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UNIVERSIDAD JUÁREZ AUTÓNOMA DE TABASCO
División Académica Multidisciplinaria De Los Ríos
Materia: Bioquímica
Unidad 3: Naturaleza de las moléculas biológicas
Unidad 4: Naturaleza de las moléculas biológicas
Unidad 5: Nucleótidos, Ácidos Nucleícos, Reacciones
bioenergéticas y principales ciclos metabólicos
Alumna: Maryleen Olivia López Flores
Profesora: M.A. Carolina Del Carmen Pérez Sánchez
Tenosique, Tabasco08 de Mayo De 2015
INDICE
Unidad 3: Naturaleza de las moléculas biológicas
3.1 Aspectos generales y clasificación de Glúcidos.
3.1.1Monosacáridos. Estructuras lineales y cíclicas.
3.1.2 Derivados fosforilados, desoxiazúcares, aminosas y derivados ácidos. Enlace glucosídico.
3.1.3 Disacáridos: estructura y función.
3.1.4Polisacáridos de interés biológico.
3.1.5Glucoproteínas y proteoglicanos.
3.2 Aspectos generales y clasificación de lípidos.
3.2.1Estructura, clasificación y propiedades delos lípidos.
3.2.2 Ácidos grasos.
3.2.2 Lípidos complejos: Triacilglicéridos, Fosfoglicéridos, esfingolípidos y ceras.
3.2.3 Lípidos simples: Terpenos, Esteroides y Prostaglandinas.
3.2.4Derivados lipídicos Separación y análisis de lípidos
Unidad 4: Naturaleza de las moléculas biológicas
4.1 Aminoácidos y péptidos.
4.1.1 Estructura y propiedades iónicas.
4.1.2Principales aminoácidos.
4.1.3Enlace peptídico.
4.1.4Estudio de la secuencia peptídica.
4.2Proteínas.
4.2.1Concepto y función. Clasificación
4.2.2Estructura primaria de las proteínas.
4.2.3 Estructura secundaria: hélice alfa y lámina beta. Proteínas fibrosas función.
5.1Nucleotidos y ácidos nucleicos
5.1.1 purinas y pirimidinas
5.1.2Nucleótidos y Nucleósidos
5.1.3 Ácidos nucleicos
5.2 Reacciones bioenergéticas y principales ciclos metabólicos
5.2.1 Introducción
5.2.2 Catabolismo y producción de la Energía. Cadena respiratoria, Glucólisis,
Fosforilación oxidativa, Oxidación de los ácidos grasos, Degradación de
proteínas y aminoácidos
5.2.3 Biosíntesis y utilización de la energía. (Ciclo de ácidos tricarboxílicos,
Biosíntesis de carbohidratos
Biosíntesis de lípidos
Unidad 5: Nucleótidos, Ácidos Nucleícos, Reacciones bioenergéticas
y principales ciclos metabólicos
4.2.4 Estructura terciaria. Proteínas globulares.
4.2.5Estructura cuaternaria,
4.2.6 Desnaturalización y renaturalización de proteínas.
4.3 Enzimas.
4.3.1. Clasificación internacional de las enzimas.
4.3.2 Coenzimas y Cofactores
4.3.3 Cinética enzimática
3.1 Aspectos generales y clasificación de Glúcidos.
CARBOHIDRATOS
Glúcidos Azúcares Hidratos de carbono Osas
Fórmula empírica (CH2O)n
Los carbohidratos son aldehídos o cetonas con grupos hidroxilo que
pueden existir como cadenas o anillos.
los carbohidratos o hidratos de carbono son compuestos terciarios
formados por tres bioelementos: carbono, hidrogeno y oxidación
(C,H,O)
Clasificacion
3.1.1MONOSACARIDOS
ESTRUCTURA LINEAL Y CICLICA
Los monosacáridos o azúcares simples son los glúcidos más sencillos, que no se
hidrolizan, es decir, que no se descomponen para dar otros compuestos, conteniendo
de tres a seis átomos de carbono.
Se pueden clasificar según el número de carbonos que contiene la cadena en: triosas,
tetrosas, pentosas y hexosas.
La estructura básica de todos los monosacáridos es una cadena de átomos de
carbono no ramificada en la que todos ellos están unidos por enlaces simples. Uno de
estos átomos de carbono está unido a uno de oxígeno por un enlace doble formando
un grupo carbonilo; todos los demás están unidos a grupos hidroxilo.
Si el grupo carbonilo se encuentra en un extremo de la cadena carbonada el
monosacáridos es un aldehído y recibe el nombre de aldosa; si el grupo carbonilo se
encuentra en cualquier otra posición el monosacárido es una cetona y recibe el
nombre de cetosa
Estructura Lineal Y Ciclica
3.1.2 Derivados fosforilados, desoxiazúcares, aminosas y
derivados ácidos. Enlace glucosídico.
Tipo Formación Ejemplo Estructura
Amino azúcar Sustitución
de un OH
Por un grupo amino
(-NH2)
Glucosamina
Derivados
fosforilados
Se añade un grupo
fosfato
Glucosa-6-
fosfato
Desoxiazucares Se reduce la
ribosa
Pierde un atomo de
O en un (OH)
Desoxiribosa
Derivados
ácidos
Oxida el
carbono 6
Presenta grupo
carboxilo
Glucuronato
o acido
glucuronico
Enlace glucosídico
El enlace glucosídico o glicosídico es el enlace para unir monosacáridos
con el fin de formar disacáridos o polisacáridos. Su denominación más
correcta es enlace O-glucosídico pues se establece en forma de éter
siendo un átomo de oxígeno el que une cada pareja de unidades de
monosacáridos.
Mediante este enlace se unen dos monosacáridos según el siguiente
esquema:
Disacáridos: estructura y función.
Su fórmula general es C12H22O12
algunos disacáridos son:
Las propiedades de los
disacáridos son semejantes a
las de los monosacáridos: son
sólidos cristalinos de color
blanco, sabor dulce y solubles
en agua.
Los disacáridos desempeñan funciones importantes en la dieta humana. También
llamados azúcares dobles, los disacáridos son un tipo de carbohidrato que
contienen dos moléculas de azúcar llamadas monosacáridos que están unidas
entre sí en un compuesto. Tu cuerpo digiere los disacáridos presentes en los
alimentos y los divide en dos moléculas de azúcar individuales que luego son
absorbidas por el intestino delgado.
3.1.4 Polisacáridos de interés biológico.
Los polisacáridos están formados por la unión de centenares de monosacáridos,
unidos por enlaces“O-glucosídicos”.
Los polisacáridos son macromoléculas de elevado peso molecular y estructura
compleja.
Disacárido Estructura Papel biológico
Sacarosa β-D-Fructosa (2→1) α-D-
Glucosa
Azúcar vegetal
(azúcar de mesa)
Maltosa α-D-Glucosa (1→4) α-D-
Glucosa
Almidón,
glucógeno
Lactosa β-D-Galactosa (1→4) α-D-
Glucosa
Azúcar de la leche
Celobiosa β-D-Glucosa(1→4) β-D-Glucosa Celulosa
Disacáridos de importancia biológica
Existe una multitud de disacáridos diferentes en la naturaleza,
aunque los que se encuentran en los seres vivos con mayor
frecuencia son los siguientes:
3.1.5 Glucoproteínas y proteoglicanos.
Las glicoproteínas o glicoproteínas son moléculas compuestas por
una proteína unida a uno o varios glúcidos, simples o compuestos.
El término glicoproteína se usa en general para referirse a una molécula de
dimensiones específicas, integrada normalmente por uno o
más oligosacáridos unidos de modo covalente a cadenas laterales específicas
de polipéptidos. Suelen tener un mayor porcentaje de proteínas que de glúcidos.
Los proteoglicanos son macromoléculas formadas por una proteína central, a lo
largo de la cual se asocian, por su extremo terminal, numerosas moléculas de
glicosaminoglicanos sulfatados.
Existe una enorme variedad de proteoglicanos, dependiendo del tipo y largo de la
proteína central y del tipo, número y longitud de los glicosaminoglicanos asociados a
ella.
LÍPIDOS
3.2 Aspectos generales y clasificación de lípidos.
3.2.1Estructura, clasificación y propiedades de los lípidos.
Los lípidos son biomoléculas orgánicas formadas básicamente por carbono e hidrógeno y
generalmente también oxígeno; pero en porcentajes mucho más bajos. Además pueden
contener también fósforo, nitrógeno y azufre .
