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Virus de l'hépatite A et E
                 Virus et marqueurs diagnostiques




                                       Vincent THIBAULT
                                     Laboratoire de Virologie

         Groupe Hospitalier
          Pitié-Salpêtrière
Assistance Publique Hôpitaux de Paris
      V.Thibault DU_janv.-2010   1
Hépatites virales
                  mode de transmission préférentiel


 parentéral                                             féco-oral


 B                                 non A, non B                 A
1965         D                                                  1972
           1977
                               C                          E
                           1990                          1991

                                   F, G, TTV, autres…
V.Thibault DU_janv.-2010   2
Historique VHA
 “La Jaunisse”
 1745 : Cockayne, hépatites épidémiques
 1908 : McDonald, "notion de virus…"
 Reproduction de la maladie 1942 :
        Volontaires (Voegt, Havens), Paul 1943 ingestion feces/serum
 Entité clinique :
       17-18ème siècle - 1923 Blumer - 1947 McCallum (VHA "infectious"-VHB "serum")
 Visualisation : 1973 (Feinstone)
 Développement de la sérologie : épidémiologie
 1979 : culture (Provost et Hilleman)
 1981... : Clonage, Séquences nucléotidiques
 1991… : Vaccination
 2006 : Déclaration obligatoire

V.Thibault DU_janv.-2010   3
Virus de l'hépatite A




V.Thibault DU_janv.-2010   4
Virus de l’Hépatite A


                                                     •   Famille : Picornaviridae
                                           Capside        (entérovirus type 72)
                                                     •   Genre : hépatovirus
                                                     •   Taille 27-32 nm
27-32nm
                                           ARN (+)   •   Non enveloppé
                                                     •   Structure icosaèdrique
                                                     •   ARN simple brin,
                                           Vpg
                                                          •   polarité positive
                                                          •   lié de façon covalente à
                                                              une protéine Vpg




   V.Thibault DU_janv.-2010   5
P1 prot. Capside                   P2                           P3

         0                      Structurales                               Non structurales
                                                                                                              7478


                       1B        1C       1D         2A   2B          2C       3 3C (PRO)        3D (POL)       AAA
                                                                              A-B
  Vpg          1A
2.5kDa     IRES
                                                                                 3
         Traduction                                  2A                         A-B
                       VP2       VP3       VP1            2B           2C          3C (PRO)       3D (POL)      poly-
                                                                                                              protéine
             VP4                                                                                              2 227 AA


                                                           ?                      Vpg
                                                                                    Protéase
                                                                    Liaison NTP
                                                                      Hélicase                      ARN
                   VP0                                                                           Polymérase

                      VP2           VP3        VP1                             Réplication
             VP4                                          2A


                      VP2           VP3        VP1                          X5 – X12
             VP4         Protéines de surface             2A          Maturation finale
                            immunogénicité
    V.Thibault DU_janv.-2010    6
Cycle de multiplication du VHA en culture de cellules
         Attachement

                                Libération                           Réplication
                                du génome

 Espace                                                                                                  +
de Disse                                                                                                 -
                          ire




                                                    Traduction
                  cellula




                                                     Synthèse                                        +
                                                de la polyprotéine
                                                                                                         -
             rane
         Memb




                                            P3
                                                  Maturation
                                           P2                                              Réticulum
                                                                                         endoplasmique
                                      P1
                                                                           Empaquetage




                                                                                 Canalicule
                                                                       Relargage  biliaire

 V.Thibault DU_janv.-2010         7
VHA : physiopathologie

                                          Absence d'effet cytopathique direct :
                                          cytolyse résultant du processus immun de
                                          défense de l'hôte,
                                                médiation cellulaire
                                                médiation humorale




V.Thibault DU_janv.-2010   8
Propriétés Physiques du VHA
                   Agents                      Stabilité
                  Chaleur
    Autoclavage (121°C, 20')    Inactivation
    100°C                       Inactivation
    60°C                        Stable 1 heure
    température ambiante        Stable 1 mois (selles, eaux, sols)
                                Plusieurs jours sur surface sèche
                                4 h. Sur les mains
    4°C                         Stable plusieurs mois
    Congelé                     Stable des mois ou années
                Acide-base      pH 1 : stable 5 h.
                                PH 3-11 : stable au moins 30'
                     U.V.       Inactivation
                 Chimiques
    Chlore, ozone,              Inactivation
    glutaraldéhyde, iode
    Alcool 70°                  3' : inactivation partielle

V.Thibault DU_janv.-2010    9
Variabilité génétique
                          P1 prot. Capside                P2                         P3

         0                     Structurales                         Non structurales
                                                                                                     7478


