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第26回統合DBミーティング@NIBIO の内容を共有します。

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  • 第26回統合DBミーティング Integrated DB MTG in NIBIO 2013/11/19 1
  • 本日の予定 • Sagace – アクセス解析 – Sagaceに追加するDBについて • 進捗報告 • 厚生労働科学研究成果データベース のカタログ化 – 分担 • 分子生物学会 – 準備,当日の予定等の確認 2
  • アクセス解析 (9/22-10/19 vs 10/20-11/16) 3
  • アクセス数減少の原因 • 連携機関のトラブルやメンテナンス により減少する傾向 • Googleの検索アルゴリズムのアップ デートは直接的ではなさそう。 4
  • 追加予定のDBについて ファセット分類/ データベース名 日本で維持されてい 産業中毒文献検索 る可移植性腫瘍株一 覧表 文献・用語集・辞 データベースの種類 生物資源 書 生物種 特定生物なし 動物(ヒト以外) 生体の階層 その他 細胞・組織 分類 B A 5
  • 進捗報告 • Sagace – 薬用植物総合情報データベースのメタデータ 作成 – RDFa Lite クローラーの完成 • http://sagace.nibio.go.jp/translation/rdfalite.php • 基盤研内部のデータのRDF化 – 希少疾病用医薬品のRDFの修正 – Virtuosoを最新版の更新 6
  • RDFa Lite クローラー web page html 7
  • html クローラーの検出結果 8
  • 厚生労働科学研究成果データ ベースのカタログ化 • カタログに既存に存在するもの,”デー タベース”という語が存在するもの, URLが存在するものを色付け。 • 50件済 – http://bit.ly/1iq6Bgm • 一人60件程度 – (目安2時間程度) • 12月中に完了を目処に。 9
  • 分子生物学会の準備 • 12月3日〜6日@神戸コンベンションセン ター • NBDCによる特別企画の1ブースを使用 • ブース名:医薬基盤研究所のデータベース とLinked Open Dataへの取り組み 10
  • 前日までの準備 • • • • • • ポスター,チラシ作成 デモの準備 スライドショー用スライド作成(各15秒 5~10枚) アンケートの作成 荷物(PC,ディスプレイ,チラシ等)の送付 前日準備 11
  • ポスター・チラシ作成 • 昨年度はポスターはSagaceと基盤研 内のDB紹介のみ • 案1:昨年度と同じ • 案2:3分割して,Sagace, TargetMine, Toxygatesをそれぞれ掲 載する。 12
  • デモ • 今年はデモ用ブースが存在 • 3〜5日のそれぞれの日の午後に1回ずつ • 10~15分程度,デモの時間あり。 – 案1 毎日実施 • Sagace,TargetMine,Toxygatesについて5分ず つくらい紹介する • 案2 一日1サービス紹介 • 案3 デモをしない。 13
  • その他 • スライドショー用スライド作成 – 各15秒 5~10枚 – Sagace,TargetMine,Toxygates • アンケートの作成 • 荷物(PC,ディスプレイ,チラシ等)の送付 • 前日準備 – 2日 14:00〜18:00 • 注意事項等 – 会場はwifiでの接続 – 展示説明員の名札 5枚 14
  • 当日 ( 9:30 ~ 17:00 ) • • • • • • デモ(NIBIOブース,デモブース) チラシの配布 ポスターの紹介 サービスの紹介 アンケート シフト – 2時間半毎 – 今週中に都合の悪い時間帯を教えて下さい。 15
  • 報告など・今後の予定 • 生命医薬情報学連合大会 • 今後の予定など • 11月・12月 – 実験動物バンクのRDF化 – 外部データベースとの連携 – 分子生物学会 • 1月 – BioHackathon 国内版
  • 次回 • 暫定 12月20日(金) 17