMIENTO DE ATP

Las reservas de ATP en el organismo no exceden de unos pocos segundos de
consumo. En principio, el ATP se produce de forma continua, pero cualquier proceso
que bloquee su producción provoca la muerte rápida (como es el caso de
determinados gases de combate diseñados para tal fin; o venenos como el cianuro,
que bloquean la cadena respiratoria; o el arsénico, que sustituye el fósforo y hace
que sean inutilizables las moléculas fosfóricas).

Las moléculas de creatina enlazan un fosfato mediante un enlace rico en energía
como el ATP. El ADP puede convertirse en ATP por acoplamiento con la hidrólisis de
fosfato de creatina. La creatina, por tanto, recicla el fosfato liberado por la
hidrólisis de la molécula de ATP original. Esto ayuda a mantener la energía
fácilmente movilizada sin agotar las reservas de ATP.

El ATP no se puede almacenar en su estado natural, sino sólo como intermediarios de
la cadena de producción de ATP. Por ejemplo, el glucógeno puede ser convertido
en glucosa y aportar combustible a la glucolisis si el organismo necesita más ATP. El
equivalente vegetal del glucógeno es el almidón. La energía puede también ser
almacenada como grasa, mediante neo-síntesis de ácidos grasos.

Ácido ascórbico
                              El ácido ascórbico es un ácido de azúcar con
                              propiedades antioxidantes. Su aspecto es de polvo o
                              cristales de color blanco-amarillento. Es soluble en
                              agua. El enantiómero L- del ácido ascórbico se conoce
                              popularmente como vitamina C. El nombre "ascórbico"
                              procede del prefijo a- (que significa "no") y de la
palabra latina scorbuticus (escorbuto), una enfermedad causada por la deficiencia
de                                    vitamina                                C.

En 1937, Walter Haworth recibió el Premio Nobel de
Química por su trabajo en la determinación de la
estructura del ácido ascórbico (compartido con Paul
Karrer, que recibió su premio por el trabajo con las
vitaminas). Ese mismo año el premio de Fisiología y
Medicina fue para Albert Szent-Györgyi por sus
estudios de las funciones biológicas del ácido L-
ascórbico. En el momento de su descubrimiento, en
los años 20, fue llamado ácido hexurónico por algunos
investigadores.

La síntesis química del ácido L-ascórbico es un procedimiento caro y complicado que
conlleva muchos pasos químicos que parten de la D-glucosa, y un único paso
enzimático que implica a la sorbitol-deshidrogenasa. La última etapa del proceso es
la transformación catalizada del ácido 2-ceto-L-gulónico (2-KGL) en ácido L-
ascórbico.

Se     ha    observado     que,     en   la     naturaleza,  algunas     bacterias
como Acetobacter, Gluconbacter yErwinia, son capaces de transformar la glucosa en
ácido         2,5-diceto-D-gulónico         (2,5-DKG),       mientras         que
otras, Corynebacterium, Brevibacterium y Arthrobacter, son capaces de transformar
el ácido 2,5-DKG en ácido 2-KLG gracias a la enzima 2,5-DKG-reductasa.

Gracias a la tecnología de ADN recombinante, ha sido posible aislar el gen de la 2,5-
DKG-reductasa en la especie Corynebacterium y expresarlo en Erwinia berbicola,
capaz de transformar la glucosa en 2,5-DKG gracias a tres enzimas. Las células
de Erwiniatransformadas son capaces de convertir directamente la glucosa en ácido
2-KLG.

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Las coenzimas

  • 1. Las coenzimas Las coenzimas son pequeñas moléculas orgánicas no proteicas que transportan grupos químicos entre enzimas. A veces se denominan cosustratos. Estas moléculas son sustratos de las enzimas y no forman parte permanente de la estructura enzimática. Esto distingue a las coenzimas de los grupos prostéticos, que son componentes no protéicos que se enlazan estrechamente a las enzimas, tales como los centros hierro-azufre, la flavina o los grupos hemo. Tanto coenzimas como grupos prostéticos pertenecen a un grupo más amplio, los cofactores, que son moléculas no protéicas (por lo general, moléculas orgánicas o iones metálicos) que requieren las enzimas para su actividad. En el metabolismo, las coenzimas están involucradas en reacciones de transferencia de grupos (como la coenzima A y la adenosina trifosfato (ATP)), y las reacciones redox (como la coenzima Q10 y la nicotinamida adenina dinucleótido (NAD+)). Las coenzimas se consumen y se reciclan continuamente en el metabolismo; un conjunto de enzimas añade un grupo químico a la coenzima y otro conjunto de enzimas lo extrae. Por ejemplo, las enzimas como la ATP sintasa fosforilan continuamente la adenosina difosfato (ADP), convirtiéndola en ATP, mientras que enzimas como las quinasas desfosforilan el ATP y lo convierten de nuevo en ADP. Las moléculas de coenzima son a menudo vitaminas o se hacen a partir de vitaminas. Muchas coenzimas contienen el nucleótido adenosina como parte de su estructura, como el ATP, la coenzima A y el NAD+. Esta estructura común puede reflejar un origen evolutivo como parte de los ribozimas en un antiguo mundo de ARN.
