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ENZIMAS
Las enzimas son proteínas
 Catalizan reacciones químicas necesarias
para la sobrevivencia celular
 Sin las enzimas los procesos biológicos
serían tan lentos que las células no podrían
existir.
 Las enzimas pueden actuar dentro de la
célula , fuera de ésta, y en el tubo de ensayo.
E + S ESEP  E + P
E E E E
La enzima disminuye la energía de
activación
Tiempo de la reacción
E + S
E + P
Sin enzima
Con enzima
• La Ea de la hidrólisis de la urea
baja de 30 a 11 kcal/mol con la
acción de las enzimas, acelerando
la reacción 1014 x
• El aumento de temperatura
necesario para producir la reacción
no catalizada seria de 529ºC
Enzima - Catalizador
 Tanto la enzima como el catalizador
aceleran la velocidad de una reacción
química.
 Una enzima puede transformar 1000
moléculas de sustrato/ segundo
 Las enzimas tienen 3 propiedades que los
catalizadores NO tienen
• Especificidad por el sustrato
• Se inactivan por desnaturación
• Pueden ser reguladas
 Las enzimas se unen a los reactivos
(sustratos) reduciendo la energía de
activación
 Cada enzima tiene una forma única
con un sitio o centro activo en el que
se une al sustrato
 Después de la reacción, enzimas y
productos se separan.
 Las moléculas enzimáticas no han
cambiado después de participar en la
reacción
Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a:
• Fijación estereoquímicamente complementaria
del substrato
• Transformación catalítica del mismo
En ambas funciones participan:
• Cadenas laterales de los aminoácidos
• Grupos o moléculas no proteicas:
 Grupos prostéticos
 Iones metálicos
 Cofactores
Los siguientes hechos:
 Especificidad de la reacción enzimática
 Carácter heterogéneo de la catálisis enzimática
Nos llevan a postular la existencia de un Centro
Activo en la molécula de enzima, capaz de:
 Fijar específicamente al substrato
 Transformarlo catalíticamente.
Enzima
Sitio activo
Sustrato
 Complementariedad geométrica
 Complementariedad de cargas, uniones
iónicas
 Modelos:
 Encaje inducido
 Llave – cerradura.
 Estado de transición
La unión del sustrato es muy
específica
Teorías de la acción enzimática, 1
Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)
Substrato y enzima se acoplan de forma estereospecífica,
de la misma manera que una llave se ajusta a su
cerradura.
Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se
considera insuficiente al no explicar algunos fenómenos
de la inhibición enzimática
Teorías de la acción enzimática, 2
Modelo de Ajuste Inducido (Koshland)
Tanto la enzima como el substrato sufren una alteración
en su estructura por el hecho físico de la unión.
Está mucho más de acuerdo con todos los datos
experimentales conocidos hasta el momento.
Teorías de la acción enzimática, 3
La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad
definiendo la acción enzimática como
Estabilización del Estado de Transición
Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en realidad
complementario no al substrato o al producto, sino al
estado de transición entre ambos.
Una enzima puede unir dos sustratos
en su sitio activo
Clasificación y
nomenclatura de enzimas
EC 2.7.1.1
Número Enzyme Commission:
Enzyme
Comission
Grupo Subgrupo
Nombre común (sustrato+”asa”): Hexokinasa
Clasificación y nomenclatura
ATP: hexosa fosfotransferasa
Nombre sistemático:
Donador Aceptor
Grupo transferido
Tipo de reacción catalizada
Grupos
químicos
Enzimas
EC 1.x  Oxidorreductasas
EC 2.x  Transferasas
EC 3.x  Hidrolasas
EC 4.x  Liasas
EC 5.x  Isomerasas
EC 6.x  Ligasas
Clasificación de enzimas por Grupos
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de
oxigeno ó hidrogeno son trasladados entre moléculas:
En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a
la vez el aceptor y el dador electrónico.
AH2 + B A + BH2
Clasificación y nomenclatura
Ared + Box Aox + Bred
Nombre: Dador:Aceptor oxidorreductasa
Nombre común:
Glucosa oxidasa
b-D-Glucosa : O2 1-oxidorreductasa
Dador Aceptor
EC 1.1.3.4
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas:
EC 1.1.x - Deshidrogenasas
EC 1.2.x - Oxidasas
EC 1.3.x - Peroxidasas
EC 1.4.x - Oxigenasas
EC 1.5.x - Hidroxilasas
EC 1.6.x - Reductasas
etc.
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa
Deslignificación ó Bioblanqueamiento
A-X + B A + B-X
Grupo 2: Transferasas
Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó
grupo de átomos entre moléculas:
Dador: Aceptor Grupo transferido - transferasa
ATP: D-Hexosa Fosfotransferasa EC 2.7.1.1
Nombre común: hexokinasa
Clasificación y nomenclatura
Clasificación de subgrupo de las transferasas:
EC 2.1.x - Grupos monocarbonados
EC 2.2.x - Grupos aldehido o ceto
EC 2.3.x - Aciltransferasas
EC 2.4.x - Glicosiltransferasas
EC 2.5.x - Alquil- o Ariltransferasas
EC 2.6.x - Grupos nitrogenados
EC 2.7.x - Grupos fosfato
EC 2.8.x - Grupos sulfato
EC 2.9.x - Grupos selenio
Clasificación y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Aplicaciones: Síntesis de oligosacáridos
Grupo 3: Hidrolasas
Catalizan reacciones de hidrólisis y también su reverso. Son
las más comunes en el dominio de la tecnología enzimática:
A-B + H2O A-OH + H-B
No se suelen utilizar nombres sistemáticos en las
hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre
Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3.4.23.4.
Clasificación y nomenclatura
Clasificación de las hidrolasas:
3.1.-.- Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas)
3.2.-.- Glicosidasas
3.3.-.- Éter hidrolasas
3.4.-.- Péptido hidrolasas
3.5.-.- Acil anhídrido hidrolasas
etc.
Grupo 3: Hidrolasas
Clasificación y nomenclatura
Aplicaciones: Lipasas → Síntesis de tensioactivos
Proteasas → Fabrico de quesos
Glicosidasas → Clarificación de jugos; liberación de aromas en los
vinos; aplicaciones textiles
Caso particular  Péptido hidrolasas: clasificación común (no
sistemática)
I. Según la situación del enlace atacado:
- Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas)
- Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas)
II. Según el mecanismo catalítico:
- Serin proteinasas
- Tiol proteinasas
- Aspartil proteinasas
- Metaloproteinasas
Grupo 3: Hidrolasas
Clasificación y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Catalizan reacciones reversibles de remoción de grupo de
átomos del sustrato (este grupo no incluye las hidrolasas):
A-B A + B
Clasificación y nomenclatura
Ejemplo
Nombre sistemático:
Histidina amonio-liasa (EC 4.3.1.3)
Nombre común:
Histidasa
Clasificación de las liasas:
4.1.x - Actúan sobre enlaces C-C
4.2.x - Actúan sobre enlaces C-O
4.3.x - Actúan sobre enlaces C-N
4.4.x - Actúan sobre enlaces C-S
4.5.x - Actúan sobre enlaces C-Haluro (S-, Cl-, Br-, I- At-)
4.6.x - Actúan sobre enlaces P-O
4.99.x - Otras liases
Clasificación y nomenclatura
Aplicaciones: Pectato liasa – Remueve los compuestos indeseables (ceras,
pectinas, proteínas) en fibras en la industria textil – “bioscouring”
Grupo 4: Liasas
Grupo 5: Isomerasas
Catalizan reacciones de isomerización moleculares
Clasificación y nomenclatura
A B
Ejemplo:
Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5)
5.1.x - Rasemasas y Epimerasas
5.2.x - cis-Trans-Isomerasas
5.3.x - Oxidoreductasas Intramolecular
5.4.x - Transferasas Intramoleculares (mutases)
5.5.x - Liasas Intramoleculares
5.99.x - Otras Isomerasas
Grupo 5: Isomerasas
Clasificación y nomenclatura
Clasificación de las isomerasas:
Grupo 6: Ligasas
Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas
de la hidrólisis de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.).
A + B + ATP A-B + ADP + Pi
Clasificación y nomenclatura
Ejemplo: Glutationa sintasa (EC 6.2.2.3)
Nombre sistémico:
G-L-glutamilo-L-cisteina:glicina ligase
Grupo 6: Ligasas
Clasificación y nomenclatura
Clasificación de las ligasas:
6.1.x - Forman enlaces C-O
6.2.x - Forman enlaces C-S
6.3.x - Forman enlaces C-N
6.4.x - Forman enlaces C-C
6.5.x - Forman enlaces ésteres fosfóricos
6.6.x - Actúan sobre enlaces N-metal
Cinética Enzimática
Cinética Enzimática
 La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto
de cada uno de los factores que intervienen en la actividad
enzimática, que se evalúa a través de la velocidad de la
reacción catalizada.
 Las variables más importantes son:
• Concentración de enzima, sustratos y productos
(incluyendo inhibidores y/o activadores)
• pH
• Temperatura
 Ella está basada en la medición de la velocidad de reacción. Así en la reacción:
 Se tendrá:
 Como se observa en la figura, la velocidad de reacción (pendiente) disminuye
continuamente a partir de un valor máximo inicial. Esto se puede deber a:
 Desaturación de la enzima con sustrato, por disminución de la
concentración del sustrato
 Inactivación de la enzima por su inherente inestabilidad
 Inhibición por el producto
 Desplazamiento del equilibrio, si la reacción es reversible
dt
ds
dt
dp
v 