                     1B         1C        1D   2A   2B         2C       3 3C (PRO)        3D (POL)     AAA
                                                                       A-B
  Vpg         1A
2.5kDa
                        Comparaison nucléotidique
                          7 Génotypes : IA,B ; II; IIIA,B ; IV-VII
                                    Homme : génotype I (90%), (III, II=VII)
                                    Singes : IV, V, VI
                        Sérotype unique
                          Nombre limité d'épitopes antigéniques VP1, VP3
                          Tests immunologiques
                          Vaccination (HM175, CR326)
                                    virus inactivé cultivé sur MRC-5

    V.Thibault DU_janv.-2010   10
Génotypes et
         phylogénie
    VP1/P2A
    Génotypes : >15% variations
    Sous types : 7.5% variations




     D'après Nainan et al. 2006
     Clin. Microb. Rev. ; 19:63-79




    IV Nonhuman primate, Philippines
    V Nonhuman primate, Kenya
    VI Nonhuman primate, Indonesia




Phylogenetic analysis of 3,582 HAV isolates
in the VP1/P2B region (315-bp fragment).
        V.Thibault DU_janv.-2010   11
Répartition mondiale des génotypes




Génotypes infectant l'homme en noir , les singes en rouge.
Souche PA21 (génotype IIIA), isolée d'un singe Panamanian Owl en vert.


                                   Cristina J, Costa-Mattioli M. Virus Res. 2007 Aug;127(2):151-7.
   V.Thibault DU_janv.-2010   12
VHA : Paramètres Biologiques
Ac anti-VHA = hépatite A ancienne ou vaccination
IgM anti-VHA = hépatite aiguë A (clinique)

                                                            protection contre réinfection
                                   Ag foie                                   IgG
                                  Symptomes
                                       Ictère


                             VHA Selles
                                                                  IgM
                                  VHA Sang




 0       1        2          3     4      5     6   7   8   9    10      24
  V.Thibault DU_janv.-2010   13
                                                                Semaines
VHA : Marqueurs disponibles
1- Sang : Marqueurs indirects
                IgM                            Marqueurs indirects (+++)
                IgG                                     (ELISA)
       Génome viral (RT-PCR) 105 virions/mL sang      Salive :
                                                         IgG (ELISA)
2- Selles : 109 virions/g selles                         Génome viral (RT-PCR)

       Génome viral (RT-PCR) - épidémiologie
       Particules virales IEM - EIA

3- Milieux :                                         Marqueurs directs
       Génome viral (RT-PCR)                            (plus spécialisé)
       Particules virales IEM
4- Foie :
       Ag viral à la surface des hépatocytes
       Génome viral : hybridation, RT-PCR
   V.Thibault DU_janv.-2010   14
IgM HAV uniquement à bon escient !



                                     1%
                                    11 %
                                    82 %

                                Faux positifs
                                           Roque Afonso et al. CID 2006:42 -887


  Alaska : test "réflexe" si Ig-VHA totales +          Ig M HAV
   32 % de faux + (Castrodale CID 2005:41;e86)

  Vaccination : 8 à 20 % d'IgM VHA + dans les 2 à 3 semaines suivant
  l'injection…

  NE RECHERCHER L'IgM anti-VHA QU'EN CAS D'HEPATITE AIGUË

V.Thibault DU_janv.-2010   15
Marqueurs biochimiques

                 Diagnostic                    Transaminases (ALAT, ASAT)
                                               Bilirubine
                                               Phosphatase alcaline
                                               Facteurs de coagulation


Sérologie +++

      IgM anti VHA : infection récente

      IgG anti VHA : infection passée ou vaccination

      IgM et IgG anti VHA

Diagnostic direct (-) [uniquement dans le cadre d'études]

      Virémie : techniques sensibles (105 v./mL)

      Recherche de virus dans les selles, prolongée, importante
      (109v./mL), épidémiologie
                                                         Salive :
                                                             IgG (ELISA)
V.Thibault DU_janv.-2010   16                                Génome viral (RT-PCR)
Hépatite A : le vaccin
                                       virus inactivé
 AVAXIM 160U suspension injectable seringue préremplie
    Virus de l'hépatite A souche GBM cultivée sur cellules diploïdes humaines MRC-
       5 , inactivé
 HAVRIX 1 440 U Elisa/ml susp inj IM Ad en seringue
 HAVRIX 720 U Elisa/0,5 ml susp inj IM Enf/Nour en seringue
    Souche HM 175 du virus de l'hépatite A cultivée sur cellules humaines
       diploïdes MRC5

 Le schéma vaccinal habituel comprend 1 dose suivie d'un rappel (1 dose) 6 à
 12 mois plus tard.
 La      persistance            des   anticorps   anti-VHA   après    vaccination     n'est
 actuellement pas connue . Les données disponibles suggèrent la persistance
 des anticorps anti-VHA à un niveau protecteur jusqu'à 10 ans (20 ans ?)
 après primo-immunisation.