  • 2. Tipos de coenzimas VITAMINAS Y DERIVADOS Componente Grupo químico Coenzima Vitamina Distribución adicional transferido Bacterias, arqueas NAD+ y NADP+ Niacina (B3) ADP Electrones y eucariotas Ácido Grupo acetilo y otros Bacterias, arqueas Coenzima A pantoténico ADP grupos acilo y eucariotas (B5) Grupos metilo, Ácido Ácido fólico Residuos de Bacterias, arqueas formilo, metileno y tetrahidrofólico (B9) glutamato y eucariotas formimino Filoquinona (K1) Bacterias, arqueas Menaquinona Grupo carbonilo y Vitamina K Ninguno y eucariotas (K2) electrones * Sintética Menadiona(K3)* Bacterias, arqueas Ácido ascórbico Vitamina C Ninguno Electrones y eucariotas Riboflavina Metanógenos y Coenzima F420 Aminoácidos Electrones (B2) algunas bacterias
  • 3. NO VITAMINAS Coenzima Grupo químico transferido Distribución Adenosina trifosfato (ATP) Grupo fosfato Bacterias, arqueas y eucariotas S-Adenosil metionina Grupo metilo Bacterias, arqueas y eucariotas 3'-Fosfoadenosina-5'- Grupo sulfato Bacterias, arqueas y eucariotas fosfosulfato Coenzima Q Electrones Bacterias, arqueas y eucariotas Átomo de oxígeno y Tetrahidrobiopterina Bacterias, arqueas y eucariotas electrones Diacilgliceroles y grupos Citidina trifosfato Bacterias, arqueas y eucariotas lipídicos Azúcares nucleótidos Monosacáridos Bacterias, arqueas y eucariotas Algunas bacterias y la mayoría de Glutatión Electrones eucariotas Coenzima M Grupo metilo Metanógenos Coenzima B Electrones Metanógenos Metanofurano Grupo formilo Metanógenos Tetrahidrometanopterina Grupo metilo Metanógenos
  • 4. Funciones de las coenzimas La principal función de las coenzimas es actuar como intermediarios metabólicos. Elmetabolismo conlleva una amplia gama de reacciones químicas, pero la mayoría corresponden a unos tipos básicos de reacciones que implican la transferencia de grupos funcionales. Esta química común permite a las células utilizar un pequeño conjunto de intermediarios metabólicos para transportar grupos químicos entre las diferentes reacciones . Estos intermediarios en la transferencia de grupos son las coenzimas. Cada clase de reacción de transferencia de grupo se lleva a cabo por una coenzima particular, que es el sustrato de un conjunto de enzimas que la producen, y un conjunto de enzimas que la consumen. Un ejemplo de esto son las deshidrogenasas, que utilizan la nicotinamida adenina dinucleótido (NADH) como cofactor. Aquí, cientos de enzimas diferentes eliminan los electrones de sus sustratos y reducen el NAD+ a NADH. Esta coenzima reducida es entonces un sustrato para cualquiera de las reductasas presentes en la célula que necesitan reducir sus sustratos. Las coenzimas se reciclan continuamente, por lo tanto, como parte del metabolismo. A modo de ejemplo, la cantidad total de ATP en el cuerpo humano es aproximadamente 0,1 moles. Este ATP se ve constantemente degradado en ADP, y luego se convierte de nuevo en ATP. Así, en un momento determinado, el importe total de ATP más ADP se mantiene relativamente constante. La energía utilizada por las células humanas requiere la hidrólisis de 100 a 150 moles de ATP diario que es alrededor de 50 a 75 kg. Típicamente, un ser humano usará su peso corporal de ATP en el transcurso del día. Esto significa que cada molécula de ATP se recicla de 1000 a 1500 veces al día. El principal papel de las vitaminas es actuar como coenzimas en el organismo, aunque las vitaminas tienen otras funciones en el cuerpo. Las coenzimas también se fabrican a partir de nucleótidos, como la adenosina trifosfato (que es el transportador bioquímico de los grupos fosfato), o la coenzima A (que transporta grupos acilo). La mayoría de las coenzimas se encuentran en una enorme variedad de especies, y algunas son universales para todas las formas de vida. Una excepción a esta amplia distribución es un grupo único de coenzimas que evolucionaron en metanógenas, y que se limitan al grupo de las arqueas.
