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Asignación de Bioinformática

  1. 1. Trabajo especial de bioinformática 4368<br />Vaya a http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Genome<br />Seleccione la opción de Nucleotides localizada en la parte superior izquierda. <br />En el recuadro de Draft Human Genome, seleccione la opción de Map Viewer.<br />¿Cuántos cromosomas tiene un perro, una rata y Arabidopsis?<br />Utilizando el recuadro de Search, determine en qué cromosoma(s), se encuentran los <br /> genes relacionados con lo siguiente: (recuerde presioanr find luego de escribir la premisa)<br /> a. Anemia falciforme (sickle cell anemia)<br /> b. Parkinson<br /> c. Alzheimer<br /> d. fibrosis cística<br /> e. Diabetes<br /> f. cancer (seleccione uno de ellos y mencione el cromosoma en el que se encuentra)<br />6. Vaya a http://www.ncbi.nlm.nih.gov/<br /> Usando GenBank, realice una búsqueda de la siguiente secuancia de de acceso: AF321136<br /> Abra el archivo y conteste:<br /> a. organismo del cual proviene la secuencia<br /> b. número de genes presentes en la secuencia<br /> c. función sugerida de alguno de el o los genes<br /> d. Seleccione 20 nucleótidos de cualquier región de uno de los genes. <br /> e. Seleccione los amino ácidos que desee de una de las secuencias de proteínas presentes.<br />7. Vaya a http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ y determine a qué organismo pertenece la siguiente <br /> secuencia de: <br /> a. Realice una búsqueda usando la secuencia de DNA y proteínas que <br /> copio en 2d y 2e (arriba).<br /> b. ¿Cuáles fueron los tres primeros “hits” obtenidos de cada una?<br />8. Vaya a http://expasy.cbr.nrc.ca/tools/scnpsit1.html<br /> a. Seleccione la secuencia completa de CcmH en AF321136 y realice una búsqueda.<br /> b. Escriba el primer motif, motivo o secuencia conservada que encuentre y su función.<br />Dr. Carlos RíosVelázquez<br />
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