         Hepatitis A Vaccine versus Immune Globulin for Post-exposure Prophylaxis
V.Thibault DU_janv.-2010   17
                                                        Victor et al. 2007 N Engl J Med 357;17
Difficultés diagnostiques
                                     En routine

                   Adresser prélèvements
                              au
             Centre national de référence du VHA

                                 Pr E Dussaix
                           Laboratoire de virologie
                            Hôpital Paul Brousse
                       12-14 av Paul Vaillant Couturier
                            94804 Villejuif cedex
                            Tel : 01 45 59 37 21

http://invs.sante.fr/surveillance/cnr/liste
  V.Thibault DU_janv.-2010   18
SRAS ?




                                Hépatite E ?            Grippe




V.Thibault DU_janv.-2010   19
Historique VHE
       Découverte dépendante de la connaissance des virus des hépatites
         1955 : Inde, hépatite chez des personnes immunisées contre le
          VHA, épidémie particulière. "NANBH"
       Entité clinique 1980 - similitude avec l’hépatite A :
             Inde : prévalence de l’hépatite A importante
             Epidémie : autre virus des hépatites, contamination par l’eau
       1983 : reproduction de l’hépatite non A-non B chez un volontaire
       immunisé contre VHA (Balayan)
             Hépatite à J36
             J28-45, visualisation de particules virales > VHA (27-30nm)
             Reproduction de l’infection chez le singe (cynomolgus)
             Hépatite "non A - non B" à transmission entérique (ENANB)
       1990 : Reyes et al. clonage et séquençage      "VHE"
       1991 : Tam et al. VHE
       2000 : Panda et al. cDNA infectieux
V.Thibault DU_janv.-2010   20
V.Thibault DU_janv.-2010   21
VHE                            Virus non enveloppé
                                                  Sphérique (SRV)
 Famille : Hepeviridae                           Surface irrégulière
 Genre : Hepevirus                                Capside 27-34 nm
                                                Symétrie icosaédrique



                                                  ARN simple brin
                                                    hélice droite
                                                      polarité +
                                                        7,5kb
                                                 poly-A extrémité 3’



                                             Stabilité
                                Au laboratoire : instable(-70 à +8°C)
                                     Décongélation/congélation
                                      Tractus GI : stable (pH)
V.Thibault DU_janv.-2010   22
Organisation génomique
                        Non structurales                      Structurales

                                                   7 200 nt               ARN polarité +
                                                                                            3’NC
5’ NC   28                                               5109                      7124
                                                                                           Poly-A

                                                                 ORF3
        MeT      Y       Pro         P   X   Hel       RdRp               ORF2

 Génotypes 1-3
                                                                   Protéines
                                                                                  DIAGNOSTIC
                                                                 immunogènes

Hétérogénéité génétique
  Au moins 4 groupes majeurs (<20% hétérogénéité ORF2) subdivisés
  en 24 sous groupes dont homologues animaux :
  Epitopes majeurs : parties C-ter de l’ORF3 et ORF2
  Protection croisée entre différentes souches : un seul sérotype
              Développement de tests sérologiques (performances équivalentes entre
               les différents types ?)
              Vaccin : ORF 2 recombinante
    V.Thibault DU_janv.-2010   23
Hétérogénéité génétique

   Au moins 4 groupes majeurs (<20% hétérogénéité ORF2) subdivisés en 24 sous
   groupes dont homologues animaux :
     I-       Birmanie et certaines souches africaines et asiatiques
     II-      Mexique et certaines souches du Niger
     III- Amérique, Italie, NZ, Autriche, Grèce, Argentine (+ souches porcines)
     IV-      Chine, Taiwan et Japon (plus sévère que III ?)

   Epitopes majeurs : parties C-ter de l’ORF3 et ORF2
             Connaissances limitées sur l’immunité contre les Ag natifs
             Parties structurales variables
             Grande homologie des parties non structurales

 Protection croisée entre différentes souches : un seul sérotype
             Développement de tests sérologiques (performances équivalentes entre
              les différents types ?)
             Vaccin : ORF 2 recombinante
   V.Thibault DU_janv.-2010   24
NL (porc)
 301 nt 5' end of ORF2 sequences from 275 HEV strains,
                                                               3c      Taiwan (porc)
 Génotype < 20% hétérogénéité ORF2
                           Japon 3b                               3d          3e France, UK, Japon,
                           + porc                                                 Espagne + porc

                                                                                         Espagne, UK, Grèce,
                                                                                         NL, Japon + porc
                                                                                    3f
                                                                                                 4e
                                                                                                 Inde (porc)


                                                          3                                            4a
        US, Japon,
        Corée, NL + porc
                                                                    4                            Chine, Taiwan
                                  3a

                                                          1     2
                   Chine, Inde,                                                                    4b
                                 1c
                   Nepal, Russie                                                                 Chine, Taiwan
                                                                                                 Japon, Vietnam

                  Chine, Pakistan,      1b
                  Bengladesh                                                                4c

                    Inde, Népal, Birmanie,   1a
                    Japon, Espagne                           1d
                                                                        4d
                                        Algérie, Namibie, 1e                 Chine (porc)
D'après Lu et al. Rev. Med.             Afrique C.
Virol. 2006;16:5-36                                               Mexico, Nigeria                    0.05
                                             Maroc, Algérie
       V.Thibault DU_janv.-2010    25
Similarités des
souches humaines et
      animales
  Borgen et al. BMC Infectious Diseases
                2008, 8:61




Genetic relatedness between HEV
strains from human and non-human
sources and from various countries.
Minimal spanning trees of 81 sequences
of 148 nucleotides HEV RNA showing
genetic distances between genotype 3
HEV
strains from humans and animals.
Dutch cases are marked with ID
numbers inside the colored circles.