  • 5. Coenzimas NAD+ y NADH La nicotinamida adenina dinucleótido (abreviado NAD+, y también llamada difosfopiridina nucleótido y Coenzima I), es una coenzima que se encuentra en todas las células vivas. El compuesto es un dinucleótido, ya que consta de dos nucleótidos unidos a través de sus grupos fosfato con un nucleótido que contiene un anillo adenosina y el otro que contiene nicotinamida. En el metabolismo, el NAD+ participa en las reacciones redox (oxidorreducción), llevando los electrones de una reacción a otra. La coenzima, por tanto, se encuentra en dos formas en las células: NAD+ y NADH. El NAD+, que es un agente oxidante, acepta electrones de otras moléculas y pasa a ser reducido, formándose NADH, que Coenzima NAD puede ser utilizado entonces como agente reductor para donar electrones. Estas reacciones de transferencia de electrones son la principal función del NAD+. Sin embargo, también es utilizado en otros procesos celulares, en especial como sustrato de las enzimas que añaden o eliminan grupos químicos de las proteínas, en modificaciones post-traduccionales. Debido a la importancia de estas funciones, las enzimas que intervienen en el metabolismo del NAD+ son objetivos para el descubrimiento de medicamentos. En los organismos, el NAD+ puede ser sintetizado desde cero (de novo) a partir de losaminoácidos triptófano o ácido aspártico. Alternativamente, los componentes de las coenzimas se obtienen a partir de los alimentos, como la vitamina llamada niacina. Compuestos similares son liberados por las reacciones que descomponen la estructura del NAD+. Estos componentes preformados pasan luego a través de una ruta que los recicla de vuelta a la forma activa. Algunos NAD+ también se convierten en nicotinamida adenina dinucleótido fosfato (NADP+), cuya química es similar a la de la coenzima NAD+, aunque tiene diferentes funciones en el metabolismo. BIOSÍNTESIS El NAD+ se sintetiza a través de dos rutas metabólicas: en una ruta de novo a partir de aminoácidos, o en rutas de rescate mediante el reciclado de componentes preformados como nicotinamida convertida de nuevo a NAD+.
  • 6. Producción de novo La mayoría de los organismos sintetizan NAD+ a partir de componentes simples. El conjunto específico de reacciones varía entre los organismos, pero una característica común es la generación de ácido quinolínico (QA) a partir de un aminoácido, ya sea triptófano (Trp) en los Algunas rutas metabólicas que sintetizan y consumen NAD+ en los vertebrados. Las abreviaturas se definen en el texto. animales y algunas bacterias, o bien ácido aspártico en algunas bacterias y plantas. El ácido quinolínico se convierte en ácido nicotínico mononucleótido (NaMN) mediante transferencia de un grupo fosforibosa. Un grupo adenilato se transfiere entonces para formar ácido nicotínico adenina dinucleótido (NaAD). Por último, el grupo ácido nicotínico del NaAD es amidado a un grupo nicotinamida (Nam), formando nicotinamida adenina dinucleótido. En un nuevo paso, algunos NAD+ se convierten en NADP+ mediante la NAD+ kinasa, que fosforila el NAD+. En la mayoría de los organismos, esta enzima utiliza ATP como fuente del grupo fosfato, aunque en las bacterias tales como Mycobacterium tuberculosis y en las arqueas comoPyrococcus horikoshii, el polifosfato inorgánico es una alternativa como donante de fosfato. FUNCIONES La nicotinamida adenina dinucleótido tiene varias funciones esenciales en el metabolismo. Actúa como coenzima en las reacciones redox, como donante de grupos ADP-ribosa en las reacciones de ADP-ribosilación, como precursor del segundo mensajero de la molécula cíclica de ADP-ribosa, así como sustrato para las ADN ligasas bacterianas y un grupo de enzimas llamadas sirtuinas, que usan NAD+ para eliminar los grupos proteícos acetilo. Oxidoreductasas La principal función del NAD+ en el metabolismo es la transferencia de electrones de una reacción redox a otra. Este tipo de reacción es catalizada por un gran grupo de enzimas llamadas oxidoreductasas. Los nombres correctos para estas enzimas contienen los nombres de sus sustratos: por ejemplo, la NADH-ubiquinona