Es un grupo de sustancias muy heterogéneas que sólo tienen en común estas dos
características:
1. Son insolubles en agua.
2. Son solubles en disolventes orgánicos, como éter, cloroformo, benceno, etc.
Son los derivados reales ó potenciales de los ácidos grasos y substancias
relacionadas
Lípidos
Lípidos simples
Tienen estructuras poco complejas y no se pueden descomponer por
procesos químicos o se pueden descomponer en un número limitado de
compuestos sencillos
Grasas Esteroides Aceites
Lípidos
complejos
Tienen variantes en sus
estructuras, se pueden
descomponer en
compuestos sencillos
Fosfolípidos
Clasificación
Funciones
Los lípidos desempeñan importantes funciones en los seres vivos. Estas son, entre
otras, las siguientes:
Estructural: Son componentes estructurales fundamentales de las membranas
celulares.
Energética: Al ser moléculas poco oxidadas sirven de reserva energética pues
proporcionan una gran cantidad de energía.
Protectora: Las ceras impermeabilizan las paredes celulares de los vegetales
y de las bacterias y tienen también funciones protectoras en los insectos y
en los vertebrados.
Transportadora: Sirven de transportadores de sustancias en los medios
orgánicos.
Reguladora del metabolismo: Contribuyen al normal funcionamiento del
organismo. Desempeñan esta función las vitaminas (A,D, K y E). Las
hormonas sexuales y las de la corteza suprarrenal también son lípidos.
Reguladora de la temperatura: También sirven para regular la temperatura.
Por ejemplo, las capas de grasa de los mamíferos acuáticos de los mares
de aguas muy frías.
Ácidos grasos
Se conocen unos 70 ácidos grasos que se pueden clasificar en dos grupos :
ACIDOS GRASOS
SATURADOS
Solo tienen enlaces
simples y suelen
encontrarse en grasas
animales.
INSATURADOS
Tienen un doble enlace,
suelen encontrarse
fundamentalmente en
grasas de origen vegetal
Los ácidos grasos son ácidos carboxílicos con cadenas largas de hidrocarburos. Los
ácidos
grasos se encuentran con mayor frecuencia en la naturaleza.
Los ácidos grasos pueden saturarse con hidrógeno(y, por tanto, no tienen enlaces
dobles carbono-carbono) o pueden ser no saturados (y tienen enlaces dobles carbono-
carbono). Los ácidos grasos con más de un enlace doble se llaman ácidos grasos
poliinsaturados.
ácido esteárico
un ácido graso con 18 carbonos
sin dobles enlaces
ácido oleico
un ácido graso con 18 carbonos
con un enlace doble
ácido linolénico
un ácido graso con 18 carbonos
con tres enlaces dobles
ácido linoleico
un ácido graso con 18 carbonos
con dos enlaces dobles
Ejemplos de ácidos grasos:
3.2.3 Lípidos complejos: Triacilglicéridos, Fosfoglicéridos,
esfingolípidos y ceras.
Los triglicéridos son grasas transportadas en la
sangre de las comidas que comemos.
El exceso de calorías, el alcohol o el azúcar en
la sangre en el cuerpo son convertidos en
triglicéridos y guardados en células grasas a
través del cuerpo.
A los triglicéridos generalmente se les denomina
grasas si se encuentran en estado sólido a
temperatura ambiente. La mayor parte de los
triglicéridos derivados de los mamíferos son
grasas, como la grasa de ternera o la manteca
de cerdo. A pesar de que estas grasas son
sólidas a temperatura ambiente, la temperatura
del cuerpo de los animales hace que las grasas
se encuentren en un estado fluido, permitiendo
su distribución en el cuerpo
Los ácidos grasos de los triglicéridos comunes
son ácidos carboxílicos lineales y largos,
entre 12 y 20 átomos de carbono.
Fosfoglicéridos:
Los lípidos que contienen un grupo fosfato se llaman fosfolípidos. Las dos principales clases
de fosfolípidos son los fosfoglicéridos y los esfingolípidos.
Los fosfoglicéridos (llamados también fosfoacilgliceroles) son parecidos a los triglicéridos,
excepto que el grupo terminal OH de glicerol forma un éster con el ácido fosfórico en vez de con
un ácido graso, lo que da como resultado un ácido fosfatídico.
Los esfingolípidos son el segundo gran grupo (por abundancia) de lípidos de
membrana. Su base estructural es la ceramida (esfingosina con un ácido graso
unido a su grupo amino mediante enlace amida).
Esfingolípidos
Ceras
Las ceras (céridos) se forman por la unión de un acido graso de cadena larga (de 14
a 36 átomos de carbono) con un monoalcohol, también de cadena larga ( de a
átomos de carbono) mediante un enlace éster.
Las ceras tienes esencialmente función de impermeabilización y protección.
Lípidos simples: Terpenos, Esteroides y Prostaglandinas.
Los terpenos son una clase diferente de lípidos. Se conocen más de 20,000
terpenos. Pueden ser hidrocarburos o pueden contener oxígeno y ser alcoholes,
cetonas o aldehídos. Ciertos terpenos se han empleado por miles de años como
especias, perfumes y medicamentos.
mentol
geraniol
Clasificación de los torpenos
Numero de átomos
de carbono
Unidad de
isopropeno
Nombre que se les
denomina
10 2 Monoterpeno
15 3 Sesquiterpenos
20 4 Diterpeno
30 6 Triterpenos
40 8 tetrapertenos
Esteroides
Todos los esteroides contienen un sistema
de anillos tetracíclicos, compuesto por tres
anillos de seis miembros y un anillo de cinco.
Las hormonas esteroides se dividen en cinco clases: glicocorticoides,
mineralocorticoides, andrógenos, estrógenos y progestinas.
Prostaglandinas
Las prostaglandinas son derivados de ácidos grasos que son reguladores
bioquímicos incluso más potentes que los esteroides. Se denominan prostaglandinas
porque se aislaron por primera vez a partir de las secreciones de la glándula de la
próstata.
Las prostaglandinas tienen un anillo de cicIopentano con dos cadenas laterales
largas en posición trans una respecto a otra, con una de las cadenas laterales
finalizando en un ácido carboxílico.
Derivados lipidicos
Se obtienen por hidrólisis de grasas, frecuentemente contienen un número par de átomos de
carbono.
Se encuentran en alimentos vegetales y animales, también se encuentran en formas complejas
con otras sustancias.
No se pueden clasificar como simples o compuestos, sino:
• Los terpenos, terpenoides o isoprenoides, son lípidos derivados del
hidrocarburo isopropeno. Los terpenos biológicos constan, como mínimo
de dos moléculas de isopreno. Algunos terpenos importantes son los
aceites esenciales, el fitol, las vitaminas A, K y E.
Terpenos
• Los eicosanoides son lípidos derivados de los ácidos grasos esenciales
de 20 carbonos tipo omega-3 y omega-6. Todos los eicosanoides son
moléculas de 20 átomos de carbono.
Eicosanoides
• Los esteroides son lípidos derivados del núcleo del hidrocarburo
esterano, se componen de cuatro anillos fusionados de carbono que
posee diversos grupos funcionales por lo que la molécula tiene partes
hidrofílicas e hidrofóbicas. Entre los esteroides más destacados se
encuentran los ácidos biliares, las hormonas sexuales, las
corticosteroides, la vitamina D y el colesterol.
Esteroides
4.1 Aminoácidos y péptidos.
4.1.1 Estructura y propiedades.
Los aminoácidos son compuestos nitrogenados
que se caracterizan por presentar un grupo
amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH)
unidos al mismo carbono. Estos dos grupos se
pueden ionizar en medio acuoso, siendo los
responsables del anfoterismo de los
aminoácidos, es decir, pueden actuar como
ácidos o como bases, en función del pH del
medio (los compuestos que son capaces de
aceptar o ceder protones se denominan
anfóteros o anfolitos)
PÉPTIDOS
La unión de dos o más aminoácidos (AA)
mediante enlaces amida origina los péptidos.
En los péptidos y en las proteínas, estos
enlaces amida reciben el nombre de enlaces
peptídicos y son el resultado de la reacción del
grupo carboxilo de un AA con el grupo amino de
otro, con eliminación de una molécula de agua.