     V.Thibault DU_janv.-2010   26
Similarités des souches humaines et animales
Bilic et al. Journal of General Virology
          (2009), 90, 863–873




                                     humaines               aviaires

                                                Unrooted phylogenetic tree of four avian HEV
                                                and nine mammalian HEV isolates, based on
                                                the complete genome region
     V.Thibault DU_janv.-2010   27
Similarités des souches humaines et animales
Zhao et al. Journal of Medical Virology
       81:1371–1379 (2009)




Phylogenetic tree of based on
full-length   sequences        HEV
genotypes 1, 2, 3, 4, and
avian   HEV    and     the     new
genotype from rabbits.




    V.Thibault DU_janv.-2010   28
V.Thibault DU_janv.-2010   29
Culture et Modèles animaux

• Culture
        Difficile
       Culture primaire d’hépatocytes de macaques (cynomolgus)
       Cellules PLC/PRF/5 hépatocarcinome (Tanaka et al. J. Gen Virol. 2007)
       Cellule embryonnaire


• Modèles animaux
        Primates : reproduction de la pathologie humaine
       Volontaires...
       VHE du porc, du poulet
       Présence d’Ac chez poulet, porc, rat, souris, mouton...

  V.Thibault DU_janv.-2010   30
VHE : Paramètres Biologiques

                                    Titre peu élevé
                             protection contre réinfection ?

                                                  IgG
              Symptomes

                  Ictère


          VHE Selles
                                       IgM
             VHE Sang




0      10 20 30 40 50 60 70 80 90 100             200
V.Thibault DU_janv.-2010 31
                                  Jours
HEV – virémie-                                       selle


   transmission
                                      serum
                                              salive




Concentré de plaquettes à J0
Transfusé à un homme de
64 ans traité pour Lymphome
non-Hodgkinien      par   GM                                   IgG
autologue


                                                               IgM




Matsubayashi K, et al. Transfusion.
2008 Jul;48(7):1368-75.

     V.Thibault DU_janv.-2010   32
Immunodépression, hépatite chronique et
                stratégie diagnostique




     Dans le cadre d'une investigation chez un patient immuno déprimé,
                          La détection du génome viral (RT-PCR) sera privilégiée !
                               (ceci s'applique pour de nombreux diagnostics viraux - PCR)

Kamar et al. American Journal of Transplantation 2008; 8: 1744–1748
    V.Thibault DU_janv.-2010   33
Stratégie Diagnostique
Marqueurs non biologiques
       circonstances de la maladie (voyage, autres causes, épidémie)
             A adapter en fonction de la zone géographique ? (Sud versus Nord ?)

       clinique : hépatite “classique”, absence de chronicité (chez
       l'immunocompétent ! )

Absence de marqueurs biologiques : diagnostic d'exclusion
       Absence des marqueurs des virus des autres hépatites (A, B, C, D)
       Notions sérologiques pour d’autres virus (EBV, CMV, herpès)

Marqueurs sérologiques spécifiques
       IgM anti-HEV
       IgG anti-HEV (+++)
       RT-PCR : détection du génome viral (sang, selles)

V.Thibault DU_janv.-2010   34
Spécificité et Sensibilité des ELISAs
    Epidémie Indonésie,
      82 symptomatiques; 174 asymptomatiques; 496 contrôles
    Comparaison de 5 tests sérologiques
      Référence = RT-PCR
      Concordance IgM : 81%
      Concordance IgG : 85%




                                              Myint et al. JCM, 2006, p. 1581–1583
V.Thibault DU_janv.-2010   35
Performance des tests
                                                                            IgM anti-HEV

                                                        Microplaque         Microplaque            Test rapide
                                                          Adaltis          MP Diagnostics         MP Diagnostics
                                     anti-HEV IgG

                                                      positif   négatif    positif     négatif    positif   négatif

                                     Positif (n=41)     40        1          39            2        37        4
                                     Negatif (n=9)      5         4          5             4        4         5
                                     Total (n=50)       45        5          44            6        41        9

Panels                                                          Sensibilité Spécificité          VPP        VPN
50 sérums ARN HEV (+), G3                                           %           %                 %          %
406 sérums IgG ARN HEV (-)                      Microplaque
                                                  Adaltis             90             100         100        98.8

