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  • NLM has been indexing the biomedical literature since 1879, to help provide health professionals access to information necessary for research, health care, and education. What was once a printed index to articles, the Index Medicus , became a database now known as MEDLINE.  MEDLINE contains journal citations and abstracts for biomedical literature from around the world.  Since 1996, free access to MEDLINE has been available to the public online via PubMed.
  • Transcript

    • 1. 線上醫學資料庫介紹: PubMed 臺大醫圖推廣服務股 2009 年 9 月
    • 2. PubMed 簡介 <ul><li>PubMed 為美國國家醫學圖書館之下的美國國家生物技術資訊中心 (National Center for Biotechnology Information 簡稱 NCBI) 所研發生物醫學相關文獻的 Web-based 檢索系統。 </li></ul><ul><li>以收錄生命科學相關文獻為主,並收錄資訊科學、航太科學等其他學科文獻;收錄年代自 1948 年起,亦包含即將出版的醫學文獻,共計約 5,200 種生醫期刊, 1,800 萬筆書目資料 。 </li></ul><ul><li>提供部分免費及付費全文連結服務。 </li></ul>
    • 3. 連線方式 1. 美國國家醫學圖書館 2. 醫圖資料庫網頁
    • 4. http://www.nlm.nih.gov
    • 5. 醫圖首頁->資料庫網頁
    • 6. 系列資料庫 檢索區 功能列 服務項目
    • 7. 基本檢索 1. 作者檢索 2. 刊名檢索 3. 關鍵詞 (keywords) 或標題 (subject) 檢索
    • 8. 作者檢索 <ul><li>輸入型式: last name( 姓 ) 空格 initials( 名字的首字縮寫 ) ,不用標點符號。例如:陳定信教授: chen ds </li></ul><ul><li>多位作者: marshall b warren j 或 </li></ul><ul><li>marshall b AND warren j </li></ul><ul><li>若只知道作者的姓,可在作者名稱後面加 [au] ,例: Marshall[au] </li></ul><ul><li>2002 年以後出版的文獻,可用作者全名 (full name) 檢索。 </li></ul>
    • 9. 範例 chen ds
    • 10. 刊名檢索 (1) <ul><li>查詢某一本期刊出版的文獻 </li></ul><ul><li>輸入型式:期刊的全名、縮寫或是 ISSN </li></ul><ul><ul><li>全名: American Journal of Infection Control </li></ul></ul><ul><ul><li>縮寫: Am J Infect Control </li></ul></ul><ul><ul><li>ISSN : 0196-6553 </li></ul></ul><ul><li>若期刊名是標題詞彙或一般詞彙,可在期刊名後面加註 [ta] ,例如: nature[ta] </li></ul>
    • 11. nature[ta]
    • 12. 刊名檢索 (2) <ul><li>查詢期刊名的全名或縮寫型式 </li></ul><ul><li>點選 PubMed Services 的 Journal Database </li></ul><ul><li>輸入型式: </li></ul><ul><ul><li>期刊全名: New England Journal of Medicine </li></ul></ul><ul><ul><li>期刊縮寫: NEJM </li></ul></ul><ul><ul><li>ISSN : 0028-4793 </li></ul></ul><ul><li>Journal Subject Terms 查 詢學科主題期刊 Nursing[st] </li></ul>
    • 13. new england journal of medicine
    • 14.  
