EDIT tools presentation in INBIO (Costa Rica)

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EDIT tools presentation in INBIO (Costa Rica)

  1. 1. Instituto Nacional de Biodiversidad (INBIO) 20 agosto 2009, Heredia Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT Pere Roca Ristol Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC), España
  2. 2. Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT Areas de trabajo en WP 5: -taxonomic editing -publishing of edited data -data storage and exchange -collections & specimens -descriptions; -fieldwork -literature -geography
  3. 3. Se detectaron dos necesidades básicas: -herramienta web de fácil uso para la publicación de mapas EDIT mapViewer -visualizar información georeferenciada proveniente de diferentes fuentes mapREST services Pasos: 1) Construcción de una infraestructura centralizada de datos geográficos -edición capas GIS -introducción en bases de datos (postGIS) -instalación de programario servidor (GeoServer, ImageMagick, PHP…) 2)Desarrollo de las aplicaciones web (mapRest services y EDIT mapViewer) Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
  4. 4. Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT Elementos centrales para el desarrollo Herramientas del servidor: generación y manipulación de imágenes para descarga, conexión base de datos… Estándares para servicions geoespaciales EDIT mapViewer mapREST services Servidores de mapas Bases de datos geográfica Todas las herramientas usadas y creadas son gratuitas y de código abierto
  5. 5. Base datos geográfica en Madrid (CSIC) Mi base de datos remota El usuario construye las URLs con su información y los parámetros de simbolización deseados ejemplo: especie 1 presente en áreas con código 1, 2 y 3. especie 2 en áreas 4 y 5. Aplicar estilo “a” a especie 1, y estilo “b” a especie 2 Usuario define el estilo “a” como.. color azul, borde negro, grosor 5… Imagen (mapa) Archivo de simbolización (usar en aplicación web local) Especialmente útil en bases de datos distribuidas. Nos da total independencia en la simbolización Ejemplos en uso: 1) Distribuciones EDIT PalmWeb portal EDIT Diptera portal EDIT Cichorieae portal 2) Registros Mercantour/Alpi Marittime ATBI Gemer ATBI Uso para distribuciones (polígonos) y registros (puntos) mapREST services Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
  6. 6. archivo CSV EDIT mapViewer http://edit.csic.es/geo/mapviewer/edit_cr.html Datos georeferenciados en latitud / longitud y datum WGS84 y con notación decimal Operaciones básicas: -Composición del mapa (añadir/quitar capas) y navegación (zoom in/out, pan…) -Simbolización datos propios -Acceso información propia (query) -Leyenda, escala -Impresión en diferentes formatos y resoluciones -acceso información de GBIF Operaciones más complejas: -creación y simbolización de nuestros propios polígonos -Análisis geo-espacial: 1) Número de registros por unidad espacial (polígono) 2) Número de géneros por unidad espacial 3) Relación número de géneros/núm. Registros 4) Análisis completitud del inventario Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
  7. 7. Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT
  8. 8. Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT Análisis de la fiabilidad de los inventarios (I): Número géneros / número de registros Número de registros Número de géneros Área muy muestrada, con poca diversidad (géneros). Las posibilidades de encontrar nuevos géneros es baja Área muypoco muestrada, con relativamante alta diversidad. Las posibilidades de encontrar nuevos géneros es baja Número de géneros/Número de registros
  9. 9. Alta pendiente al final de la curva. Si siguiéramos muestreando encontraríamos nuevas especies. Zona mal muestreada (inventario incompleto) Baja pendiente al final de la curva. Aunque aumentemos las observaciones no encontrariamos nuevas especies La unidad territorial está biológicamente exhausta Zona bien muestreada Visualización en forma de mapa Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT Análisis de la fiabilidad de los inventarios (II): curvas de acumulación/colecta
  10. 10. Algunos videos… y alguna pregunta? gracias! mapREST services: http://www.screencast.com/t/iFRTfDDB1 Análisis espacial: http://www.screencast.com/t/RUfWGvui Simbolización datos puntuales: http://www.screencast.com/t/kb5YNSvZ  Uso herramienta GBIF: http://www.screencast.com/t/iXCFJ5GB  Interrogación datos: http://www.screencast.com/t/TLclIQRGQk8  Impresión mapas: http://www.screencast.com/t/eBSYhc5EHBi Desarrollo de herramientas geográficas en el proyecto EDIT

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