Clasificación de los Aminoácidos
De acuerdo a su Obtención por el Organismo
Esenciales No Esenciales
Valina (Val, V) Alanina (Ala, A)
Leucina (Leu, L) Prolina (Pro, P)
Treonina (Thr, T) Glicina (Gly, G)
Lisina (Lys, K) Serina (Ser, S)
Triptófano (Trp, W) Cisteína (Cys,C)
Histidina (His, H) Asparagina (Asn, N)
Fenilalanina (Phe, F) Glutamina (Gln, Q)
Isoleucina (Ile, I) Tirosina (Tyr, Y)
Arginina (Arg, R) Aspartato (Asp, D)
Metionina (Met, M) Glutamato (Glu, E)
Clasificación de los Aminoácidos
Fer HIzo un Lío Tremendo y Valentina Le Metió un Triptófano
Fenilalanina
Histidina
Isoleucina
Lisina
Treonina
Valina
Leucina
Metionina
Triptófano
Arginina
Arginina e Histidina solo son
esenciales en periodos de
crecimiento celular, la
infancia, la lactancia y la
enfermedad
Aminoácidos Esenciales: Mnemotecnia
Un péptido es el producto de unión de
dos o más aminoácidos
El enlace peptídico es el enlace covalente tipo
amida que se forma entre el grupo α-carboxilo
de un aminoácido y el α-amino de otro.
Enlace Peptídico
La reacción es una condensación con
eliminación de una molécula de agua
Los aminoácidos que conforman el péptido
pasan a denominarse residuos de
aminoácidos.
Los péptidos presentan en un extremo un grupo amino sin reaccionar
(amino terminal o N-terminal) y en el otro un carboxilo sin reaccionar
(carboxilo terminal o C-terminal)
Enlace Peptídico
Tiene carácter parcial de doble
enlace, por lo que es muy rígido.
Se comporta como un híbrido de
resonancia.
Estructura del Enlace Péptidico
La configuración trans está mas
favorecida; la cis esta impedida
estéricamente.
+
- El Oxígeno carbonílico tiene
carga parcial negativa y el
Nitrógeno amida carga parcial
positiva, por tanto el enlace tiene
carácter polar
4.2 Proteínas.
4.2.1 Concepto y función. Clasificación
Las proteínas son biomoléculas orgánicas
formadas por C, H, O, N y en menor medida P y S
y otros elementos (Fe,Cu, Mg,...).
Son polímeros no ramificados de aminoácidos (aa)
que se unen mediante enlaces peptídicos. Son las
moléculas orgánicas más abundantes en los seres
vivos.
Su importancia radica en la variedad de funciones
diferentes que pueden desempeñar.
Función de las proteínas
Proteínas
Holoproteínas
(solo contienen
aa)
Globulares
Fibrosas
Heteroproteínas
(aa + otro
componente no
proteico)
Glicoproteínas
Fosfoproteínas
Lipoproteínas
Nucleoproteínas
Cromoproteínas
Clasificación
4.2.2 Estructura primaria de las proteínas
La estructura primaria de una proteína es su secuencia de aminoácidos, es decir,
vendría especificada por los aminoácidos que la forman y el orden de colocación
de los mismos a lo largo de la cadena polipeptídica. La secuencia de aminoácidos
de una proteína se escribe empezando por el extremo amino terminal y finalizando
por el carboxi-terminal.
4.2.3 Estructura secundaria: hélice alfa y lámina beta. Proteínas
fibrosas función.
Es la disposición espacial que adopta la secuencia de aa debido a la capacidad de
giro de los enlaces. De los posibles plegamientos hay algunos que dan lugar a
estructuras estables y son los que se mantienen.
La estructura secundaria puede ser de dos tipos:
Hélice a
Un tipo de estructura secundaria es la hélice a
En una hélice a, la columna vertebral del polipéptido se enrolla alrededor del eje largo
de la molécula de la proteína
Los sustituyentes de los carbonos a de los aminoácidos se proyectan hacia fuera de la
hélice; por tanto, se minimiza el impedimento estérico. Cada hidrógeno unido a un
nitrógeno amiduro se enlaza a un oxígeno carbonilo de un aminoácido alejado a una
distancia de cuatro aminoácidos. Recuerde que un puente de hidrógeno puede tener
lugar entre un hidrógeno enlazado a un nitrógeno y un par electrones no compartidos
del oxígeno.
Hoja plegada b
El segundo tipo de estructura secundaria es una hoja plegada b.
En una hoja plegada b la columna vertebral del polipéptido se extiende en una
estructura en forma de zigzag que se asemeja a una serie de pliegues. El puente de
hidrógeno en una hoja plegada b tiene lugar entre las cadenas peptídicas adyacentes
Las proteínas fibrosas
son generalmente proteínas estáticas, cuya
función principal es la de proporcionar soporte
mecánico a las células y los organismos, suelen
ser insolubles y están formadas por una unidad
repetitiva simple que se ensambla para formar
fibras. Entre las proteínas fibrosas podemos
encontrar la alfa-queratina, componente principal
del pelo y las uñas; el colágeno, presente en la
piel, los tendones, huesos y dientes.
Proteínas globulares
las cadenas polipétidas se pliegan en forma
esférica y poseen una estructura más complejas
que las anteriores, ya que puede haber más de
una estructura secundaria en la misma
molécula. Son solubles en agua .
Algunas de las más importantes son:
Mioglobina, citocromo, ribonucleasa, lisozima.
Estructura terciaria:
Esta representada por los súper
plegamientos y enrollamientos de la
estructura secundaria, constituyendo
formas tridimensionales geométricas
muy complicadas que se mantienen
por enlaces fuertes (puentes disulfuro
entre dos cisteinas) y otros débiles
(puentes de hidrógeno; fuerzas de van
der waals; interacciones iónicas e
interacciones hidrofóbicas).
•Punto de vista funcional, esta
estructura es la más importante pues,
al alcanzarla es cuando la mayoría de
las proteínas adquieren su actividad
biológica o función.
•Muchas proteínas tienen estructura
terciaria globular caracterizadas por ser
solubles en disoluciones acuosas, como
la mioglobina o muchos enzimas.
•no todas las proteínas llegan a formar
estructuras terciarias
Estructura Cuaternaria
Están formadas por la unión mediante enlaces débiles (no covalentes) de varias cadenas
polipeptídicas con estructura terciaria, para formar un complejo proteico. Cada una de estas
cadenas polipeptídicas recibe el nombre de protómero.
La estructura cuaternaria debe considerar:
(1) El número y la naturaleza de las distintas subunidades o monómeros que integran el
oligómero
(2) La forma en que se asocian en el espacio para dar lugar al oligómero.
(formadas por dos o mas cadenas peptidicas que pueden ser iguales o diferentes)
Desnaturalización y renaturalización de proteínas
A la destrucción de la estructura terciaria sumamente organizada de una proteína se le llama
desnaturalización
Cualquier cosa que rompa el enlace encargado de mantener la forma tridimensional de la
proteína ocasiona que ésta sufra desnaturalización (se desdobla). Debido a que estos enlaces
son débiles, las proteínas se pueden desnaturalizar fácilmente.
A continuación se indican algunas de las formas en que se desnaturalizan las proteínas:
•Al cambiar el pH las proteínas se desnaturalizan porque se modifican las cargas de
muchas de las cadenas laterales.
•Ciertos reactivos como la urea desnaturalizan las proteínas al formar puentes de hi-drógeno en
los grupos proteicos, los cuales son más fuertes que los puentes de hidrógeno que se forman
entre los grupos.
•Las proteínas también se desnaturalizan por calor o por agitación.
Un ejemplo muy conocido es el cambio que sufre la clara de huevo cuando se
calienta o se bate
4.3 Enzimas.
4.3.1. Clasificación internacional de las enzimas.
Las enzimas son el grupo más variado y especializado de las proteínas, su función
es actuar como catalizadores, permitiendo que las reacciones que transcurren en
los seres vivos puedan desarrollarse a un ritmo adecuado.
Un catalizador, por definición, es un compuesto que con su sola presencia aumenta
la velocidad de la reacción sin experimentar ninguna modificación.
Al igual que las proteínas, les hay de muy diferentes tamaños y requerimientos.
Cofactor (Coenzima):
Átomo, ion o molécula que participa en el proceso catalítico sin ser enzima ni
substrato.
Los cofactores participan de dos maneras distintas:
1. A través de una fijación muy fuerte a la
proteína y salen sin ser modificados del
ciclo catalítico
2. Como un segundo substrato; salen
modificados del ciclo catalítico y por lo
general requieren otra enzima para volver
al estado original.
Los cofactores enzimáticos suelen ser
moléculas complejas, que nuestro
organismo no puede sintetizar, por lo
general.
Por esa razón muchos cofactores
enzimáticos deben ser, en todo en parte,
ingresados con la dieta; muchos de ellos
son, por lo tanto, vitaminas.
Ni todos los cofactores son vitamínicos ni
todas las vitaminas son cofactores
enzimáticos
Estudio de la velocidad de reacciones catalizadas enzimáticamente, proporcionando
información directa acerca del mecanismo de la reacción catalítica y de la especifidad
del enzima.