E
S P
Baja
concentración
de sustrato
ALTA
concentración
de sustrato
SATURACION
v
[s]
Efecto de la concentración de substrato
.
.
.
. . . . .
dt
t
s
p
[ ]
Concepto de velocidad inicial
d[P]
v = , t 0
E + S ES E + P
k+1
k-1
k+2
Una cinética hiperbólica implica un proceso saturante:
Hay un número limitado de sitios en la enzima
para fijar substrato; una vez que están ocupados
todos, por mucho que aumente la concentración
de substrato, la velocidad permanecerá constante
tendiendo a un valor asintótico
El sistema de ecuaciones diferenciales que describe la dinámica
del sistema
E + S ES E + P
k+1
k-1
k+2
Sistema No admite solución analítica.
- Simulaciones numéricas
- Hipótesis que lo simplifiquen
Hipótesis de Michaelis - Menten
E + S ES E + P
k+1
k-1
k+2
- La primera parte del mecanismo,
E + S ES
k+1
k-1
Tiene lugar mucho más rápidamente que la segunda:
ES E + P
k+2
  
 
 
K
E S
ES
es
x
e x s
x
m   

0
x
e s
K s
m


0
v
k e s
K s
m


2 0
k e V
 
2 0 max
v
V s
K s
m


max
Hipótesis de
Michaelis-Menten
Equilibrio rápido
v k x
 2
Hipótesis de estado estacionario
Según veíamos en la simulación numérica, hay un tiempo
relativamente prolongado en el curso de la reacción en el
que la variación de complejo [ES] es prácticamente igual
a cero:
dx/dt = k+1es - (k-1 + k+2) x = 0
A partir de esta expresión podemos llegar a obtener una
expresión que nos da la velocidad para la concentración
de substrato
 
dx
dt
k es k k x
   
  
0 1 1 2
   
k es k e x s k k x
   
   
1 1 0 1 2
x
e s
k k
k
s
e s
K s
m





 

0
1 2
1
0
v
V s
K s
m


max
v k x
 2
k e V
 
2 0 max
Hipótesis de
estado estacionario
A partir de las suposiciones de Michaelis-Menten y
Estado estacionario, llegamos a la ecuación
Km + s
v =
Vmax * s
La única diferencia radica en el significado de Km:
Km = k-1/k+1 en mecanismo de M.M.
Km = (k-1 + k+2)/k+1 en mecanismo de E.E.
Significado de la constante Km
1. Constante de equilibrio de disociación del complejo ES
(en condiciones de equilibrio rápido)
2. Medida inversa de la afinidad de la enzima por el substrato
(en condiciones de equilibrio rápido)
3. Mide la función de fijación (en cond.de equilibrio rápido)
4. Concentración de substrato para la que la velocidad se hace
igual a la mitad de la máxima (s0.5)
5. Se define para una pareja enzima-substrato
6. Se mide en unidades de concentración
Significado de la constante Vmax = k+2 e0
1. Velocidad asintótica para s
2. Directamente proporcional a la concentración de
enzima (hoy se prefiere caracterizar a la enzima
por k+2)
3. Mide función de transformación catalítica
4. Se expresa en unidades de velocidad
Relación entre Km y Vmax
Michaelis y Menten
Concentración de Sustrato [S]
Velocidad
de
la
reacción
(v)
Km
Vmax
Vmax/2
La Km es la concentración de sustrato
donde se obtiene la mitad de la Vmax
Concentración de Sustrato [S]
Velocidad
de
la
reacción
(v)
Km
Vmax
Vmax/2
A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato
A menor Km mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato
Representación directa
s
0 20 40 60 80 100
v
0
20
40
60
80
100
Km
Vmax
v
V s
K s
mx
m