  • 7. oxidoreductasa cataliza la oxidación del NADH por la coenzima Q. Sin embargo, estas enzimas son también conocidas como deshidrogenasas o reductasas, por lo que la NADH-ubiquinona oxidoreductasa también suele ser llamada NADH deshidrogenasa o, a veces, coenzima Q reductasa. Cuando están enlazados a una proteína, el NAD+ y el NADH suelen mantenerse en un motivo estructural conocido como pliegue Rossmann. El nombre proviene de Michael Rossmann, que fue el primer científico en darse cuenta de lo común que es esta estructura dentro de las proteínas enlazadas a nucleótidos. Este pliegue contiene tres o más hebras beta paralelas enlazadas mediante dos hélices alfa en el orden beta-alfa-beta-alfa- beta. Esto forma una hoja beta flanqueada por una capa de hélices alfa a cada lado. Debido a que cada pliegue Rossmann enlaza un nucleótido, los dominios de enlace para el dinucleótido NAD+ consisten de dos pares de El pliegue de Rossmann en la zona de la lactato pliegues Rossmann, con cada pliegue deshidrogenasa de Cryptosporidium parvum, con el NAD+ en rojo, las láminas beta en amarillo enlazando un nucleótido dentro del cofactor. y las hélices alfa en púrpura. Sin embargo, este pliegue no es universal entre las enzimas dependientes de NAD, ya que se ha descubierto recientemente que una clase de enzimas bacterianas involucradas en el metabolismo de los aminoácidos se enlazan a la coenzima pero carecen de esta forma de pliegue. Cuando se enlaza al sitio activo de una oxidoreductasa, el anillo nicotinamida de la coenzima se coloca de modo que pueda aceptar un hidruro del otro sustrato. Ya que el carbono C4 que acepta el hidrógeno es proquiral, esto puede ser explotado en la cinética de enzimas para dar información sobre el mecanismo enzimático. Esto se hace mediante la mezcla de una enzima con un sustrato que tiene átomos de deuterio sustituidos por los hidrógenos, de tal forma que la enzima reducirá el NAD+ mediante la transferencia de un deuterio en lugar de un átomo de hidrógeno. En este caso, una enzima puede producir uno de los dos estereoisómeros de NADH. En algunas enzimas, el hidrógeno se transfiere desde el plano superior del anillo de nicotinamida (las oxidoreductasas clase A), mientras que en otras enzimas (las oxidoreductasas de clase B) la transferencia se produce desde abajo.
  • 8. A pesar de esta similitud en la forma en que las proteínas se unen a las coenzimas, las enzimas casi siempre muestran un alto nivel de especificidad, ya sea por el NAD+ o el NADP+. Esta especificidad refleja las distintas funciones metabólicas de las dos coenzimas, y es el resultado de diferentes clases de residuos de aminoácidos en los dos tipos de sitios de unión al coenzima. Por ejemplo, en el sitio activo de las enzimas Aspecto del NAD en 3D. dependientes de ADP, se forma un enlace iónico entre una cadena lateral de aminoácidos básico y el grupo fosfato ácido del NADP+. Por el contrario, en las enzimas dependientes de NAD, la carga en este bolsillo se invierte, impidiendo el enlace del NADP+. Sin embargo, hay algunas excepciones a esta regla general, y enzimas como la aldosa reductasa, glucosa-6-fosfato deshidrogenasa, y la metilentetrahidrofolato reductasa pueden utilizar ambas coenzimas en algunas especies. Papel en el metabolismo redox Las reacciones redox catalizadas por oxidoreductasas son vitales en todo el metabolismo, pero una esfera particularmente importante es la liberación de energía de los nutrientes. Los compuestos reducidos, como laglucosa, se oxidan, liberando así la energía. Esta energía se transfiere al NAD+ mediante reducción a NADH, como parte de la glucolisis y el ciclo del ácido cítrico (ciclo de Krebs). En eucariotas, los electrones transportados por el NADH que se produce en el citoplasma mediante glucolisis son transferidos al Esquema del metabolismo redox interior de la mitocondria por lanzaderas mitocondriales, como la lanzadera malato- aspartato. El NADH es oxidado a su vez por la cadena de transporte de electrones, que bombea protones a través de la membrana y genera ATP a través de la fosforilación oxidativa. Estos sistemas de lanzadera también tienen la misma función de transporte en los cloroplastos. Dado que tanto las formas oxidadas como reducidas de nicotinamida adenina dinucleótido se utilizan en estos conjuntos de reacciones enlazadas, la célula mantiene aproximadamente concentraciones iguales de NAD+ y NADH. Una