La velocidad de una reacción catalizada por un enzima depende de:
1. la concentración de moléculas de sustrato [S]
2. la temperatura
3. la presencia de inhibidores
4. pH del medio, que afecta a la conformación (estructura espacial) de la molécula
enzimática
Nucleótidos
Los nucleótidos son moléculas orgánicas formadas por la unión covalente de
un monosacáridos de cinco carbonos (pentosa), una base nitrogenada y un
grupo fosfato. El nucleósido es la parte del nucleótido formada únicamente por
la base nitrogenada y la pentosa.
Son los monómeros de los ácidos nucleicos (ADN y ARN) en los cuales forman
cadenas lineales de miles o millones de nucleótidos, pero también realizan
funciones importantes como moléculas libres (por ejemplo, el ATP o el GTP).
Los nucleótidos pueden existir como monofosfatos, difosfatos y trifosfatos.
Se nombran agregando al nombre del nucleósido los términos monofosfato,
difosfato o trifosfato.
Un nucleósido es una molécula monomérica orgánica que integra las
macromoléculas de ácidos nucleicos que resultan de la unión covalente
entre una base nitrogenada con una pentosa que puede ser ribosa o
desoxirribosa. Ejemplos de nucleósidos son la citidina, uridina, adenosina,
guanosina, timidina y la inosina.
Nucleósido
Citidina
Uridina
Ácidos nucleicos
Los ácidos nucleicos (AN) fueron
descubiertos por Freidrich Miescher en 1869.
En la naturaleza existen solo dos tipos de
ácidos nucleicos: El ADN (ácido
desoxirribonucleico) y el ARN (ácido
ribonucleico) y están presentes en todas las
células.
Los ácidos nucleicos tienen al menos dos
funciones: trasmitir las características
hereditarias de una generación a la siguiente
y dirigir la síntesis de proteínas específicas.
Tanto la molécula de ARN como la molécula
de ADN tienen una estructura de forma
helicoidal.
Químicamente, estos ácidos están formados, por unidades llamadas
nucleótidos: cada nucleótido a su vez, está formado por tres tipos de
compuestos:
1. Una pentosa o azúcar de cinco carbonos: se conocen dos tipos de
pentosas que forman parte de los nucleótidos, la ribosa y la desoxirribosa,
esta última se diferencia de la primera por que le falta un oxígeno y de allí
su nombre. El ADN sólo tiene desoxirribosa y el ARN tiene sólo ribosa, y de
la pentosa que llevan se ha derivado su nombre, ácido desoxirribonucleico y
ácido ribonucleico, respectivamente.
2. Una base nitrogenada: que son compuestos anillados que contienen
nitrógeno. Se pueden identificar cinco de ellas: adenina, guanina,
citosina, uracilo y timina.
3. Un radical fosfato: es derivado del ácido fosfórico (H3PO4
-).
Los ácidos nucleicos son el ácido desoxirribonucleico
(ADN) y el ácido ribonucleico (ARN). El ADN porta la
información genética que comanda la formación de un
organismo completo y, junto con el ARN, determinan
las bases del funcionamiento celular a través de la
expresión de la información que contienen.
INTRODUCIÓN
Los alimentos que consumen los atletas/deportistas tienen que necesariamente
primero ser digeridos, proceso por el cual el alimento se degrada en materias más
pequeñas y asimilables. Luego se procede a la absorción de los nutrimentos
derivados de los alimentos. Finalmente, los nutrimentos circulantes llegan a la célula
para que ocurra el metabolismo.
El funcionamiento del organismo humano depende de una variedad de procesos
bioquímicos que en conjunto representan el metabolismo de las células corporales.
Las reacciones químicas involucradas en el metabolismo proveen (y utilizan)
compuestos de energía indispensables para mantener trabajando todos nuestros
órganos del cuerpo, mantienen vivo al ser humano. Para el atleta, los procesos
liberadores y de síntesis de energía que constituyen el metabolismo facilita la
ejecutoria deportiva, y, en muchos casos, la mejora, particularmente cuando se llevan
a cabo manipulaciones dietéticas efectivas. Claro esta, existen otros factores que
determinan el nivel de efectividad en el rendimiento competitivo, tales como el nivel de
entrenamiento o aptitud física, la periodización del entrenamiento físico,
características genéticas del deportista (factores hereditarios), la edad del competidor,
entre otras.
Catabolismo y producción de la Energía. Cadena respiratoria,
Glucólisis, Fosforilación oxidativa, Oxidación de los ácidos grasos,
Degradación de proteínas y aminoácidos.
METABOLISMO
El conjunto de todas las transformaciones químicas que se producen en una célula u
organismo recibe el nombre de metabolismo. Es una actividad muy coordinada cuyos
objetivos de forma sintética serían:
1)Obtención de energía del medio ambiente
2)Obtención de moléculas características de la propia célula.
Catabolismo es el conjunto de reacciones
metabólicas mediante las cuales las
moléculas orgánicas más o menos
complejas (glúcidos, lípidos), que proceden
del medio externo o de reservas internas,
se rompen o degradan total o parcialmente
transformándose en otras moléculas más
sencillas y liberándose energía en mayor o
menor cantidad que se almacena en forma
de ATP.
Esta energía será utilizada por la célula
para realizar sus actividades vitales
(transporte activo, contracción muscular,
síntesis de moléculas) .
Cadena Respiratoria
La glucólisis o glicolisis (del griego glycos: azúcar y lysis: ruptura), es la vía metabólica encargada de
oxidar o fermentar la glucosa y así obtener energía para la célula. Ésta consiste de diez reacciones
enzimáticas que convierten a la glucosa en dos moléculas de piruvato, la cual es capaz de seguir otras
vías metabólicas y así continuar entregando energía al organismo.
Es la vía inicial del catabolismo (degradación) de carbohidratos, y tiene tres funciones principales:
1.- La generación de moléculas de alta energía (ATP y NADH) como fuente de energía celular en
procesos de respiración aeróbica (presencia de oxígeno) y anaeróbica (ausencia de oxígeno).
2.- La generación de piruvato que pasará al Ciclo de Krebs, como parte de la respiración aeróbica.
3.- La producción de intermediarios de 6 y 3 carbonos que pueden ser ocupados por otros procesos
celulares.
La fosforilación oxidativa es un proceso metabólico que utiliza energía liberada por la
oxidación de nutrientes para producir adenosina trifosfato (ATP).
La fosforilación oxidativa se define como la formación de ATP generada por la
transferencia de electrones. Todas las rutas catabólicas, en los organismos aerobios,
convergen para permitir el flujo de electrones hasta el oxígeno, produciendo energía
para la generación de ATP constituyendo la etapa final del catabolismo de todas las
biomoléculas.
oxidación de los ácidos grasos
Es un mecanismo clave para la obtención de energía metabólica (ATP) por
parte de los organismos aeróbicos. Dado que los ácidos grasos son moléculas
muy reducidas, su oxidación libera mucha energía; en los animales, su
almacenamiento en forma de triacilgliceroles es más eficiente y
cuantitativamente más importante que el almacenamiento de glúcidos en forma
de glucógeno.
La β-oxidación de los ácidos grasos lineales es el principal proceso productor
de energía, pero no el único. Algunos ácidos grasos, como los de cadena impar
o los insaturados requieren, para su oxidación, modificaciones de la β-oxidación
o rutas metabólicas distintas. Tal es el caso de la α-oxidación, la ω-oxidación o
la oxidación peroxisómica.
Este ciclo, conocido también como de los ácidos
tricarboxílicos o ciclo de Krebs, es la vía de oxidación
de la mayor parte de carbohidratos, ácidos grasos y
aminoácidos
CICLO DE KREBS
En células Eucariotas se realiza en la matriz mitocondrial, en la
procariotas se realiza en el citoplasma, en organismos aeróbicos, el ciclo
de Krebs es parte de la vía catabólica que realiza la oxidación de glúcidos,
ácidos grasos y aminoácidos
Bibliografía
Cerrón T.G. (2008) Bioquímica. México.: GAFRA Editores.
Marrón L.G.(2013) Química, Biología y Genética. Villahermosa, Tabasco.: Ideo Gráficos S.A de C.V
Nelson D.L., Cox. M.M (2006) Principios de Bioquímica (4ta edición) Barcelona.: OMEGA
Wade L.G. (2004) Química orgánica (5ta Edición) Madrid.: PEARSON Educación.
Chan R. ( 2010) Química (7ma. Edición) México D.F.: MC GRAW HILL/interamericana editores. S.A de C.V
Yurkanis. P. (2007) Fundamentos De Química Orgánica. México.: Pearson education.
Calleja J. (2012) Disacáridos. Consultado el 08 de Mayo de 2015, de
http://biologia.laguia2000.com/bioquimica/disacaridos.
