Validatie van de Random Prime Labelling voor de diagnostiek In combinatie met directe fluorochroominbouw
Doel <ul><li>Validatie van deze labelling ten behoeve van de FISH diagnostiek. </li></ul>
Voor- en nadelen <ul><ul><ul><li>Labelling: </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Inzetten gaat sneller </li></ul><...
Voor- en nadelen <ul><ul><ul><li>Hybridisatie: </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Meer hybridisaties  </li></ul>...
Voor- en nadelen <ul><ul><ul><li>Detectie: </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+tijdwinst van ongeveer 1 uur </li>...
Voor- en nadelen <ul><ul><ul><li>Detectie: </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+tijdwinst van ongeveer 1 uur </li>...
Eisen: <ul><ul><ul><li>Specificiteit </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Sensitiviteit </li></ul></ul></ul>
Materiaal: <ul><ul><ul><li>Patiënten met bewezen deletie (22q11) </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Patiënten met bewezen...
21q11 en 21qter
1008M13
M51 en 22qter
Resultaten <ul><li>Van alle  bekende  patiënten die op de oude manier zijn geFISHed, is de nieuwe methode vergelijkbaar op...
Resultaten <ul><li>Van alle  bekende  patiënten die op de oude manier zijn geFISHed, is de nieuwe methode vergelijkbaar op...
Random Prime Labelling vs. Nick labelling <ul><ul><ul><li>Specifieker </li></ul></ul></ul>
Random Prime Labelling vs. Nick labelling <ul><ul><ul><li>Specifieker </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Uniformer </li><...
Random Prime Labelling vs. Nick labelling <ul><ul><ul><li>Specifieker </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Uniformer </li><...
Wat kan er nog geoptimaliseerd worden <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul>
Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul>...
Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul>...
Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul>...
Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul>...
Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul>...
Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul>...
Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul>...
Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul>...
Voorstel: <ul><ul><li>Staf: </li></ul></ul><ul><ul><li>Selectie probes </li></ul></ul>
Voorstel: <ul><ul><li>Staf: </li></ul></ul><ul><ul><li>Selectie probes </li></ul></ul><ul><ul><li>Research: </li></ul></ul...
Voorstel: <ul><ul><li>Staf: </li></ul></ul><ul><ul><li>Selectie probes </li></ul></ul><ul><ul><li>Research: </li></ul></ul...
Upcoming SlideShare
Loading in …5
×

Validatie van de Random Prime Labelling voor de diagnostiek

733 views
656 views

Published on

Voordracht RP-labelling 4-2-2004

Published in: Technology, Business
0 Comments
0 Likes
Statistics
Notes
  • Be the first to comment

  • Be the first to like this

No Downloads
Views
Total views
733
On SlideShare
0
From Embeds
0
Number of Embeds
0
Actions
Shares
0
Downloads
0
Comments
0
Likes
0
Embeds 0
No embeds