  • 9. proporción alta de NAD+/NADH permite a este coenzima actuar como agente oxidante y como reductor. En contraste, la función principal del NADP+ es como agente reductor en el anabolismo, estando la coenzima implicada en rutas como la síntesis de ácidos grasos y la fotosíntesis. Dado que el NADPH es necesario para conducir las reacciones redox como un fuerte agente reductor, la proporción NADP+/NADPH se mantiene muy baja. Aunque es importante en el catabolismo, el NADH se utiliza también en las reacciones anabólicas, como la gluconeogénesis. Esta necesidad de NADH en el anabolismo plantea un problema creciente para los procariotas que crecen en nutrientes que liberan sólo una pequeña cantidad de energía. Por ejemplo, las bacterias nitrificantes como Nitrobacter oxidan el nitrito a nitrato, lo que libera energía suficiente para bombear los protones y generar ATP, pero no la suficiente como para producir NADH directamente. Como el NADH sigue siendo necesario para las reacciones anabólicas, estas bacterias utilizan una nitrito oxidoreductasa para producir la suficiente fuerza motriz de protones como para ejecutar parte de la cadena de transporte de electrones en sentido inverso, generando NADH. Funciones no redox La coenzima NAD+ se consume también en las reacciones de transferencia de ADP- ribosa. Por ejemplo, las enzimas llamadas ADP-ribosiltransferasas añaden la fracción ADP-ribosa de esta molécula a las proteínas, en una modificación postraduccional llamada ADP-ribosilación. Esta reacción implica la adición de un solo grupo ADP- ribosa (mono-ADP-ribosilación), o la transferencia de ADP-ribosa a las proteínas en cadenas largas ramificadas (poli-ADP-ribosilación). La mono-ADP-ribosilación se identificó por primera vez como el mecanismo de un grupo de toxinas bacterianas, en particular la toxina del cólera, pero también participan en la señalización celular normal. La poli-ADP-ribosilación es llevada a cabo por las polimerasas poli-(ADP- ribosa). La estructura de poli-(ADP-ribosa) está implicada en la regulación de varios eventos celulares, y es más importante en el núcleo celular, en procesos como la reparación del ADN o el mantenimiento del telómero mantenimiento. Además de estas funciones dentro de la célula, se ha descubierto recientemente un grupo de ADP-ribosiltransferasas extracelulares, pero sus funciones aún no están claras.
  • 10. Otra función de esta coenzima en la señalización celular es como precursor de la ADP-ribosa cíclica, que se produce a partir de NAD+ por ADP-ribosil ciclasas, como parte de un sistema de segundo mensajero. Esta molécula actúa en la señalización de calcio mediante la liberación de calcio de las reservas intracelulares. Esto lo hace mediante el Estructura de la ADP-ribosa cíclica enlace y apertura de una clase de canales de calcio llamados receptores de rianodina, que se encuentran en las membranas de los orgánulos como el retículo endoplasmático. El NAD+ también es consumido por las sirtuinas, que son deacetilasas dependientes de NAD, como la Sir2. Estas enzimas actúan mediante la transferencia de un grupo acetilo de sus proteínas sustrato a la fracción ADP-ribosa del NAD+; esto rompe la coenzima y libera nicotinamida y O-acetil-ADP-ribosa. Las sirtuinas parecen estar implicadas en la regulación de la transcripción a través de histonas deacetilantes y alteración de la estructura del nucleosoma. Aunque las proteínas no histonas pueden ser desacetilizadas también por las sirtuinas. Esta actividad de las sirtuinas es especialmente interesante debido a su importancia en la regulación del envejecimiento. Otras enzimas dependientes de NAD son las ADN ligasas bacterianas, que unen dos extremos de ADN mediante el uso de NAD+ como sustrato para donar un grupo adenosina monofosfato (AMP) al fosfato 5' de un extremo de ADN. Este intermediario es atacado luego por el grupo hidroxilo 3' del otro extremo de ADN, formando un nuevo enlace fosfodiéster. Esto contrasta con las ADN ligasas eucarióticas, que utilizan el ATP para formar intermediarios ADN-AMP.