                                                Microplaque
                                               MP Diagnostics         88          99.5           95.7       98.5

                                                Test rapide
     J. Izopet                                 MP Diagnostics         82             100         100        97.8
Comm. Pers. CVV 2008
     V.Thibault DU_janv.-2010   36
Stratégie Diagnostique
                   Se donner les moyens de faire le diagnostic

           Diagnostic Indirect                       Diagnostic Direct
     Recherche de l'immunité antivirale           Recherche du génome sur
               IgM anti VHE                      prélèvements sang et selles
               IgG anti VHE


        Diagnostic                IgG           IgM              RT-PCR

           Certain                ++             ++                +

          Probable               - ou +          -                 +

          Douteux                 +++            -                 -

  Immunité ancienne                +             -                 -


V.Thibault DU_janv.-2010   37
VHE et vaccination
 20 µg d'antigène rHEV (capside exprimée
 dans baculovirus) dans 0.5 ml de PBS sur
 0.5 mg d'hydroxyde d'aluminium.
 3 injections

                   Moyenne géométrique du taux
                           d'anticorps anti-VHE




Efficacité : 95,5% après 3 doses




              Risque cumulé d'un premier épisode
                                     d'hépatite E

Shrestha,et al 2007 N Engl J Med 356;9
     V.Thibault DU_janv.-2010   38
Adresser les prélèvements
                              au
             Centre national de référence du VHE

                                        Dr E Nicand
                                  Laboratoire de biologie
                                    HIA Val de Grâce
                                   Tel : 01 40 51 40 00


