• Save
Validatie van de Random Prime Labelling voor de diagnostiek
Upcoming SlideShare
Loading in...5
×
 

Validatie van de Random Prime Labelling voor de diagnostiek

on

  • 890 views

Voordracht RP-labelling 4-2-2004

Voordracht RP-labelling 4-2-2004

Statistics

Views

Total Views
890
Views on SlideShare
887
Embed Views
3

Actions

Likes
0
Downloads
0
Comments
0

1 Embed 3

http://www.slideshare.net 3

Accessibility

Categories

Upload Details

Uploaded via as Microsoft PowerPoint

Usage Rights

© All Rights Reserved

Report content

Flagged as inappropriate Flag as inappropriate
Flag as inappropriate

Select your reason for flagging this presentation as inappropriate.

Cancel
  • Full Name Full Name Comment goes here.
    Are you sure you want to
    Your message goes here
    Processing…
Post Comment
Edit your comment

Validatie van de Random Prime Labelling voor de diagnostiek Validatie van de Random Prime Labelling voor de diagnostiek Presentation Transcript

  • Validatie van de Random Prime Labelling voor de diagnostiek In combinatie met directe fluorochroominbouw
  • Doel
    • Validatie van deze labelling ten behoeve van de FISH diagnostiek.
  • Voor- en nadelen
        • Labelling:
            • +Inzetten gaat sneller
            • +Uniforme fragmentlengte en schoon start DNA
            • +Minder DNA nodig
            • +Commercieel
            • -Extra digestie en zuiveringsstap
            • -Duurder
  • Voor- en nadelen
        • Hybridisatie:
            • +Meer hybridisaties
            • +Uniform
            • +Inzet- en wasstappen sneller/korter
            • +Geen formamide nodig (hybaid)
            • -Duurder
            • -Insluiten met lijm
            • -Beheer hybaid
  • Voor- en nadelen
        • Detectie:
            • +tijdwinst van ongeveer 1 uur
  • Voor- en nadelen
        • Detectie:
            • +tijdwinst van ongeveer 1 uur
        • Microscopie:
            • +Uniformer signaal
            • +Specifieker signaal
            • +Eerder analyseren
            • +Reproduceerbaar
  • Eisen:
        • Specificiteit
        • Sensitiviteit
  • Materiaal:
        • Patiënten met bewezen deletie (22q11)
        • Patiënten met bewezen trisomie (21)
        • Patiënten zonder bewezen deletie (22q11)
        • Onbekenden (diverse probes getest)
  • 21q11 en 21qter
  • 1008M13
  • M51 en 22qter
  • Resultaten
    • Van alle bekende patiënten die op de oude manier zijn geFISHed, is de nieuwe methode vergelijkbaar op:
    • Locatie
    • Aantonen van de afwijking
  • Resultaten
    • Van alle bekende patiënten die op de oude manier zijn geFISHed, is de nieuwe methode vergelijkbaar op:
    • Locatie
    • Aantonen van de afwijking
  • Random Prime Labelling vs. Nick labelling
        • Specifieker
  • Random Prime Labelling vs. Nick labelling
        • Specifieker
        • Uniformer
  • Random Prime Labelling vs. Nick labelling
        • Specifieker
        • Uniformer
        • Reproduceerbaarder
  • Wat kan er nog geoptimaliseerd worden
        • Optimale probe concentratie
  • Optimaliseren
        • Optimale probe concentratie
        • Cot-1 hoeveelheid
  • Optimaliseren
        • Optimale probe concentratie
        • Cot-1 hoeveelheid
  • Optimaliseren
        • Optimale probe concentratie
        • Cot-1 hoeveelheid
        • Competitie tijd
  • Optimaliseren
        • Optimale probe concentratie
        • Cot-1 hoeveelheid
        • Competitie tijd
        • Hybridisatie zonder formamide in doos verder uittesten
  • Optimaliseren
        • Optimale probe concentratie
        • Cot-1 hoeveelheid
        • Competitie tijd
        • Hybridisatie zonder formamide in doos verder uittesten
        • Optimale inbouw per fluorochroom
  • Optimaliseren
        • Optimale probe concentratie
        • Cot-1 hoeveelheid
        • Competitie tijd
        • Hybridisatie zonder formamide in doos verder uittesten
        • Optimale inbouw per fluorochroom
        • Lymfocyten voorbehandeling verder uittesten
  • Optimaliseren
        • Optimale probe concentratie
        • Cot-1 hoeveelheid
        • Competitie tijd
        • Hybridisatie zonder formamide in doos verder uittesten
        • Optimale inbouw per fluorochroom
        • Lymfocyten voorbehandeling verder uittesten
        • Overnemen van de NaCl/isopropanol precipitatie
          • (tijdwinst: 1 nacht)
  • Optimaliseren
        • Optimale probe concentratie
        • Cot-1 hoeveelheid
        • Competitie tijd
        • Hybridisatie zonder formamide in doos verder uittesten
        • Optimale inbouw per fluorochroom
        • Lymfocyten voorbehandeling verder uittesten
        • Overnemen van de NaCl/isopropanol precipitatie
          • (tijdwinst: 1 nacht)
        • Houdbaarheid van de gelabelde probes
  • Voorstel:
      • Staf:
      • Selectie probes
  • Voorstel:
      • Staf:
      • Selectie probes
      • Research:
      • Bestellen/kopen per mail
      • Opslag en registratie
      • Opgroeien
      • Meten
      • Amplificatie
      • Digestie en kolomzuivering
      • Gel analyse
      • Labelling en testen en QC
      • Centrale registratie en opslag
  • Voorstel:
      • Staf:
      • Selectie probes
      • Research:
      • Bestellen/kopen per mail
      • Opslag en registratie
      • Opgroeien
      • Meten
      • Amplificatie
      • Digestie en kolomzuivering
      • Gel analyse
      • Labelling en testen en QC
      • Centrale registratie en opslag
    • Diagnostiek:
      • Labelling van rest-DNA
      • Testen en QC
      • Pre-mixen maken van probes
      • Registratie en opslag