  • 11. Coenzima A (CoA) La coenzima A (CoA) es una coenzima de transferencia de grupos acilo que participa en diversas rutas metabólicas (ciclo de Krebs, síntesis y oxidación deácidos grasos). Se deriva de una vitamina: el ácido pantoténico (vitamina B5), y es una coenzima libre. Su aislamiento se produjo en 1951 por el bioquímico alemán (y premio Nobel) Feodor Lynen, en forma de acetil-coenzima A a partir de células de levadura. Su parte reactiva es la función tiol (-SH) de la tioetanolamina, que se simboliza a menudo Coenzima A como HS-CoA (o CoA-SH). Por lo tanto, la reacción con un ácido carboxílico forma un enlace aciltioéster rico en energía. Fuentes alimenticias de esta coenzima son: despojos, setas, carne y yema de huevo. Reacción: CoA-SH + R-COOH => S-CoA-CO-R (+ H2O) BIOSÍNTESIS La molécula de coenzima A consta de varios componentes: un nucleótido (adenosina difosfato, ADP), una vitamina (ácido pantoténico, vitamina B5) y un aminoácido (cisteína). Se sintetiza en un proceso de cinco etapas a partir del pantotenato: 1. El pantotenato se fosforila a 4'-fosfopantotenato mediante la enzima pantotenato kinasa. 2. Una cisteína es añadida al 4'-fosfopantotenato mediante la enzima fosfopantotenoilcisteína sintetasa, para formar 4'-fosfo-N-pantotenoilcisteína (PPC). 3. La PPC se descarboxila a 4'-fosfo-panteteína mediante la fosfopantotenoilcisteína descarboxilasa. 4. La 4'-fosfo-panteteína es adenililada para formar defosfo-CoA mediante la enzima fosfopanteteína adenilil transferasa. 5. Por último, la defosfo-CoA es fosforilada a CoA (coenzima A) utilizando ATP, mediante la enzima defosfo-CoA kinasa.
  • 12. FUNCIÓN Puesto que la coenzima A es químicamente un tiol, puede reaccionar con los ácidos carboxílicos para formar tioésteres, funcionando así como un transportador de grupos acilo. Asiste en la transferencia de ácidos grasos desde el citoplasma a las mitocondrias. Una molécula de coenzima A que transporta un grupo acetilo se conoce como acetil-CoA. Cuando no lleva grupo acilo generalmente se denomina CoASH o HSCoA. Grupos acilo transportados por el Coenzima A * Acetil-CoA * Propionil-CoA * Acetoacetil-CoA * Cumaril-CoA (utilizado en la biosíntesis de flavonoides) * Derivados acilo de ácidos dicarboxílicos: o Malonil-CoA o Succinil-CoA o Hidroximetilglutaril-CoA (utilizado en la biosíntesis de isoprenoides) o Pimelil-CoA (utilizado en la biosíntesis de biotina) * Butiril-CoA Adenosina trifosfato (ATP) La adenosina trifosfato (abreviado ATP, y también llamada adenosín-5'-trifosfato o trifosfato de adenosina) es una molécula utilizada por todos los organismos vivos para proporcionar energía en las reacciones químicas. También es el precursor de una serie de coenzimas esenciales como el NAD+ o la coenzima A. El ATP es uno de los cuatro Fórmula estructural del ATP monómeros utilizados en la síntesis de ARN celular. Además, es una coenzima de transferencia de grupos fosfato que se enlaza de manera no-covalente a las enzimas quinasas (co-sustrato). El ATP fue descubierto en 1929 por Karl Lohmann. En 1941, Fritz Albert Lipmann propuso el ATP como principal molécula de transferencia de energía en la célula.
  • 13. PROPIEDADES Y ESTRUCTURA El ATP es un nucleótido trifosfato que se compone de adenosina (adenina y ribosa, como β-D-ribofuranosa) y tres grupos fosfato. Su fórmula molecular es C10H16N5O13P3. La estructura de la molécula consiste en una base purina (adenina) enlazada al átomo de carbono 1' de un azúcar pentosa. Los tres grupos fosfato se enlazan al átomo de carbono 5' de la pentosa. Los grupos fosforilo, comenzando con el grupo más cercano a la ribosa, se conocen como fosfatos alfa (α), beta (β) y gamma (γ). Estructura en 3D del ATP El ATP es altamente soluble en agua y muy estable en soluciones de pH entre 6.8 y 7.4, pero se hidroliza rápidamente a pH extremo. Por consiguiente, se almacena mejor como una sal anhidra. La masa molecular del ATP es de 507,181 g/mol y su acidez es de 6.5. Es una molécula inestable y tiende a ser hidrolizada en el agua. Si el ATP y el ADP se encuentran en equilibrio químico, casi todos los ATP se convertirán a ADP. Las células mantienen la proporción de ATP a ADP en el punto de diez órdenes de magnitud del equilibrio, siendo las concentraciones de ATP miles de veces superior a la concentración de ADP. Este desplazamiento del equilibrio significa que la hidrólisis de ATP en la célula libera una gran cantidad de energía. Al ATP se le llama a veces "molécula de alta energía", aunque esto no es correcto, ya que una mezcla de ATP y ADP en equilibrio en el agua no puede hacer un trabajo útil. El ATP no contiene "enlaces de alta energía", y cualquier otra molécula inestable serviría como una forma de almacenar energía si la célula mantuviera su concentración lejos del equilibrio. El ATP tiene múltiples grupos ionizables con diferentes constantes de disociación del ácido. En solución neutra, el ATP está ionizado y existe principalmente como ATP4-, con una pequeña proporción de ATP3-. Como tiene varios grupos cargados negativamente en solución neutra, puede quelar metales con una afinidad muy elevada. El ATP existe en la mayoría de las células en un complejo con Mg2+.