Stephenson N. (2009) glúcidos II: polisacáridos. Consultado el 6 de mayo de 2015. De http://bi-lo-ia-
20.blogspot.mx/2009/glucidos-ii-polisacarido.html
Audiovisuales (2012) Youtube, cadena respiratoria. Consultado del canal de Emabiologa:
http://www.youtube.com/watch?v=tindgxs8zkk.

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Bioquímica: Moléculas biológicas

  • 1. UNIVERSIDAD JUÁREZ AUTÓNOMA DE TABASCO División Académica Multidisciplinaria De Los Ríos Materia: Bioquímica Unidad 3: Naturaleza de las moléculas biológicas Unidad 4: Naturaleza de las moléculas biológicas Unidad 5: Nucleótidos, Ácidos Nucleícos, Reacciones bioenergéticas y principales ciclos metabólicos Alumna: Maryleen Olivia López Flores Profesora: M.A. Carolina Del Carmen Pérez Sánchez Tenosique, Tabasco08 de Mayo De 2015
  • 2. INDICE Unidad 3: Naturaleza de las moléculas biológicas 3.1 Aspectos generales y clasificación de Glúcidos. 3.1.1Monosacáridos. Estructuras lineales y cíclicas. 3.1.2 Derivados fosforilados, desoxiazúcares, aminosas y derivados ácidos. Enlace glucosídico. 3.1.3 Disacáridos: estructura y función. 3.1.4Polisacáridos de interés biológico. 3.1.5Glucoproteínas y proteoglicanos. 3.2 Aspectos generales y clasificación de lípidos. 3.2.1Estructura, clasificación y propiedades delos lípidos. 3.2.2 Ácidos grasos. 3.2.2 Lípidos complejos: Triacilglicéridos, Fosfoglicéridos, esfingolípidos y ceras. 3.2.3 Lípidos simples: Terpenos, Esteroides y Prostaglandinas. 3.2.4Derivados lipídicos Separación y análisis de lípidos Unidad 4: Naturaleza de las moléculas biológicas 4.1 Aminoácidos y péptidos. 4.1.1 Estructura y propiedades iónicas. 4.1.2Principales aminoácidos. 4.1.3Enlace peptídico. 4.1.4Estudio de la secuencia peptídica. 4.2Proteínas. 4.2.1Concepto y función. Clasificación 4.2.2Estructura primaria de las proteínas. 4.2.3 Estructura secundaria: hélice alfa y lámina beta. Proteínas fibrosas función.
  • 3. 5.1Nucleotidos y ácidos nucleicos 5.1.1 purinas y pirimidinas 5.1.2Nucleótidos y Nucleósidos 5.1.3 Ácidos nucleicos 5.2 Reacciones bioenergéticas y principales ciclos metabólicos 5.2.1 Introducción 5.2.2 Catabolismo y producción de la Energía. Cadena respiratoria, Glucólisis, Fosforilación oxidativa, Oxidación de los ácidos grasos, Degradación de proteínas y aminoácidos 5.2.3 Biosíntesis y utilización de la energía. (Ciclo de ácidos tricarboxílicos, Biosíntesis de carbohidratos Biosíntesis de lípidos Unidad 5: Nucleótidos, Ácidos Nucleícos, Reacciones bioenergéticas y principales ciclos metabólicos 4.2.4 Estructura terciaria. Proteínas globulares. 4.2.5Estructura cuaternaria, 4.2.6 Desnaturalización y renaturalización de proteínas. 4.3 Enzimas. 4.3.1. Clasificación internacional de las enzimas. 4.3.2 Coenzimas y Cofactores 4.3.3 Cinética enzimática
  • 4. 3.1 Aspectos generales y clasificación de Glúcidos. CARBOHIDRATOS Glúcidos Azúcares Hidratos de carbono Osas Fórmula empírica (CH2O)n Los carbohidratos son aldehídos o cetonas con grupos hidroxilo que pueden existir como cadenas o anillos. los carbohidratos o hidratos de carbono son compuestos terciarios formados por tres bioelementos: carbono, hidrogeno y oxidación (C,H,O)
  • 6. 3.1.1MONOSACARIDOS ESTRUCTURA LINEAL Y CICLICA Los monosacáridos o azúcares simples son los glúcidos más sencillos, que no se hidrolizan, es decir, que no se descomponen para dar otros compuestos, conteniendo de tres a seis átomos de carbono. Se pueden clasificar según el número de carbonos que contiene la cadena en: triosas, tetrosas, pentosas y hexosas. La estructura básica de todos los monosacáridos es una cadena de átomos de carbono no ramificada en la que todos ellos están unidos por enlaces simples. Uno de estos átomos de carbono está unido a uno de oxígeno por un enlace doble formando un grupo carbonilo; todos los demás están unidos a grupos hidroxilo. Si el grupo carbonilo se encuentra en un extremo de la cadena carbonada el monosacáridos es un aldehído y recibe el nombre de aldosa; si el grupo carbonilo se encuentra en cualquier otra posición el monosacárido es una cetona y recibe el nombre de cetosa
  • 8. 3.1.2 Derivados fosforilados, desoxiazúcares, aminosas y derivados ácidos. Enlace glucosídico. Tipo Formación Ejemplo Estructura Amino azúcar Sustitución de un OH Por un grupo amino (-NH2) Glucosamina Derivados fosforilados Se añade un grupo fosfato Glucosa-6- fosfato Desoxiazucares Se reduce la ribosa Pierde un atomo de O en un (OH) Desoxiribosa Derivados ácidos Oxida el carbono 6 Presenta grupo carboxilo Glucuronato o acido glucuronico
  • 9. Enlace glucosídico El enlace glucosídico o glicosídico es el enlace para unir monosacáridos con el fin de formar disacáridos o polisacáridos. Su denominación más correcta es enlace O-glucosídico pues se establece en forma de éter siendo un átomo de oxígeno el que une cada pareja de unidades de monosacáridos. Mediante este enlace se unen dos monosacáridos según el siguiente esquema:
  • 10. Disacáridos: estructura y función. Su fórmula general es C12H22O12 algunos disacáridos son: Las propiedades de los disacáridos son semejantes a las de los monosacáridos: son sólidos cristalinos de color blanco, sabor dulce y solubles en agua. Los disacáridos desempeñan funciones importantes en la dieta humana. También llamados azúcares dobles, los disacáridos son un tipo de carbohidrato que contienen dos moléculas de azúcar llamadas monosacáridos que están unidas entre sí en un compuesto. Tu cuerpo digiere los disacáridos presentes en los alimentos y los divide en dos moléculas de azúcar individuales que luego son absorbidas por el intestino delgado.
  • 11. 3.1.4 Polisacáridos de interés biológico. Los polisacáridos están formados por la unión de centenares de monosacáridos, unidos por enlaces“O-glucosídicos”. Los polisacáridos son macromoléculas de elevado peso molecular y estructura compleja. Disacárido Estructura Papel biológico Sacarosa β-D-Fructosa (2→1) α-D- Glucosa Azúcar vegetal (azúcar de mesa) Maltosa α-D-Glucosa (1→4) α-D- Glucosa Almidón, glucógeno Lactosa β-D-Galactosa (1→4) α-D- Glucosa Azúcar de la leche Celobiosa β-D-Glucosa(1→4) β-D-Glucosa Celulosa Disacáridos de importancia biológica Existe una multitud de disacáridos diferentes en la naturaleza, aunque los que se encuentran en los seres vivos con mayor frecuencia son los siguientes:
  • 12. 3.1.5 Glucoproteínas y proteoglicanos. Las glicoproteínas o glicoproteínas son moléculas compuestas por una proteína unida a uno o varios glúcidos, simples o compuestos. El término glicoproteína se usa en general para referirse a una molécula de dimensiones específicas, integrada normalmente por uno o más oligosacáridos unidos de modo covalente a cadenas laterales específicas de polipéptidos. Suelen tener un mayor porcentaje de proteínas que de glúcidos. Los proteoglicanos son macromoléculas formadas por una proteína central, a lo largo de la cual se asocian, por su extremo terminal, numerosas moléculas de glicosaminoglicanos sulfatados. Existe una enorme variedad de proteoglicanos, dependiendo del tipo y largo de la proteína central y del tipo, número y longitud de los glicosaminoglicanos asociados a ella.