Representación recíproca doble
(Lineweaver - Burk)
1/s
-0.4 -0.2 0.0 0.2 0.4 0.6
1/v
0.00
0.01
0.02
0.03
0.04
1 1 1
v
K
V s V
m
mx mx
  
-1/Km
1/Vmax
Representación Lineweaver-Burke
Representación s -s/v
(Eadie - Hofstee)
s
-20 0 20 40 60 80 100 120
s/v
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
1.2
s
v V
s
K
V
mx
m
mx
  
1
-Km
Representación Hanes
Representación v/s - v
(Wong - Hanes)
v/s
0 2 4 6 8 10 12 14 16
v
0
20
40
60
80
100
v K
v
s
V
m mx
   
Vmax
Representación de Eadie-Hofstee
Métodos de linealización para determinación
parámetros cinéticos
Método Eje Y Eje X Intercepto
Eje Y
Intercepto
Eje x
Pendiente
Lineweaver-
Burke
1/v 1/s 1/V -1/K K/V
Hanes s/v s K/V -K 1/V
Eadie-
Hofstee
v v/s V V/K -K
Definición Actividad Enzimática
 Es el número de moles de sustrato que
reaccionan para formar producto, por mol de
enzima y por unidad de tiempo. Esto supone
que la enzima está plenamente saturada con
sustrato y por tanto que la reacción se efectúa
con su máxima rapidez
 El índice de recambio muestra la eficiencia
impresionante de la catálisis enzimática
 A fin de normalizar la medición de la actividad, se ocupa el valor de
la velocidad inicial de reacción, donde eses factores son
despreciables. Así,
 Esta velocidad inicial no se espera que sea observada en un proceso
enzimático donde, debido a los elevados tiempos de operación, es
razonable suponer que esos factores ejercerán su influencia.
0
0
0


 















t
t
t
dt
ds
dt
dp
v
a
Cálculo de Actividad Enzimática
 La velocidad de reacción catalizada por 0,1ml
de una dilución 1:100 de Fosfatasa Alcalina es
0,3umoles / min. de producto. ¿Cuál es su
actividad enzimática?
 0,1ml-------- 0,3umoles producto / min.
1,0ml------------3,0umoles producto / min.
dil 1:100-------------300umoles producto / min.
Respuesta: 300U/ml
Número o Índice de Recambio
 Es útil definir una constante de velocidad más
general, k cat , para describir la velocidad
limitante de cualquier reacción enzimática a
saturación
 kcat x Et= Vmáx
 V0 = k cat x Et x [S] / KM + [S];
 Kcat es una constante de velocidad de 1er
orden con unidades de tiempo-1, también
llamada Número de Recambio
Efecto del pH en la ENZIMA
Cada enzima tiene un pH óptimo para su actividad
El pH afecta las interacciones iónicas
1. Sobre la fijación del substrato al centro activo:
- Grupos disociables de la enzima
- Grupos disociables del substrato
2. Sobre la transformación catalítica del substrato
3. Sobre la estructura de la proteína enzimática
Efecto del pH
En el efecto de la temperatura hay dos componentes:
1. Aceleración de la reacción según la ecuación
de Arrhenius
k = A exp (-Ea/RT)
2. Desnaturalización térmica de la proteína
Efecto de la temperatura en la ENZIMA
Cada enzima tiene una temperatura óptima.
Temperatura
15º 40º 75º
Aumento de la
velocidad
Desnaturación
por calor
ORGANISMOS TERMÓFILOS
 Son organismos que viven a altas tº y realizan
sus reacciones enzimáticas a estas altas tº
 Ejemplos son los que viven en las aguas
termales
 Es tema de investigación el aislamiento de las
enzimas de estos organismos para desarrollar
procesos industriales en condiciones más
extremas
Coenzimas
 Las coenzimas son pequeñas moléculas
orgánicas, que se unen a la enzima.
 Las coenzimas colaboran en la reacción
enzimática recibiendo transitoriamente
algún grupo químico: H+ , OH, CH3 .
 La enzima sin la coenzima recibe el nombre
de APOENZIMA
El NAD es una coenzima aceptora de H
Sustrato
oxidado
Algunas enzimas requieren metales para
mejorar su actividad
Isoenzimas o Isozimas
 Son formas moleculares diferentes de una
misma enzima
 Catalizan la misma reacción
 Ejemplo: Lactato deshidrogenasa
 Lactato + NAD ==== Piruvato + NADH
 M4, M3H1, M2H2, M1H3 y H4
 Se diferencian por su movilidad electroforética
 Usadas en clínica: sueros normales y sueros
con alguna patología
 Así esta actividad corresponde al máximo potencial
catalítico que las enzimas poseen para un determinado
conjunto de condiciones ambientales. Luego, estas
deben ser consideradas en las expresiones matemáticas
representativas del proceso enzimático.
 Existen situaciones (sustratos heterogéneos) donde la
velocidad inicial de reacción no es representativa del real
potencial catalítico de la enzima.
 Se asume que la velocidad inicial de reacción es
proporcional a la concentración de proteína enzimática.
Inhibición enzimática
Inhibidor:
Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de
interacciones con el centro activo u otros centros específicos
(alostéricos).
Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a
la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática
De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores:
I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo
II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la
molécula, causando un cambio conformacional con
repercusión negativa en la actividad enzimática.
Inhibición enzimática
isostérica
Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos:
1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre,
con el complejo enzima-substrato o con ambos:
E + I EI
2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima:
E + I E’
ES + I ESI
Inhibición reversible
(a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre,
impidiendo la fijación del substrato: Inhibición Competitiva
(b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo
haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la
fijación del substrato a la enzima, pero sí impide la acción
catalítica: Inhibición No Competitiva
(c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato
una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo
se conoce como Inhibición Anticompetitiva
Inhibición Competitiva
Inhibidores Competitivos
 Compiten con el sustrato por el sitio
activo de la enzima
 Se une solo a la enzima libre
 V máx no se altera y K M cambia
Inhibición competitiva
Al aumentar la cantidad
de SUSTRATO el
inhibidor competitivo es
desplazado y se forma
producto
E ES
EI
I
S
E + P
Características:
- Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas
- A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibición
- Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del
substrato.
- El inhibidor es tan específico como el substrato
Se define una constante de
equilibrio de disociación del
inhibidor:
Ki =
[E] [I]
[EI]
En condiciones de equilibrio rápido, llamando y a la concentración
del complejo EI, para la inhibición competitiva obtenemos el siste-
ma de ecuaciones
v
V s
K
i
K
s
mx
m
i