  • 14. FUNCIONES Fuente de energía El ATP es la principal fuente de energía para la mayoría de las funciones celulares. Esto incluye la síntesis de macromoléculas como el ADN, el ARN y las proteínas. También desempeña un papel fundamental en el transporte de macromoléculas a través de las membranas celulares, es decir, en la exocitosis y endocitosis. Debido a la presencia de enlaces ricos en energía (entre los grupos fosfato son los enlaces anhídrido del ácido), esta molécula se utiliza en los seres vivos para proporcionar la energía que se consume en las reacciones químicas. De hecho, la reacción de hidrólisis de la adenosina trifosfato en adenosina difosfato y fosfato es una reacción exergónica donde la variación de entalpía libre estándar es igual a - 30,5 kJ/mol: Por el contrario, la reacción de síntesis de la adenosina trifosfato a partir de adenosina difosfato y fosfato es una reacción endergónica donde la variación de entalpía libre estándar es igual a +30,5 kJ/mol: La reacción de hidrólisis del ATP en adenosín monofosfato (y pirofosfato) es una reacción exergónica donde la variación de entalpía libre estándar es igual a -42 kJ/mol: La energía se almacena en los enlaces entre los grupos fosfato. Sin embargo, hay un nivel de entalpía a sobrepasar antes de liberar esta energía (estado de transición). Esto explica por qué la hidrólisis de los enlaces pirofosfato no sucede todo el tiempo. Las enzimas son capaces de reducir ese umbral de entalpía para utilizar la energía liberada. Si la energía se almacena en los enlaces anhídridos, podríamos preguntarnos cuál es el interés de los seres vivos para sintetizar la molécula en su conjunto y no sólo el pirofosfato libre. La razón es, probablemente, la capacidad de las enzimas para reconocer el ATP, más fácil de hidrolizar específicamente que los pirofosfatos libres, que son muy similares a todos los grupos fosfatos presentes en las biomoléculas.
  • 15. El ADP puede ser fosforilado por la cadena respiratoria de las mitocondrias y los procariotas, o por los cloroplastos de las plantas, para restaurar el ATP. La coenzima ATP/ADP es un proveedor de energía universal, y es la principal fuente de energía directamente utilizable por la célula. En los seres humanos, el ATP constituye la única energía utilizable por el músculo. En la síntesis del ácido nucleico ARN, el ATP es uno de los cuatro nucleótidos incorporados directamente en las moléculas por las enzimas ARN polimerasas. La energía que conduce esta polimerización procede de la ruptura del pirofosfato (dos grupos de fosfato). El proceso es similar en la biosíntesis de ADN, salvo que el ATP se reduce al desoxirribonucleótido dATP, antes de su incorporación en el ADN. El ATP está críticamente involucrado en el mantenimiento de la estructura celular, facilitando el montaje y desmontaje de elementos del citoesqueleto. En un proceso similar, el ATP es necesario para el acortamiento de los filamentos de actina y miosina necesarios para la contracción muscular. Este último proceso es una de las principales necesidades energéticas de los animales y es esencial para la locomoción y la respiración. Señalización extracelular El ATP, el ADP o la adenosina son reconocidos por los receptores purinérgicos. En los seres humanos, esta señalización tiene un importante papel tanto en el sistema nervioso central como en el periférico. La liberación de ATP de las sinapsis, los axones y la neuroglía activa los receptores de membrana purinéricos conocidos como P2. Los receptores P2Y son metabotrópicos, es decir, modulan el calcio intracelular y, a veces, los niveles de AMP cíclico. Señalización intracelular Es utilizado por las quinasas como la fuente de grupos fosfato en sus reacciones de transferencia de fosfato. La actividad de las quinasas sobre los sustratos como las proteínas o los lípidos de la membrana son una forma común de transducción de señales. La fosforilación de una proteína por una quinasa puede activar esta cascada. La adenilato ciclasa también usa el ATP y lo transforma en AMP cíclico (AMPc), una molécula segundo mensajero que está involucrada en el desencadenamiento de las señales de calcio mediante la liberación de calcio intracelular. Esta forma de transducción de señales es particularmente importante en la función cerebral, aunque está involucrada en la regulación de multitud de otros procesos celulares.