  • 13. LÍPIDOS 3.2 Aspectos generales y clasificación de lípidos. 3.2.1Estructura, clasificación y propiedades de los lípidos. Los lípidos son biomoléculas orgánicas formadas básicamente por carbono e hidrógeno y generalmente también oxígeno; pero en porcentajes mucho más bajos. Además pueden contener también fósforo, nitrógeno y azufre . Es un grupo de sustancias muy heterogéneas que sólo tienen en común estas dos características: 1. Son insolubles en agua. 2. Son solubles en disolventes orgánicos, como éter, cloroformo, benceno, etc. Son los derivados reales ó potenciales de los ácidos grasos y substancias relacionadas
  • 14. Lípidos Lípidos simples Tienen estructuras poco complejas y no se pueden descomponer por procesos químicos o se pueden descomponer en un número limitado de compuestos sencillos Grasas Esteroides Aceites Lípidos complejos Tienen variantes en sus estructuras, se pueden descomponer en compuestos sencillos Fosfolípidos Clasificación
  • 15. Funciones Los lípidos desempeñan importantes funciones en los seres vivos. Estas son, entre otras, las siguientes: Estructural: Son componentes estructurales fundamentales de las membranas celulares. Energética: Al ser moléculas poco oxidadas sirven de reserva energética pues proporcionan una gran cantidad de energía. Protectora: Las ceras impermeabilizan las paredes celulares de los vegetales y de las bacterias y tienen también funciones protectoras en los insectos y en los vertebrados. Transportadora: Sirven de transportadores de sustancias en los medios orgánicos. Reguladora del metabolismo: Contribuyen al normal funcionamiento del organismo. Desempeñan esta función las vitaminas (A,D, K y E). Las hormonas sexuales y las de la corteza suprarrenal también son lípidos. Reguladora de la temperatura: También sirven para regular la temperatura. Por ejemplo, las capas de grasa de los mamíferos acuáticos de los mares de aguas muy frías.
  • 16. Ácidos grasos Se conocen unos 70 ácidos grasos que se pueden clasificar en dos grupos : ACIDOS GRASOS SATURADOS Solo tienen enlaces simples y suelen encontrarse en grasas animales. INSATURADOS Tienen un doble enlace, suelen encontrarse fundamentalmente en grasas de origen vegetal Los ácidos grasos son ácidos carboxílicos con cadenas largas de hidrocarburos. Los ácidos grasos se encuentran con mayor frecuencia en la naturaleza. Los ácidos grasos pueden saturarse con hidrógeno(y, por tanto, no tienen enlaces dobles carbono-carbono) o pueden ser no saturados (y tienen enlaces dobles carbono- carbono). Los ácidos grasos con más de un enlace doble se llaman ácidos grasos poliinsaturados.
  • 17. ácido esteárico un ácido graso con 18 carbonos sin dobles enlaces ácido oleico un ácido graso con 18 carbonos con un enlace doble ácido linolénico un ácido graso con 18 carbonos con tres enlaces dobles ácido linoleico un ácido graso con 18 carbonos con dos enlaces dobles Ejemplos de ácidos grasos:
  • 18.
  • 19. 3.2.3 Lípidos complejos: Triacilglicéridos, Fosfoglicéridos, esfingolípidos y ceras. Los triglicéridos son grasas transportadas en la sangre de las comidas que comemos. El exceso de calorías, el alcohol o el azúcar en la sangre en el cuerpo son convertidos en triglicéridos y guardados en células grasas a través del cuerpo. A los triglicéridos generalmente se les denomina grasas si se encuentran en estado sólido a temperatura ambiente. La mayor parte de los triglicéridos derivados de los mamíferos son grasas, como la grasa de ternera o la manteca de cerdo. A pesar de que estas grasas son sólidas a temperatura ambiente, la temperatura del cuerpo de los animales hace que las grasas se encuentren en un estado fluido, permitiendo su distribución en el cuerpo Los ácidos grasos de los triglicéridos comunes son ácidos carboxílicos lineales y largos, entre 12 y 20 átomos de carbono.
  • 20. Fosfoglicéridos: Los lípidos que contienen un grupo fosfato se llaman fosfolípidos. Las dos principales clases de fosfolípidos son los fosfoglicéridos y los esfingolípidos. Los fosfoglicéridos (llamados también fosfoacilgliceroles) son parecidos a los triglicéridos, excepto que el grupo terminal OH de glicerol forma un éster con el ácido fosfórico en vez de con un ácido graso, lo que da como resultado un ácido fosfatídico.
  • 21. Los esfingolípidos son el segundo gran grupo (por abundancia) de lípidos de membrana. Su base estructural es la ceramida (esfingosina con un ácido graso unido a su grupo amino mediante enlace amida). Esfingolípidos
  • 22. Ceras Las ceras (céridos) se forman por la unión de un acido graso de cadena larga (de 14 a 36 átomos de carbono) con un monoalcohol, también de cadena larga ( de a átomos de carbono) mediante un enlace éster. Las ceras tienes esencialmente función de impermeabilización y protección.
  • 23. Lípidos simples: Terpenos, Esteroides y Prostaglandinas. Los terpenos son una clase diferente de lípidos. Se conocen más de 20,000 terpenos. Pueden ser hidrocarburos o pueden contener oxígeno y ser alcoholes, cetonas o aldehídos. Ciertos terpenos se han empleado por miles de años como especias, perfumes y medicamentos. mentol geraniol Clasificación de los torpenos Numero de átomos de carbono Unidad de isopropeno Nombre que se les denomina 10 2 Monoterpeno 15 3 Sesquiterpenos 20 4 Diterpeno 30 6 Triterpenos 40 8 tetrapertenos
  • 24. Esteroides Todos los esteroides contienen un sistema de anillos tetracíclicos, compuesto por tres anillos de seis miembros y un anillo de cinco. Las hormonas esteroides se dividen en cinco clases: glicocorticoides, mineralocorticoides, andrógenos, estrógenos y progestinas. Prostaglandinas Las prostaglandinas son derivados de ácidos grasos que son reguladores bioquímicos incluso más potentes que los esteroides. Se denominan prostaglandinas porque se aislaron por primera vez a partir de las secreciones de la glándula de la próstata. Las prostaglandinas tienen un anillo de cicIopentano con dos cadenas laterales largas en posición trans una respecto a otra, con una de las cadenas laterales finalizando en un ácido carboxílico.
  • 25. Derivados lipidicos Se obtienen por hidrólisis de grasas, frecuentemente contienen un número par de átomos de carbono. Se encuentran en alimentos vegetales y animales, también se encuentran en formas complejas con otras sustancias. No se pueden clasificar como simples o compuestos, sino: • Los terpenos, terpenoides o isoprenoides, son lípidos derivados del hidrocarburo isopropeno. Los terpenos biológicos constan, como mínimo de dos moléculas de isopreno. Algunos terpenos importantes son los aceites esenciales, el fitol, las vitaminas A, K y E. Terpenos • Los eicosanoides son lípidos derivados de los ácidos grasos esenciales de 20 carbonos tipo omega-3 y omega-6. Todos los eicosanoides son moléculas de 20 átomos de carbono. Eicosanoides • Los esteroides son lípidos derivados del núcleo del hidrocarburo esterano, se componen de cuatro anillos fusionados de carbono que posee diversos grupos funcionales por lo que la molécula tiene partes hidrofílicas e hidrofóbicas. Entre los esteroides más destacados se encuentran los ácidos biliares, las hormonas sexuales, las corticosteroides, la vitamina D y el colesterol. Esteroides
  • 26. 4.1 Aminoácidos y péptidos. 4.1.1 Estructura y propiedades. Los aminoácidos son compuestos nitrogenados que se caracterizan por presentar un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH) unidos al mismo carbono. Estos dos grupos se pueden ionizar en medio acuoso, siendo los responsables del anfoterismo de los aminoácidos, es decir, pueden actuar como ácidos o como bases, en función del pH del medio (los compuestos que son capaces de aceptar o ceder protones se denominan anfóteros o anfolitos) PÉPTIDOS La unión de dos o más aminoácidos (AA) mediante enlaces amida origina los péptidos. En los péptidos y en las proteínas, estos enlaces amida reciben el nombre de enlaces peptídicos y son el resultado de la reacción del grupo carboxilo de un AA con el grupo amino de otro, con eliminación de una molécula de agua.