 
1
K
e x y s
x
K
e x y i
y
m
i

 

 
( )
( )
0
0
Que resuelto para x nos da
x
e s
K
i
K
s
m
i







 
0
1
De donde
Por tanto, en la inhibición competitiva,
1. El efecto cinético del inhibidor es el aumento aparente de la
Km, que aparece multiplicada por el factor (1 + i/Ki)
2. La Vmax no aparece modificada; para concentraciones muy
altas del substrato, v = Vmax, igual que en ausencia de inhibidor
3. Cuanto más pequeño sea el valor de Ki mayor será la potencia
del inhibidor competitivo.
Km
Sin
inhibidor
Km
con
inhibidor
Sin inhibidor
Con inhibidor
El inhibidor competitivo
aumenta la Km
1/s
-0.3 -0.2 -0.1 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6
1/v
0.00
0.01
0.02
0.03
0.04
0.05
0.06
0.07
-1/Km
-1/(Km(1 + i/Ki))
1/Vmax
Inhibición competitiva - Representación recíproca doble
Ejemplo Inhibidor Competitivo
 Ácido succínico + FAD == ácido
fumárico + FADH2
 El inhibidor competitivo es el ácido
malónico
 Es un análogo estructuralmente
parecido al ácido succínico
Ácido Fólico y Sulfanilamida
 La sulfanilamida es un análogo estructural
del ácido p - aminobenzoico (PABA)
 PABA es el punto de partida para la síntesis
de ácido fólico en las bacterias
 El ácido fólico es una vitamina esencial para
la proliferación (división) bacteriana
 Sulfanilamida se usa en el tratamiento
algunas infecciones
Metotrexato y Dihidrofolato
 El ácido fólico en sus formas de dihidro y
tetrahidrofolato es coenzima de la reacción
catalizada por la dihidrofolato reductasa
 Esta reacción es parte del metabolismo de
los nucleótidos para la síntesis de DNA
 Metotrexato se usa en la terapia de algunos
cánceres, inhibiendo la síntesis de DNA
Inhibidor competitivo
su estructura es similar a la del sustrato
No se forma producto
Inhibición No Competitiva
Inhibidor No Competitivo
 Se une a un lugar diferente del sitio
activo la enzima
 Se une a la enzima libre y también al
complejo enzima-sustrato
 Por acción del inhibidor disminuye la Vm
pero el valor de Km no se altera
Inhibición NO competitiva
Inhibidor NO competitivo
El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un
sitio diferente del sitio activo
E ES
EI
I
S
E + P
I
ESI
S
Inhibición
No Competitiva
El inhibidor se fija indistintamente a la enzima libre E
y al complejo enzima-substrato ES; ni el complejo EI
ni el complejo ESI son productivos
Inhibición
Anticompetitiva o
Incompetitiva
Inhibidor Incompetitivo
En este tipo de inhibición el inhibidor se enlaza al centro
activo pero solo después de que el sustrato lo haya hecho y,
por tanto, inhibidor y sustrato no compiten. De esta manera,
aunque todo el sustrato esté saturando la enzima y toda la
enzima esté como complejo ES, el inhibidor puede
enlazarse produciendo un complejo inactivo ESI.
Como I solo se une a ES estimula la formación de ES y, por
tanto, incrementa la unión del sustrato a la enzima,
disminuyendo Km . Sin embargo, el complejo ESI no
conduce a productos y Vm disminuye.
Inhibidor Incompetitivo
 Se une a un lugar diferente del sitio
activo de la enzima
 Se une sólo al complejo enzima-sustrato
 Los efectos que tiene: disminuye el valor
de Km y también el de Vmáx
E ES
S
E + P
I
ESI
Inhibición
Anticompetitiva
El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES;
el complejo ESI no es productivo
Modelo Kap Vap
Inh comp Km(1+i/Ki) Vm
Inh no comp total Km Vm/(1+i/Ki)
Inh anticomp Km/(1+i/Ki) Vm/(1+i/Ki)
Determinación de parámetros cinéticos de
inhibición
Inhibición Irreversible
- Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo
químico de la enzima, modificándola covalentemente
- Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki,
sino por una constante de velocidad ki:
E + I E’
- A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los
inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuación
del inhibidor.
- Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente
tóxicos.
Inhibidores Irreversibles
 Producen inactivación permanente de la
actividad enzimática
 Se interfiere con el normal desarrollo de
una reacción o vía metabólica
 Ejemplos: p-cloromercuribenzoato,
yodoacetato, diisopropilfluorfosfato
Algunos tipos de inhibidores irreversibles
1. Reactivos de grupos -SH
2. Organofosfóricos
3. Ligandos de metales
4. Metales pesados
Inhibición enzimática
alosterica
Enzimas Alostéricas
 Son enzimas cuya estructura proteica está formada
de varias subunidades
 No se rigen por la cinética de M - M
 Además del sitio o centro activo tienen sitios
alostéricos o de regulación
 Sitio activo/sustratos;
 Sitio alostérico/moduladores o reguladores
 La relación entre la velocidad de reacción y la
concentración de sustrato sigue cinética sigmoídea
Enzimas alostéricas
 Las enzimas alostéricas
presentan estructura
cuaternaria.
 Tienen diferentes sitios
activos, unen mas de una
molécula de sustrato
 La unión del sustrato es
cooperativa
 la curva de velocidad
presenta una forma
sigmoidal
Concepto de Cooperatividad
 La unión de los sustratos al sitio activo de
una subunidad produce un cambio
conformacional que por contacto físico se
transmite a las subunidades vecinas,
facilitando las interacciones
 Modelos de unión: secuencial y concertado
 Ejemplos: unión Hb-O2, enzimas alostéricas
y sus sustratos
Moduladores Alostéricos
 También reciben el nombre de efectores
y pueden ser positivos o negativos
 Se unen al sitio alostérico que puede
estar en la misma subunidad que tiene
al sitio activo o en las subunidades
regulatorias
 Su unión produce un cambio
conformacional que afecta al sitio activo
Aspartato Transcarbamilasa
 Ác L-asp + Carbamil-P === Carbamil-
asp + Pi . Primera reacción en la síntesis
de pirimidinas
 Efector positivo: CTP
Efector negativo: ATP
 Tiene dos subunidades catalíticas para
los sustratos y tres subunidades
regulatorias para los efectores
RESUMEN
 Las enzimas son proteínas que catalizan
las reacciones biológicas
 Presentan especificidad por su sustrato
 Cada enzima presenta dos parámetros
importantes Vmax (saturación de la
enzima) y la Km (medida de la afinidad
por el sustrato)
RESUMEN
 La actividad enzimática puede ser
inhibida, por inhibidores competitivos
(similares al sustrato) o por inhibidores
no competitivos.
 La temperatura y el pH afectan a la