    • 15. 關鍵詞或標題檢索 (1) <ul><li>PubMed 具有自動詞彙轉換功能( Automatic Term Mapping ),使用者輸入關鍵詞,系統會根據主題詞表,自動找出相對應的主題詞彙,並同時檢索關鍵詞與主題詞。 </li></ul>
    • 16. MeSH Database <ul><li>Medical Subject Headings ,醫學標題表,簡稱 MeSH 。 </li></ul><ul><li>是 NLM 針對生物醫學資料所整理出的主題詞彙。對同一概念採用固定的詞彙表達方式,以方便生物醫學領域的學者或從業人員彼此間的溝通, MEDLINE 及 PubMed 都是採用 MeSH 做為主題分析的根據 。 </li></ul>
    • 17. Keyword vs. Subject Heading 想找「癌症」相關文章 cancer tumor… Keyword Search Subject Heading Automatic Term Mapping… neoplasms
    • 18. cancer
    • 19. 輸入 cancer ,系統會自動轉譯成上述詞彙進行檢索 &quot;neoplasms&quot;[MeSH Terms] OR &quot;neoplasms&quot;[All Fields] OR &quot;cancer&quot;[All Fields]
    • 20. 關鍵詞或標題檢索 (2) <ul><li>詞彙檢索: single cell vs. “single cell” </li></ul><ul><li>切截:以 * 作為切截符號,如: librar* (library, libraries…) </li></ul><ul><li>多個關鍵詞彙 : chen ds hepatitis b nejm </li></ul><ul><li>運用布林邏輯: AND 、 OR 、 NOT </li></ul><ul><ul><li>例如: bird flu OR avian flu </li></ul></ul><ul><ul><li>兩個以上的運算元時,如果有 ( ) ,則括弧內的先運算: common cold AND (vitamin c OR zinc) </li></ul></ul>
    • 21. 範例 <ul><li>以”腦部腫瘤病患護理”之相關研究為例 </li></ul><ul><li>關鍵詞: brain tumor 、 nursing </li></ul><ul><li>檢索詞: brain tumor AND nursing </li></ul>
    • 22. brain tumor AND nursing
    • 23. 進階檢索 1. 限制檢索 (Limits) 2. 預覽索引檢索 (Preview/Index) 3. 歷史檢索 (History)
    • 24. 限制檢索 (Limits) <ul><li>可依下列條件進行限制檢索,以檢索出最適合的文獻: </li></ul><ul><ul><li>特定欄位名稱,如: author, journal </li></ul></ul><ul><ul><li>全文或摘要 (Full Text or Abstract) </li></ul></ul><ul><ul><li>文獻類型 (Typeof Article ,例: article, review, clinical trial, RCT…) </li></ul></ul><ul><ul><li>研究對象的性別 (Gender) ,年齡 (Ages) </li></ul></ul><ul><ul><li>Publication Date 或 PubMed 收錄的時間 ( Added to PubMed ) </li></ul></ul><ul><ul><li>出版日期 (Publication Date) </li></ul></ul><ul><ul><li>語言 (Languages) </li></ul></ul><ul><ul><li>研究對象 (Humans or Animals) </li></ul></ul>
    • 25.  
    • 26.  
    • 27. 限縮條件: published in the last 1 year, Female, English, Nursing journals 資料筆數 2281430 - >338
    • 28. 預覽 / 索引: 預覽 <ul><li>顯示文獻資料前,預覽檢索結果之筆數。 </li></ul><ul><li>可預覽 最近三次 的檢索結果的筆數,使用者可決定是否要修正檢索策略,如不修正,可從筆數直接連接並顯示檢索結果。 </li></ul><ul><li>可在 Add Term(s) to Query or View Index 輸入詞彙預覽檢索結果。且可利用布林邏輯加入原有的檢索策略進行第二次檢索。 </li></ul>
    • 29. 最近三次的檢索結果
    • 30. taiwan
    • 31.  
    • 32. 預覽 / 索引: 索引 <ul><li>顯示檢索詞彙的索引內容 </li></ul><ul><li>在 Add Term(s) to Query or View Index 輸入檢索詞彙並按下 「 Index 」 選項,查詢結果會依據字母順序排序,列於捲動的視窗中。 </li></ul><ul><li>可利用 AND 、 OR 、 NOT 布林邏輯進行後續的檢索策略。 </li></ul>
    • 33.  
    • 34. 即在下方按照英文字母順序,顯示與 sars 相關的標題詞彙。斜線後面代表副標題,數字表示目前 PubMed 收錄的筆數。
    • 35. 歷史檢索 (History) <ul><li>每次檢索,系統都會產生一個檢索號碼,本區可看到檢索步驟的歷史紀錄。 </li></ul><ul><li>如要運用先前的檢索策略,可直接輸入檢索號碼,並運用布林邏輯加以運算。 </li></ul><ul><li>例如: #2 AND #7 </li></ul><ul><li>可手動清除,若超過 8 小時 未使用 PubMed ,系統會自動消除歷史紀錄。 </li></ul>
    • 36.  
    • 37. #4 AND #6 (chen ds) AND (cancer)
    • 38.  