No notes for slide

Validatie van de Random Prime Labelling voor de diagnostiek

  1. 1. Validatie van de Random Prime Labelling voor de diagnostiek In combinatie met directe fluorochroominbouw
  2. 2. Doel <ul><li>Validatie van deze labelling ten behoeve van de FISH diagnostiek. </li></ul>
  3. 3. Voor- en nadelen <ul><ul><ul><li>Labelling: </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Inzetten gaat sneller </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Uniforme fragmentlengte en schoon start DNA </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Minder DNA nodig </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Commercieel </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>-Extra digestie en zuiveringsstap </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>-Duurder </li></ul></ul></ul></ul></ul>
  4. 4. Voor- en nadelen <ul><ul><ul><li>Hybridisatie: </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Meer hybridisaties </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Uniform </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Inzet- en wasstappen sneller/korter </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Geen formamide nodig (hybaid) </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>-Duurder </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>-Insluiten met lijm </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>-Beheer hybaid </li></ul></ul></ul></ul></ul>
  5. 5. Voor- en nadelen <ul><ul><ul><li>Detectie: </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+tijdwinst van ongeveer 1 uur </li></ul></ul></ul></ul></ul>
  6. 6. Voor- en nadelen <ul><ul><ul><li>Detectie: </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+tijdwinst van ongeveer 1 uur </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Microscopie: </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Uniformer signaal </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Specifieker signaal </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Eerder analyseren </li></ul></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><ul><li>+Reproduceerbaar </li></ul></ul></ul></ul></ul>
  7. 7. Eisen: <ul><ul><ul><li>Specificiteit </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Sensitiviteit </li></ul></ul></ul>
  8. 8. Materiaal: <ul><ul><ul><li>Patiënten met bewezen deletie (22q11) </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Patiënten met bewezen trisomie (21) </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Patiënten zonder bewezen deletie (22q11) </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Onbekenden (diverse probes getest) </li></ul></ul></ul>
  9. 9. 21q11 en 21qter
  10. 10. 1008M13
  11. 11. M51 en 22qter
  12. 12. Resultaten <ul><li>Van alle bekende patiënten die op de oude manier zijn geFISHed, is de nieuwe methode vergelijkbaar op: </li></ul><ul><li>Locatie </li></ul><ul><li>Aantonen van de afwijking </li></ul>
  13. 13. Resultaten <ul><li>Van alle bekende patiënten die op de oude manier zijn geFISHed, is de nieuwe methode vergelijkbaar op: </li></ul><ul><li>Locatie </li></ul><ul><li>Aantonen van de afwijking </li></ul>
  14. 14. Random Prime Labelling vs. Nick labelling <ul><ul><ul><li>Specifieker </li></ul></ul></ul>
  15. 15. Random Prime Labelling vs. Nick labelling <ul><ul><ul><li>Specifieker </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Uniformer </li></ul></ul></ul>
  16. 16. Random Prime Labelling vs. Nick labelling <ul><ul><ul><li>Specifieker </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Uniformer </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Reproduceerbaarder </li></ul></ul></ul>
  17. 17. Wat kan er nog geoptimaliseerd worden <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul>
  18. 18. Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul></ul></ul>
  19. 19. Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul></ul></ul>
  20. 20. Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Competitie tijd </li></ul></ul></ul>
  21. 21. Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Competitie tijd </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Hybridisatie zonder formamide in doos verder uittesten </li></ul></ul></ul>
  22. 22. Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Competitie tijd </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Hybridisatie zonder formamide in doos verder uittesten </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Optimale inbouw per fluorochroom </li></ul></ul></ul>
  23. 23. Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Competitie tijd </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Hybridisatie zonder formamide in doos verder uittesten </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Optimale inbouw per fluorochroom </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Lymfocyten voorbehandeling verder uittesten </li></ul></ul></ul>
  24. 24. Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Competitie tijd </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Hybridisatie zonder formamide in doos verder uittesten </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Optimale inbouw per fluorochroom </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Lymfocyten voorbehandeling verder uittesten </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Overnemen van de NaCl/isopropanol precipitatie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><li>(tijdwinst: 1 nacht) </li></ul></ul></ul></ul>
  25. 25. Optimaliseren <ul><ul><ul><li>Optimale probe concentratie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Cot-1 hoeveelheid </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Competitie tijd </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Hybridisatie zonder formamide in doos verder uittesten </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Optimale inbouw per fluorochroom </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Lymfocyten voorbehandeling verder uittesten </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Overnemen van de NaCl/isopropanol precipitatie </li></ul></ul></ul><ul><ul><ul><ul><li>(tijdwinst: 1 nacht) </li></ul></ul></ul></ul><ul><ul><ul><li>Houdbaarheid van de gelabelde probes </li></ul></ul></ul>
  26. 26. Voorstel: <ul><ul><li>Staf: </li></ul></ul><ul><ul><li>Selectie probes </li></ul></ul>
  27. 27. Voorstel: <ul><ul><li>Staf: </li></ul></ul><ul><ul><li>Selectie probes </li></ul></ul><ul><ul><li>Research: </li></ul></ul><ul><ul><li>Bestellen/kopen per mail </li></ul></ul><ul><ul><li>Opslag en registratie </li></ul></ul><ul><ul><li>Opgroeien </li></ul></ul><ul><ul><li>Meten </li></ul></ul><ul><ul><li>Amplificatie </li></ul></ul><ul><ul><li>Digestie en kolomzuivering </li></ul></ul><ul><ul><li>Gel analyse </li></ul></ul><ul><ul><li>Labelling en testen en QC </li></ul></ul><ul><ul><li>Centrale registratie en opslag </li></ul></ul>
  28. 28. Voorstel: <ul><ul><li>Staf: </li></ul></ul><ul><ul><li>Selectie probes </li></ul></ul><ul><ul><li>Research: </li></ul></ul><ul><ul><li>Bestellen/kopen per mail </li></ul></ul><ul><ul><li>Opslag en registratie </li></ul></ul><ul><ul><li>Opgroeien </li></ul></ul><ul><ul><li>Meten </li></ul></ul><ul><ul><li>Amplificatie </li></ul></ul><ul><ul><li>Digestie en kolomzuivering </li></ul></ul><ul><ul><li>Gel analyse </li></ul></ul><ul><ul><li>Labelling en testen en QC </li></ul></ul><ul><ul><li>Centrale registratie en opslag </li></ul></ul><ul><li>Diagnostiek: </li></ul><ul><ul><li>Labelling van rest-DNA </li></ul></ul><ul><ul><li>Testen en QC </li></ul></ul><ul><ul><li>Pre-mixen maken van probes </li></ul></ul><ul><ul><li>Registratie en opslag </li></ul></ul>

×