enzima en su actividad catalítica.
 Algunas enzimas requieren de
coenzimas y/o cofactores para su
actividad.
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  • 2. Las enzimas son proteínas  Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia celular  Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las células no podrían existir.  Las enzimas pueden actuar dentro de la célula , fuera de ésta, y en el tubo de ensayo. E + S ESEP  E + P E E E E
  • 3. La enzima disminuye la energía de activación Tiempo de la reacción E + S E + P Sin enzima Con enzima • La Ea de la hidrólisis de la urea baja de 30 a 11 kcal/mol con la acción de las enzimas, acelerando la reacción 1014 x • El aumento de temperatura necesario para producir la reacción no catalizada seria de 529ºC
  • 4. Enzima - Catalizador  Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una reacción química.  Una enzima puede transformar 1000 moléculas de sustrato/ segundo  Las enzimas tienen 3 propiedades que los catalizadores NO tienen • Especificidad por el sustrato • Se inactivan por desnaturación • Pueden ser reguladas
  • 5.
  • 6.  Las enzimas se unen a los reactivos (sustratos) reduciendo la energía de activación  Cada enzima tiene una forma única con un sitio o centro activo en el que se une al sustrato  Después de la reacción, enzimas y productos se separan.  Las moléculas enzimáticas no han cambiado después de participar en la reacción
  • 7. Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a: • Fijación estereoquímicamente complementaria del substrato • Transformación catalítica del mismo En ambas funciones participan: • Cadenas laterales de los aminoácidos • Grupos o moléculas no proteicas:  Grupos prostéticos  Iones metálicos  Cofactores
  • 8. Los siguientes hechos:  Especificidad de la reacción enzimática  Carácter heterogéneo de la catálisis enzimática Nos llevan a postular la existencia de un Centro Activo en la molécula de enzima, capaz de:  Fijar específicamente al substrato  Transformarlo catalíticamente.
  • 10.  Complementariedad geométrica  Complementariedad de cargas, uniones iónicas  Modelos:  Encaje inducido  Llave – cerradura.  Estado de transición La unión del sustrato es muy específica
  • 11. Teorías de la acción enzimática, 1 Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer) Substrato y enzima se acoplan de forma estereospecífica, de la misma manera que una llave se ajusta a su cerradura. Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se considera insuficiente al no explicar algunos fenómenos de la inhibición enzimática
  • 12. Teorías de la acción enzimática, 2 Modelo de Ajuste Inducido (Koshland) Tanto la enzima como el substrato sufren una alteración en su estructura por el hecho físico de la unión. Está mucho más de acuerdo con todos los datos experimentales conocidos hasta el momento.
  • 13. Teorías de la acción enzimática, 3 La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad definiendo la acción enzimática como Estabilización del Estado de Transición Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en realidad complementario no al substrato o al producto, sino al estado de transición entre ambos.
  • 14. Una enzima puede unir dos sustratos en su sitio activo
  • 16. EC 2.7.1.1 Número Enzyme Commission: Enzyme Comission Grupo Subgrupo Nombre común (sustrato+”asa”): Hexokinasa Clasificación y nomenclatura ATP: hexosa fosfotransferasa Nombre sistemático: Donador Aceptor Grupo transferido Tipo de reacción catalizada Grupos químicos Enzimas
  • 17. EC 1.x  Oxidorreductasas EC 2.x  Transferasas EC 3.x  Hidrolasas EC 4.x  Liasas EC 5.x  Isomerasas EC 6.x  Ligasas Clasificación de enzimas por Grupos Clasificación y nomenclatura
  • 18. Grupo 1: Oxidorreductasas Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de oxigeno ó hidrogeno son trasladados entre moléculas: En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a la vez el aceptor y el dador electrónico. AH2 + B A + BH2 Clasificación y nomenclatura Ared + Box Aox + Bred
  • 19. Nombre: Dador:Aceptor oxidorreductasa Nombre común: Glucosa oxidasa b-D-Glucosa : O2 1-oxidorreductasa Dador Aceptor EC 1.1.3.4 Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas
  • 20. Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas: EC 1.1.x - Deshidrogenasas EC 1.2.x - Oxidasas EC 1.3.x - Peroxidasas EC 1.4.x - Oxigenasas EC 1.5.x - Hidroxilasas EC 1.6.x - Reductasas etc. Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa Deslignificación ó Bioblanqueamiento
  • 21. A-X + B A + B-X Grupo 2: Transferasas Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó grupo de átomos entre moléculas: Dador: Aceptor Grupo transferido - transferasa ATP: D-Hexosa Fosfotransferasa EC 2.7.1.1 Nombre común: hexokinasa Clasificación y nomenclatura
  • 22. Clasificación de subgrupo de las transferasas: EC 2.1.x - Grupos monocarbonados EC 2.2.x - Grupos aldehido o ceto EC 2.3.x - Aciltransferasas EC 2.4.x - Glicosiltransferasas EC 2.5.x - Alquil- o Ariltransferasas EC 2.6.x - Grupos nitrogenados EC 2.7.x - Grupos fosfato EC 2.8.x - Grupos sulfato EC 2.9.x - Grupos selenio Clasificación y nomenclatura Grupo 2: Transferasas Aplicaciones: Síntesis de oligosacáridos
  • 23. Grupo 3: Hidrolasas Catalizan reacciones de hidrólisis y también su reverso. Son las más comunes en el dominio de la tecnología enzimática: A-B + H2O A-OH + H-B No se suelen utilizar nombres sistemáticos en las hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3.4.23.4. Clasificación y nomenclatura
  • 24. Clasificación de las hidrolasas: 3.1.-.- Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas) 3.2.-.- Glicosidasas 3.3.-.- Éter hidrolasas 3.4.-.- Péptido hidrolasas 3.5.-.- Acil anhídrido hidrolasas etc. Grupo 3: Hidrolasas Clasificación y nomenclatura Aplicaciones: Lipasas → Síntesis de tensioactivos Proteasas → Fabrico de quesos Glicosidasas → Clarificación de jugos; liberación de aromas en los vinos; aplicaciones textiles
  • 25. Caso particular  Péptido hidrolasas: clasificación común (no sistemática) I. Según la situación del enlace atacado: - Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas) - Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas) II. Según el mecanismo catalítico: - Serin proteinasas - Tiol proteinasas - Aspartil proteinasas - Metaloproteinasas Grupo 3: Hidrolasas Clasificación y nomenclatura