    • 39. 檢索結果 1. 顯示格式 (Display Formats) 2. 書目狀態 (Citation Status)
    • 40. 檢索結果 顯示格式及功能列表 書目資料 Recent Activity Also try
    • 41. 顯示格式及功能列表 Send to . Text . File . Printer . Clipboard . Collections . E-mail . RSS Feed . Order Sort by . Pub Date . First Author . Last author . Journal . Title 系統預設之 filter 若 publication type 屬 review 類型者列於此
    • 42. 書目資料 (Citation) Article Title Authors Related Articles PubMed 利用程式比較篇名、摘要及 MeSH 主題詞之詞彙,再利用加權演算所得之文章 Status Tag Publication Date Journal Title Abbreviation Volume ( Issue Number) : Page Number Source Free Full Text PMID 文章的身分證號,如需申請館際合作,需提供此項資訊
    • 43. 書目狀態 <ul><li>(1) 文獻書目資料已經過審核 </li></ul><ul><li>MEDLINE </li></ul><ul><ul><li>收錄範圍同本館 Ovid MEDLINE 資料庫 </li></ul></ul><ul><ul><li>收錄年代: 1966 – present </li></ul></ul><ul><ul><li>內容有給 MeSH Term </li></ul></ul><ul><ul><li>會加註 [PubMed - indexed for MEDLINE] </li></ul></ul><ul><li>OLDMEDLINE Citations </li></ul><ul><ul><li>收錄年代: 1950 – 1965 </li></ul></ul><ul><ul><li>內容未給 MeSH Term 且不提供摘要 </li></ul></ul><ul><ul><li>會加註 [PubMed – OLD MEDLINE] </li></ul></ul><ul><li>PubMed not Medline </li></ul><ul><ul><li>非 Medline 收錄的文獻 </li></ul></ul><ul><ul><li>會加註 [PubMed] </li></ul></ul>
    • 44. <ul><li>(2) 文獻書目資料尚未被審核 </li></ul><ul><li>Publisher Supplied </li></ul><ul><ul><li>由出版社提供即時或未出版之書目資料,但並非所有書目資料皆會收錄至 MEDLINE </li></ul></ul><ul><ul><li>會加註 [PubMed - as supplied by publisher] </li></ul></ul><ul><li>In Process Citations </li></ul><ul><ul><li>資料每日增加,但尚未經專業人員處理 </li></ul></ul><ul><ul><li>會加註 [PubMed - in process] </li></ul></ul>書目狀態 ( 續 )
    • 45. 書目資料的儲存 1. 暫存剪貼簿 Clipboard 2. 儲存單次檢索策略 (Details : URL) 3. 儲存檢索結果 (File 、 Collections 、 E-mail 、 RSS)
    • 46. 暫存剪貼簿 Clipboard <ul><li>可將不同檢索策略中所挑選檢索結果暫存於此 (8 小時 ) ,以供儲存或列印之用。 </li></ul><ul><li>最多儲存 500 筆。 </li></ul>1. 點選所需 2. Send to Clipboard
    • 47. Clipboard*
    • 48. 儲存單次檢索策略 (Details) <ul><li>得出檢索結果後,點選” Details” 。 </li></ul><ul><li>按下 URL ,該檢索策略出現在網址列,加入瀏覽器的 Bookmark 。 </li></ul>加到我的最愛 檢索策略
    • 49. 儲存檢索結果 (File 、 Collections 、 E-mail 、 RSS…)
    • 50. 將檢索結果存成文字檔,以便轉入書目軟體加以運用。 Display 格式選” MEDLINE ” , Send to 選 “ File” 。
    • 51. 取得全文 1.PubMed Central 2. 免費電子全文 3. 本館訂購之電子或紙本期刊 4. 其他途徑
    • 52. <ul><li>線上取得全文 </li></ul><ul><ul><li>PubMed Central ( PMC: NIH 於 1999 年推動 PMC 數位圖書館計畫 , 廣邀學術期刊及學會組織參與 , 收錄生命科學相關的電子資源 , 且與 PubMed 期刊論文索引資料庫整合 , 提供全文連結 ) </li></ul></ul><ul><ul><li>免費電子全文 (期刊出版商或代理商提供) </li></ul></ul><ul><ul><li>本館訂購之電子期刊 </li></ul></ul>
    • 53. 若左下方顯示醫圖的 logo ,代表本校有訂購全文,點選該 logo 即可 LinkOut 連結至全文。
    • 54. 其他全文取得途徑 <ul><li>本館館藏目錄 </li></ul><ul><li>( http://tulips.ntu.edu.tw  查詢是否有紙本可複印) </li></ul><ul><li>全國文獻傳遞服務系統 ( http://ndds.stpi.org..tw/ ) </li></ul><ul><ul><li>需先申請帳號密碼 </li></ul></ul><ul><ul><li>需詳細填寫刊名、卷期年份、篇名、作者、 PMID </li></ul></ul><ul><li>西文期刊文獻快遞服務 ( http://jade.lib.ntu.edu.tw/rapid_frontend/index.html ) </li></ul><ul><ul><li>以計中帳號認證 </li></ul></ul>
