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Incanterの紹介
 

Incanterの紹介

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    Incanterの紹介 Incanterの紹介 Presentation Transcript

    • INCANTER の紹介
    • INCANTER の紹介 Twitter : @Mozk_ 生物情報科学科 4年
    • は Clojure の上で動く っぽい何か
    • Clojureは Java VM の上で動く    LISPっぽい何か
    • LISPとは???(defun local-similarity (a b) ;; a, b : sequence (declare (optimize (speed 3) (safety 0) (debug 0))) (let ((memo (make-hash-table :test equal))) (labels ((dp (x y) (declare (fixnum x y)) (or #1=(gethash `(,x ,y) memo) (setf #1# (cond ((< x 0) 0) ((< y 0) 0) (:else (let ((diagonal-local-distance (if (eql (elt a x) (elt b y)) 1 -1))) (max (+ diagonal-local-distance (dp (1- x) (1- y))) (1- (dp (1- x) y)) (1- (dp x (1- y))) 0)))))))) (iter outer (for x from 0 below (length a)) (iter inner (for y from 0 below (length b)) (in outer (maximizing (dp x y))))))))
    • Lispははるか昔に作られた Javaよりも昔 Cよりも昔 Fortranよりも昔 コンピュータよりも昔 人類よりも昔 地球ができるよりも昔宇宙自体がLispプログラムであり 本物のLisperがわざわざ実装 しようとしないのも当然だ 『Lispの真実』(http://www.aoky.net/articles/leon_bambrick/lisp_truth.htm)
    • 熱狂的信者と括弧が多い言語(defun fact (n) (if (= n 0) 1 (* n (fact (1- n)))))
    • 前置きは終わりにしてIncanter.org からダウンロード
    • 立ち上げると
    • 立ち上げると なんか、しょぼい・・・おまじない:(use (incanter core stats charts))
    • 簡単なことから(def r (sample-normal 1000))(view (histogram r)) r ← rnorm(1000) hist(r)
    • 見比べ!
    • どんどん比較● (doc histogram)● (find-doc “histogram”)● ?hist● ??hist
    • どんどん比較● (dataset [“x1” “x2”] [[1 2 3] [4 5 6]])● data.frame(x1 = c(1,2,3), x2 = c(4,5,6))
    • どんどん比較● (read-dataset “http://hoge.jp/a.csv” :header true)● read.table(“http://hoge.jp/a.csv”, header = T)
    • 基本的な部分ではだいたいRと対応する 書き方がある!
    • Incanterの利点
    • Javaとの親和性が高い!(def output-stream (java.io.ByteArrayOutputStream.))(save (function-plot sin -1 1) output-stream)
    • Javaとの親和性が高い!(view (function-plot #(java.lang.Math/sqrt %) 0 2))
    • 柔軟(with-data iris (view $data) (view ($ [:Sepal.Length :Sepal.Width])) (view ($ [:not :Petal.Width])))(view ($data iris))(view ($[:Sepal.Length :Sepal.Width] iris))(view ($[:not :Petal.Width] iris)))
    • Clojureの純粋な拡張である● Incanterを使ってウェブアプリ● http://data-sorcery.org/ 2009/11/29/incanter-webapp/
    • 欠点ユーザ/パッケージが少ない
    • おわり
    • バイトでRのチュートリアル動画を作りました。   http://togotv.dbcls.jp/20111107.html