  • 26. Grupo 4: Liasas Catalizan reacciones reversibles de remoción de grupo de átomos del sustrato (este grupo no incluye las hidrolasas): A-B A + B Clasificación y nomenclatura Ejemplo Nombre sistemático: Histidina amonio-liasa (EC 4.3.1.3) Nombre común: Histidasa
  • 27. Clasificación de las liasas: 4.1.x - Actúan sobre enlaces C-C 4.2.x - Actúan sobre enlaces C-O 4.3.x - Actúan sobre enlaces C-N 4.4.x - Actúan sobre enlaces C-S 4.5.x - Actúan sobre enlaces C-Haluro (S-, Cl-, Br-, I- At-) 4.6.x - Actúan sobre enlaces P-O 4.99.x - Otras liases Clasificación y nomenclatura Aplicaciones: Pectato liasa – Remueve los compuestos indeseables (ceras, pectinas, proteínas) en fibras en la industria textil – “bioscouring” Grupo 4: Liasas
  • 28. Grupo 5: Isomerasas Catalizan reacciones de isomerización moleculares Clasificación y nomenclatura A B Ejemplo: Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5)
  • 29. 5.1.x - Rasemasas y Epimerasas 5.2.x - cis-Trans-Isomerasas 5.3.x - Oxidoreductasas Intramolecular 5.4.x - Transferasas Intramoleculares (mutases) 5.5.x - Liasas Intramoleculares 5.99.x - Otras Isomerasas Grupo 5: Isomerasas Clasificación y nomenclatura Clasificación de las isomerasas:
  • 30. Grupo 6: Ligasas Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas de la hidrólisis de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.). A + B + ATP A-B + ADP + Pi Clasificación y nomenclatura Ejemplo: Glutationa sintasa (EC 6.2.2.3) Nombre sistémico: G-L-glutamilo-L-cisteina:glicina ligase
  • 31. Grupo 6: Ligasas Clasificación y nomenclatura Clasificación de las ligasas: 6.1.x - Forman enlaces C-O 6.2.x - Forman enlaces C-S 6.3.x - Forman enlaces C-N 6.4.x - Forman enlaces C-C 6.5.x - Forman enlaces ésteres fosfóricos 6.6.x - Actúan sobre enlaces N-metal
  • 33. Cinética Enzimática  La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto de cada uno de los factores que intervienen en la actividad enzimática, que se evalúa a través de la velocidad de la reacción catalizada.  Las variables más importantes son: • Concentración de enzima, sustratos y productos (incluyendo inhibidores y/o activadores) • pH • Temperatura
  • 34.  Ella está basada en la medición de la velocidad de reacción. Así en la reacción:  Se tendrá:  Como se observa en la figura, la velocidad de reacción (pendiente) disminuye continuamente a partir de un valor máximo inicial. Esto se puede deber a:  Desaturación de la enzima con sustrato, por disminución de la concentración del sustrato  Inactivación de la enzima por su inherente inestabilidad  Inhibición por el producto  Desplazamiento del equilibrio, si la reacción es reversible dt ds dt dp v    E S P
  • 36. v [s] Efecto de la concentración de substrato . . . . . . . .
  • 37. dt t s p [ ] Concepto de velocidad inicial d[P] v = , t 0
  • 38. E + S ES E + P k+1 k-1 k+2 Una cinética hiperbólica implica un proceso saturante: Hay un número limitado de sitios en la enzima para fijar substrato; una vez que están ocupados todos, por mucho que aumente la concentración de substrato, la velocidad permanecerá constante tendiendo a un valor asintótico
  • 39. El sistema de ecuaciones diferenciales que describe la dinámica del sistema E + S ES E + P k+1 k-1 k+2 Sistema No admite solución analítica. - Simulaciones numéricas - Hipótesis que lo simplifiquen
  • 40. Hipótesis de Michaelis - Menten E + S ES E + P k+1 k-1 k+2 - La primera parte del mecanismo, E + S ES k+1 k-1 Tiene lugar mucho más rápidamente que la segunda: ES E + P k+2
  • 41.        K E S ES es x e x s x m     0 x e s K s m   0 v k e s K s m   2 0 k e V   2 0 max v V s K s m   max Hipótesis de Michaelis-Menten Equilibrio rápido v k x  2
  • 42. Hipótesis de estado estacionario Según veíamos en la simulación numérica, hay un tiempo relativamente prolongado en el curso de la reacción en el que la variación de complejo [ES] es prácticamente igual a cero: dx/dt = k+1es - (k-1 + k+2) x = 0 A partir de esta expresión podemos llegar a obtener una expresión que nos da la velocidad para la concentración de substrato
  • 43.   dx dt k es k k x        0 1 1 2     k es k e x s k k x         1 1 0 1 2 x e s k k k s e s K s m         0 1 2 1 0 v V s K s m   max v k x  2 k e V   2 0 max Hipótesis de estado estacionario
  • 44. A partir de las suposiciones de Michaelis-Menten y Estado estacionario, llegamos a la ecuación Km + s v = Vmax * s La única diferencia radica en el significado de Km: Km = k-1/k+1 en mecanismo de M.M. Km = (k-1 + k+2)/k+1 en mecanismo de E.E.
  • 45. Significado de la constante Km 1. Constante de equilibrio de disociación del complejo ES (en condiciones de equilibrio rápido) 2. Medida inversa de la afinidad de la enzima por el substrato (en condiciones de equilibrio rápido) 3. Mide la función de fijación (en cond.de equilibrio rápido) 4. Concentración de substrato para la que la velocidad se hace igual a la mitad de la máxima (s0.5) 5. Se define para una pareja enzima-substrato 6. Se mide en unidades de concentración
  • 46. Significado de la constante Vmax = k+2 e0 1. Velocidad asintótica para s 2. Directamente proporcional a la concentración de enzima (hoy se prefiere caracterizar a la enzima por k+2) 3. Mide función de transformación catalítica 4. Se expresa en unidades de velocidad
  • 47. Relación entre Km y Vmax Michaelis y Menten Concentración de Sustrato [S] Velocidad de la reacción (v) Km Vmax Vmax/2 La Km es la concentración de sustrato donde se obtiene la mitad de la Vmax
  • 48. Concentración de Sustrato [S] Velocidad de la reacción (v) Km Vmax Vmax/2 A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato A menor Km mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato
  • 49.
  • 50. Representación directa s 0 20 40 60 80 100 v 0 20 40 60 80 100 Km Vmax v V s K s mx m  
  • 51. Representación recíproca doble (Lineweaver - Burk) 1/s -0.4 -0.2 0.0 0.2 0.4 0.6 1/v 0.00 0.01 0.02 0.03 0.04 1 1 1 v K V s V m mx mx    -1/Km 1/Vmax Representación Lineweaver-Burke