  • 16. Síntesis de desoxirribonucleótidos En todos los organismos conocidos, los desoxirribonucleótidos que componen el ADN se sintetizan por la acción de enzimas ribonucleótido reductasas (RNR). Estas enzimas reducen el grupo hidroxilo 2' en el azúcar ribosa, que pasa a ser desoxirribosa, formando un desoxirribonucleótido (dATP). Todas las enzimas ribonucleótido reductasas usan un radical sulfidrilo común en un mecanismo de reacción que depende de los residuos cisteína, que se oxidan para formar enlaces disulfuro en el curso de la reacción. Las enzimas RNR son recicladas mediante reacción con tiorredoxina o glutaredoxina. ALMACENAMIENTO DE ATP Las reservas de ATP en el organismo no exceden de unos pocos segundos de consumo. En principio, el ATP se produce de forma continua, pero cualquier proceso que bloquee su producción provoca la muerte rápida (como es el caso de determinados gases de combate diseñados para tal fin; o venenos como el cianuro, que bloquean la cadena respiratoria; o el arsénico, que sustituye el fósforo y hace que sean inutilizables las moléculas fosfóricas). Las moléculas de creatina enlazan un fosfato mediante un enlace rico en energía como el ATP. El ADP puede convertirse en ATP por acoplamiento con la hidrólisis de fosfato de creatina. La creatina, por tanto, recicla el fosfato liberado por la hidrólisis de la molécula de ATP original. Esto ayuda a mantener la energía fácilmente movilizada sin agotar las reservas de ATP. El ATP no se puede almacenar en su estado natural, sino sólo como intermediarios de la cadena de producción de ATP. Por ejemplo, el glucógeno puede ser convertido en glucosa y aportar combustible a la glucolisis si el organismo necesita más ATP. El equivalente vegetal del glucógeno es el almidón. La energía puede también ser almacenada como grasa, mediante neo-síntesis de ácidos grasos. Ácido ascórbico El ácido ascórbico es un ácido de azúcar con propiedades antioxidantes. Su aspecto es de polvo o cristales de color blanco-amarillento. Es soluble en agua. El enantiómero L- del ácido ascórbico se conoce popularmente como vitamina C. El nombre "ascórbico" procede del prefijo a- (que significa "no") y de la
  • 17. palabra latina scorbuticus (escorbuto), una enfermedad causada por la deficiencia de vitamina C. En 1937, Walter Haworth recibió el Premio Nobel de Química por su trabajo en la determinación de la estructura del ácido ascórbico (compartido con Paul Karrer, que recibió su premio por el trabajo con las vitaminas). Ese mismo año el premio de Fisiología y Medicina fue para Albert Szent-Györgyi por sus estudios de las funciones biológicas del ácido L- ascórbico. En el momento de su descubrimiento, en los años 20, fue llamado ácido hexurónico por algunos investigadores. La síntesis química del ácido L-ascórbico es un procedimiento caro y complicado que conlleva muchos pasos químicos que parten de la D-glucosa, y un único paso enzimático que implica a la sorbitol-deshidrogenasa. La última etapa del proceso es la transformación catalizada del ácido 2-ceto-L-gulónico (2-KGL) en ácido L- ascórbico. Se ha observado que, en la naturaleza, algunas bacterias como Acetobacter, Gluconbacter yErwinia, son capaces de transformar la glucosa en ácido 2,5-diceto-D-gulónico (2,5-DKG), mientras que otras, Corynebacterium, Brevibacterium y Arthrobacter, son capaces de transformar el ácido 2,5-DKG en ácido 2-KLG gracias a la enzima 2,5-DKG-reductasa. Gracias a la tecnología de ADN recombinante, ha sido posible aislar el gen de la 2,5- DKG-reductasa en la especie Corynebacterium y expresarlo en Erwinia berbicola, capaz de transformar la glucosa en 2,5-DKG gracias a tres enzimas. Las células de Erwiniatransformadas son capaces de convertir directamente la glucosa en ácido 2-KLG.