http://invs.sante.fr/surveillance/cnr/liste


  V.Thibault DU_janv.-2010   39

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  • 1. Virus de l'hépatite A et E Virus et marqueurs diagnostiques Vincent THIBAULT Laboratoire de Virologie Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière Assistance Publique Hôpitaux de Paris V.Thibault DU_janv.-2010 1
  • 2. Hépatites virales mode de transmission préférentiel parentéral féco-oral B non A, non B A 1965 D 1972 1977 C E 1990 1991 F, G, TTV, autres… V.Thibault DU_janv.-2010 2
  • 3. Historique VHA “La Jaunisse” 1745 : Cockayne, hépatites épidémiques 1908 : McDonald, "notion de virus…" Reproduction de la maladie 1942 : Volontaires (Voegt, Havens), Paul 1943 ingestion feces/serum Entité clinique : 17-18ème siècle - 1923 Blumer - 1947 McCallum (VHA "infectious"-VHB "serum") Visualisation : 1973 (Feinstone) Développement de la sérologie : épidémiologie 1979 : culture (Provost et Hilleman) 1981... : Clonage, Séquences nucléotidiques 1991… : Vaccination 2006 : Déclaration obligatoire V.Thibault DU_janv.-2010 3
  • 4. Virus de l'hépatite A V.Thibault DU_janv.-2010 4
  • 5. Virus de l’Hépatite A • Famille : Picornaviridae Capside (entérovirus type 72) • Genre : hépatovirus • Taille 27-32 nm 27-32nm ARN (+) • Non enveloppé • Structure icosaèdrique • ARN simple brin, Vpg • polarité positive • lié de façon covalente à une protéine Vpg V.Thibault DU_janv.-2010 5
  • 6. P1 prot. Capside P2 P3 0 Structurales Non structurales 7478 1B 1C 1D 2A 2B 2C 3 3C (PRO) 3D (POL) AAA A-B Vpg 1A 2.5kDa IRES 3 Traduction 2A A-B VP2 VP3 VP1 2B 2C 3C (PRO) 3D (POL) poly- protéine VP4 2 227 AA ? Vpg Protéase Liaison NTP Hélicase ARN VP0 Polymérase VP2 VP3 VP1 Réplication VP4 2A VP2 VP3 VP1 X5 – X12 VP4 Protéines de surface 2A Maturation finale immunogénicité V.Thibault DU_janv.-2010 6
  • 7. Cycle de multiplication du VHA en culture de cellules Attachement Libération Réplication du génome Espace + de Disse - ire Traduction cellula Synthèse + de la polyprotéine - rane Memb P3 Maturation P2 Réticulum endoplasmique P1 Empaquetage Canalicule Relargage biliaire V.Thibault DU_janv.-2010 7
  • 8. VHA : physiopathologie Absence d'effet cytopathique direct : cytolyse résultant du processus immun de défense de l'hôte, médiation cellulaire médiation humorale V.Thibault DU_janv.-2010 8
  • 9. Propriétés Physiques du VHA Agents Stabilité Chaleur Autoclavage (121°C, 20') Inactivation 100°C Inactivation 60°C Stable 1 heure température ambiante Stable 1 mois (selles, eaux, sols) Plusieurs jours sur surface sèche 4 h. Sur les mains 4°C Stable plusieurs mois Congelé Stable des mois ou années Acide-base pH 1 : stable 5 h. PH 3-11 : stable au moins 30' U.V. Inactivation Chimiques Chlore, ozone, Inactivation glutaraldéhyde, iode Alcool 70° 3' : inactivation partielle V.Thibault DU_janv.-2010 9
  • 10. Variabilité génétique P1 prot. Capside P2 P3 0 Structurales Non structurales 7478 1B 1C 1D 2A 2B 2C 3 3C (PRO) 3D (POL) AAA A-B Vpg 1A 2.5kDa Comparaison nucléotidique 7 Génotypes : IA,B ; II; IIIA,B ; IV-VII Homme : génotype I (90%), (III, II=VII) Singes : IV, V, VI Sérotype unique Nombre limité d'épitopes antigéniques VP1, VP3 Tests immunologiques Vaccination (HM175, CR326) virus inactivé cultivé sur MRC-5 V.Thibault DU_janv.-2010 10
  • 11. Génotypes et phylogénie VP1/P2A Génotypes : >15% variations Sous types : 7.5% variations D'après Nainan et al. 2006 Clin. Microb. Rev. ; 19:63-79 IV Nonhuman primate, Philippines V Nonhuman primate, Kenya VI Nonhuman primate, Indonesia Phylogenetic analysis of 3,582 HAV isolates in the VP1/P2B region (315-bp fragment). V.Thibault DU_janv.-2010 11
  • 12. Répartition mondiale des génotypes Génotypes infectant l'homme en noir , les singes en rouge. Souche PA21 (génotype IIIA), isolée d'un singe Panamanian Owl en vert. Cristina J, Costa-Mattioli M. Virus Res. 2007 Aug;127(2):151-7. V.Thibault DU_janv.-2010 12
  • 13. VHA : Paramètres Biologiques Ac anti-VHA = hépatite A ancienne ou vaccination IgM anti-VHA = hépatite aiguë A (clinique) protection contre réinfection Ag foie IgG Symptomes Ictère VHA Selles IgM VHA Sang 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 24 V.Thibault DU_janv.-2010 13 Semaines
  • 14. VHA : Marqueurs disponibles 1- Sang : Marqueurs indirects IgM Marqueurs indirects (+++) IgG (ELISA) Génome viral (RT-PCR) 105 virions/mL sang Salive : IgG (ELISA) 2- Selles : 109 virions/g selles Génome viral (RT-PCR) Génome viral (RT-PCR) - épidémiologie Particules virales IEM - EIA 3- Milieux : Marqueurs directs Génome viral (RT-PCR) (plus spécialisé) Particules virales IEM 4- Foie : Ag viral à la surface des hépatocytes Génome viral : hybridation, RT-PCR V.Thibault DU_janv.-2010 14