  • 27. Clasificación de los Aminoácidos De acuerdo a su Obtención por el Organismo Esenciales No Esenciales Valina (Val, V) Alanina (Ala, A) Leucina (Leu, L) Prolina (Pro, P) Treonina (Thr, T) Glicina (Gly, G) Lisina (Lys, K) Serina (Ser, S) Triptófano (Trp, W) Cisteína (Cys,C) Histidina (His, H) Asparagina (Asn, N) Fenilalanina (Phe, F) Glutamina (Gln, Q) Isoleucina (Ile, I) Tirosina (Tyr, Y) Arginina (Arg, R) Aspartato (Asp, D) Metionina (Met, M) Glutamato (Glu, E)
  • 28. Clasificación de los Aminoácidos Fer HIzo un Lío Tremendo y Valentina Le Metió un Triptófano Fenilalanina Histidina Isoleucina Lisina Treonina Valina Leucina Metionina Triptófano Arginina Arginina e Histidina solo son esenciales en periodos de crecimiento celular, la infancia, la lactancia y la enfermedad Aminoácidos Esenciales: Mnemotecnia
  • 29. Un péptido es el producto de unión de dos o más aminoácidos El enlace peptídico es el enlace covalente tipo amida que se forma entre el grupo α-carboxilo de un aminoácido y el α-amino de otro. Enlace Peptídico La reacción es una condensación con eliminación de una molécula de agua Los aminoácidos que conforman el péptido pasan a denominarse residuos de aminoácidos.
  • 30. Los péptidos presentan en un extremo un grupo amino sin reaccionar (amino terminal o N-terminal) y en el otro un carboxilo sin reaccionar (carboxilo terminal o C-terminal) Enlace Peptídico
  • 31. Tiene carácter parcial de doble enlace, por lo que es muy rígido. Se comporta como un híbrido de resonancia. Estructura del Enlace Péptidico La configuración trans está mas favorecida; la cis esta impedida estéricamente. + - El Oxígeno carbonílico tiene carga parcial negativa y el Nitrógeno amida carga parcial positiva, por tanto el enlace tiene carácter polar
  • 32. 4.2 Proteínas. 4.2.1 Concepto y función. Clasificación Las proteínas son biomoléculas orgánicas formadas por C, H, O, N y en menor medida P y S y otros elementos (Fe,Cu, Mg,...). Son polímeros no ramificados de aminoácidos (aa) que se unen mediante enlaces peptídicos. Son las moléculas orgánicas más abundantes en los seres vivos. Su importancia radica en la variedad de funciones diferentes que pueden desempeñar.
  • 33. Función de las proteínas
  • 34. Proteínas Holoproteínas (solo contienen aa) Globulares Fibrosas Heteroproteínas (aa + otro componente no proteico) Glicoproteínas Fosfoproteínas Lipoproteínas Nucleoproteínas Cromoproteínas Clasificación
  • 35.
  • 36. 4.2.2 Estructura primaria de las proteínas La estructura primaria de una proteína es su secuencia de aminoácidos, es decir, vendría especificada por los aminoácidos que la forman y el orden de colocación de los mismos a lo largo de la cadena polipeptídica. La secuencia de aminoácidos de una proteína se escribe empezando por el extremo amino terminal y finalizando por el carboxi-terminal.
  • 37. 4.2.3 Estructura secundaria: hélice alfa y lámina beta. Proteínas fibrosas función. Es la disposición espacial que adopta la secuencia de aa debido a la capacidad de giro de los enlaces. De los posibles plegamientos hay algunos que dan lugar a estructuras estables y son los que se mantienen. La estructura secundaria puede ser de dos tipos: Hélice a Un tipo de estructura secundaria es la hélice a En una hélice a, la columna vertebral del polipéptido se enrolla alrededor del eje largo de la molécula de la proteína Los sustituyentes de los carbonos a de los aminoácidos se proyectan hacia fuera de la hélice; por tanto, se minimiza el impedimento estérico. Cada hidrógeno unido a un nitrógeno amiduro se enlaza a un oxígeno carbonilo de un aminoácido alejado a una distancia de cuatro aminoácidos. Recuerde que un puente de hidrógeno puede tener lugar entre un hidrógeno enlazado a un nitrógeno y un par electrones no compartidos del oxígeno.
  • 38. Hoja plegada b El segundo tipo de estructura secundaria es una hoja plegada b. En una hoja plegada b la columna vertebral del polipéptido se extiende en una estructura en forma de zigzag que se asemeja a una serie de pliegues. El puente de hidrógeno en una hoja plegada b tiene lugar entre las cadenas peptídicas adyacentes
  • 39. Las proteínas fibrosas son generalmente proteínas estáticas, cuya función principal es la de proporcionar soporte mecánico a las células y los organismos, suelen ser insolubles y están formadas por una unidad repetitiva simple que se ensambla para formar fibras. Entre las proteínas fibrosas podemos encontrar la alfa-queratina, componente principal del pelo y las uñas; el colágeno, presente en la piel, los tendones, huesos y dientes. Proteínas globulares las cadenas polipétidas se pliegan en forma esférica y poseen una estructura más complejas que las anteriores, ya que puede haber más de una estructura secundaria en la misma molécula. Son solubles en agua . Algunas de las más importantes son: Mioglobina, citocromo, ribonucleasa, lisozima.
  • 40. Estructura terciaria: Esta representada por los súper plegamientos y enrollamientos de la estructura secundaria, constituyendo formas tridimensionales geométricas muy complicadas que se mantienen por enlaces fuertes (puentes disulfuro entre dos cisteinas) y otros débiles (puentes de hidrógeno; fuerzas de van der waals; interacciones iónicas e interacciones hidrofóbicas). •Punto de vista funcional, esta estructura es la más importante pues, al alcanzarla es cuando la mayoría de las proteínas adquieren su actividad biológica o función. •Muchas proteínas tienen estructura terciaria globular caracterizadas por ser solubles en disoluciones acuosas, como la mioglobina o muchos enzimas. •no todas las proteínas llegan a formar estructuras terciarias
  • 41. Estructura Cuaternaria Están formadas por la unión mediante enlaces débiles (no covalentes) de varias cadenas polipeptídicas con estructura terciaria, para formar un complejo proteico. Cada una de estas cadenas polipeptídicas recibe el nombre de protómero. La estructura cuaternaria debe considerar: (1) El número y la naturaleza de las distintas subunidades o monómeros que integran el oligómero (2) La forma en que se asocian en el espacio para dar lugar al oligómero. (formadas por dos o mas cadenas peptidicas que pueden ser iguales o diferentes)
  • 42. Desnaturalización y renaturalización de proteínas A la destrucción de la estructura terciaria sumamente organizada de una proteína se le llama desnaturalización Cualquier cosa que rompa el enlace encargado de mantener la forma tridimensional de la proteína ocasiona que ésta sufra desnaturalización (se desdobla). Debido a que estos enlaces son débiles, las proteínas se pueden desnaturalizar fácilmente. A continuación se indican algunas de las formas en que se desnaturalizan las proteínas: •Al cambiar el pH las proteínas se desnaturalizan porque se modifican las cargas de muchas de las cadenas laterales. •Ciertos reactivos como la urea desnaturalizan las proteínas al formar puentes de hi-drógeno en los grupos proteicos, los cuales son más fuertes que los puentes de hidrógeno que se forman entre los grupos. •Las proteínas también se desnaturalizan por calor o por agitación. Un ejemplo muy conocido es el cambio que sufre la clara de huevo cuando se calienta o se bate
  • 43. 4.3 Enzimas. 4.3.1. Clasificación internacional de las enzimas. Las enzimas son el grupo más variado y especializado de las proteínas, su función es actuar como catalizadores, permitiendo que las reacciones que transcurren en los seres vivos puedan desarrollarse a un ritmo adecuado. Un catalizador, por definición, es un compuesto que con su sola presencia aumenta la velocidad de la reacción sin experimentar ninguna modificación. Al igual que las proteínas, les hay de muy diferentes tamaños y requerimientos.
  • 44. Cofactor (Coenzima): Átomo, ion o molécula que participa en el proceso catalítico sin ser enzima ni substrato. Los cofactores participan de dos maneras distintas: 1. A través de una fijación muy fuerte a la proteína y salen sin ser modificados del ciclo catalítico 2. Como un segundo substrato; salen modificados del ciclo catalítico y por lo general requieren otra enzima para volver al estado original. Los cofactores enzimáticos suelen ser moléculas complejas, que nuestro organismo no puede sintetizar, por lo general. Por esa razón muchos cofactores enzimáticos deben ser, en todo en parte, ingresados con la dieta; muchos de ellos son, por lo tanto, vitaminas. Ni todos los cofactores son vitamínicos ni todas las vitaminas son cofactores enzimáticos
  • 45. Estudio de la velocidad de reacciones catalizadas enzimáticamente, proporcionando información directa acerca del mecanismo de la reacción catalítica y de la especifidad del enzima. La velocidad de una reacción catalizada por un enzima depende de: 1. la concentración de moléculas de sustrato [S] 2. la temperatura 3. la presencia de inhibidores 4. pH del medio, que afecta a la conformación (estructura espacial) de la molécula enzimática
  • 46. Nucleótidos Los nucleótidos son moléculas orgánicas formadas por la unión covalente de un monosacáridos de cinco carbonos (pentosa), una base nitrogenada y un grupo fosfato. El nucleósido es la parte del nucleótido formada únicamente por la base nitrogenada y la pentosa. Son los monómeros de los ácidos nucleicos (ADN y ARN) en los cuales forman cadenas lineales de miles o millones de nucleótidos, pero también realizan funciones importantes como moléculas libres (por ejemplo, el ATP o el GTP). Los nucleótidos pueden existir como monofosfatos, difosfatos y trifosfatos. Se nombran agregando al nombre del nucleósido los términos monofosfato, difosfato o trifosfato.