    • 55. 其他服務 1.MeSH Database 2.Single Citation Matcher 3.Clinical Queries
    • 56. MeSH 的架構與運用 <ul><li>MeSH 共有兩萬多個標題,分為 16 大類 ,以樹狀結構階層方式呈現。每大類細分成若干小類,小類之下又可再細分,最多可細分成 11 個階層,愈下層代表愈狹義。 </li></ul><ul><li>使用者在進行資料庫檢索時,可做為選用正確主題詞彙之參考。 </li></ul><ul><li>使用 MeSH 查詢時,可同時找到相關同義詞的文獻,並可依需要做廣義詞、狹義詞的選擇查詢。 </li></ul>
    • 57. Nose bleed Epistaxis Entry Terms MeSH tree structure Subheadings v
    • 58. &quot;Epistaxis/nursing&quot;[Mesh]
    • 59. Single Citation Matcher 欄位化的檢索方式,可依刊名、出版年 、 卷期頁數、作者、篇名搜尋, 已有書目資料部份或全部欄位時使用 。 nejm Chen DS v
    • 60. Clinical Queries <ul><li>提供臨床病理資料之查詢,使用者可依 Haynes RB 等專家所制定的最佳化檢索策略機制進行檢索,如:治療方式 (therapy) 、診斷方式 (diagnosis) 、病因 (etiology) 、癒後狀況 (prognosis) 或臨床指導 (clinical prediction guides) 。 </li></ul><ul><li>並可選擇檢索係具相關性 (sensitivity) 或精確率高 (specificity) 。 </li></ul>
    • 61. sars Narrow :較普遍之主題,提高精確率以利篩選 Broad :新興主題發表文獻少,找尋範圍需廣 1. 方便臨床醫師快速找出有用資訊 2. 搜尋系統性評讀文獻 3. 有關醫學基因的主題
    • 62. sars[All Fields] AND ( r andomized controlled trial[Publication Type] OR (randomized[Title/Abstract] AND controlled[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract])) RCT(randomizxed controlled trials) : 隨機對照臨床試驗為最高等級證據。 Archie Cochrane 在其著 作中曾提到,要在醫療資源有限情形下,公平運用這些資源 ,並確定介入的醫療行為是否確實有效,應從 RCT 的證據, 來做為判斷的基礎。
    • 63. 在實證醫學中,評讀文獻之產生,是經由系統性文獻 評讀方式 (systematic review, SR) ,將相關疾病之 RCT 研究文獻,以統合分析 (meta-analysis) 整理後,產生綜 合論點。 雖然 RCT 為最高等級證據,但有些因醫學倫理等因素 ,無法應用此研究方法,故將相關文獻予以彙整後, 進行統合分析,更相形重要。 實證醫學也藉由文獻的統合分析 (meta-analysis) 、決策 分析 (decision analysis) ,形成新的醫療決策架構。
    • 64.  
    • 65. 個人化服務 (My NCBI) 1. 註冊、登入 2. 儲存檢索策略或結果 3. 新知通告服務 4. 自訂檢索結果分類群組
    • 66. 註冊、登入
    • 67. My NCBI <ul><li>主要功能: </li></ul><ul><li>My Saved Data </li></ul><ul><li>Search Filters </li></ul><ul><li>Preferences </li></ul>
    • 68. 儲存檢索策略 (Save Search) 2. 完成檢索後,  按 Save Search 儲存策略 1. 登入   My NCBI
    • 69. 儲存檢索策略 & 新知通告服務 可選擇以 email 接收最新之檢索結果
    • 70.  
    • 71. 儲存檢索結果 1. 點選所需 2. Send to Collections
    • 72. Collections 新建 collection 或 附加到既有之 collection
    • 73. Collections
    • 74. Preferences
    • 75. Search Filters 自訂檢索結果分類群組 例如: 1.Clinical Trials 2.Full Text 3.Published in the last 5 years
    • 76.  
    • 77. 數位學習課程 (http://elearning.lib.ntu.edu.tw/)
    • 78. 線上練習 <ul><li>以 tumor 為 keyword 進行檢索,查看 Details ,了解 MeSH 概念;給予限制條件再檢索( Limits : full text, dates… ) </li></ul><ul><li>比較 single cell 與” single cell” 檢索結果的差異 </li></ul><ul><li>查詢 JAMA 這本期刊的詳細資料及最新收錄 </li></ul><ul><li>查看 history ,如何運用 AND 、 OR 去 combine search </li></ul><ul><li>以 PMID12395312 查詢,取得全文連結 </li></ul><ul><li>將檢索策略設為我的最愛( Details-URL- 加入 bookmark ) </li></ul><ul><li>將檢索結果存成可以匯入 EndNote 的文字檔( display 格式選 MEDLINE ,再 send to File ) </li></ul><ul><li>send to Clipboard 暫存,按 Clipboard* 取出,再 send to Collections( 須先註冊 My NCBI) </li></ul>
    • 79. 感謝您的聆聽! 若有任何問題,歡迎請洽臺大醫圖 院內分機: 62208 或電話: 23562208

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