Ketika asam amino digunakan sebagai sumber energi, mereka akan mengalami proses katabolisme seperti oksidasi menjadi CO2 melalui siklus TCA atau glukoneogenesis. Ada dua proses enzimatik utama yaitu transaminasi dan deaminasi. Transaminasi memindahkan gugus amino antara asam amino dan α-ketoglutarat, sementara deaminasi melepaskan gugus amino dari glutamat. Kedua proses ini memungkinkan penggabungan dan pengguna