  • 15. IgM HAV uniquement à bon escient ! 1% 11 % 82 % Faux positifs Roque Afonso et al. CID 2006:42 -887 Alaska : test "réflexe" si Ig-VHA totales + Ig M HAV 32 % de faux + (Castrodale CID 2005:41;e86) Vaccination : 8 à 20 % d'IgM VHA + dans les 2 à 3 semaines suivant l'injection… NE RECHERCHER L'IgM anti-VHA QU'EN CAS D'HEPATITE AIGUË V.Thibault DU_janv.-2010 15
  • 16. Marqueurs biochimiques Diagnostic  Transaminases (ALAT, ASAT)  Bilirubine  Phosphatase alcaline  Facteurs de coagulation Sérologie +++ IgM anti VHA : infection récente IgG anti VHA : infection passée ou vaccination IgM et IgG anti VHA Diagnostic direct (-) [uniquement dans le cadre d'études] Virémie : techniques sensibles (105 v./mL) Recherche de virus dans les selles, prolongée, importante (109v./mL), épidémiologie Salive : IgG (ELISA) V.Thibault DU_janv.-2010 16 Génome viral (RT-PCR)
  • 17. Hépatite A : le vaccin virus inactivé AVAXIM 160U suspension injectable seringue préremplie  Virus de l'hépatite A souche GBM cultivée sur cellules diploïdes humaines MRC- 5 , inactivé HAVRIX 1 440 U Elisa/ml susp inj IM Ad en seringue HAVRIX 720 U Elisa/0,5 ml susp inj IM Enf/Nour en seringue  Souche HM 175 du virus de l'hépatite A cultivée sur cellules humaines diploïdes MRC5 Le schéma vaccinal habituel comprend 1 dose suivie d'un rappel (1 dose) 6 à 12 mois plus tard. La persistance des anticorps anti-VHA après vaccination n'est actuellement pas connue . Les données disponibles suggèrent la persistance des anticorps anti-VHA à un niveau protecteur jusqu'à 10 ans (20 ans ?) après primo-immunisation. Hepatitis A Vaccine versus Immune Globulin for Post-exposure Prophylaxis V.Thibault DU_janv.-2010 17 Victor et al. 2007 N Engl J Med 357;17
  • 18. Difficultés diagnostiques En routine Adresser prélèvements au Centre national de référence du VHA Pr E Dussaix Laboratoire de virologie Hôpital Paul Brousse 12-14 av Paul Vaillant Couturier 94804 Villejuif cedex Tel : 01 45 59 37 21 http://invs.sante.fr/surveillance/cnr/liste V.Thibault DU_janv.-2010 18
  • 19. SRAS ? Hépatite E ? Grippe V.Thibault DU_janv.-2010 19
  • 20. Historique VHE Découverte dépendante de la connaissance des virus des hépatites 1955 : Inde, hépatite chez des personnes immunisées contre le VHA, épidémie particulière. "NANBH" Entité clinique 1980 - similitude avec l’hépatite A : Inde : prévalence de l’hépatite A importante Epidémie : autre virus des hépatites, contamination par l’eau 1983 : reproduction de l’hépatite non A-non B chez un volontaire immunisé contre VHA (Balayan) Hépatite à J36 J28-45, visualisation de particules virales > VHA (27-30nm) Reproduction de l’infection chez le singe (cynomolgus) Hépatite "non A - non B" à transmission entérique (ENANB) 1990 : Reyes et al. clonage et séquençage "VHE" 1991 : Tam et al. VHE 2000 : Panda et al. cDNA infectieux V.Thibault DU_janv.-2010 20
  • 22. VHE Virus non enveloppé Sphérique (SRV) Famille : Hepeviridae Surface irrégulière Genre : Hepevirus Capside 27-34 nm Symétrie icosaédrique ARN simple brin hélice droite polarité + 7,5kb poly-A extrémité 3’ Stabilité Au laboratoire : instable(-70 à +8°C) Décongélation/congélation Tractus GI : stable (pH) V.Thibault DU_janv.-2010 22
  • 23. Organisation génomique Non structurales Structurales 7 200 nt ARN polarité + 3’NC 5’ NC 28 5109 7124 Poly-A ORF3 MeT Y Pro P X Hel RdRp ORF2 Génotypes 1-3 Protéines DIAGNOSTIC immunogènes Hétérogénéité génétique Au moins 4 groupes majeurs (<20% hétérogénéité ORF2) subdivisés en 24 sous groupes dont homologues animaux : Epitopes majeurs : parties C-ter de l’ORF3 et ORF2 Protection croisée entre différentes souches : un seul sérotype  Développement de tests sérologiques (performances équivalentes entre les différents types ?)  Vaccin : ORF 2 recombinante V.Thibault DU_janv.-2010 23
  • 24. Hétérogénéité génétique Au moins 4 groupes majeurs (<20% hétérogénéité ORF2) subdivisés en 24 sous groupes dont homologues animaux : I- Birmanie et certaines souches africaines et asiatiques II- Mexique et certaines souches du Niger III- Amérique, Italie, NZ, Autriche, Grèce, Argentine (+ souches porcines) IV- Chine, Taiwan et Japon (plus sévère que III ?) Epitopes majeurs : parties C-ter de l’ORF3 et ORF2  Connaissances limitées sur l’immunité contre les Ag natifs  Parties structurales variables  Grande homologie des parties non structurales  Protection croisée entre différentes souches : un seul sérotype  Développement de tests sérologiques (performances équivalentes entre les différents types ?)  Vaccin : ORF 2 recombinante V.Thibault DU_janv.-2010 24
  • 25. NL (porc) 301 nt 5' end of ORF2 sequences from 275 HEV strains, 3c Taiwan (porc) Génotype < 20% hétérogénéité ORF2 Japon 3b 3d 3e France, UK, Japon, + porc Espagne + porc Espagne, UK, Grèce, NL, Japon + porc 3f 4e Inde (porc) 3 4a US, Japon, Corée, NL + porc 4 Chine, Taiwan 3a 1 2 Chine, Inde, 4b 1c Nepal, Russie Chine, Taiwan Japon, Vietnam Chine, Pakistan, 1b Bengladesh 4c Inde, Népal, Birmanie, 1a Japon, Espagne 1d 4d Algérie, Namibie, 1e Chine (porc) D'après Lu et al. Rev. Med. Afrique C. Virol. 2006;16:5-36 Mexico, Nigeria 0.05 Maroc, Algérie V.Thibault DU_janv.-2010 25