  • 52. Representación s -s/v (Eadie - Hofstee) s -20 0 20 40 60 80 100 120 s/v 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 1.2 s v V s K V mx m mx    1 -Km Representación Hanes
  • 53. Representación v/s - v (Wong - Hanes) v/s 0 2 4 6 8 10 12 14 16 v 0 20 40 60 80 100 v K v s V m mx     Vmax Representación de Eadie-Hofstee
  • 54. Métodos de linealización para determinación parámetros cinéticos Método Eje Y Eje X Intercepto Eje Y Intercepto Eje x Pendiente Lineweaver- Burke 1/v 1/s 1/V -1/K K/V Hanes s/v s K/V -K 1/V Eadie- Hofstee v v/s V V/K -K
  • 55. Definición Actividad Enzimática  Es el número de moles de sustrato que reaccionan para formar producto, por mol de enzima y por unidad de tiempo. Esto supone que la enzima está plenamente saturada con sustrato y por tanto que la reacción se efectúa con su máxima rapidez  El índice de recambio muestra la eficiencia impresionante de la catálisis enzimática
  • 56.  A fin de normalizar la medición de la actividad, se ocupa el valor de la velocidad inicial de reacción, donde eses factores son despreciables. Así,  Esta velocidad inicial no se espera que sea observada en un proceso enzimático donde, debido a los elevados tiempos de operación, es razonable suponer que esos factores ejercerán su influencia. 0 0 0                    t t t dt ds dt dp v a
  • 57. Cálculo de Actividad Enzimática  La velocidad de reacción catalizada por 0,1ml de una dilución 1:100 de Fosfatasa Alcalina es 0,3umoles / min. de producto. ¿Cuál es su actividad enzimática?  0,1ml-------- 0,3umoles producto / min. 1,0ml------------3,0umoles producto / min. dil 1:100-------------300umoles producto / min. Respuesta: 300U/ml
  • 58. Número o Índice de Recambio  Es útil definir una constante de velocidad más general, k cat , para describir la velocidad limitante de cualquier reacción enzimática a saturación  kcat x Et= Vmáx  V0 = k cat x Et x [S] / KM + [S];  Kcat es una constante de velocidad de 1er orden con unidades de tiempo-1, también llamada Número de Recambio
  • 59. Efecto del pH en la ENZIMA Cada enzima tiene un pH óptimo para su actividad El pH afecta las interacciones iónicas
  • 60. 1. Sobre la fijación del substrato al centro activo: - Grupos disociables de la enzima - Grupos disociables del substrato 2. Sobre la transformación catalítica del substrato 3. Sobre la estructura de la proteína enzimática Efecto del pH
  • 61. En el efecto de la temperatura hay dos componentes: 1. Aceleración de la reacción según la ecuación de Arrhenius k = A exp (-Ea/RT) 2. Desnaturalización térmica de la proteína
  • 62. Efecto de la temperatura en la ENZIMA Cada enzima tiene una temperatura óptima. Temperatura 15º 40º 75º Aumento de la velocidad Desnaturación por calor
  • 63. ORGANISMOS TERMÓFILOS  Son organismos que viven a altas tº y realizan sus reacciones enzimáticas a estas altas tº  Ejemplos son los que viven en las aguas termales  Es tema de investigación el aislamiento de las enzimas de estos organismos para desarrollar procesos industriales en condiciones más extremas
  • 64. Coenzimas  Las coenzimas son pequeñas moléculas orgánicas, que se unen a la enzima.  Las coenzimas colaboran en la reacción enzimática recibiendo transitoriamente algún grupo químico: H+ , OH, CH3 .  La enzima sin la coenzima recibe el nombre de APOENZIMA
  • 65. El NAD es una coenzima aceptora de H Sustrato oxidado
  • 66. Algunas enzimas requieren metales para mejorar su actividad
  • 67.
  • 68. Isoenzimas o Isozimas  Son formas moleculares diferentes de una misma enzima  Catalizan la misma reacción  Ejemplo: Lactato deshidrogenasa  Lactato + NAD ==== Piruvato + NADH  M4, M3H1, M2H2, M1H3 y H4  Se diferencian por su movilidad electroforética  Usadas en clínica: sueros normales y sueros con alguna patología
  • 69.  Así esta actividad corresponde al máximo potencial catalítico que las enzimas poseen para un determinado conjunto de condiciones ambientales. Luego, estas deben ser consideradas en las expresiones matemáticas representativas del proceso enzimático.  Existen situaciones (sustratos heterogéneos) donde la velocidad inicial de reacción no es representativa del real potencial catalítico de la enzima.  Se asume que la velocidad inicial de reacción es proporcional a la concentración de proteína enzimática.
  • 71. Inhibidor: Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de interacciones con el centro activo u otros centros específicos (alostéricos). Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores: I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula, causando un cambio conformacional con repercusión negativa en la actividad enzimática.
  • 73. Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos: 1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre, con el complejo enzima-substrato o con ambos: E + I EI 2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima: E + I E’ ES + I ESI
  • 74. Inhibición reversible (a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre, impidiendo la fijación del substrato: Inhibición Competitiva (b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la fijación del substrato a la enzima, pero sí impide la acción catalítica: Inhibición No Competitiva (c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo se conoce como Inhibición Anticompetitiva
  • 76. Inhibidores Competitivos  Compiten con el sustrato por el sitio activo de la enzima  Se une solo a la enzima libre  V máx no se altera y K M cambia
  • 77. Inhibición competitiva Al aumentar la cantidad de SUSTRATO el inhibidor competitivo es desplazado y se forma producto
  • 78.
  • 79. E ES EI I S E + P Características: - Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas - A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibición - Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del substrato. - El inhibidor es tan específico como el substrato Se define una constante de equilibrio de disociación del inhibidor: Ki = [E] [I] [EI]
  • 80. En condiciones de equilibrio rápido, llamando y a la concentración del complejo EI, para la inhibición competitiva obtenemos el siste- ma de ecuaciones v V s K i K s mx m i          1 K e x y s x K e x y i y m i       ( ) ( ) 0 0 Que resuelto para x nos da x e s K i K s m i          0 1 De donde