  • 47. Un nucleósido es una molécula monomérica orgánica que integra las macromoléculas de ácidos nucleicos que resultan de la unión covalente entre una base nitrogenada con una pentosa que puede ser ribosa o desoxirribosa. Ejemplos de nucleósidos son la citidina, uridina, adenosina, guanosina, timidina y la inosina. Nucleósido Citidina Uridina
  • 48. Ácidos nucleicos Los ácidos nucleicos (AN) fueron descubiertos por Freidrich Miescher en 1869. En la naturaleza existen solo dos tipos de ácidos nucleicos: El ADN (ácido desoxirribonucleico) y el ARN (ácido ribonucleico) y están presentes en todas las células. Los ácidos nucleicos tienen al menos dos funciones: trasmitir las características hereditarias de una generación a la siguiente y dirigir la síntesis de proteínas específicas. Tanto la molécula de ARN como la molécula de ADN tienen una estructura de forma helicoidal.
  • 49. Químicamente, estos ácidos están formados, por unidades llamadas nucleótidos: cada nucleótido a su vez, está formado por tres tipos de compuestos: 1. Una pentosa o azúcar de cinco carbonos: se conocen dos tipos de pentosas que forman parte de los nucleótidos, la ribosa y la desoxirribosa, esta última se diferencia de la primera por que le falta un oxígeno y de allí su nombre. El ADN sólo tiene desoxirribosa y el ARN tiene sólo ribosa, y de la pentosa que llevan se ha derivado su nombre, ácido desoxirribonucleico y ácido ribonucleico, respectivamente. 2. Una base nitrogenada: que son compuestos anillados que contienen nitrógeno. Se pueden identificar cinco de ellas: adenina, guanina, citosina, uracilo y timina. 3. Un radical fosfato: es derivado del ácido fosfórico (H3PO4 -). Los ácidos nucleicos son el ácido desoxirribonucleico (ADN) y el ácido ribonucleico (ARN). El ADN porta la información genética que comanda la formación de un organismo completo y, junto con el ARN, determinan las bases del funcionamiento celular a través de la expresión de la información que contienen.
  • 50. INTRODUCIÓN Los alimentos que consumen los atletas/deportistas tienen que necesariamente primero ser digeridos, proceso por el cual el alimento se degrada en materias más pequeñas y asimilables. Luego se procede a la absorción de los nutrimentos derivados de los alimentos. Finalmente, los nutrimentos circulantes llegan a la célula para que ocurra el metabolismo. El funcionamiento del organismo humano depende de una variedad de procesos bioquímicos que en conjunto representan el metabolismo de las células corporales. Las reacciones químicas involucradas en el metabolismo proveen (y utilizan) compuestos de energía indispensables para mantener trabajando todos nuestros órganos del cuerpo, mantienen vivo al ser humano. Para el atleta, los procesos liberadores y de síntesis de energía que constituyen el metabolismo facilita la ejecutoria deportiva, y, en muchos casos, la mejora, particularmente cuando se llevan a cabo manipulaciones dietéticas efectivas. Claro esta, existen otros factores que determinan el nivel de efectividad en el rendimiento competitivo, tales como el nivel de entrenamiento o aptitud física, la periodización del entrenamiento físico, características genéticas del deportista (factores hereditarios), la edad del competidor, entre otras.
  • 51. Catabolismo y producción de la Energía. Cadena respiratoria, Glucólisis, Fosforilación oxidativa, Oxidación de los ácidos grasos, Degradación de proteínas y aminoácidos. METABOLISMO El conjunto de todas las transformaciones químicas que se producen en una célula u organismo recibe el nombre de metabolismo. Es una actividad muy coordinada cuyos objetivos de forma sintética serían: 1)Obtención de energía del medio ambiente 2)Obtención de moléculas características de la propia célula. Catabolismo es el conjunto de reacciones metabólicas mediante las cuales las moléculas orgánicas más o menos complejas (glúcidos, lípidos), que proceden del medio externo o de reservas internas, se rompen o degradan total o parcialmente transformándose en otras moléculas más sencillas y liberándose energía en mayor o menor cantidad que se almacena en forma de ATP. Esta energía será utilizada por la célula para realizar sus actividades vitales (transporte activo, contracción muscular, síntesis de moléculas) .
  • 53. La glucólisis o glicolisis (del griego glycos: azúcar y lysis: ruptura), es la vía metabólica encargada de oxidar o fermentar la glucosa y así obtener energía para la célula. Ésta consiste de diez reacciones enzimáticas que convierten a la glucosa en dos moléculas de piruvato, la cual es capaz de seguir otras vías metabólicas y así continuar entregando energía al organismo. Es la vía inicial del catabolismo (degradación) de carbohidratos, y tiene tres funciones principales: 1.- La generación de moléculas de alta energía (ATP y NADH) como fuente de energía celular en procesos de respiración aeróbica (presencia de oxígeno) y anaeróbica (ausencia de oxígeno). 2.- La generación de piruvato que pasará al Ciclo de Krebs, como parte de la respiración aeróbica. 3.- La producción de intermediarios de 6 y 3 carbonos que pueden ser ocupados por otros procesos celulares.
  • 54. La fosforilación oxidativa es un proceso metabólico que utiliza energía liberada por la oxidación de nutrientes para producir adenosina trifosfato (ATP). La fosforilación oxidativa se define como la formación de ATP generada por la transferencia de electrones. Todas las rutas catabólicas, en los organismos aerobios, convergen para permitir el flujo de electrones hasta el oxígeno, produciendo energía para la generación de ATP constituyendo la etapa final del catabolismo de todas las biomoléculas.
  • 55. oxidación de los ácidos grasos Es un mecanismo clave para la obtención de energía metabólica (ATP) por parte de los organismos aeróbicos. Dado que los ácidos grasos son moléculas muy reducidas, su oxidación libera mucha energía; en los animales, su almacenamiento en forma de triacilgliceroles es más eficiente y cuantitativamente más importante que el almacenamiento de glúcidos en forma de glucógeno. La β-oxidación de los ácidos grasos lineales es el principal proceso productor de energía, pero no el único. Algunos ácidos grasos, como los de cadena impar o los insaturados requieren, para su oxidación, modificaciones de la β-oxidación o rutas metabólicas distintas. Tal es el caso de la α-oxidación, la ω-oxidación o la oxidación peroxisómica.
  • 56. Este ciclo, conocido también como de los ácidos tricarboxílicos o ciclo de Krebs, es la vía de oxidación de la mayor parte de carbohidratos, ácidos grasos y aminoácidos CICLO DE KREBS En células Eucariotas se realiza en la matriz mitocondrial, en la procariotas se realiza en el citoplasma, en organismos aeróbicos, el ciclo de Krebs es parte de la vía catabólica que realiza la oxidación de glúcidos, ácidos grasos y aminoácidos
  • 57. Bibliografía Cerrón T.G. (2008) Bioquímica. México.: GAFRA Editores. Marrón L.G.(2013) Química, Biología y Genética. Villahermosa, Tabasco.: Ideo Gráficos S.A de C.V Nelson D.L., Cox. M.M (2006) Principios de Bioquímica (4ta edición) Barcelona.: OMEGA Wade L.G. (2004) Química orgánica (5ta Edición) Madrid.: PEARSON Educación. Chan R. ( 2010) Química (7ma. Edición) México D.F.: MC GRAW HILL/interamericana editores. S.A de C.V Yurkanis. P. (2007) Fundamentos De Química Orgánica. México.: Pearson education. Calleja J. (2012) Disacáridos. Consultado el 08 de Mayo de 2015, de http://biologia.laguia2000.com/bioquimica/disacaridos. Stephenson N. (2009) glúcidos II: polisacáridos. Consultado el 6 de mayo de 2015. De http://bi-lo-ia- 20.blogspot.mx/2009/glucidos-ii-polisacarido.html Audiovisuales (2012) Youtube, cadena respiratoria. Consultado del canal de Emabiologa: http://www.youtube.com/watch?v=tindgxs8zkk.