  • 26. Similarités des souches humaines et animales Borgen et al. BMC Infectious Diseases 2008, 8:61 Genetic relatedness between HEV strains from human and non-human sources and from various countries. Minimal spanning trees of 81 sequences of 148 nucleotides HEV RNA showing genetic distances between genotype 3 HEV strains from humans and animals. Dutch cases are marked with ID numbers inside the colored circles. V.Thibault DU_janv.-2010 26
  • 27. Similarités des souches humaines et animales Bilic et al. Journal of General Virology (2009), 90, 863–873 humaines aviaires Unrooted phylogenetic tree of four avian HEV and nine mammalian HEV isolates, based on the complete genome region V.Thibault DU_janv.-2010 27
  • 28. Similarités des souches humaines et animales Zhao et al. Journal of Medical Virology 81:1371–1379 (2009) Phylogenetic tree of based on full-length sequences HEV genotypes 1, 2, 3, 4, and avian HEV and the new genotype from rabbits. V.Thibault DU_janv.-2010 28
  • 30. Culture et Modèles animaux • Culture Difficile Culture primaire d’hépatocytes de macaques (cynomolgus) Cellules PLC/PRF/5 hépatocarcinome (Tanaka et al. J. Gen Virol. 2007) Cellule embryonnaire • Modèles animaux Primates : reproduction de la pathologie humaine Volontaires... VHE du porc, du poulet Présence d’Ac chez poulet, porc, rat, souris, mouton... V.Thibault DU_janv.-2010 30
  • 31. VHE : Paramètres Biologiques Titre peu élevé protection contre réinfection ? IgG Symptomes Ictère VHE Selles IgM VHE Sang 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 200 V.Thibault DU_janv.-2010 31 Jours
  • 32. HEV – virémie- selle transmission serum salive Concentré de plaquettes à J0 Transfusé à un homme de 64 ans traité pour Lymphome non-Hodgkinien par GM IgG autologue IgM Matsubayashi K, et al. Transfusion. 2008 Jul;48(7):1368-75. V.Thibault DU_janv.-2010 32
  • 33. Immunodépression, hépatite chronique et stratégie diagnostique Dans le cadre d'une investigation chez un patient immuno déprimé, La détection du génome viral (RT-PCR) sera privilégiée ! (ceci s'applique pour de nombreux diagnostics viraux - PCR) Kamar et al. American Journal of Transplantation 2008; 8: 1744–1748 V.Thibault DU_janv.-2010 33
  • 34. Stratégie Diagnostique Marqueurs non biologiques circonstances de la maladie (voyage, autres causes, épidémie) A adapter en fonction de la zone géographique ? (Sud versus Nord ?) clinique : hépatite “classique”, absence de chronicité (chez l'immunocompétent ! ) Absence de marqueurs biologiques : diagnostic d'exclusion Absence des marqueurs des virus des autres hépatites (A, B, C, D) Notions sérologiques pour d’autres virus (EBV, CMV, herpès) Marqueurs sérologiques spécifiques IgM anti-HEV IgG anti-HEV (+++) RT-PCR : détection du génome viral (sang, selles) V.Thibault DU_janv.-2010 34
  • 35. Spécificité et Sensibilité des ELISAs Epidémie Indonésie, 82 symptomatiques; 174 asymptomatiques; 496 contrôles Comparaison de 5 tests sérologiques Référence = RT-PCR Concordance IgM : 81% Concordance IgG : 85% Myint et al. JCM, 2006, p. 1581–1583 V.Thibault DU_janv.-2010 35
  • 36. Performance des tests IgM anti-HEV Microplaque Microplaque Test rapide Adaltis MP Diagnostics MP Diagnostics anti-HEV IgG positif négatif positif négatif positif négatif Positif (n=41) 40 1 39 2 37 4 Negatif (n=9) 5 4 5 4 4 5 Total (n=50) 45 5 44 6 41 9 Panels Sensibilité Spécificité VPP VPN 50 sérums ARN HEV (+), G3 % % % % 406 sérums IgG ARN HEV (-) Microplaque Adaltis 90 100 100 98.8 Microplaque MP Diagnostics 88 99.5 95.7 98.5 Test rapide J. Izopet MP Diagnostics 82 100 100 97.8 Comm. Pers. CVV 2008 V.Thibault DU_janv.-2010 36
  • 37. Stratégie Diagnostique Se donner les moyens de faire le diagnostic Diagnostic Indirect Diagnostic Direct Recherche de l'immunité antivirale Recherche du génome sur IgM anti VHE prélèvements sang et selles IgG anti VHE Diagnostic IgG IgM RT-PCR Certain ++ ++ + Probable - ou + - + Douteux +++ - - Immunité ancienne + - - V.Thibault DU_janv.-2010 37
  • 38. VHE et vaccination 20 µg d'antigène rHEV (capside exprimée dans baculovirus) dans 0.5 ml de PBS sur 0.5 mg d'hydroxyde d'aluminium. 3 injections Moyenne géométrique du taux d'anticorps anti-VHE Efficacité : 95,5% après 3 doses Risque cumulé d'un premier épisode d'hépatite E Shrestha,et al 2007 N Engl J Med 356;9 V.Thibault DU_janv.-2010 38
  • 39. Adresser les prélèvements au Centre national de référence du VHE Dr E Nicand Laboratoire de biologie HIA Val de Grâce Tel : 01 40 51 40 00 http://invs.sante.fr/surveillance/cnr/liste V.Thibault DU_janv.-2010 39