  • 81. Por tanto, en la inhibición competitiva, 1. El efecto cinético del inhibidor es el aumento aparente de la Km, que aparece multiplicada por el factor (1 + i/Ki) 2. La Vmax no aparece modificada; para concentraciones muy altas del substrato, v = Vmax, igual que en ausencia de inhibidor 3. Cuanto más pequeño sea el valor de Ki mayor será la potencia del inhibidor competitivo.
  • 83. 1/s -0.3 -0.2 -0.1 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 1/v 0.00 0.01 0.02 0.03 0.04 0.05 0.06 0.07 -1/Km -1/(Km(1 + i/Ki)) 1/Vmax Inhibición competitiva - Representación recíproca doble
  • 84. Ejemplo Inhibidor Competitivo  Ácido succínico + FAD == ácido fumárico + FADH2  El inhibidor competitivo es el ácido malónico  Es un análogo estructuralmente parecido al ácido succínico
  • 85. Ácido Fólico y Sulfanilamida  La sulfanilamida es un análogo estructural del ácido p - aminobenzoico (PABA)  PABA es el punto de partida para la síntesis de ácido fólico en las bacterias  El ácido fólico es una vitamina esencial para la proliferación (división) bacteriana  Sulfanilamida se usa en el tratamiento algunas infecciones
  • 86. Metotrexato y Dihidrofolato  El ácido fólico en sus formas de dihidro y tetrahidrofolato es coenzima de la reacción catalizada por la dihidrofolato reductasa  Esta reacción es parte del metabolismo de los nucleótidos para la síntesis de DNA  Metotrexato se usa en la terapia de algunos cánceres, inhibiendo la síntesis de DNA
  • 87. Inhibidor competitivo su estructura es similar a la del sustrato No se forma producto
  • 88.
  • 89.
  • 91. Inhibidor No Competitivo  Se une a un lugar diferente del sitio activo la enzima  Se une a la enzima libre y también al complejo enzima-sustrato  Por acción del inhibidor disminuye la Vm pero el valor de Km no se altera
  • 93. Inhibidor NO competitivo El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un sitio diferente del sitio activo
  • 94.
  • 95. E ES EI I S E + P I ESI S Inhibición No Competitiva El inhibidor se fija indistintamente a la enzima libre E y al complejo enzima-substrato ES; ni el complejo EI ni el complejo ESI son productivos
  • 96.
  • 98. Inhibidor Incompetitivo En este tipo de inhibición el inhibidor se enlaza al centro activo pero solo después de que el sustrato lo haya hecho y, por tanto, inhibidor y sustrato no compiten. De esta manera, aunque todo el sustrato esté saturando la enzima y toda la enzima esté como complejo ES, el inhibidor puede enlazarse produciendo un complejo inactivo ESI. Como I solo se une a ES estimula la formación de ES y, por tanto, incrementa la unión del sustrato a la enzima, disminuyendo Km . Sin embargo, el complejo ESI no conduce a productos y Vm disminuye.
  • 99. Inhibidor Incompetitivo  Se une a un lugar diferente del sitio activo de la enzima  Se une sólo al complejo enzima-sustrato  Los efectos que tiene: disminuye el valor de Km y también el de Vmáx
  • 100. E ES S E + P I ESI Inhibición Anticompetitiva El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES; el complejo ESI no es productivo
  • 101. Modelo Kap Vap Inh comp Km(1+i/Ki) Vm Inh no comp total Km Vm/(1+i/Ki) Inh anticomp Km/(1+i/Ki) Vm/(1+i/Ki) Determinación de parámetros cinéticos de inhibición
  • 102. Inhibición Irreversible - Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo químico de la enzima, modificándola covalentemente - Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki, sino por una constante de velocidad ki: E + I E’ - A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuación del inhibidor. - Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente tóxicos.
  • 103. Inhibidores Irreversibles  Producen inactivación permanente de la actividad enzimática  Se interfiere con el normal desarrollo de una reacción o vía metabólica  Ejemplos: p-cloromercuribenzoato, yodoacetato, diisopropilfluorfosfato
  • 104. Algunos tipos de inhibidores irreversibles 1. Reactivos de grupos -SH 2. Organofosfóricos 3. Ligandos de metales 4. Metales pesados
  • 106. Enzimas Alostéricas  Son enzimas cuya estructura proteica está formada de varias subunidades  No se rigen por la cinética de M - M  Además del sitio o centro activo tienen sitios alostéricos o de regulación  Sitio activo/sustratos;  Sitio alostérico/moduladores o reguladores  La relación entre la velocidad de reacción y la concentración de sustrato sigue cinética sigmoídea
  • 107. Enzimas alostéricas  Las enzimas alostéricas presentan estructura cuaternaria.  Tienen diferentes sitios activos, unen mas de una molécula de sustrato  La unión del sustrato es cooperativa  la curva de velocidad presenta una forma sigmoidal
  • 108.
  • 109. Concepto de Cooperatividad  La unión de los sustratos al sitio activo de una subunidad produce un cambio conformacional que por contacto físico se transmite a las subunidades vecinas, facilitando las interacciones  Modelos de unión: secuencial y concertado  Ejemplos: unión Hb-O2, enzimas alostéricas y sus sustratos
  • 110. Moduladores Alostéricos  También reciben el nombre de efectores y pueden ser positivos o negativos  Se unen al sitio alostérico que puede estar en la misma subunidad que tiene al sitio activo o en las subunidades regulatorias  Su unión produce un cambio conformacional que afecta al sitio activo
  • 111. Aspartato Transcarbamilasa  Ác L-asp + Carbamil-P === Carbamil- asp + Pi . Primera reacción en la síntesis de pirimidinas  Efector positivo: CTP Efector negativo: ATP  Tiene dos subunidades catalíticas para los sustratos y tres subunidades regulatorias para los efectores
  • 112.
  • 113. RESUMEN  Las enzimas son proteínas que catalizan las reacciones biológicas  Presentan especificidad por su sustrato  Cada enzima presenta dos parámetros importantes Vmax (saturación de la enzima) y la Km (medida de la afinidad por el sustrato)
  • 114. RESUMEN  La actividad enzimática puede ser inhibida, por inhibidores competitivos (similares al sustrato) o por inhibidores no competitivos.  La temperatura y el pH afectan a la enzima en su actividad catalítica.  Algunas enzimas requieren de coenzimas y/o cofactores para su actividad.